一块古代“口香糖”一5700年前古人全部基因组检出
从一块被咀嚼过的古代“口香糖”——桦树沥青样本中,科学家得到了一名5700年前、名为“Lola”的古人类的全部基因组。通过对桦树沥青中含有的植物、动物和微生物DNA进行分析,还揭示了“Lola”的口腔微生物组和可能的饮食来源。这项遗传学研究发表在17日的英国《自然·通讯》杂志上。 桦树沥青由桦树皮加热后产生,自中更新世(约76万—12.6万年前)开始一直被用作胶黏剂。考古遗址中曾发现过小块的桦树沥青,上面通常含有牙印,显示出这些物质曾被咀嚼过,恰似一块“口香糖”。 此次,丹麦哥本哈根大学考古学家汉纳斯·舒欧德及其同事,对桦树沥青样本中的人类DNA进行测序,确定这名个体为一名女性,并为她取名为“Lola”。研究人员根据多个基因的遗传变异发现,“Lola”可能有着深色的头发、黝黑的肌肤、蓝色的眼睛。 研究团队认为,相较于斯堪的那维亚中部的狩猎采集者,她与欧洲大陆的西方狩猎采集者的亲缘关系更为接近。研究人员还对桦树沥青中发现......阅读全文
叶绿体基因组的概念
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。
前基因组的概念
中文名称前基因组英文名称pregenome定 义某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
基因组重排的原理
1998年Maxygen公司的Stemmer等人提出了一种新的分子育种方法——全基因组重排技术,这种技术是分子定向进化在全基因组水平上的延伸,它将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组-,因此可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。基因组重排技术主要在传统诱变的基础上与原生质体融合相结合进
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
Nature:水母基因组之谜
太平洋侧腕水母的基因组中缺少很多常见基因。 栉水母基因序列草图的发表揭示了一种与众不同的神经系统。 栉水母(comb jelly)——或栉水母门动物(ctenophore)——看起来就像微小的迪斯科球,它们利用特殊的纤毛推动自己在海洋中游动,并且用粘性触手来捕获更微小的猎物。圣奥古斯丁佛罗里达大
认识泛基因组测序
什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
基因组的进化特征
基因组不仅仅是生物体基因的总和,基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
科区与华大基因科技有限公司签订合作协议
5月6日,科尔沁区政府与深圳华大基因科技有限公司签订合作协议。华大基因将在医学、农业、制药、精准扶贫等方面为科尔沁区提供科技平台、技术平台、教育平台支撑。 华大基因是全球最大的基因组学研究中心,其数据中心、产业孵化中心、测序能力及基因组信息分析能力位居世界第一,在全世界基因测序上贡献率近50%
Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组
据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里,来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程,最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病(ANKL)起源于NK细胞异常增殖,病情进展迅速,多数患者在极短时间内发生多器官衰竭,部分患者会出现吞噬血细胞的现象,病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗,平均生存时间也仅有几个月。目前,临床上ANKL的治疗面临两大问题:患者对传统化疗方案不敏感,医学界没有统一的治疗标
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病(ANKL)起源于NK细胞异常增殖,病情进展迅速,多数患者在极短时间内发生多器官衰竭,部分患者会出现吞噬血细胞的现象,病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗,平均生存时间也仅有几个月。目前,临床上ANKL的治疗面临两大问题:患者对传统化疗方案不敏感,医学界没有统一的治疗标
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
基因组所发布表观基因组关联研究开放平台EWAS-Open-Platform
近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展,物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而,目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中,关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时,能够高效、高性能地分析多物种大样本数据,成为方法学方面的迫切要求。
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
10种易致癌食物名单食品-专家称仅腌菜致癌
据中国之声《央广新闻》报道,近日网上热传的"10种易致癌食物"名单,葵花子、口香糖、爆米花等大家常爱吃的食品纷纷上榜,不过对于这份名单,食品安全专家却表示,大部分都没有谣传的那么危险。 网传的易致癌食品中有葵花子、口香糖、味精、猪肝、油条、河粉、板条、米粉、粉丝类食品,腌菜、市售瓶装鲜果汁
全球最大古人类基因库创建,基因和疾病历史传播情况绘成
1月11日,大型国际专家团队分析了34000年前生活在西欧和亚洲的近5000名人类的骨骼和牙齿化石,创建出世界上最大的古人类基因库。通过对古人类DNA进行测序并将其与现代样本进行比较,团队绘制了基因和疾病随人口和时间推移的历史传播情况。《自然》杂志10日刊发的4篇开创性论文,揭示了这一令人震惊的
周忠和任中科院古脊椎动物与古人类研究所所长
据中科院人教局网站通知,中科院经研究,决定: 任古脊椎动物与古人类研究所所长(任期5年);董军社、邓涛任古脊椎动物与古人类研究所副所长(任期5年);免去高星的古脊椎动物与古人类研究所副所长职务(保留副局级待遇)。
你会的剔牙,这群古人类812万年前就会了
古人类什么时候开始进食植物类食物?何时出现延续至今的剔牙行为?又是怎么剔牙的?这些现代人演化过程中有意思的话题,不仅公众有浓厚兴趣,也是科学家们长期关注和持续研究的课题之一。 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(中科院古脊椎所)青年研究员吴妍带领的研究团队,通过对湖南道县福岩洞遗址出土的、迄今
最新研究:7500和6300年前两次环境巨变影响河姆渡古人类
全新世(距今1万年)以来,全球快速回暖,海平面上升,中国东部滨海地区地貌随之发生改变,这对新石器时期以宁(波)绍(兴)平原上河姆渡文化为代表的古人类生产生活等有何影响? 中国学者最新发表于国际专业学术期刊《古地理、古气候、古生态》上的研究论文表明,古地磁场长期变化和古强度变化的区域对比,可以为
30万年前华龙洞人是东亚向智人演化的最早古人类
中新网安徽东至12月8日电(记者孙自法韩苏原)2024华龙洞遗址学术研讨会12月6日至8日在遗址所在地安徽省池州市东至县举行,来自中外古人类学研究及相关领域的近百名专家学者相聚一堂,他们通过对华龙洞遗址实地考察和深入研讨提出,约30万年前的华龙洞人是东亚地区向智人(现代人)演化的最早古人类。12月6
上海交大内蒙古人民医院临床医学转化创新中心揭牌
内蒙古科技厅与上海交通大学组建上海交通大学-内蒙古自治区人民医院临床医学转化创新中心,深入贯彻落实“科技兴蒙”行动。10月8日,上海交通大学-内蒙古自治区人民医院临床医学转化创新中心在呼和浩特揭牌成立。 该中心将充分发挥上海交通大学在医学工程方面科技创新优势,通过设立医工交叉基金、开展1+1(
研究揭示黑足猫进化中最显著遗传变化密码
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518020.shtm大型猫科动物,如虎和狮子的保护工作受到高度关注,并且已经具有国际合作水平的保护政策和行动的支持。而黑足猫(Felis nigripes)作为全世界最小的猫科动物,正面临种群数量急剧减少
全基因组测序揭示蒙古族遗传结构
内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。 历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响其他
“大灰狼”如何变家犬?“狗狗祖先”DNA来揭秘
作为家犬的唯一野生祖先,灰狼的相关研究对理解家犬起源具有重要的作用。为探究东亚灰狼遗传演化历史及其与家犬的联系,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所联合西北大学等单位开展了中国古代灰狼群体母系遗传研究。5月29日,相关研究成果发表于《整合动物学》。 在这项研究中,研究人员成功获取了来自中国北方的
三氯蔗糖使用限量
GB2760—1997(g/kg):餐桌甜味剂,0.05g/包、片;果汁(味)型饮料、酱菜类、复合调味料、配制酒、雪糕、冰淇淋、冰棍、糕点、饼干、面包、不加糖的甜罐头水果、饮料,0.25;改性口香糖、蜜饯,1.5。美国于1998年4.1.批准用于焙烤制品及预混合料、饮料及其基Chemicalbo
超大规模遗传:尼安德特人与现代人有多次“基因交流”
英国《自然·生态与演化》杂志26日发表了一项最新成果:科学家利用大型现代人基因组数据,对当今东亚人和欧洲人携带的尼安德特人DNA片段进行了研究。这项,尼安德特人与解剖学意义上的现代人的祖先,曾在多个时间点发生过“基因交流”。 解剖学上的现代人从非洲向外扩散时,曾在欧亚大陆西部遇到尼安德特人。
“女娲”基因组计划发布第五项成果
近日,“女娲”基因组团队重点阐释了适应性选择下非编码调控元件对表型演化的影响,相关研究发表于《分子生物学与进化》。这项工作是中国科学院生物物理研究所徐涛院士、何顺民研究员牵头的“女娲”(NyuWa)中国人群基因组计划的一部分。“女娲”中国人群基因组计划旨在构建中国人群的全基因组数据资源,并全面解析中
邓涛:当古生物遇到新科技
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495015.shtm 古生物学是一门古老的学科,已经有两百多年的历史。历史上如始祖鸟、北京猿人等关键化石的发现都填补了生命演化历史的空白。如今,新的观测分析手段,诸如高精度成像与解析技术、分子古生物学