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NatCommun:微生物组的可靠“时钟”

尽管人类微生物组在过去几年中受到了人们的广泛关注,但一直以来难以观察其在各种刺激下随时间变化的情况。最常见的分析方法是从粪便样本中提取细菌,然后对它们的基因组进行测序,但是这种方法会丢失肠道中细菌的位置和时间等关键信息。 如今,来自哈佛大学的研究人员创建的一种新工具提供了解决此问题的方法,他们设计改造了一部分细菌基因,可以用于检测和记录菌群随着时间变化的情况。相关结果发表在最近的Nature communications。 该系统使用“基因电路”,作为测量细菌生长的遗传“时钟”。该调控因子由三个细菌基因组成,这些细菌基因编码三种蛋白质(tetR,cl和lacI),每种蛋白质均阻断其他一种蛋白质的表达。这些基因被链接到一个负反馈回路中,因此当一种阻断蛋白的浓度降低到一定水平以下时,受其影响的蛋白就会顺利表达出来,从而阻止了第三种蛋白的表达,并且进行不断重复,形成周期效应。 当将所有三个基因都插入质粒并转入细菌后,完成的负......阅读全文

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

Cell:微生物组的确影响免疫

麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划(HFGP)的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起

Nature聚焦微生物组的家

  人体内充满了微小的微生物,这些成百上千的细菌物种被统称为微生物组(microbiome),人们认为它们有助于人体的健康与生存。胃肠道,尤其是结肠是最高密度和最高多样性细菌物种的家园。然而由于食物和流体的通过,这一系统不断发生变化,这些生物体是如何能够存留于其中并旺盛生长的呢?   由加州理工大

国际人类微生物组联盟启动

经过近3年的酝酿和筹备,以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会,以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康,目前大量的研究都集中在分析人

Cell:微生物组的确影响免疫

  麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划(HFGP)的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。  人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等

Nature:揭秘地球微生物组计划

  地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的目标是尽可能多地对地球微生物群落进行取样,以便促进人们对微生物及其与包括植物、动物和人类在内的环境之间的关系的理解。这一任务需要来自世界各地的科学家的帮助。到目前为止,这一计划已覆盖了从北极到南极的七大洲和43个国家,而且有超

后微生物组时代 首次发现人体特有的病毒组

  我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为,但是关于身体许多区域的噬菌体,也就是感染细菌的病毒,科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现,在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多,这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。

肠道细胞利用microRNAs控制微生物组

    生物学前沿之一就是谈论操纵我们的肠道微生物组(microbiome)。这听起来像一个大胆的想法,但它看起来像是我们可能一直就在修改我们的微生物组,甚至都没有意识到这一点。一篇新的来自美国哈佛大学医学院的Howard Weiner、Shirong Liu及其研究团队的论文提示

人类微生物组影响健康机制揭秘

  英国《自然》杂志8月31日发表的一篇生物学论文称,美国科学家发现,肠道菌群会产生名为N-酰基酰胺的小型有机复合物,它们与受体相互作用,参与人体生理的包括免疫等各方面活动,而这正是人类微生物组影响生理健康的背后机制。   科学家已经意识到,人类基因组并不能完全解释人类疾病与健康的关键问题,因为

Nat Commun:微生物组的可靠“时钟”

  尽管人类微生物组在过去几年中受到了人们的广泛关注,但一直以来难以观察其在各种刺激下随时间变化的情况。最常见的分析方法是从粪便样本中提取细菌,然后对它们的基因组进行测序,但是这种方法会丢失肠道中细菌的位置和时间等关键信息。   如今,来自哈佛大学的研究人员创建的一种新工具提供了解决此问题的方法