Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型

人类细胞内的DNA,即我们熟知的基因型,为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的,但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成,这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色,身高,体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些特征中都可以被我们周围的环境所调节,例如,暴露在压力、阳光或微生物下,可以导致一系列结果。 近日,《科学》杂志发布了《从基因型到表型》(Genotype to Phenotype)特刊,扩展了我们对基因型和表型的认知,并探索了在理解人类表型发展的影响因素方面的最新进展。在本期特刊的四篇综述文章中,十余位全球顶尖研究人员展示包括单细胞基因组学分析、GWAS在内的多种方法。这些方法将共同增进了我们对基因型和表现型之间复杂关系的理解,并有助于推动人类健康。 解析人类基因型与表现型关联来源 Deconstructing the sour......阅读全文

表型组的定义

中文名称表型组英文名称phenome定  义一个细胞、组织、器官、生物体或物种所有表型的总和。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

PlantScreen植物表型应用——高通量种子萌发活力与表型监测

种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。     种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工

霍奇金淋巴瘤的病理组织学介绍

  病变部位淋巴结等正常淋巴组织结构全部或部分破坏,呈现多种非肿瘤性反应性细胞成分,多为淋巴细胞,并可见浆细胞、嗜酸粒细胞、中性粒细胞、组织细胞、成纤维细胞及纤维组织。在多种反应性细胞背景成分中散在数量不等的典型RS细胞及其变异型。典型RS细胞为双核或多核巨细胞,核仁嗜酸性,大而明显,胞质丰富。若细

霍奇金病的病理组织学介绍

  病变部位淋巴结等正常淋巴组织结构全部或部分破坏,呈现多种非肿瘤性反应性细胞成分,多为淋巴细胞,并可见浆细胞、嗜酸粒细胞、中性粒细胞、组织细胞、成纤维细胞及纤维组织。在多种反应性细胞背景成分中散在数量不等的典型RS细胞及其变异型。典型RS细胞为双核或多核巨细胞,核仁嗜酸性,大而明显,胞质丰富。若细

植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例

植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对

基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术

  微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群,在全球碳循环中发挥关键作用,也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐,且自然界大部分微藻难以培养。近日,中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库,并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和

分子生态学词汇单倍体基因型

单倍型,是单倍体基因型的简称,在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合;通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。按照某一指定基因座上基因重组发生的数量,单倍型可以指至少两个基因座甚至整个染色体。

单倍型与基因型的区别

  更进一步的讲,单倍型也是指一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性(SNPs)。一个单倍型内的这类统计学关联性和等位基因的确认被认为是可以明确的识别所有其他多态区域。这些信息对于探查普通疾病的基因学非常有用,也被用于人类单倍体型图计划(HapMap)中。基因在一条染色体上的组合称单元

单倍体基因型的图谱计划的目的

  项目的目标并不是直接确定与疾病相关的基因,而是通过确定单倍型,使单倍型图成为用于进行关联研究的一个工具。在关联研究中,研究人员将患者的单倍型与健康人(对照)的单倍型相比较。如果与对照相比,某一种单倍型在患者中经常出现,影响该疾病的基因可能就存在于这个单倍型内部或附近。  常见的疾病如癌症、中风、

数字PCR在基因型鉴定的应用

PCR也可以用于检测一个生物中是否存在某特定DNA序列,这被称为基因型鉴定。例如,基因型鉴定可通过发现样品中是否存在某种群特异性序列来判断样本的真实性。基因型鉴定还可用于法医分析判断在现场发现的DNA样品是否和嫌疑人的吻合,令凶手无处遁形。

有机体基因型适应的概念

又称达尔文适应值或适合度·某一基因型个体与其他基因型个体相比时能够存活并留下后代的能力·一般用W或w表示·是对自然选择进行定量研究的重要参数·通常将适应值的最高值定为1。

单倍体基因型的图谱计划的意义

  HapMap还将产生截止2013年尚很难预料的知识上的进展。未来可以在患者的遗传构成的基础上实现个体化医疗,从而得到最好的效果并将副作用降至最低。与长寿和抗病能力有关的遗传变异将被确定,从而产生具有广泛益处的新疗法。对任何新知识而言,HapMap既带来新的挑战,又带来不可预料的空前的机遇。

细菌耐药表型的检测

β-内酰胺酶检测    β-内酰胺酶(β-lactamase)是细菌产生的可水解β-内酰胺环抗生素的酶。β-内酰胺酶的产生是细菌对(β-内酰胺类)抗菌药物耐药最常见的机制,广泛地涉及到许多社区获得性感染和医院内感染的重要病原菌,在各种耐药机制中占80%。    β-内酰胺酶是由多种酶组成的酶家族,通

细胞化学词汇质粒表型

中文名称:质粒表型英文名称:plasmid phenotype定  义:由于质粒的存在而赋予宿主细胞在一定环境条件下所表现的性状。包括对抗生素的抗性、产生抗生素、某些代谢特征和宿主控制的限制与修饰作用等。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

免疫表型的分析程序

实验材料 单克隆抗体抗凝血试剂、试剂盒 溶血素PBS实验步骤 1. 取 20 单克隆抗体与 100 μl 抗凝血,共同混合置室温 20 min。2. 加溶血素 1500 μI,置室温避光 15 min,2500 r/min 离心 5 min。3. 弃上清,加 1500 μI PBS,混匀,2500

免疫表型的分析程序

细胞表面抗原检测的染色方案 细胞胞质内及细胞核内抗原检测的染色方案             实验材料 单克隆抗体 抗凝血

作物表型组学阐述

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。与广泛的遗传信息相比,表型分析

真空压力表型号

  真空压力表广泛应用与输送气体,液体的管道及容器中测量无危险,无结晶体,不凝固体及对合金不起腐蚀 作用的液体,气体,蒸汽等介质的压力大小。真空压力表具有体积小,性能安全可靠,显示清晰等优点。  真空压力表型号:YZ-60,YZ-100,YZ-150,YZ-60Z,YZ-100Z,YZ-150Z,Y

免疫表型的分析程序

细胞表面抗原检测的染色方案 细胞胞质内及细胞核内抗原检测的染色方案             实验材料 单克隆抗体 抗凝血

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predi

根系原位多光谱表型成像系统在植物表型研究的应用

Videometer系列多光谱成像系统广泛应用于:植物/作物表型组学研究分析;根系表型分析;作物育种与种子品质检测;植物/作物胁迫生理响应;作物病理学分析与病原检测;食品检测;中药成分分析与品质检测。来自哥本哈根大学、丹麦理工大学以及丹麦Videometer公司的专家在刚刚利用该设备在Plant a

单细胞测序新突破:-北大绘制出人类胚胎基因调控图谱

  北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术,绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱,有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术,以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular

微生物所开发新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用

  微生物所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明ZL和美国

单细胞分离策略的优缺点

据美国能源部微生物基因组学计划的主管Tanja Woyke介绍,研究人员使用几种方法分离单细胞,它们各有优缺点。Quake曾使用微流体方法来分离一种称为TM7的无法培养微生物1。TM7是杆状的,于是Quake及其团队专门捕获口腔微生物群落中的杆状细菌。随后他们通过核糖体RNA来追踪所要的细胞。在35

新型微流控界面纳升注射技术还可以这么拓展应用?

  中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国

开发新型微滴反应筛选技术并开展单细胞分析应用

  中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国

2013技术展望之细胞培养

  原乍一看,细胞培养经过这么多年的发展,似乎不会在明年有什么大的改进。毕竟大部分培养细胞的方法都已成熟。但是,与其他领域一样,研究需求将大大推动细胞培养技术的发展。在未来的一年里,我们也许会看到干细胞、单细胞培养的方法有重大发展。   单细胞脱颖而出   许多基因组和转录组研究也指出

详解原代细胞、细胞系与细胞株之间的区别?

细胞培养物来源于原代外植体或分散的细胞悬液。通常在这样的培养物中原代细胞增殖形成汇合地单层细胞或密集地细胞悬液。这类细胞生命周期有限,在有限的生命周期内需掌握好细胞的生长空间,以保持细胞群中基因型和表型的一致性。 细胞系是不断生长,分化的细胞群,因其经过遗传改造,致使其具有无限增长的潜能。体外生长的

孟德尔豌豆实验(图)

孟德尔认为子一代的遗传性状来自于亲代父本和母本,然后再把这些性状传给子二代,而不是在子代那里混合起来的。 纯合的父本(圆豌豆)和纯合的母本(皱豌豆)杂交,每个亲代产生一种配子,S 或 s,杂交之后产生的子一代的基因型都是Ss,而表型都是圆豌豆。 当子一代进行自交时,它产生两种卵细胞,S和s,还有两种

大前庭水管患者的PDS基因型分析

  近年来国外的多项研究表明大前庭水管综合征和Pendred综合征(前庭水管扩大或伴内耳畸形、神经性聋和甲状腺肿)与PDS(SLC26A4)基因突变有密切的关系。PDS基因含21个外显子,开放阅读框架2343 bp,编码780个氨基酸的蛋白质Pendrin。Pendrin主要由疏