利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...
利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predictors for Efficient Plant Breeding Decisions Using Phenomic-Assisted Selection in Soybean的研究论文,介绍了在大豆中利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子的方法。爱荷华州立大学的Asheesh K. Singh教授为本文通讯作者。表型辅助育种技术的发展速度已经滞后于基因组辅助育种技术,现在基因组辅助育种已成为培育主流品种的关键技术。然而,表型技术的进步使植物学家能够获得可以分析的高维数据集,从而优化育种计划的运作......阅读全文
植物病理表型测量系统概述
植物病理表型测量系统PathoScreenProBlu集可见光成像、多光谱成像、叶绿素荧光成像和GFP荧光成像功能于一身,是目前国际上功能最全、成像面积最大(最大成像面积53cm x 53cm)的病理表型测量系统。该系统配备600万像素高清相机,全自动滤光轮和功能强大的分析软件,操作简单、功能强
植物表型成像分析图片展
FluorCam和PlantScreen分别是国内外广泛使用的叶绿素荧光成像系统和植物大型表型成像分析平台。 全球顶尖的研究机构充分发挥了它们的功能,取得了顶尖的研究成果。我们将陆续摘选代表性研究论文中的成像图分享给大家。这些成像图“华而又实”——画面优美、结论直观、真实可信,从中可以获得视觉和思
冠层分析仪能测出玉米哪些数据
目前,以有效的方式收集有用、可解释和与生物学相关的表型数据仍然是植物育种、基因定位和基因组预测的瓶颈。自主且价格合理的冠层Rovers是一种高效且可扩展的方法,可用于生成基于传感器的田间作物数据集。装有激光雷达的Rover可以对整个杂交玉米(Zea mays L.)田进行三维重建。表型分析方法的
利用弹性网正则化或卷积神经网络构建评估扁豆丝囊菌...
利用弹性网正则化或卷积神经网络构建评估扁豆丝囊菌根腐病模型丝囊菌根腐病是限制扁豆和豌豆产量的主要疾病,能够导致严重的经济损失。目前商业化推广种植的品种大都缺乏根腐病抗性,因此,研究者致力于通过遗传育种方法开发出抗病性更好的扁豆品种。 作物表型由于与植物表达性状(受基因和环境因素间的相互作用影响)的评
机器学习技术加速植物精准设计育种
种子被誉为农业的“芯片”,育种科技创新是推动农业发展的核心动力。未来植物育种的新范式是基因组学、基因编辑、合成生物学等生物技术(BT)与数据科学、机器学习、人工智能等信息技术(IT)的多元化融合。农业农村部“十四五”规划将“智慧种业”列在“智慧农业”领域七大攻关任务之首。任务中明确提出:构建数字化育
机器学习方法可精准预测作物抗病性
近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合国内科研单位,利用机器学习策略,成功开发出根据作物基因型精准预测抗病表型的方法。相关研究成果发表在《工程》(Engineering)上。在作物抗病性研究中,已知的作物抗病基因数量有限。近年研究发现,作物感病基因突变、能塑造作物健
野外型高通量植物表型平台简介
野外型高通量植物表型平台可以高通量对大田中的农作物进行自动表型成像的系统。它可以在长40 m、宽10 m、高6 m的范围内对植物进行表型分析。该系统可以配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、高光谱成像和激光3D成像,在田间对植物进行三维形态学分析。
植物表型研究文章TOP10(三)
TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。
高通量小型植物光合表型测量系统
高通量小型植物光合表型测量系统是一款对小型植物自动进行顶部高通量光合表型高清成像(600万像素)测量的系统,配备6种滤光片进行叶绿素荧光成像和反射光谱成像。能够获得用于表型分析的可见光成像、用于光合作用分析的叶绿素荧光成像、在近红外区的NIR反射成像RNIR、反映叶绿素含量的叶绿素指数成像RCh
植物表型研究文章TOP10(四)
TOP 2● 田间表型:作物育种新方向(Trends Plant Sci,2014)田间表型分析受限因素太多,因此限制了大家研究数量性状遗传学的能力,特别是哪些与产量和胁迫耐受性相关的性状。发展有效的基于田间高通量表型分析平台(HTPPs)仍然是未来育种进展的瓶颈。然而,传感器、高性能计算技术的发展
植物表型研究文章TOP10(二)
TOP 7● 动态根系生长和结构在养分限制条件下的反应(Biotechnol. Adv. ,2014)通过简单介绍现有和正在开发的从实验室到田间的根表型定量分析技术,从田间部分根剖面的量化到整个根系的三维重建。 最后,此文讨论这些方法如何能够并且应该与建模紧密相关以探索根本的现象。不同植物根系的量化
PlantScreenSC植物表型分析技术方案
植物表型分析系统PlantScreen-SC包括传送系统、成像系统、环境传感器、服务器等硬件及配套软件,适用于高70cm、宽幅50cm以内的植株。该系统是可用于生物农药、植物源生物刺激剂及土壤调理剂研发的大型表型系统。 成像系统包括叶绿素荧光成像单元和RGB成像单元。前者采用脉冲调制式叶绿素荧光成像
温室型高通量植物表型平台概述
温室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量植株(从幼苗到成熟植株即可)进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像、根系近红外成像、高光谱成像中的一种或多种,每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头,结合样品旋转装置,就可以对植株进行3D形
植物表型研究文章TOP10(一)
鸡年接近尾声,各行各业都已经做了各种年度盘点,小编也不能免俗,以影响因子和引用次数为标准,将近五年跟植物表型研究相关的文章,做了盘点,列出了植物表型研究文章的TOP10 ,从微观表型到宏观表型,从实验室表型到田间表型,从基因型到表型,赶紧一睹为快吧。 TOP 10● 植物表型组学数据中动态数量性状位
植物表型测量系统的技术指标
1、成像面积不小于13x13cm;2、测量参数包括Fo,Fo’,Fs,Fm,Fm’,Fp,FtDn,FtLn,Fv,NPQ_Dn,NPQ_Ln,Qp_Dn,Qp_Ln,qN,QY,QY_Ln,PARabs,Rfd,BGF,UV-Chl.F等60多个叶绿素荧光参数和稳态荧光、基本形态分析;3、高分
植物表型成像系统WIWAM-Screening功能简介
WIWAM Screening植物表型野外样带成像分析系统由野外移动式植物表型组学成像分析平台、RGB成像、叶绿素荧光成像、高光谱成像、植物红外热成像、植物近红外成像等组成,移动式成像分析平台具轮子,可以沿轨道滑行并对植物进行表型组成像分析;各成像分析单元为模块式结构,可灵活安装配置到移动式成像
多功能植物光合表型测量系统相关
多功能植物光合表型测量系统PlantExplorer采用创新的多光谱叶绿素荧光/可见光成像技术,利用最新的LED技术、CCD技术、通信技术,实现了对植物表型的创新测量,可以在获取RGB成像、叶绿素成像、花青素成像的同时,获取叶绿素荧光成像(成像面积40cm x 53cm)。系统包括带光学滤光轮的
谷子高质量图基因组“面纱”揭开
谷子即小米,起源于中国,作为粮食作物深受老百姓喜爱。近日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队,通过对谷子种质资源的基因组分析,组装了首个谷子高质量图基因组,系统阐明了谷子起源及驯化改良的过程,并创制了谷子图基因组精准高效育种方法,为培育谷子突破性品种提供了理论基础和
博普特田间植物表型产品和解决方案在精准农业方向...2
高通量的表型分析直接影响三个方面:更精确的遗传筛选、鉴定新的遗传变异以及改进对目标群体环境因子的筛选,进而较好做遗传决策。植物田间高通量表型分析也间接影响育种规模以及育种周期。下图是法国农业科学院Fred教授提出的田间表型研究不同遥感传感器的总结,实际上在科研中,田间多种传感器结合也得到了深度应用和
复旦人类表型组研究院与SCIEX开展分子表型技术创新合作
2020年1月15日,SCIEX全球总裁Inese Lowenstein率团访问复旦大学人类表型组研究院,并为研究院与SCIEX中国合作建设的分子表型技术创新中心揭牌。未来,SCIEX中国将助力复旦人类表型组研究院瞄准目标代谢表型的精准定量测量,建立表型组学质谱专业人才培训基地;联合发展创新的质
莫道克大学和布鲁克达成战略联盟支持国际表型组学中心
2019年9月20日,莫道克大学(Murdoch University)和布鲁克(Nasdaq: BRKR)联合宣布了一项战略合作计划。据悉,此次合作将为澳大利亚国家表型组研究中心(Australian National Phenome Centre,以下简称ANPC)的建设,乃至世界各地的疾病
多组学数据库“齐聚荟”-助力油菜“全能”竞技
油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油
院士专家研讨“表型组时代的人类健康”
10月24日,由复旦大学、中国生物物理学会表型组学分会、上海国际人类表型组研究院联合主办的第二届中国人类表型组大会及第三届国际人类表型组研讨会举行。作为表型组学研究领域最为重要的前沿学术峰会,今年两场大会均聚焦“表型组时代的人类健康”这一主题,吸引了来自全球的300余位正式代表、近千位听众在线参
多功能植物光合表型测量系统相关概述
多功能植物光合表型测量系统PlantExplorer采用创新的多光谱叶绿素荧光/可见光成像技术,利用最新的LED技术、CCD技术、通信技术,实现了对植物表型的创新测量,可以在获取RGB成像、叶绿素成像、花青素成像的同时,获取叶绿素荧光成像(成像面积40cm x 53cm)。系统包括带光学滤光轮的
植物表型测量系统的主要功能
广泛应用于植物光合生理生态、植物逆境胁迫生理与易感性、气孔功能、植物环境如土壤重金属污染响应与生物检测、植物抗性、作物育种、Phenotyping、转基因、稳态荧光成像测量等研究,是“数字化植物”的重要利器!。
植物表型成像系统WIWAM-Screening功能分析
红外热成像分析(选配):用于成像分析植物在光辐射情况下的二维发热分布,良好的散热可以使植物耐受较长时间的高光辐射或低水条件(干旱) 近红外成像分析(选配):用于观测分析植物的水分状态及其在不同组织间的分布变异,处于良好浇灌状态的植物表现出对近红外光谱的高吸收性,而处于干旱状态的植物则表现出对近
多功能植物光合表型测量系统功能特性
创新的多功能植物光合表型平台 可见光成像+多光谱成像+叶绿素荧光(调制和非调制)成像 同一个相机采集所有成像 全自动马达聚焦系统,带全景和微距聚焦程序 出色的高清相机(1.3 M pixel)测量叶绿素荧光 高信噪比叶绿素荧光成像 高质量10 Mp镜头,带光谱可见光和近红外涂层 无
基于深度学习的全基因组选择新方法诞生
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物》(Mole
如何使用植物表型成像系统完成十字花科表型研究的论文
最近,来自比利时根特大学的专家利用WIWAM XY植物表型系统发表了题为Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae的文章,发表在植物学著名期刊New Phytol
激动人心!农业“国之重器”从蓝图走向现实
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518299.shtm2月27日,在武汉东湖科学城核心区光谷科学岛的红泥地里,国家作物表型组学研究重大科技基础设施(即“神农设施”)项目启动建设。“这是农业领域众多科学家从‘十二五’到‘十四五’努力推动,终