多组学数据库“齐聚荟”助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油菜遗传育种的核心研究内容之一。 华中农业大学信息学院教授杨庆勇团队发布油菜群体变异数据库BnVIR,建立了甘蓝型油菜基因型与基因表达、表型的关联,为快速高效地挖掘油菜候选变异和基因提供了平台。这是继该团队构建首个油菜泛基因组及其数据库BnPIR、油菜转录组数据库BnTIR、植物遗传变异参考面板数据库Plant-ImputeDB后又一重要工作,对油菜种质资源精准鉴定、评价、利用以及分子育种具有重要推动作用。相关论文2月8日在线发表于《分子植物》。 寻找遗传变异从“图”开始 油菜是世界四大油料作物之一,我国年均油菜生产和消费居......阅读全文

首个免疫衰老多组学数据库设立

记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory,旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老

多组学数据库“齐聚荟”-助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

科学家合作构建再生生物学多组学数据库

  随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

我国首个以牧草为主的多组学数据库平台建立

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505990.shtm美洲狼尾草一类的小米(millets)是抗非生物胁迫能力强、营养丰富的禾本科优质牧草及粗粮。它可保证生活在极端气候条件地区人们的粮食安全,并为其它作物提供与耐非生物胁迫有关的遗传资源。

首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布

  近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。  黄瓜是葫芦科的重要经济蔬菜作物。黄瓜基因组中有近3

首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。黄瓜参考基因组“9930”和核心种质资源。中国农科院蔬菜所

科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库

  水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释

首个近完整黄瓜参考基因组及多组学综合数据库发布

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》(IF5 year = 21.4)上。黄瓜(Cucumis s

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

首个菊科多组学数据平台AMIR发布

10月8日,华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、药用植物资源可持续利用团队梅之南教授和杨庆勇教授课题组,发布了首个专门面向菊科植物的多组学数据库平台——Asteraceae Multi-omics Information Resource(AMIR)。该平台涵盖了74种菊科植物的多

植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

水稻多器官单细胞多组学图谱问世

  记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。  单细胞组学是近年来生命科学

Illumina完成收购SomaLogic,强势整合多组学版图

  美通社消息,2026年1月30日 ,Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)今日宣布,已完成对数据驱动的蛋白质组学技术领导者SomaLogic的收购。此次收购将高度互补的蛋白质组学能力纳入Illumina的多组学产品组合,加强客户大规模获取蛋白质组学洞察的途径,以助力加速药物发现并对医

CASMS分论坛:多组学整合与大数据

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

单细胞多组学整合技术有了新突破

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

空间多组学质谱技术研讨会(2023)

  空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。  质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如

单细胞多组学整合技术有了新突破

近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘

苦荞       董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于