plosbiology:我们对基因表达数据存在普遍误解

数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题,随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高,这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日,特拉维夫大学的Shir Mandelbaum,Zohar Manber,Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS Biology》上发表文章,指出RNA-seq技术产生的数据经常出现技术偏差,进而导致错误的结论。 通过分析数十个可公开获得的,针对细胞对多种不同压力的反应的RNA-seq数据集合, Mandelbaum及其同事注意到,长度过短或过长的基因集合反复显示出表达水平的变化。(图片来源:Www.pixabay.com) 作者对此感到困惑,然后试图搞清楚这一现象背后究竟是真实的生物学反应,还是实验过程引入的人为误差。为了解决这个问题,他们比较了相同生物学条件下的重复批次的样本。重复样品之间基因表达的差异可以反映与生物学因素无关的技术性影响......阅读全文

plos-biology:我们对基因表达数据存在普遍误解

  数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题,随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高,这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。  11月12日,特拉维夫大学的Shir Mandelbaum,Zohar Manber,Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS

09候选院士最新PLoS-Biology文章

  摘要: 记者报道,09候选院士中科院上海生科院上海药物研究所蒋华良课题组和神经科学研究所徐天乐课题组在《PLoS Biology》上联合发表了关于离子通道门控机制研究的论文(PLoS Biology, 2009, 7: e1000151),Inherent Dynamics of the Aci

Plos-Biology:骨质疏松症治疗新靶标

  研究人员首次揭示了组蛋白甲基转移酶SETD2介导的组蛋白H3k36三甲基化修饰在骨髓间质干细胞(bone mesenchymal stem cells, BMSCs)命运决定中的作用,建立了骨骼系统衰老的小鼠模型,并揭示了骨质疏松症治疗新靶标。  国际学术期刊Plos Biology在线发表了中

Plos-Biology:骨质疏松症治疗新靶标

  近日,国际学术期刊 Plos Biology 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所邹卫国研究组的最新研究成果“H3K36 trimethylation mediated by SETD2 regulates the fate of bone marrow mesenchymal ste

PLOS-Biology:专访基因组学领域的8位大牛

  过去几十年已经彻底改变了遗传学和基因组学,那么,下一个十年呢?《PLOS Biology》请了不同领域的8位牛人科学家,谈谈他们的预测。无一例外,所有预测都指向更大规模和更多类型的数据。当然,这些大牛都很乐观,许了遗传学和基因组学一个光明的未来。  Wellcome Trust Sanger研究

PLOS-biology:科学家们发现最早的红藻化石

  研究者们最近发现了世界上最早的植物生命存在的证据:在印度中部地区的沉积岩中发现了两块距今16亿年的红藻化石。  如果如研究者们猜想的那样,这的确是红藻的化石,那么我们对地球上最早出现的植物生命的时间的认知可能就要再次翻新了。  “对于如此古老的材料,又没有DNA的残留,因此我们不能百分之百确定,

PLoS-Biology:轻微“饥饿感”有助于增强学习力

  众所周知,在动物和人体模型中,摄入较少的热量会给健康带来许多好处,包括延年益寿和提高学习能力。然而,关于这些结果之间的联系还不清楚。  8月1日发表在PLoS生物学上的一项研究揭示:吃得少能让蠕虫(Caenorhabditis elegans)的思维变敏捷,限制卡路里摄入可能还会促进大脑发展,是

PLoS-Biology:轻微“饥饿感”有助于增强学习力

  众所周知,在动物和人体模型中,摄入较少的热量会给健康带来许多好处,包括延年益寿和提高学习能力。然而,关于这些结果之间的联系还不清楚。  8月1日发表在PLoS生物学上的一项研究揭示:吃得少能让蠕虫(Caenorhabditis elegans)的思维变敏捷,限制卡路里摄入可能还会促进大脑发展,是

Plos-Biology:新研究重新定义小胶质细胞的功能

  在体内,疾病和伤害可以留下许多细胞碎片。在中枢神经系统(CNS)内部,包括大脑和脊髓的区域,某些细胞(称为小胶质细胞)的工作是清除细胞碎片。小胶质细胞具有巨噬细胞的功能,其在周围神经系统(PNS)中的CNS外具有类似功能,该区域包含大部分感觉和运动神经。  长期以来,科学家一直认为小胶质细胞局限

PLoS-Biology:锌在精子成熟过程中的关键作用

  研究利用模式动物秀丽线虫C. elegans鉴定了Zn2+转运蛋白ZIPT-7.1,阐述了ZIPT-7.1蛋白在生殖腺细胞发育过程中对胞内Zn2+水平的调控作用及其影响精子激活运动的分子机制;揭示了Zn2+及其转运蛋白在功能性精子获得调控中的作用机理。图片来源于网络   PLoS Biology

Plos-Biology:低效力疫苗可能会导致“超级”病毒的出现

  美国NIH的科学家以及英国和澳大利亚的联合课题组2015年7月27在《Plos Biology》发文称,效果很弱的疫苗能够增强高致病性病毒的传播。人类与不同的病毒抗争了很多年。从以前的巫医到草药,再到现代的疫苗和抗病毒药物,医药的进步挽救了太多人的生命。其中,尤其是疫苗,更是人类的守护神。人类在

PLOS-Biology:提高风湿性关节炎药物疗效

  根据6月13日在PLOS Biology上发表的一项新研究,给关节炎药物装配“可拆卸锁”上可以使其更安全,更有效。这些发现提出了一种改善全世界数百万患者服用药物疗效的新方法。  单克隆抗体英夫利昔单抗和阿达木单抗已成为自身免疫性疾病类风湿性关节炎的重磅药物,因为它们能够阻断肿瘤坏死因子α(TNF

PLoS-Biology:使用电子显微镜绘制神经回路

美国编码人员和神经学家正联手绘制出兔眼的超显微图像,此图像涉及每一个细胞,其大小可达20万亿字节。通过比较正常与损坏视网膜的图像,科学家从而揭示导致失明的原因,或许从中能找到治愈损伤眼睛的好办法。 这是一项伟大的创新工程,得借助专业软件、电子显微镜和特别锋利的刀才能完成。如果一切顺利,该科

想不到吧?PLOS-Biology:人体细胞内部温度可达50°C

  作为细胞的“发电厂”,线粒体将营养分子氧化所释放的自由能的一部分,转化为ATP和细胞所需的其他有用的能量形式。然而,这种能量转换过程远没有达到100%的效率,而且释放的能量很大一部分被耗散为热能。这就提出了迄今为止尚未探索的,关于这种热量产生对线粒体和其他细胞成分温度影响的问题。  由于人类细胞

PLoS-Biology发表生物物理所和纽约大学合作研究项目成果

  日前,《PLoS Biology》杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所脑与认知国家重点实验室罗欢副研究员、刘祖祥副研究员和纽约大学David Poeppel教授的合作研究成果:Auditory cortex tracks both auditory and visual sti

PLOS-Biology-:发现人体淋巴结构细胞竟抑制T细胞功能

  淋巴器官的微环境可以通过结构和分子支持帮助机体维持健康的免疫功能。尽管在小鼠身上的研究已经发现小鼠体内的成纤维细胞网状细胞(fibroblastic reticular cells,FRCs)在淋巴结中创造了一种必需的T细胞支持结构,但是关于人类FRCs的功能却鲜有研究。  近日来自伯明翰大学、

PLOS-Biology:掉发的看过来!未来这种药或可治疗脱发

  前段时间,90后脱发一度成为社会热议话题,并屡次登顶网络热搜,可见脱发问题已严重影响当下年轻人的生活。为解决这一“世纪”烦恼,来自曼彻斯特大学的科学家们经过多项研究后有了新的发现:一种治疗骨质疏松症药物的副作用能促进毛发的生长,这一发现或能为开发日后治疗脱发的药物提供新思路。http://hai

中科院微生物所百人计划项目发表PLoS-Biology文章

  生物应对环境变化和生存的能力与其独特的生物学特征密切相关。白色念珠菌(Candida albicans)是人体内常见的一种机会性致病真菌。由于抗生素的滥用、艾滋病的流行、癌症化疗和器官移植等新的医疗技术的应用,导致有免疫系统缺陷的人大量增加。因此也导致以白色念珠菌为主的真菌感染成为我国及全世

PLoS-Biology:长白头发,竟与先天免疫系统有直接关系

  如今随着生活压力的增大,白发已不再是年龄的象征,无论男女老少,都出现了不同程度的白发现象。近日,由英国国家卫生研究院和阿拉巴马大学伯明翰分校(UAB)的科学家们完成的一项关于小鼠的新研究,揭示了头发变白的机制。  研究结果以题为“A direct link between MITF, innat

Plos-Biology:转录因子Foxp1维持Treg-cell稳态和抑制性功能

  5月24日,国际学术期刊Plos Biology 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所王海坤课题组的研究论文“Foxp1 is critical for the maintenance of regulatory T-cell homeostasis and suppressive functi

什么是基因表达调控?基因表达调控有什么意义

意义:1.适应环境、维持生长和增殖:生物体赖以生存的外环境是在不断变化的,为了生存,所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应,调节代谢,以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化:多细胞生物调节基因的表达除为适

什么是基因表达?

基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质,所有已知的生命,都利用基因表达来合成生命的大分子。

电流激活基因表达

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505925.shtm

-环境影响基因表达

  日复一日、年复一年,我们的基因不断地和我们所生活的环境、邻居、家人,以及我们自己的心态“对话”。这些社会性互动的结果会进入我们细胞的控制室,改变基因的强弱表达,从而影响我们的习性、行为、生理、心理与健康。美国知名科学作家戴维·多布斯日前撰写了《基因的社会生活——改变你的分子组成》一文,介绍了科学

人脑基因表达图集

  小鼠的全基因组基因表达的高分辨率图已经问世几年时间了,但是,对于人脑而言,此前只发表过相对来说比较粗糙的分布图。这是由于与小鼠相比,人脑规模增大了1000倍,以及死后组织供应有限和质量较差等因素所导致的。现在,Michael Hawrylycz及其在“艾伦脑科学研究

基因表达的机制

转录转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的DN

基因表达的概念

基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质,所有已知的生命,都利用基因表达来合成生命的大分子。

基因表达的调控

转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调

基因表达的步骤

基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,RNA剪接,翻译和翻译后修饰,进行调控来实现对基因表达的调控。基因调控赋予细胞对结构和功能的控制,基因调控是细胞分化、形态发生以及任何生物的多功能性和适应性的基础。基因调控也可以作为进化改变的底物,因为控制基因表达的时间、位置和量可以对基因在细胞或多细胞生

什么是基因表达?

基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质,所有已知的生命,都利用基因表达来合成生命的大分子。