一文了解蛋白质组学分析技术

蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。 蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。 可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖......阅读全文

植物蛋白质组学和糖基化实验1

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白的总糖

重磅!布鲁克宣布收购IP2蛋白质组学软件

  2020年9月30日,布鲁克对外宣布最近收购了IP2(Integrated Proteomics Pipeline)搜索引擎和蛋白质组学工作流程软件平台。IP2搜索引擎由美国Scripps研究所John Yates III教授与Robin Park、Tao Xu博士共同创立Integrated

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(一)

大家好,我是黄博,吉凯一小兵,蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男(我一直是这么定位自己的)是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事,真的是有血、有泪、有shi!情节需要,中间可能会穿插一些技术方面的内容,请各位自动忽略。那是一个月黑风高的晚上,本人和大尾巴狼(我实在不想

蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点

为探究生物进程的分子机制,需要确定介导这个过程的蛋白质-蛋白质间的相互作用。研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。其原理是当靶蛋白和诱饵蛋白特异结合后,诱饵蛋白结合于报道基因的启动子,启动报道 基因在酵母细胞内的表

水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展

  蛋白质的翻译后修饰,如磷酸化、乙酰化等,是调节蛋白质生物学功能的关键步骤,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广,其研究极具挑战性。近期,中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方

《自然》子刊专题:蛋白质组学中的质谱

涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条,一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化,另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术(Mass spectrometry,MS)是蛋白质组学常用

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程介绍

  大家好,我是黄博,吉凯一小兵,蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男(我一直是这么定位自己的)是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事,真的是有血、有泪、有shi!情节需要,中间可能会穿插一些技术方面的内容,请各位自动忽略。   那是一个月黑风高的晚上,本人和大尾巴狼

花粉管钙通道抑制后蛋白质组学研究

实验概要本实验运用蛋白质组学技术手段对钙通道受抑制后花粉管中蛋白质表达模式进行研究,以期鉴定出与Ca2 调节花粉管生长相关的蛋白质,拓展对Ca2 在花粉管生长调节机制的认识。主要设备IPGphor II等电聚焦系统(Amersham Biosciences,Sweden)ZipTipC18 (Mil

蛋白质组学研究选材四大原则

中国饮食文化博大精深,《舌尖上的中国》向世界展示了我们这个完美的吃货民族。一道成功佳肴,食材挑选有着非常严格的标准。在医学基础研究领域,实验与做菜亦有共通之处,做饭时如果偷懒,用煮过面条的汤煮馄饨,馄饨的卖相口感观感都大为降低。实验也如此,一是一,二是二,必要精确审慎,更不可以偷懒,变通条件。偷工减

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(二)

“那iTRAQ的原理是什么,有哪些优势?”“iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)技术由美国AB SCIEX公司研发,最早于2004年美国质谱年会上被提出,是一种基于体外等重同位素标记的相对定量技术。该技术利用同

植物蛋白质组学和糖基化实验(二)

刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法(根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离,并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 缓冲液中,室温下温育 2

植物蛋白质组学和糖基化实验(五)

1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鉴定本方法是我们实验室以油菜籽为实验材料建立的,本方法也适用于其他植物材料。( 1 ) 将 6 g 植物材料放入 4°C 预冷的研钵中,加入 50 ml 预冷的 TBS 缓冲液,研磨萃取蛋白质(见注释 13),接着 10000 g 离心萃取物 30 min,去

植物蛋白质组学和糖基化实验(四)

3.3 我的糖基化蛋白在哪实验人员可通过这个方法获得关于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的结构信息。这类实验可在纯化的糖蛋白或者从 1D 或 2D 电泳胶上分离出来的蛋白上进行,首先,用蛋白内切酶消化蛋白质,通过高效液相色谱(HPLC) 分离消化后的肽和糖肽混合物。对含有糖苷的收集组分进行糖

生物信息学技术分离蛋白质组的介绍

  生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中

蛋白质组学发文章的四重境界(二)

译文:细胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能验证。遥想当初,很多老师意气风发砸钱做芯片,数据堆积如山,一脸懵逼。然而如今世风日下,基因芯片灌水发文章很难上5分,怎么将课题继续下去?其实芯片数据结合蛋白质组学可以玩出新花样,比如下面这篇:Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5

植物蛋白质组学和糖基化实验2

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

蛋白质组学发文章的四重境界(一)

某宝典卷首曰:“欲练神功,必先自宫。”卷尾曰:“即使自宫,未必成功。”这个惨痛案例告诉我们,欲成大事必付出常人难及的巨大代价,然而最终是否成功,仍有很多因素影响,练错一招,走火入魔。临床医生做科研亦如此,白天忙临床已经是一把辛酸泪,还要晚上写文章、申课题,简直是满纸荒唐言。倘若砸下百万经费就能发CN

IsoPlexis单细胞蛋白质组学检测服务即将启动啦!

  重磅消息来袭  你想要的单细胞  蛋白质组学检测服务即将启动啦!  单细胞蛋白质检测技术  传统的细胞分析通常包含数千个或更多的细胞,提供了一个总体平均值,掩盖了重要的细胞异质性,尤其是一些发挥重要作用的稀有细胞群体的意义,比如免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞等均展现出广泛的异质性。  当前,随着单细

优化蛋白质组学中膜蛋白的溶解性

据来自最近的研究,“在疾病的分子标志物和药物开发中,的组是至关重要的。然而,在这一领域的进展缓慢,主要来源于用分析膜蛋白非常困难。” 他说:“这项调查的目的是探讨和优化溶解膜蛋白的方法,用于CD14人单核的鸟枪法膜蛋白质组的研究。研究比较了几种体系: i)纯有机相(甲醇) ii)酸敏性洗

蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点

  双向凝胶电泳  双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,

植物蛋白质组学和糖基化实验(一)

实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白

王洪博士:膜蛋白质组学|WeOmics-O28

“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project,CN-HUPO,西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室共同举办,并由西湖

植物蛋白质组学和糖基化实验(三)

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

蛋白质组学技术分析方法及其仪器使用比较

1 蛋白质组学概述 “蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Ele

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻

生物质谱——蛋白质组学研究的肱股之臣

  分析测试网讯 2017年11月29日,由北京大学,首都科技条件平台主办,安特百科(北京)技术发展有限公司(分析测试百科网)协办的题为“生物质谱在蛋白质组学研究中的应用”的讲座在北京大学化学与分子工程学院化学楼A201报告厅举办,来自蛋白质行业的专家学者参与了此次讲座。北京大学分析测试中心、美国密

蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点

  双向凝胶电泳  双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,

“Q-Exactive-蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座

  9月27日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了“Q Exactive 蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座。赛默飞世尔科技李静工程师为大家介绍了Q Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成及特点,着重讲解了Q Exactive 在蛋白质组学应用的优势。  赛默飞世尔科技

景杰生物:蛋白质组学驱动精准医学技术先锋

  分析测试百科网讯,中国细胞生物学学会2021年全国学术大会于4月14日在重庆盛大开幕,作为国内蛋白质组学技术开发和应用引领者的景杰生物特装参会,备受行业关注。分析测试百科网采访了景杰生物市场经理邹文安先生和学术经理王涛博士,他们进一步为我们介绍了公司的特色、本届带来的产品,并描绘了公司未来的发展

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen