毕文健等开发针对大样本两基因组分析的算法——SPAGE
复杂疾病的发生与发展不能完全由遗传变异来解释,而是遗传变异和环境因素共同作用的结果。基于关联分析找出基因与环境的交互作用(GxE effect)有助于我们了解疾病的发病机制和设计个体化治疗方案。但是这种交互作用的关联性较弱,因此常常需要较大的数据样本才能达到足够的检验效能。最近几年,随着测序技术和电子健康记录(Electroic Health Record, EHR)的发展,很多大型的生物样本资源库(Biobank)为研究者提供了非常详尽的大样本信息。比如UK-Biobank就收集了50万个样本的全基因组DNA测序信息,疾病诊断信息,以及环境因素信息。这使得我们可以在全基因组(genome-wide)乃至于全表型组(phenome-wide)尺度下进行基因与环境的交互作用(GxE)关联分析。然而,样本量的大量增长对全基因组关联分析算法的运算速度提出了更严苛的要求。比如,当分析40万样本数据时,一次逻辑回归(logistic ......阅读全文
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
基金委管理科学2019年度项目评审专家组成名单公布
近日,自然科学基金委员会管理科学部根据国务院相关规定,发布2019年度重点项目、面上项目、青年基金项目、地区基金项目管理科学专业评审组专家组成名单。 重点项目 马费成 马铁驹 王 帆 王 灿 王海燕 王慧敏 毛基业 叶 强 田立新 毕 军 吕 炜 伏润民 刘 星 孙 宁 李柏洲 李敏强 李新
找“枪手”做毕设?校方回应:严查
两位大四女生在网络平台找“枪手”做毕业设计论文,“任务”完成后,反利用平台漏洞找“枪手”要钱(要求退款)。“枪手”一怒之下,将交易过程中的聊天记录、学生相关信息曝光。 这让人啼笑皆非的一幕,就发生在西安电子科技大学计算机科学与技术学院两名“准毕业生”身上。 上述事件曝光后,有热心网友将相关信
LiCl法转化毕赤酵母菌
实验概要本实验介绍了用LiCl法将重组质粒导入毕赤酵母菌X-33的转化方法。主要试剂甘油,YPD培养基,50% PEG,1 mol/L LiCl,Sac I主要设备摇床,高速离心机,1.5 ml微量离心管,水浴锅实验材料重组质粒pPIC6αA-APC,毕赤酵母菌X-33实验步骤1. 取毕赤酵母甘油种
巴斯德毕赤酵母-对人体有害吗
十年代巴斯德毕赤酵母曾被用于生产单细胞蛋白(SCP),有很好的发酵基础,菌体密度可达100g/L干重。其生长培养液的组分包括无机盐、微量元素、生物素、氮源和碳源,廉价而无毒。它能在以甲醇为唯一碳源的培养基中快速生长,其中醇氧化酶AOX——甲醇代谢途径的关键酶可达细胞可溶性蛋白的30%。而在葡萄糖、甘
毕氏酵母氯化锂转化法
试剂1M LiCl 50% PEG3350 (氯化锂转化法只能PEG3350,不能用PEG8000,PEG3350在北京莱博生物有售,80元/100克)2mg/ml salmon sperm DNA / TE(10mM Tris-Cl, pH8.0, 1.0mM EDTA)-20℃保存注:醋酸锂对毕
毕赤酵母高效转化实验方案
毕赤酵母高效转化实验方案1.收集菌体取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP管中,4℃、10000g 离心1min,弃上清,沉淀用无菌水(4℃)洗涤,同样条件下离心,弃上清。2.菌体处理加入1ml处理液,室温下放置20min。处理液:10mM LiAc10mM DTT0
毕赤酵母系统具有哪些优点
毕赤酵母系统的优点:(1)、拥有目前调控机理严格的启动子之一醇氧化酶基因AOX1启动子,非常利于外源基因的表达调控【1】;(2)、具有翻译后的蛋白加工修饰功能例如磷酸化、糖基化等,是一种聚集多种又是的真核表达系统;(3)、既可以在细胞内表达,也可在细胞外表达;(4)、外源基因可以单拷贝或多拷贝的形式
库氏毕赤酵母产生乙醇吗
库氏毕赤酵母产生乙醇。库德毕赤酵母是一种多耐性酵母菌,能够耐受高温,高盐,高浓度乙醇,高渗透压、强酸等多种胁迫条件,可以适应复杂的乙醇发酵生产环境。该酵母菌在高温条件下34到42度具有良好的乙醇生产能力,然而当发酵温度超过44度时,库德毕赤酵母产乙醇的能力受到极大抑制。能提高库德毕赤酵母的高温乙醇发
华南农业大学“毕英佐基金”获捐520万
9月29日,华南农业大学(以下简称华农)在学校温氏楼举行捐赠仪式,由动物科学学院教授毕英佐发起成立的“毕英佐基金”获捐520万元。目前,该基金总额累计已达1000余万元。此次,毕英佐、谢爱珍伉俪捐赠100万元;广州巨元生化有限公司朱基美、刘建新,天津市中升挑战生物科技有限公司王建,张祥斌、郑妙红伉俪
2019年教育部科技奖评审委员会会议专家(第二批)名单
2019年高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)评审委员会会议将于2019年9月17-22日召开,现将参加会议的专家(第二批)名单公布如下(按姓氏笔画排序)。(相关报道:2019年教育部科技奖评审委员会专家(第一批)名单公布) 王瑞林、文元桥、方维海、叶为民、田红旗、毕军、朱苗勇、华子春、刘云
马尔文再创全球纳米分析新标杆
马尔文新一代Zetasizer Nano再创全球纳米分析新标杆 全球材料表征仪器领域领导者英国马尔文仪器宣布, 经过全面技术革新与系统优化, 新一代Zetasizer系列纳米粒度和Zeta电位及分子量分析仪日前诞生. 新一代Zetasizer系
一文读懂PCBA的故障分析
一、概述现代电子装联工艺主要是以PCBA为对象展开的,因此,电子装联工艺可靠性的研究也主要以发生在PCBA上的故障现象为对象展开的。PCBA的故障现象可分为生产过程中发生的和在用户服役期间发生的两大类。(1)在制造过程中PCBA(内部的或表面的)发生的故障现象:如爆板、分层、表面多余物、离子
一文了解xps分析元素含量
X射线光电子能谱技术(XPS)是电子材料与元器件显微分析中的一种先进分析技术,以X射线为激发光源的光电子能谱,简称XPS或ESCA。XPS不但为化学研究提供分子结构和原子价态方面的信息,还能为电子材料研究提供各种化合物的元素组成和含量、 化学状态、分子结构、化学键方面的信息。
一文了解硫酸浓度分析计算
基本公式:c=1000ρω/98 式中的c为硫酸的物质的量浓度; ρ为硫酸的密度,单位g/ml; ω为硫酸的质量分数,%。 公式可以看出三个未知数知道了其中的两个,即可计算出第三个。
颅内尤文样肉瘤病例分析
1.病历摘要 男,21岁;因“头晕、头痛伴行走不稳2d”于2018年8月入院,既往无基础疾病。入院查体:生命体征正常,GCS评分15分,四肢肌力5级,共济运动失调(双侧指鼻试验、Romberg试验阳性)。 入院头颅CT示小脑蚓部占位性病变,第四脑室及四叠体池受压。头部MRI示:小脑蚓部见不均匀长T1
一文了解xps分析元素含量
X射线光电子能谱技术(XPS)是电子材料与元器件显微分析中的一种先进分析技术,以X射线为激发光源的光电子能谱,简称XPS或ESCA。XPS不但为化学研究提供分子结构和原子价态方面的信息,还能为电子材料研究提供各种化合物的元素组成和含量、 化学状态、分子结构、化学键方面的信息。 X射线光子的能量
一文了解STR分型分析
短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。20世纪90年代初,STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。 细胞STR分型(cel
基因组分析的代表方法
基因组分析的代表方法 - end -上期回顾“二次元”基因第一回(1)“二次元”基因第一回(2)“二次元”基因第一回(3)“二次元”基因第二回(1)
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示,来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先,和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示,尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示,大约在10万年前,现代人和尼安德特人之间
获捐520万元!华农毕英佐基金总额超千万元
“我于1963年进入华南农业大学(以下简称华农)以来,已经走过了60多年;感谢我们遇到个好时代,感谢华农为我提供的好平台,促我励志成才和科技致富!作为老师最大的幸福和欣慰,莫过于被学生念念不忘!”9月29日,由华农动物科学学院教授毕英佐发起成立的“毕英佐基金”获捐520万元。捐赠仪式上,已经80岁高
魏文胜:基因组编辑平台技术及未来产业运用发展趋势
“基因组编辑未来产业运用发展是如今的热点,利用这个技术,不管做动植物转化改造还是医药领域应用,可以做的事情非常多,但是具体怎么落地?我跟大家一样,有的时候会觉得无从下手,所以今天我会更多从技术层面给大家做一个简单的介绍。” △魏文胜 北京大学生命科学学院教授 以下是正文: 各位下午好!谢谢
一文速览丨卫健委发布85项新食品安全国家标准
根据《食品安全法》规定,国家卫生健康委、市场监管总局联合印发2023年第6号公告,发布85项新食品安全国家标准和3项修改单。主要包括:《茶叶》等3项食品产品标准、《婴幼儿配方食品良好生产规范》等5项生产经营规范标准、《食品接触用塑料材料及制品》等6项食品相关产品标准、《化学分析方法验证通则》等4
库德毕赤酵母有发酵功能吗
有。库德毕赤酵母具有发酵功能,原理是利用重组库德毕赤酵母进行发酵,能够耐受高温、高盐、高浓度乙醇、高渗透压。
毕赤酵母原生质细胞的制作
实验概要本实验介绍了毕赤酵母原生质细胞的制作方法,以备转化。实验原理毕赤酵母细胞壁阻止摄入DNA,有必要去除部分细胞壁以吸收DNA。藤黄节杆菌酶是一种葡聚糖酶,可在细胞壁水解葡聚糖的β-1,3接头,还可部分地消化细胞壁。该方法的关键在于不能过度消化细胞壁,否则会导致细胞死亡。藤黄节杆菌酶消化能力受细
马尔文纳米分析仪塑造完美牙齿
旧金山加利福尼亚大学(UCSF)牙科学院口腔预防及修复科学系的Vuk Uskokovic博士正在从事的研究旨在在实验室内模拟牙釉质的生长。这个NIH资助项目中的关键分析工具就是马尔文仪器公司的Zetasizer Nano 纳米粒度与电位分析系统。利用此仪器综合的动态光散射(DLS)和Zeta
原发性颅骨尤文氏肉瘤病例分析
患者女,6岁3月。因“头痛呕吐伴食欲减退2天”入院。患者2天前无明显诱因出现头痛,伴进食后呕吐,呕吐物为胃内容物。颅脑CT表现:左颞部颅骨内板下见梭形等高密度肿块,密度不均匀,边界清楚,截面大小约38mm×75mm,相应部位颞骨骨质增厚毛糙,并见垂直针状骨(图1,2)。 图1左颞部梭形等高密度肿块
浅谈马尔文在线粒度分析仪Insitec
什么是颗粒测量: 粒度测量实质上是通过把被测颗粒和同一种材料构成的圆球相比较而得出的;不同原理的仪器选不同的物理特性或物理行为作为比较的参考量,例如:沉降仪选用沉降速度、激光粒度仪选用散射光能分布、筛分法选用颗粒能否通过筛孔等等。马尔文在线粒度分析仪Insitec在线系统主要为过程中的颗粒表征提供智
一文读懂化学发光免疫分析!
什么是化学发光免疫分析? 发光,是指分子或原子中的电子吸收能量后,由基态(较低能级)跃迁到激发态(较高能级),然后再返回到基态,并释放光子的过程。根据形成激发态分子的能量来源不同可分为:光照发光、生物发光、化学发光等。 化学发光(chemiluminescence),是在化学反应过程中,发光剂(