功能基因cDNA5’末端的克隆

一.原理⑴ 5’-RACE法① 以目的mRNA 为模板,使用5’末端P 标记的RT 引物进行反转录反应,合成1ststrand cDNA。② 使用RNase H 分解 Hybrid DNA-RNA中的RNA链。③ 使用T4 RNA Ligase 使单链cDNA进行环化或形成首尾连接物。④ 进行PCR扩增。⑵ 引物设计二.材料与方法1 材料肝脏RNA2 仪器、用具PCR仪、0.2ml PCR管、移液器3 试剂(1)RNase Free H 2 O;10×RT PCR Bμffer (含dNTP Mixture);RNase Inhibitor(40U/μl);AMV Reverse Transcriptase XL (5U/μl);RNase H (60U/μl);5×Hybrid RNA Degradation Buffer;5×RNA (ssDNA)Ligation Buffer;T4 RNALigase; 40% ......阅读全文

PK120-cDNA-克隆实验

基本方案             实验方法原理 实验材料 cDNA

PK120-cDNA-克隆实验

实验方法原理 实验材料 cDNA试剂、试剂盒 Ready-To-Go DNA 标记试剂盒人肝脏 λgt11 cDNA 文库人肝脏 λgt10 cDNA 文库杂交溶液SSC 溶液pBluescript II SK 载体仪器、耗材 PCR 扩增仪实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」1. 杂交反应抽提

用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验

            试剂、试剂盒 dNTP 溶液 二硫苏糖醇 TE 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptⅡ逆转录酶

用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验

试剂、试剂盒 dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材 水浴或加热仪热循环仪实验步骤 试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的

用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验

试剂、试剂盒dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材水浴或加热仪热循环仪实验步骤试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的 5X

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

            试剂、试剂盒 扩增缓冲液 DNA 聚合酶 DNaseI 限制性内切核酸酶 ATP 链霉亲和素-磁珠结合缓冲液 T4DNA 连接酶

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

试剂、试剂盒 扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素-磁珠结合缓冲液T4DNA 连接酶热稳定 DNA 聚合酶琼脂糖凝胶BACDNA缺口平移缓冲液杂交液平末端 cDNACot1 基因组 DNA胞浆 poly(A)+RNAdNTP 溶液DNA 分子质量标志物寡

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

本方案使用克隆在 BAC 载体上的一段 500kb 的人基因组 DNA 连续序列,直接筛选与其互补的的 cDNA。但本方法也可适用于任意大小的基因组靶 DNA。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素

基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验

差减克隆是分离和鉴定两个细胞群中差异表达的 mRNA 的有效技术。相比较的细胞类型是[+](或 测 试)细胞和[-](或驱动)细胞,在测试细胞中表达而不在驱动细胞中表达的 mRNA 将被分离出来。必需的差减次数主要取决于 cDNA 的多样性。多样性是指每一个细胞类型中不同的cDNA 或 cDNA 片

基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验

实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA (ds cDNA)试剂、试剂盒 ALuIRsaIATPT4 多聚核苷酸激酶及其缓冲液DNA连接酶和及其缓冲液Taq DNA聚合酶及其缓冲液寡核苷酸引物4dNTP 混合物驱动 dNTP 混合物转化感受态菌株HEPES缓冲液链霉亲和素溶

基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验

            实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA (ds cDNA) 试剂、试剂盒

ORF克隆和cDNA克隆在操作技术上的区别(二)

二、 相关产品   看到这里,相信大家对cDNA克隆和ORF克隆有了一定的了解,那接下来就来聊聊相关的产品吧! 1.全长cDNA克隆产品  cDNA克隆(长度是指编码区) FL / MFL开头的cDNA克隆现在基本不销售,主卖表达克隆 0-100

ORF克隆和cDNA克隆在操作技术上的区别(一)

最近天气炎热,在实验室的童孩估计有点冒火,本来在这夏困秋乏的季节,每天都昏昏欲睡,还没个假期(这也没办法,疫情嘛),还要一天天围着实验转,做的出来还好,做不出来头大心塞啊。尤其是新进实验室的小白,对于实验的方方面面更是一头雾水,面对导师的“期待与厚望”,怀着一腔热血,踌躇满志,踏上了科研的不归路。话

RACE的原理、应用和优缺点(一)

一、RACE 的简介  目前,全长基因的获得是生物工程及分子生物学研究的一个重点。尽管已经有多种方法可以获得基因的全长序列,但在很多生物研究中,由于所研究的目的基因丰度较低,从而使得由低丰度mRNA通过转录获得全长cDNA很困难。近年来发展成熟的cDNA末端快速扩增(RACE)技术为从低丰度转录快速

PCR技术在cDNA的克隆方面应用介绍

  利用PCR技术,只需增加一步逆转录反应,便可从少数mRNA的构建cDNA文库,以mRNA为模板,以oligo(dT)为引物,在依赖于RNA 的DNA聚合酶催化下体外合成cDNA第一链之后,可通过PCR扩增此链。  如在此链的3'端再加上一段鸟苷酸残基同聚物,则可以使用oligo(dT)和

cDNA感染性克隆的概念和原理

cDNA克隆是以mRNA为原材料,经体外反转录合成互补的DNA(cDNA),再与载体DNA分子连接引入寄主细胞。每一cDNA反映一种mRNA的结构,cDNA克隆的分布也反映了mRNA的分布。特点是:①有些生物,如RNA病毒没有DNA,只能用cDNA克隆;②cDNA克隆易筛选,因为cDNA库中不包含非

cDNA文库组标准流程5

4EcoRIadaptor加接:1.往双链 cDNA沉淀中加入9ulEcoRI adaptor(400ng/ul),4℃至少放置30分钟以充分溶解cDNA沉淀;2.溶解完成后,顺序加入下列试剂:1.2ul 10×Ligase Buffer1ul 10mMrATP1ul T4DNA Ligase(4U

目的基因的获取3

4、基因组文库的大小一个文库要包含99%的基因组DNA时所需要的克隆数目。 N:克隆数目 P:设定的概率值(如:0.99) x:插入片段平均大小(15~20kb) y:植物基因组大小(以kb计) 如果插入片段平均大小为 20 kb 某植物基因组大小为 4

RACEPCR克隆基因的几点建议

摘 要:  RACE是一种快速克隆cDNA末端的方法,目前, 该方法被广泛应用于未知碱基序列基因的克隆,尤其是SMART RACE技术更为人们所青睐。本文总结了我们实验室用SMART RACE技术克隆基因的一些心得体会,希望对用RACE方法克隆基因的同行有些帮助。关键词: RACE; RNA提取; 

RACE(rapidamplification-of-cDNA-ends)技术1

RACE技术的简介cDNA完整序列的获得对基因结构、蛋白质表达、基因功能的研究至关重要。完整的cDNA 序列可以通过文库的筛选和末端克隆技术获得。末端克隆技术是20世纪80年代发展起来的。RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆

目的基因的获取4

4、cDNA文库的大小 一个cDNA文库要包含99%的mRNA时所需要的克隆数目。 p: 文库包含了完整mRNA的概率(99%) 1/n: 某一种低丰度(不足14份拷贝)mRNA占细胞整个mRNA的比例 N:所需的重组载体数(克隆数) (三)基因组文库与c

在质粒载体中进行平末端片段的克隆

在质粒载体中进行平末端片段的克隆1.分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1~10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。2.苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。3.分别用TE(pH 8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100 ng/ml

在质粒载体中进行平末端片段的克隆

1.分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1~10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。2.苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。3.分别用TE(pH 8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100 ng/ml。 假设1 bp相当于660 D

基因表达快速分析新技术

实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16~20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分

SMARTTM-5RACE-PCR的原理

SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30 MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,

SMARTTM-5RACE-PCR的原理

SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5 个(

SMARTTM-5RACE-PCR的原理

SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cD

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA