背靠背两篇Nature揭示SARSCoV2结合ACE2受体的晶体结构
一种新型高致病性冠状病毒(SARS-CoV-2)自2019年12月以来肆掠全球,应对这一疫情的关键是了解病毒的受体识别机制,调节其感染性、发病机制和宿主范围。而在分子和原子水平了解SARS-CoV-2如何感染细胞有利于科学家们更快开发出更有效地预防或者治疗性药物。 3月30日,Nature杂志在线发表了两项最新研究,揭示了SARS-CoV-2识别和结合人ACE2的机制及形成的复合物的晶体结构,两项研究分别为清华大学王新泉课题组和张林琦课题组合作发表的"Structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor"以及明尼苏达大学李放教授课题组发表的"Structural basis of receptor recognition by SARS-CoV-2"。图片来源:Natu......阅读全文
Nature:基于冷冻电镜的新技术MicroED确定微小晶体结构
α-突触核蛋白(α-synuclein)是路易小体(Lewy body)的主要成分,与帕金森病和其他神经退行性病变密切相关。日前,科学家们使用尖端技术MicroED(micro-electron diffraction)解析了α-突触核蛋白的毒性核心,获得了分辨率超高的晶体结构。程亦凡博士在九月
中科院Nature发文:甲型肝炎病毒全颗粒晶体结构被解析
来自中国科学院生物物理研究所、牛津大学等单位的科学研究人员经过多年紧密合作于2014年10月19日在Nature杂志上在线发表题为Hepatitis A virus and the origins of picornaviruses的论文,详细阐述了甲型肝炎病毒的独有的结构特性、极强的
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
什么是晶体结构?
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞,因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达可采
硅的晶体结构
两个面心立方结构相互套构而成,其中一个面心立方结构沿另一个的体对角线平移1/4。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
Nature:复合无机物相场的两种晶体结构类型的加速发现
受限于材料既有大量可能的元素组成,也有庞大的潜在结构,所以探索研发新材料一直没有一个很好的办法。例如,无机结构拓展到固相结构的研究发现大部分都是依赖于晶体化学以及耗费大量时间的系统改变元素比值的材料合成。。计算方法已经发展到通过精确成分预测结构和已知晶体结构预测成分来指导材料合成,,并已经取得了
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许
晶体结构的固定熔点
实验表明:从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热,反之,从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明:在相同的热力学条件下,与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比,晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下,以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比,晶体是稳定的,非晶体是不稳定的,后者有自发转变为晶体
简述晶体结构的信息
晶体结构即晶体的微观结构,是指晶体中实际质点(原子、离子或分子)的具体排列情况。自然界存在的固态物质可分为晶体和非晶体两大类,固态的金属与合金大都是晶体。晶体与非晶体的最本质差别在于组成晶体的原子、离子、分子等质点是规则排列的(长程序),而非晶体中这些质点除与其最相近外,基本上无规则地堆积在一起
原子晶体的晶体结构
结构特征:空间立体网状结构(如金刚石、晶体硅、二氧化硅等)。原子晶体的结构特点:①由原子直接构成晶体,所有原子间只靠共价键连接成一个整体。②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。③破坏共价键需要较高的能量。在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子,原子间以坚强的共价键相结合,如单质硅(Si)、金刚石
如何选择蛋白晶体结构?
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无
Nature子刊:SLFN蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构
多家研究机构合作报道了 Schlafen(SLFN)蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构,证实 SLFN 是一个新型的核酸内切酶家族,通过破坏蛋白翻译机器调控真核生物的翻译进程,能够有效控制 HIV 病毒的复制和包装。 中山大学附属肿瘤医院,南方科技大学、德国马科斯•德尔布吕克分子医学中心
果胶酶的晶体结构
所有果胶酶结构都包括一个由七到九个平行β-螺旋组成的棱柱形右手圆柱体。产生该结构棱柱形状的三个平行β螺旋被称为PB1、PB2和PB3,PB1和PB2产生反平行的β,PB3与PB2垂直。各种酯酶、水解酶和裂合酶的所有底物结合位点都位于结构上的突出环和PB1之间的中央平行β-螺旋结构的外部裂缝上。
简述葡糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域, 大小区域之间通过连接区域连接,两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象,当葡萄糖浓度较低时,GK处于非活性超开放构象;当体内葡萄糖浓度升高时,GK与葡萄糖结合,处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶,葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两
晶体结构鉴定手段或方法
X射线衍射分析、红外光谱分析X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上,所得的衍射图称为粉末图。用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法。其优点是所需样品少,甚至0.1mg也可以测定,收集的衍生数据完全,仪器设备和试验
晶体结构的解理性简介
当晶体受到敲打、剪切、撞击等外界作用时,可有沿某一个或几个具有确定方位的晶面劈裂开来的性质。如固体云母(一种硅酸盐矿物)很容易沿自然层状结构平行的方向劈为薄片,晶体的这一性质称为解理性,这些劈裂面则称为解理面。自然界的晶体显露于外表的往往就是一些解理面。
晶体结构分析的相关介绍
晶体学中的一个重要的领域,它研究晶态物质内部在原子尺度下的微观结构。它为固体物理学、材料科学、结构化学、分子生物学、矿物学、医药学等许多学科的基础研究和应用研究提供必不可少的实验资料,使人们有可能从分子、原子以及电子分布的水平上去理解有关物质的行为规律。 按所用试样的不同,晶体结构分析有多晶体
晶体结构的主要类型介绍
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子,然后通过离子键结合成氯化钠晶体,每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子,然后通过分子间键或范德华(Van d
关于晶体结构的基本介绍
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞,因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达
请问晶体结构有哪些类型?
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子,然后通过离子键结合成氯化钠晶体,每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子,然后通过分子间键或范德华(Van
原子晶体的晶体结构介绍
结构特征:空间立体网状结构(如金刚石、晶体硅、二氧化硅等)。 原子晶体的结构特点: ①由原子直接构成晶体,所有原子间只靠共价键连接成一个整体。 ②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。 ③破坏共价键需要较高的能量。 在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子,原子间以坚强的共价键相结合,
背靠背两篇Nature揭示SARSCoV2结合ACE2受体的晶体结构
一种新型高致病性冠状病毒(SARS-CoV-2)自2019年12月以来肆掠全球,应对这一疫情的关键是了解病毒的受体识别机制,调节其感染性、发病机制和宿主范围。而在分子和原子水平了解SARS-CoV-2如何感染细胞有利于科学家们更快开发出更有效地预防或者治疗性药物。 3月30日,Nature杂志
关于晶体结构晶体的共性介绍
如果将大量的原子聚集到一起构成固体,那么显然原子会有无限多种不同的排列方式。而在相应于平衡状态下的最低能量状态,则要求原子在固体中有规则地排列。若把原子看作刚性小球,按物理学定律,原子小球应整齐地排列成平面,又由各平面重叠成规则的三维形状的固体。 人们很早就注意一些具有规则几何外形的固体,如岩
如何用衍射仪判断晶体结构
一种物质会有可能会有多种晶型,因此就有多个pdf卡片,如不同的αfe或γfe。有了pdf卡片,这种晶型的该物质的结构就已经确定了,卡上有该晶体的空间群晶格常数等信息。对于未知物质或其晶体类型,需要用透射电子衍射或者会聚束方法
简述葡萄糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域, 大小区域之间通过连接区域连接,两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象,当葡萄糖浓度较低时,GK处于非活性超开放构象;当体内葡萄糖浓度升高时,GK与葡萄糖结合,处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶,葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两
白介素受体复合物的晶体结构
白细胞介素(interleukin)是淋巴细胞、单核细胞以及其它非单核细胞等产生的细胞因子(cytokine),它们在细胞间相互作用、免疫调节、造血过程以及炎症反应中起到重要作用。而其中的白细胞介素4(IL-4)和白细胞介素13(IL-13)对于T细胞介导的体液免疫应答非常关键,与过敏和哮喘等疾病相
Cell:Ⅱ型大麻素受体的晶体结构
中国科研小组与俄罗斯和美国科学家一起获得了Ⅱ型大麻素受体的晶体结构。这些知识将有助于开发抗炎症、神经退行性疾病和其他疾病的药物。发表在《Cell》杂志上的文章作者对Ⅰ型和Ⅱ型大麻素受体进行了比较,并得出结论说,这两种受体是人体大麻素系统的“阴和阳”。 盲目治疗 大麻素受体是人体信号系统的关键
基于TbSADH晶体结构进行酶设计改造
筛选是酶定向进化的瓶颈。酶理性设计及计算机虚拟筛选技术可有效解决这一瓶颈,是定向进化领域的重要发展方向。近年来基于构象动力学指导的酶理性设计取得一系列成功,该策略的关键是精准定位残基位点,通过引入合适突变,增强催化口袋的构象变化,进而改造底物谱、对映体选择性及热稳定性等催化特性。 中科院天津工
简述晶体结构的固定熔点的介绍
实验表明:从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热,反之,从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明:在相同的热力学条件下,与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比,晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下,以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比,晶体是稳定的,非晶体是不稳定的,后者有自发转变为