刘默芳组:LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能
在较高等的真核生物中,大部分基因都含有内含子,在转录完成后需经过剪接(splicing)从mRNA前体移除内含子,以产生成熟、有翻译活性的mRNA,这个过程由剪接体(spliceosome)催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA(small nuclear RNA),即U1、U2、U4、U5和U6及与它们相互作用的蛋白因子【1】。其中,U6 snRNA处于核心地位,其保守性最强,且位于剪接体催化中心、为剪接体催化活性必需【2】。同时还发现,U6在后生动物中被高度修饰,包括末端的5 γ-单甲基化加帽和3 寡聚尿嘧啶化修饰,中间的2-O-甲基化、假尿嘧啶、m2G和m6A修饰等【3,4】。经过近40年的研究,研究者虽然已较为全面地揭示了U6生物生成的过程及其在剪接中的功能机制,但目前对U6修饰的调控机制及其在mRNA剪接中的功能还不甚了解。 之前的研究发现,在哺乳动物成年个体中,睾丸是转录活性最高、可变剪接最为丰富的组织【5】......阅读全文
复旦大学,中科院Cancer-Res发现癌症转移的新机制
生物通报道:来自中科院生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学中山医院等处的研究人员发表了题为“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章,发现KRAS通过激活NF-κB炎症信号通路激活
小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是
图文看懂|导精子发育过程中蛋白质翻译激活重要机制
《科学》(Science)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)刘默芳研究组与国内外多家实验室合作完成的以LLPS of FXR1 drives spermiogenesis by activating translation of stored mRNAs为题的
阿尔茨海默症与蛋白修饰
阿尔茨海默症(Alzheimer's disease,简称AD)俗称老年痴呆症,是一种中枢神经系统退行性疾病,引发患者的认知障碍和记忆能力损害,导致患者日益恶化的生活能力减退和死亡。已故的美国前总统里根,英国的前首相撒切尔夫人等名人均受此病困扰和折磨。 AD的主要病理特征为脑内分布有大量的β-
细胞凋亡的mRNA检测
研究者们发现了很多在细胞凋亡时表达异常的基因,检测这些特异基因的表达水平也成为检测细胞凋亡的一种常用方法。据报道,Fas 蛋白结合受体后能诱导癌细胞中的细胞毒性T细胞(cytotoxic T cells)等靶细胞。Bcl-2 和bcl-X (长) 作为抗凋亡(bcl-2 和bcl-X)的调节物,它们
细胞凋亡的mRNA检测
研究者们发现了很多在细胞凋亡时表达异常的基因,检测这些特异基因的表达水平也成为检测细胞凋亡的一种常用方法。据报道,Fas 蛋白结合受体后能诱导癌细胞中的细胞毒性T细胞(cytotoxic T cells)等靶细胞。Bcl-2 和bcl-X (长) 作为抗凋亡(bcl-2 和bcl-X)的调节物,它们
细胞化学词汇mRNA帽
中文名称:mRNA帽英文名称:mRNA cap定 义:信使核糖核酸(mRNA)的5′端帽子结构。真核生物信使核糖核酸(mRNA)的帽结构为7-甲基鸟苷-5′-三磷酸,通过5′-5′方式与mRNA的5′端相连。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
核小RNA的基本信息
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
细胞内核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
关于核小RNA的基本信息介绍
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
四川大学《Cell-Reports》解析原始侏儒症病因
近日,知名期刊《Cell Reports》刊登了四川大学生命科学学院的最新研究论文“Primordial Dwarfism Gene Maintains Lin28 Expression to Safeguard Embryonic Stem Cells from Premature D
RANi术语表
RNAi RNA干扰是最近发现的一种功能工具。当RNA导入一个细胞时,最终会引起细胞内互补mRNA的降解,从而导致基因功能活性的阻断。PTGS 转录后基因沉默(post transcriptional gene silencing);一种首先在植物中确定,然后发现在动物中也存在的现象。尽管PTGS最
开年新篇!施一公团队Science再发剪接体新成果
2016年1月8日,清华大学生命学院施一公教授研究组在《科学》(Science)就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《U4/U6.U5 三小核核糖核蛋白复合物3.8埃的结构:对剪接体组装及催化的理解》(The 3.8 A Structure of the U
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作,基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究,首次获得了对核酸去甲基化酶,例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
RNA表观修饰在造血干细胞发育中的关键作用
血液是生命的源泉。不断流动的血细胞既可以运输营养物质,又是重要的免疫保护屏障。其中,所有的血细胞都来源于造血干细胞。这群干细胞不仅可以维持血液系统的长期稳定,也是骨髓移植治疗恶性血液疾病的核心组分。目前,造血干细胞来源仍是制约临床恶性血液疾病治疗的瓶颈。因此,造血干细胞的体内发育和体外诱导扩增已
产生RNA干扰RANi-的方法
4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,
刘阳/史林启/康春生开辟新方法,定向靶向肿瘤细胞
癌症的特征是多种遗传改变或突变所引起的异常代谢和增殖。肿瘤细胞在药物代谢过程的基因突变或药物靶点的修复可引起细胞对传统疗法的耐受。最近,一种新型的簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关酶(Cas), Cas13a(以前称为C2c2)被鉴定为RNA导向的靶向RNA的CRISP
肿瘤免疫治疗有望:促使T细胞功能失调的新机制被发现
肿瘤免疫治疗为癌症患者带来新的治疗手段和希望,在多种肿瘤类型中得到了成功应用。一部分病人可以响应免疫治疗并取得理想的治疗效果,但大部分病人对免疫治疗无法产生响应。其中一个重要原因是其肿瘤微环境中T细胞的功能已经处于不可逆的失调状态。研究表明,肿瘤相关巨噬细胞是诱导T细胞功能失调的主力军之一。作为
研究发现长非编码RNA调控学习记忆新机制
4月30日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志以研究论文形式发表了中国科学技术大学刘强研究组题为Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and
刘云:免费师范生须引入淘汰机制
读了《中国科学报》1月9日大学周刊5版《免费师范生政策“七年之痒”》一文,本人深有感触,免费师范生政策的确存在一些缺陷与不足,须要调整与改进。 为了吸引优秀师范生到中西部农村学校任,教育部从2006年开始招收免费师范生。不少局外人总是热衷替免费师范生算省钱经济账,其实免费师范生最大的好处不
细胞化学词汇DNA修饰
中文名称:DNA修饰英文名称:DNA modification定 义:DNA合成后,通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
张冰团队发现调控心肌线粒体合成和心力衰竭新机制
Circulation | 心力衰竭(Heart Failure)简称心衰是一类复杂的临床综合征,为大多数心血管疾病的终末阶段。具体是指心脏无法行使正常的泵血功能以维持血液灌流来满足人体需要。临床主要表现为呼吸困难,过度疲劳和运动耐量受限【1】。在全球约有2%的成年人患有心力衰竭,且随着年龄
抗病毒蛋白结构与功能研究获进展
7月24日,Cell Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘迎芳课题组等的研究成果,题为Crystal structure of ISG54 reveals a novel RNA binding structure and potential functional mec
抗病毒蛋白结构与功能研究方面取得新进展
7月24日,Cell Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘迎芳课题组等的研究成果,题为Crystal structure of ISG54 reveals a novel RNA binding structure and potential functional
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图试剂、试剂盒 溶液和缓冲液仪器、耗材 水浴槽PCR热循环仪微量离心机塑料制品和滤器实验步骤 一、RNA 的分离收集对照组和实验组细胞,放入含 45ul2 mmol/L DTT 的 1.5 ml 微量离心管中。95℃ 水浴热解 2 min。每管加入以下物质:37℃ 温育 30
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图 试剂、试剂盒 溶液和缓冲液 仪器、耗材
单细胞mRNA差异显示实验
目前有几种方法可以显示生理刺激下组织样本中未知基因的表达水平变化。然而, 很多组织内的细胞又存在形态和功能上的异质性,因此常常需要从单个细胞水平研究基因表达的差异。现在,我们介绍一种新方法,它常规用来在单细胞水平考察未知基因的差异性表达。现代神经科学研究技术作者:U.Windhorst & H. J