基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（一）
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过程。在这个过程中，有一些非常有意思的问题是我们希望通过单细胞数据加以理解的，比如，某个组织中，某类细胞的发育生成过程；在不同条件下，细胞的改变过程和命运等等。因此，我们需要通过特定的分析手段实现对数据的分类和还原，并通过数据来勾画出细胞间的变化过程。在这样的背景下，拟时间序列分析（Pseudotime分析）为我们提供了来解决该问题的工具。拟时间序列分析（Pseudotime分析）的字面意思是通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程。从具体的分类分析和复杂程度来说，可以分为细胞轨迹分析和细胞谱系分析。细胞轨迹分析指的是简单模型的......阅读全文
序列分析仪的原理和用途
中文名称序列分析仪英文名称sequencer;sequenator定 义测定有序线性聚合物(如DNA、寡肽等)基本组成单位残基(核苷酸、氨基酸)排列顺序的仪器设备。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法；2、熟悉蛋白质基本性质分析；3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测；4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)
毗邻序列分析的方法特点和作用
中文名称毗邻序列分析英文名称nearest neighbor sequence analysis定 义分析核酸链中某核苷酸与其他核苷酸相邻频率的技术。即用5′-α-32P标记的某核苷三磷酸为底物参入核酸链，然后用特定的酶降解此核酸链生成3′核苷酸，则原来在某核苷酸5′侧的32P就转到相邻核苷酸的3
核酸序列的一般分析流程
核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.nc
核苷酸序列的分析方法介绍
核苷酸序列，就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A，T，G，C的排列顺序，或者mRNA中A，U，G，C的排列顺序，也包括rRNA，tRNA中碱基的排列顺序。 根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”，提出采用调频Z变换的分析方法，定义了相应的表达式，同
核酸和蛋白质序列分析2
（2）输出：除了以文本形式外，还可以通过JalView显示和编辑结果。此外，还可以另外使用GeneDoc（常见于文献）及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列，需要进行ORF分析，每个生
核酸和蛋白质序列分析1
在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等，识别调控区的顺式作用元件，可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本
核酸序列分析的一般流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（ad
实时定量焦磷酸序列分析仪
实时定量焦磷酸序列分析仪是一种用于生物学、基础医学、临床医学领域的分析仪器，于2016年11月3日启用。 技术指标 1.样品通量：1-96个样本；2.灵活性：每次实验中，不同样本可进行不同的检测反应；3.无试剂及耗材浪费；4.检测器：CCD；5.检测速度：最快10分钟内完成96个样本的突变序
核酸序列的一般分析流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
挑战常规！CAG重复序列决定着亨廷顿舞蹈病发病时间
亨廷顿舞蹈病（Huntington's disease, HD）是一种遗传性的致命性疾病。在这种疾病中，大脑中的神经细胞随着时间的推移而遭受破坏。它在生命中的任何时候都可能变得明显，但通常开始于一个人的三四十岁。在一项新的研究中，来自亨廷顿舞蹈病基因修饰物联盟（Genetic Modif
时间分辨荧光免疫分析分析原理
在生物流体和血清中的许多复合物和蛋白本身就可以发荧光，因此使用传统的发色团进而进行荧光检测的灵敏度就会严重下降。大部分背景荧光信号是短时存在的，因此将长衰减寿命的标记物与时间分辨荧光技术相结合，就可以使瞬时荧光干扰减到最小化。 时间分辨荧光分析法（TRFIA）实际上是在荧光分析（FIA）的基础
药剂的崩解时间分析
1.普通压制片15min内全部崩解。薄膜衣片30min内全部崩解。糖衣片60min内全部崩解。2.肠衣片：先在盐酸溶液检查2h，不得裂缝崩解或软化，于pH为6.8的磷酸盐缓冲液中1h内应全部崩解。3.含片应在30min内全部崩解或溶化。舌下片应在5min内全部崩解或溶化。4.可溶片水温15——25℃
蛋白质序列分析和结构预测实验
蛋白质序列分析和结构预测实验 实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其
一例羊膜破裂序列征病例分析
患儿，男，9月龄。因“发现左侧上唇裂开9月余”就诊。为第4胎，第3产，孕39周，剖宫产。出生时体重2.5 kg。其母否认孕期致畸因素接触史，孕期未行产前检查，分娩时胎盘状态不明。无家族史，患儿两个姐姐均身体健康无畸形。体格检查：神志清楚，全身浅表淋巴结未见肿大。心音正常，心律齐，各瓣膜区未闻及杂音，
测序技术及DNA序列测定结果分析
实验概要 在分子生物学研究中，DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等（1977）发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和 Gilbert（1977）发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大，但都是根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定的
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；（
DNA序列分析电泳仪技术参数
电泳仪电源按电压分为高压1500～5000V、中压500～1500V、低压500V以下三种；按电流分为大电流500mA～2000mA、中电流100～500mA、小电流100mA以下三种；按功率分为大功率200～400W、中功率60～200W、小功率60W以下三种。基本参数外形尺寸（L×W×D）：47
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；
前导序列
中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列，这部分序列能被转录，但不被翻译，在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点（通常 AUG）为止，在蛋白质合成过程中不被翻译。
研究揭示前额叶海马环路通过theta振荡支持时间序列信息的在线加工
10月17日，《神经科学通报》（Neuroscience Bulletin）在线发表了题为Theta Oscillations Support Prefrontal-hippocampal Interactions in Sequential Working Memory的研究论文。该研究由中国
重庆拟规定：外卖盒饭将注明制作时间和保质期
9月6日，重庆市政府法制办发布消息，该市拟制定《重庆市食品安全条例》，食品摊点生产经营设备、设施必须符合食品安全相关条件，相关工作人员须持有健康证明。 据悉，《重庆市食品安全条例(征求意见稿)》，将全文公布在市政府公众信息网(www.cq.gov.cn)上，公开征求意见和建议，
时间分辨荧光免疫分析的分析原理
共有三个原理如下时间分辨荧光免疫测定（TRFIA）是一种非同位素免疫分析技术，它用镧系元素标记抗原或抗体，根据镧系元素螯合物的发光特点，用时间分辨技术测量荧光，同时检测波长和时间两个参数进行信号分辨，可有效地排除非特异荧光的干扰，极大地提高了分析灵敏度。分析原理在生物流体和血清中的许多复合物和蛋白本
时间分辨荧光免疫分析应用
1.激素：甲状腺激素、甾体类激素。 2.病毒性肝炎标志物。 3.肿瘤相关抗原、胃蛋白酶原（PG）医学教|育网搜集整理。 4.药物。 5.多肽类。
时间分辨荧光免疫分析简述
时间分辨荧光免疫测定（TRFIA）是一种非同位素免疫分析技术，它用镧系元素标记抗原或抗体，根据镧系元素螯合物的发光特点，用时间分辨技术测量荧光，同时检测波长和时间两个参数进行信号分辨，可有效地排除非特异荧光的干扰，极大地提高了分析灵敏度。
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化，环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外，在不断增殖的肿瘤中，具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性（fitness）并不是一成不变的。在化疗药物
双胎反向动脉灌注序列症临床特点分析
单绒毛膜双胎( monochorionic twin，MC Twin) 由 于受精卵分裂及发育过程的特殊性，可发生诸多复杂的双胎特有并发症，其中以“双胎之一无头－无心畸 形”为临床特点的双胎反向动脉灌注序列症( twin reversed arterial perfusion seque
关于增强子序列的相关研究分析介绍
观测位于HPV16 LCR序列YY1结合位点上游的组织特异性增强子序列对YY1蛋白的启动子P97抑制作用的影响。 方法构建带有不同长度的HPV16野生株、启动子远端YY1位点突变株、启动子近端YY1位点突变株的5′端LCR缺损序列的荧光素酶报导质粒，以及不同长度的近端YY1/SP1重叠结合位点基
PCR技术（十五）：个体配子DNA序列的PCR分析
高等生物遗传图谱的构建依赖于选择性杂交后代的分析或者通过家系分析法来计 算连锁关系。对人类而言仅后者是可行的。使用长度多态性限制片段（RFLPS）在构 建人连锁图谱方面已取得长足的进步。为了对带有与已知表现型相关的RFLP标记的基 因进行定位，首先得建立间隔约10CM的遗传标记束（平均1CM等于1％