新一代蛋白质测序方法诞生|NatureBiotechnology论文推荐
德克萨斯大学奥斯汀分校(The University of Texas at Austin)的一个研究小组展示了一种比现有技术更灵敏的蛋白质测序新方法,能够识别单个蛋白质分子,而不再一次需要数百万个分子。这一进展可能对生物医学研究产生重大影响,使得开发用于癌症和其他疾病诊断的新的生物标志物更加容易,并增强我们对健康细胞如何发挥功能的理解。该研究小组 10 月 22 日在《自然·生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了他们的概念验证性研究结果。分子生物学教授、新技术发明人之一 Edward Marcotte 说:“我们基本上创造了一种类似 DNA 测序的技术来研究蛋白质(序列)。”当六年多以前这个项目启动的时候,Marcotte 和他的同事们最初设想的方法是把二代基因测序技术应用于蛋白质测序。二代基因测序技术使得任何生物的全基因组测序变得快速、准确、经济实惠,不仅加速了生物研究,也让我们所有人都可以在家进......阅读全文
新一代蛋白质测序方法诞生-|-Nature-Biotechnology论文推荐
德克萨斯大学奥斯汀分校研究人员发明了一种新技术,希望将蛋白质测序变得像 DNA 测序一样灵敏、快捷。 德克萨斯大学奥斯汀分校(The University of Texas at Austin)的一个研究小组展示了一种比现有技术更灵敏的蛋白质测序新方法,能够识别单个蛋白质分子,而不再一次需要数
新一代蛋白质测序方法诞生-|-Nature-Biotechnology论文推荐
德克萨斯大学奥斯汀分校(The University of Texas at Austin)的一个研究小组展示了一种比现有技术更灵敏的蛋白质测序新方法,能够识别单个蛋白质分子,而不再一次需要数百万个分子。这一进展可能对生物医学研究产生重大影响,使得开发用于癌症和其他疾病诊断的新的生物标志物更加容易,
北大学者Nature-Biotechnology公布DNA测序重要突破
一种全新概念的测序方法 北京大学生物动态光学成像中心,北京未来基因诊断高精尖创新中心等处的研究人员发表了题为“Highly accurate fluorogenic DNA sequencing with information theory–based error correction”的文
中科院成果入选Nature-Biotechnology二十年精品论文
今年三月Nature Biotechnology就满二十了。该杂志在周年特刊中回顾和展望了生物技术领域的发展,推出了二十年来中引用最高的一些精品论文,其中包括中科院高彩霞和邱金龙研究组的小麦基因组编辑研究。 序列特异性的核酸酶是精确改写基因组的便捷工具。不过植物基因组特别复杂(尤其是小麦),一
推荐一些关于单细胞测序数据的处理方法的论文
以下推荐一些关于单细胞测序数据处理方法的论文:Satija R, Farrell J A, Gennert D, et al. Spatial reconstruction of single-cell gene expression data[J]. Nature biotechnology, 2
Nature-Biotechnology:CRISPR再获重要改良
Broad研究所的研究团队日前开发了一个独特的CRISPR-Cas9基因控制系统。该系统只需要催化活性的Cas9,就能在同一个细胞中敲除和激活不同基因。这一重要成果发表在十月五日的Nature Biotechnology杂志上,文章的通讯作者是Broad研究所Silvana Konermann,
Nature-Biotechnology:噬菌体治疗方法的微生态机制
近些年,集约化农业发展中的不合理措施,如化肥农药的持续过量投入以及经济作物的单一连作等,导致土壤微生物群落结构严重失衡,生态功能急剧削弱。土壤养分周转不畅、污染难以消解、土传病害频发就是土壤微生态失衡重要证据,这些也是农业资源与环境领域亟待解决的难题。 来自南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣
新一代测序十年记:第一台测序仪的诞生
从454生命科学推出第一台新一代测序仪以来,一晃十年过去了。这十年,正是基因组学高速发展的十年。我们看到了新仪器接踵而至,也看到了新技术不断问世,让人脑洞大开。从当初耗资30亿美元的人类基因组计划,到如今1000美元的人类基因组,测序技术经历了怎样的发展?我们在此作一回顾。 454生命科学(4
Nature-Biotechnology再次发出CRISPR研究警告
Sanger研究所的科学家发现,CRISPR-Cas9基因组编辑可以在细胞中引起比以前认为更大的遗传损伤。这些结果意味着CRISPR-Cas9基因疗法可能存在安全影响,因为意外损伤可能导致某些细胞发生危险的变化。 这一研究成果公布在7月16日的Nature Biotechnology杂志上,研
中国学者Nature-Biotechnology发表蛋白质组学分析新技术
来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章,公布了新一代开放式搜索算法Open-p
《Nature-Biotechnology》人工细胞的光合引擎
创建人工细胞有两种方法:1)重新设计活细胞的基因组“软件”;2)从头组装简单的、类似细胞的结构,制造“硬件”,模仿活体细胞功能。 第二种方法面临的最大挑战之一是模仿生命结构的复杂行为和其所需的复杂化学、生物反应。 现在,来自哈佛大学和(首尔)西江大学的国际研究小组为人工细胞设计了一个可利用光
Nature-Biotechnology发布CRISPR基因编辑新成果
第一次研究人员利用一种病毒载体传送基因组编辑元件来治疗罹患一种遗传疾病的动物模型,纠正了致病突变。宾夕法尼亚大学Perelman医学院研究人员领导的一项新研究表明,将这一载体传送到新生小鼠体内可改善它们的生存,但出人意料地是治疗成年小鼠则会让它们的情况变得更糟。该研究小组将他们的成果发布在本周的
4篇Nature子刊文章发布表观遗传学里程碑成果
由一家国际生物医学研究协会联合发表的四篇新论文,预示了表观遗传分析用于临床诊断和精准医学的可行性。表观遗传分析解决了遗传测试的一些重要局限,帮助确保了准确地诊断患者,及在适当的时间予以患者正确的药物治疗。 表观遗传改变发生于所有的癌症和各种其他疾病之中。测定这些改变可以前所未有地深入了解在个体
《Nature-Biotechnology》新发现一批人类特异性蛋白质编码基因
2001年,人类基因组计划(Human Genome Project)的研究人员绘制了人类的基因蓝图,他们惊讶地发现,只有大约2万个基因能产生蛋白质。难道人类的基因只有普通小苍蝇的两倍吗?科学家们预期,远不止这些。现在,来自世界各地20个机构的研究人员汇集了超过7200个未被识别的基因片段,这些片段
Nature-Biotechnology:发现抗生素新型替代物
近日,来自伯尔尼大学的科学家发现了一种新的物质能够在没有抗生素作用下治疗几种细菌感染。科学家表示这将会阻止抗生素耐药性的发展。本研究成果题为“Engineered liposomes sequester bacterial exotoxins and protect from severe i
科学家首次测量反物质氢原子光谱-|-Nature-论文推荐
欧洲核子研究组织(CERN)的 ALPHA 项目研究人员首次测量了反原子的跃迁。虽然测量结果与普通氢原子的行为没有不同,但也许有朝一日,更精确的实验会发现两者的细微差别,揭示一种新的“物质-反物质不对称性”(matter-antimatter asymmetry)。 该实验测量的是反氢原子(由
科学家首次测量反物质氢原子光谱-|-Nature-论文推荐
该实验测量的是反氢原子(由一个正电子和一个反质子组成)的1s-2s跃迁(从基态跃迁到激发态)。这一过程对是否破坏 CPT 对称性(电荷-宇称-时间反演对称性)敏感。如果物理系统的行为在电荷、宇称和时间反演的共同作用下保持不变,我们就说该系统具有 CPT 对称性。虽然 CPT 对称性具有坚实的理论支持
-Nature等三篇论文发布SMRT测序技术新应用成果
Pacific Biosciences公司近日风光无限,发布了新系统,带动股价大涨。同时,它的单分子实时(SMRT)测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上,展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
Nature-Methods-|-朝思暮想:单细胞蛋白质组测序之梦
近期,Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics,探讨了单细胞蛋白组学的发展,提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远(Credit: S. Larochell
Nature-Biotechnology:可取代ChIPseq的新技术
生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。 这样的基因表达受到转录因子的控制,但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的
Nature-Biotechnology发布革命性免疫学技术
在抵御疾病方面,机体免疫系统无疑是首屈一指的。T细胞是免疫系统的主要武装,帮助机体杀死被病毒感染的细胞和癌细胞。 由于不了解免疫系统与其他细胞的互作,迄今为止人们还不太清楚免疫系统的具体作用机制。西奈山伊坎医学院的研究团队为此开发了JEDI T细胞(Just EGFP Death-Induci
蛋白质测序的目的和方法
所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。
Nature-Biotechnology提出一种新研究思路:ZL挖掘
巴西科学家开发了一种新的方法学,利用大数据工具开发可行的研究路线,他们已经在血友病研究分析中得到验证。 这一研究成果公布在Nature Biotechnology杂志上。 这组研究人员利用数据挖掘和网络分析等大数据工具,可以帮助科学家和医药公司从世界各地的ZL数据库中收集信息,识别技术路线和
Nature-Biotechnology:哈佛华裔发布基因组编辑新技术
作为潜在的新一代治疗和研究工具,几乎没有什么生命科学技术比基因组编辑蛋白质更具发展前景——研究人员可通过编程这些分子来改变特定基因,以治疗或甚至治愈一些遗传性疾病。 可是,要将这些基因组编辑蛋白导入到细胞中,尤其是活体动物或人类患者体内,对于研究人员而言却仍是一个巨大的挑战。 通常,研究人
Nature-Biotechnology:见光起舞—当光学碰撞CRIPSR/Cas9
日本的科学家们已经开发出一种光活化的Cas9核酸酶来控制CRISPR诱导的基因编辑,一个“开关”即可激活。这个光激活的Cas9核酸酶可以为研究者在RNA诱导的核酸酶研究上提供更大的空间和时间的控制。这篇研究在线发表在最新的Nature Biotechnology中。 来自加州大学的干细胞生物学
Nature-Biotechnology:一种新型乙酰胆碱荧光探针
北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心、PKU-IDG/麦戈文脑科学研究所李毓龙研究组及其合作者,在《Nature Biotechnology》杂志在线发表了题为《A genetically encoded fluorescent acetylcholine indicator fo
Nature-Methods发表论文报道5醛基胞嘧啶测序新技术
2015年9月7日,北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Methods》杂志在线发表题为“Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale”的研究论文(DOI: 10.1
发表论文的捷径?线粒体测序论文太多
David Roy Smith是来自加拿大韦仕敦大学的一位生物学助理教授,近期他在The Scientist杂志上发文,指出目前涌现了太多线粒体基因组测序论文,2014年GenBank中新增的线粒体基因组序列信息多达上千条,这几乎比上一年激增了15%。 Smith指出,很少有人会质疑这些线粒体
蛋白质测序的测序要求
●1 样品必需纯(>97%以上); ●2 知道蛋白质的分子量; ●3 知道蛋白质由几个亚基组成; ●4 测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。 ●5 测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。
全新一代测序技术:没有光的测序
至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心 ――明斯特大学Dag Harmsen 在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过