研究者构建了哺乳动物进化树中的更多分支
近日，在一项发表在PLOS Biology杂志上的新研究中，美国耶鲁大学的研究人员公布了一项对物种数据收集和分析方法的全面改革，以构建哺乳动物的生命进化树。该研究的目的是为科学家、动物保护管理者、政策制定者和环保主义者提供关于物种多样性过去与现在关系的更准确更全面的信息。 该研究第一作者、耶鲁大学生态学与进化生物学博士后研究员Nathan Upham说：“我们使用的化石和基因组数据往往是残缺和混乱的，但现在，我们正在重建数百万年前在早已灭绝的哺乳动物身上发生的事件。” 在现存的大约6000种哺乳动物中，大多数是啮齿类动物(42%)或蝙蝠(24%)，而常见的哺乳动物，如牛、猪、羊、猫、浣熊和猴子则相对较少。然而，到目前为止，试图为哺乳动物建立生命之树的尝试尚不能解释物种多样性的这种不均衡性。 为此，Upham与耶鲁大学生态学和进化生物学教授Walter Jetz采用了一种新方法。他们通过创建更小、更精确的进化树“补丁”来......阅读全文
研究者构建了哺乳动物进化树中的更多分支
近日，在一项发表在PLOS Biology杂志上的新研究中，美国耶鲁大学的研究人员公布了一项对物种数据收集和分析方法的全面改革，以构建哺乳动物的生命进化树。该研究的目的是为科学家、动物保护管理者、政策制定者和环保主义者提供关于物种多样性过去与现在关系的更准确更全面的信息。 该研究第一作者、耶鲁
巨型病毒点燃进化树之争
进化生物学家从来都不知道是什么制造了病毒，对它们的起源争论了十几年。但一组叫作Klosneuviruses的巨型病毒的新发现可能是“缺失的环节”，有助于解决争论——或者引发更多的争论。 2003年，研究人员报道发现了巨型病毒，并将其命名为Mimiviruses。其携带的基因表明，它们的原型可以
Science：鸟类进化树被改写
目前的鸟类进化树正在被美国最大的鸟类遗传学研究所改写。这项研究挑战了目前的分类，改变了我们对鸟类进化的认识，并提供了进行鸟类系统发育和比较研究的珍贵资源。 鸟类是目前研究得最多的动物之一，我们关于生物学的很多知识，从自然史到生态学、物种形成、繁殖等等，都来源于鸟类。尽管如此，鸟类的进化树还是备受争
NEJM：利用基因测序谱写“肿瘤进化树”
近几年来，肿瘤产生耐药突变以逃逸靶向治疗的假说已被业内科学家所默认。最近一段时间，几项重要的研究对这一假说进行了充分的证实，肿瘤学家Charles Swanton领导的肺癌癌症进化阻断计划（TRACERx）让耐药逃逸的假说逐渐为更多人所认可。 为了使TRACERx计划能够充分证实部分肿瘤细胞耐
PNAS：科学家构建肿瘤“进化树”
一个肿瘤内的个体细胞并不全是相同的。这可能听起来像是一个现代医学真理，但很久以前并不是这样，当时医生认为，从患者肿瘤采集的单一活检标本，能准确地反映整个肿瘤的生理和遗传构成。 研究人员开始意识到，癌症这种疾病是由相同的“适者生存”力量所驱动的，达尔文提出，适者生存推动了地球上生命的进化。然而，
《科学》：大规模遗传研究重塑鸟类进化树
朝确定鸟类谱系中主要分枝间进化关系的目标迈出了巨大一步 美国科学家近日进行了一项迄今为止规模最大的鸟类遗传学研究，重塑了鸟类进化树。这一研究的范围颇为广阔，许多鸟类的学名将会因之而改变，而生物学教科书和观鸟爱好者指南也不得不进行修订。相关论文发表在6月27日的《科学》（Science）杂志上。
18亿遗传密码重建开花植物进化树
为什么一项关于花花草草的研究，会被评价为“令人难以置信的成就”？英国皇家植物园领导的由279名科学家组成的国际团队，4月24日在《自然》杂志上发表了一篇新论文，公布了科学界对开花植物种系进化树的最新认识。这项研究利用了来自9500多个物种的18亿个遗传密码，覆盖了近8000个已知的开花植物属（约60
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
BMC－System－Biology发布超大规模进化树构建软件
中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台，利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整合，相
文化教育能影响遗传的致命暴力水平
数千年来，人类杀害同类的残忍一直是关注和争论的话题，其起源更是学界探究的对象。英国《自然》杂志上周发表的一项人类学新研究认为，致命的人际暴力其实是人类在演化过程中继承下来的。 在生物学中，进化树用来表示物种之间的进化关系，生物分类学家和进化论者根据各类生物间亲缘关系的远近，把各类生物安置在有分
昆明动物所等发布超大规模进化树构建软件
近日，中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台，利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整
树懒基因组中发现“化石”病毒
二趾树懒(Choloepus hoffmanni，如上图)的基因组中隐藏着一个“化石”病毒。 据美国《科学》杂志在线新闻报道，就像恐龙在焦油中留下的脚印一样，逆转录酶病毒会将其DNA中的一些片段插入到一种动物的基因组中。研究人员在树懒的基因组中发现了泡沫病毒的古老片段。研究人
哺乳动物－DNA－的快速分离
根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb，适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化，或者是 5~15 μg/300μl 全血。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 k
哺乳动物可通过肠道吸氧
近日，美国辛辛那提儿童医院研究人员证明，通过直肠提供氧气或含氧液体，能够帮助小鼠等实验动物在低氧条件下存活。研究人员认为，该方法可能提供一个挽救呼吸衰竭的危重患者的新范式。相关研究结果发表于5月14日《医学》。 未参与该研究的美国科罗拉多大学胃肠病学家Sean Colgan表示：“这看起来
哺乳动物组织的匀浆实验
实验方法原理 对于细胞内蛋白的纯化和特性分析，重要的是选择一种有效的方法来破碎细胞或组织，使蛋白迅速地从胞内相对隔离的空间中释放到缓冲液中，而该缓冲液应对所研究的蛋白的生物活性没有影响。广泛使用的破碎软组织的方法之一是匀浆。蛋白酶从其他的细胞区隔中释放出来的风险很小。可以通过在匀浆缓冲液中加人蛋白酶
哺乳动物－DNA－的快速分离
实验方法原理 根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb，适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化，或者是 5~15 μg/300μl 全血。实验材料 无 DNase 的 RNase蛋白酶 K哺乳动物组织或全血试剂、试剂盒 细胞裂解缓冲液乙
航运激增威胁北极哺乳动物
研究人员希望，他们的发现将促成破坏性更小的航线。图片来源：PNAS 对于鲸和北极熊来说，融化的海冰绝不仅仅意味着简单的栖息地丧失。一项最新研究表明，开放水域季节变长导致的北极航运量剧增，可能使在北极栖息的众多海洋哺乳动物处于危险境地。 随着夏季海冰覆盖量减少，诸如西北航道等航线在较温
哺乳动物－DNA－的快速分离
实验方法原理 根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb，适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化，或者是 5~15 μg/300μl 全血。
哺乳动物组织的匀浆实验
基本方案 附加方案：从组织匀浆液中去除黏蛋白 实验方法原理 对于细胞内蛋白的纯化和特性分析，重要的是选择一种有效的方法来破碎细胞或组织，使蛋白迅速地
Cell子刊：基因治疗将如虎添翼
免疫系统是保护机体的重要机制，但有时这一机制也会带来一些麻烦，比如排斥输血、器官移植等治疗手段。正因如此，使用病毒载体的基因治疗也需要绕过宿主的免疫应答。 腺相关病毒（AAV）是一种比较安全的病毒载体，已经用于多种基因疗法并且进入了临床试验，涉及失明、血友病、心脏病、肌营养不良等疾病。问题在于
最详细哺乳动物进化时间表发布
科技日报北京12月27日电 （实习记者张佳欣）据发表在最新一期《自然》杂志上的一项新研究，英国科学家提供了迄今为止哺乳动物进化的最详细时间表，证实现代胎盘哺乳动物群体起源于“恐龙大灭绝”之后。这项研究描述了一种新的、快速的计算方法，可以获得精确的进化树，也就是所谓的“时间线”。作者使用这种新方法分析
哺乳动物“计算时间”机制被发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521258.shtm
气候突变或影响哺乳动物数量
古埃及文物帮助科学家了解随着时间的推移哺乳动物的数量是如何发生变化的。 古埃及法老陵墓上的铭文和雕刻通常会有羚羊图案。一项新研究显示，在古埃及，当发生显著的气候变化时，诸如大羚羊此类的哺乳动物的数量也会发生波动。 这项发现基于十多年前动物学家Dale Osborn开展的针对古埃及哺乳
化石揭示早期哺乳动物皮毛外观
许多恐龙和翼龙都有艳丽的羽毛，但早期哺乳动物的皮毛颜色却很单调。对6具生活在侏罗纪和白垩纪时期的哺乳动物毛皮化石的研究表明，它们都长着灰褐色的毛发。 “它们是恐龙的食物，不想引人注目。”比利时根特大学的Matthew Shawkey表示，这种保护色有助于躲避恐龙的捕食。 过去，人们认为复原远
哺乳动物“计算时间”机制被发现
候鸟迁徙，蝴蝶振翅，心脏律动，生命的节律演绎着自然界最美妙的生命交响乐。然而，生物体如何能感知一天的时刻变化？相关问题一直悬而未决，等待着科学家们的实验与回答。北京大学国家生物医学成像科学中心主任程和平团队通过对哺乳动物的生物钟主钟——视交叉上核（SCN）的时间计算机制研究发现，哺乳动物大脑深部
哺乳动物精核的制备实验
实验材料哺乳动物组织培养细胞（如 HeLa 细胞）试剂、试剂盒PBS裂解缓冲液缓冲液 B仪器、耗材带有 B 型研磨棒的杜恩斯匀浆器光学显微镜实验步骤1. 培养并收获 3L 1×106 细胞/ml 的哺乳动物组织培养的细胞（如 HeLa）， 用 1L PBS清洗两次。2. 用 20 倍于沉淀体积（40
早期哺乳动物牙、耳如何演化？
中新网北京4月4日电 (记者 孙自法)在从爬行动物到哺乳动物的进化过程中，有两个最为重要的形态和功能变化，表现在牙齿从简单到复杂以增加食物的摄取能力、下颌头骨关节变为中耳听骨组合以提高听觉效力，二者如何演化备受学界关注。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(古脊椎所)发布消息说，该所毛方园研究员、张驰
哺乳动物细胞的生物特征
哺乳动物是全身被毛,运动快速,恒温,胎生和哺乳的脊椎动物.它是脊椎动物中躯体结构,功能和行为最复杂的一个高等动物类群.鸟类和哺乳类都是从爬行动物起源的,它们分别以不同的方式适应陆栖生活所遇到的许多基本矛盾(陆地上快速运动,防止体内水分蒸发,完善的神经系统和繁殖方式),并在新陈代谢水平全面提高的基
Nature子刊：首个哺乳动物“手机”
来自苏黎世联邦理工学院的研究人员确实地构建出了一种“手机”：他们以这种方式对哺乳动物细胞进行了重编程，使得细胞能够通过化学信号给彼此“打电话”。 打电话是一个相互交流信息的过程：A给B打电话，两者就B应该做的事情达成一致意见。一旦这样做了，B方就会给A方去电话让他或她知道。A不再回复B电话
揭秘：哺乳动物大脑的空间编码
大脑经常被比作一台电脑，它的硬件由组装在复杂回路中的神经元组成；它的软件是管理神经元行为的大量编码。但有时，即使大脑的硬件似乎不足以完成任务，它也会表现得异常出色。例如，尽管大脑的空间感知回路似乎适合代表更小的区域，但是人类和其他哺乳动物如何设法在大规模环境中导航的，这一直是个谜。 在一项新的