高通量基因分型检测平台及其应用案例

Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA,通量达到800个样本/3小时。同时,适用于多种样本类型的DNA提取,包括植物叶片、种子,毛发、血方卡、精液、口拭子、唾液、组织等。提取的DNA适用于多种下游应用,如基因分型、一代测序、二代测序等。Oktopure DNA提取仪 Nexar高通量吸取样品DNA和引物、mix至384孔卷带并封膜。Soellex对封膜完成的卷带进行PCR水浴热循环,每次最多可达230,000个样本。Araya对水浴完成的卷带扫描分析,28秒扫描一张卷带。Nexar®模块化内联液体处理与分析系统Soellex®高通量PCR水浴热循环系统Araya®内联荧光检测系统 Agripheno™基因分型采用KA......阅读全文

乙肝HBV基因分型检测临床意义

1、有助于预测慢性乙肝进展、判断乙型肝炎病程及转归    慢性乙型肝炎感染不仅会引发肝纤维化、肝硬化,更加会引发肝细胞癌的发生、发展有着密切的关系。通过HBV基因分型检测技术可精准、精确的检测出HBV的复制情况、患者自身病情恶化程度及病情的恢复状况2、判断乙型肝炎病毒致病性    由于我国慢性乙型肝

应用非标记探针法进行基因分型(一)

RET原癌基因单个碱基的突变可以引发多发性内分泌腺瘤2型。RET突变传统的基因分型方法是外显子测序。一种闭管操作的基因分型方法已经成熟,此方法用的是一种饱和DNA染料,非标记探针及高分辨率熔解扩增子分析。此方法需要两个连续的聚合酶链式反应阶段,主要的和第二次实验。主要的实验共用7个反应和8个非标记探

应用非标记探针法进行基因分型(三)

高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1(爱荷华科技,盐湖城,犹他州)上进行分析,将LightCycle毛细管加入HR-1中,0.3℃/s加热。主要的实验中,RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据,除了外显子14。因为所有报道的外显子1

应用非标记探针法进行基因分型(七)

一般来说,用特定突变探针产生1/3结果。首先,当突变序列与特定突变探针互补时,突变等位基因的熔解Tm要高于野生型(△Tm为-2℃至-5℃)。第二,当突变在相同位置但是与特定突变探针序列不互补时,突变等位基因被野生型等位基因相似的Tm值及稳定性所遮蔽(野生型等位基因Tm±0.5℃)。在这种情况下,没有

应用非标记探针法进行基因分型(五)

用相似的方法分析外显子11(表3;补充图2;补充表3;http://jmd.amjpathol.org),且所有外显子11的RET序列变化用扩增子高分辨率熔解分析进行检测(没有显示数据)。外显子11的主要实验用一个在致病密码子630和634上的野生型探针。检测的外显子11的8个序列变化均有一个等位基

应用非标记探针法进行基因分型(六)

外显子14:多重探针分析       主要实验的外显子14, 两个野生型的探针同时用于一个反应,用来检测所有已报道的外显子14的突变,同时消除密码子836(p.S836S)多态性(图4;a和b;表3;补充表5;http://jmd.amjpathol.org)。WT14A探针在65℃-76℃

应用非标记探针法进行基因分型(二)

材料和方法样品      此报道中用到的野生型RET基因的DNA基因组样品或有RET序列变化的样品在以前描述过。RET基因序列变化改变RET蛋白的功能引发MEN2综合症的是突变,然而RET序列改变不会引发MEN2综合症是多态。不能确定意义的稀有的或不会引起MEN2综合症的RET基因序列变化成为“序列

应用非标记探针法进行基因分型(四)

外显子10和11:多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10(密码子609、611、618和620)和11(密码子630和634),且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40(表1)。RET10外显子的主要实验包括两个单独的实验和

乙肝病毒基因分型检测技术

检测盲点  “千人一方、万人一药”局面难改变  93.7%的患者长期得不到有效治疗 中华医学会肝病学会等权威肝病机构,在北京、上海、天津、河北、湖南、广东等全国20多个地区开展的一项针对万人乙肝患者治疗效果的调查显示,检测上的局限性是导致乙肝长期治疗效果不好的主要原因。 由于治疗过程中缺乏对乙肝病毒

关于HLA分型高分辨分型应用的介绍

  1、地中海贫血治疗  2、造血干细胞移植异基因造血干细胞移植是现能根治重型Β地贫的方法。如有HLA相配的造血干细胞供者,应作为治疗重型Β地贫的首选方法。  3、急性白血病,骨髓移植。  4、对ANLL疗效较好。  ①同基因骨髓移植,供者为同卵孪生子。  ②同种异基因骨髓移植,供者为患者的兄弟姐妹

高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享

  KASP技术经验分享   KASP技术经验分享   KASP技术经验分享   重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.   1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?   我们要求所提交的

高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享

  重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.   1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?   我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点

高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享

重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点BLAST结果证明为

STR基因分型应用于细胞鉴定的意义

新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。 背景介绍应用于

用PCR进行基因分型

与许多一次做数百块Southern blots的研究人员一样,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)时觉得见效很快,不再需要等几天才能看到结果,不再需要DNA显微图像或者操作紫外线了。随着技术的不断进步,RCR使基因组学和转录组学发生了翻天覆地的变化,甚至随着免疫PCR的普及开始进军蛋白

药物检测案例酰胺类药物及其制剂的质量检测

一、性状对乙酰氨基酚、盐酸利多卡因、盐酸布比卡因的性状描述见表1。二、鉴别 (一)化学法 1.芳香第一反应  对乙酰氨基酚结构中共有在的芳氨基,可在酸性条件下加热水解,水解产物可发生重氮化一偶合反应。鉴别方法:取本品约0.1g,加稀盐酸5ml,置水浴中加热40分钟,放冷;取0.5ml,滴加亚硝酸钠试

生化检测项目载脂蛋白E基因分型介绍

载脂蛋白E基因分型介绍:  载脂蛋白E(ApoE)是一种富含精氨酸的碱性蛋白质,ApoE在脂类代谢中起着重要的作用。载脂蛋白(Apo)E基因常见的等位基因型分为三种ε2、ε3、ε4,ApoE基因型的检测可以作为临床辅助诊断和风险率估计的指标。载脂蛋白E基因分型正常值:  载脂蛋白E主要存在于CM、V

RTPCR检测汉坦病毒基因及分型

材料: (1)急性期病人血清、鼠肺、鼠血或分离的汉坦病毒(2)引物:引物序列(5’~3’)位置片段(bp)逆转录引物TAGTAGTAGACTCC1~14LMS通用外引物AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG1910~1939M(+)GTACAICCTGTRCCIACCCC2373

基因分型检测可准确检测特定的生物标志物?

  英国癌症研究所和皇家马斯登医院的研究人员近日证实,基于血液的基因分型检测可准确检测特定的生物标志物,有望指导转移性乳腺癌的靶向治疗。  研究人员利用Guardant Health的液体活检分析和Bio-Rad的微滴式数字PCR(ddPCR)检测来鉴定患者循环肿瘤DNA(ctDNA)中的突变,包括

罗氏454高通量测序平台的特点及应用

Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台,GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展,必将带动整个测序领域的技术发展,对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生

SNP分型技术在临床检测市场的应用前景

SNP(Single nucleotide polymorphism)即单核苷酸多态性,它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变, 使得群体之间和个体之间产生了差异。   SNP的检测方法很多,它们主要基于以下4种基本原理:(1)等位基因特异性杂交;(2)内

SNP分型技术在临床检测市场的应用前景

  SNP(Single nucleotide polymorphism)即单核苷酸多态性,它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变, 使得群体之间和个体之间产生了差异。   SNP的检测方法很多,它们主要基于以下4种基本原理:(1)等位基因特异

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——高通量环境毒性...

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——高通量环境毒性生物标记检测捷克全球变化研究所与丹麦哥本哈根大学长期合作研究开发一种环境毒性物质如除草剂、重金属等的高通量生物标记筛选方法。他们使用高等植物的光自养细胞悬液,结合FluorCam叶绿素荧光成像系统、FMT150藻类培养与在线监测系统、Alg

高通量疫苗、兽药研发及兽药残留检测公共平台

  前言:本文摘选自《××农业大学高通量疫苗、兽药研发及农药残留检测公共平台的认证报告》,分为上下两篇。该系列分为高通量疫苗研发技术简介,兽药研发及农药残留检测技术简介,高通量疫苗及、兽药研发及农药残留检测公共平台共三期,希望对广大动物科学研究者有所帮助。  【平台简介】  高通量疫苗、兽药研发及兽

高通量植物表型平台简介

  高通量植物表型平台是植物表型组学、植物功能基因组学、现代遗传育种研究的强大工具。利用高通量植物表型平台可以快速获取大量植株的各种信息。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良,获得更大的果实/种子,更高的含油量(油料作物),更发达的根系等等。通过高通量植物表型平台可以快速获取大量植物表型信息。

斑马鱼——CRISPR高通量基因功能研究新平台

  近日,来自美国NIH的研究人员进行了一项研究,他们利用CRISPR-CAS9技术靶向斑马鱼特定DNA序列进行基因功能探索和人类治病基因的发现研究,相关研究成果在线发表在国际学术期刊genome research。  在这项研究中,研究人员发现利用基因编辑技术CRISPR-CAS9进行斑马鱼基因靶

HP分型检测的简介

  开展幽门螺杆菌清除工作时,需先进行幽门螺杆菌分型,测定毒力菌株,以指导专家给出正确清幽方案,减少耐药菌株的产生,因此现阶段确认幽门螺旋杆菌感染后利用分型检测设备对幽门螺旋杆菌进一步检测分型,有助于幽门螺旋杆菌引发的相关疾病的正确诊断和治疗。

什么是STR分型检测?

STR分型检测(short tandem repeat)是一种检测技术。主要用于检测人类及哺乳动物的基因组。

STR分型检测技术介绍

STR(short tandem repeat,短片段重复序列)广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中,具有高度多态性,它们一般由2-6个碱基构成一个核心序列,核心序列串联重复排列,由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的

用PCR进行基因分型2

质谱法原则上,添加到引物末端的核苷能够直接依据质量,利用通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectroscopy,MALDI-TOFMS)直接检测出来,这是一种不需标