circRNA机制研究汇总(一)
文章导读超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制,并于2019年4月5日,将该成果发表在了circulation杂志(IF=18.88)中。在本研究中,作者首先利用生物信息学分析RNA测序数据并结合SE目录,识别与SE相关的circRNAs,并利用qPCR和原位杂交技术检测发现发现circNfix在人类、大鼠和小鼠的成年心脏中过表达。然后通过在心肌梗死(MI)后心肌细胞(CM)中干扰或过表达circNfix,探究其对细胞增殖和心肌修复过程中的作用,并发现下调circNfix能够促进心肌梗死后CM增殖和血管生成,并抑制CM凋亡,减轻心功能障碍,改善预后效果。最后作者利用染色质免疫......阅读全文
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
文章导读 2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
RNA与机体健康研究最新进展一览
【1】Cell:我国科学家揭示环状RNA在先天免疫中起着重要作用 doi:10.1016/j.cell.2019.03.046 在真核生物中,共价闭合的环状RNA(circular RNA, circRNA)是由前体mRNA反向剪接数千个基因的外显子产生的。它们通常低水平表达,并经常表现出细
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(一)
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大
小环状干扰-RNA-(sciRNA)-作为基因沉默的有效治疗平台
为了实现由RNA干扰(RNAi)途径介导的有效的治疗性基因沉默,小干扰RNA (sirna)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定sirna潜力的超rna结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜
又传喜讯云序客户一次测序两项成果影响因子合计10分!
感恩有你,一路同行,新年快乐! 感恩有你,一路同行!2019年伊始,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!一元复始,万象更新!转眼间我们迎来了2019年,站在新时代新的历史起点,回望刚刚过去的2018年,不断创新收获硕果丰盈;展望2019,任重道远却
不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化,作为最新的国
外泌体环状RNA作为结肠ai分子标志物的实例应用
文章导读如今想要短平快靠单纯测序+验证发表一篇5分左右文章,光靠一个热点环状RNA还不够,环状RNA+外泌体,环状RNA+m6A,环状RNA+环状DNA等方向都是可以去尝试的。小编今 天以云序用户以环状RNA+外泌体作为研究方向的案例进行解析。2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers
睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3
总结: 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式,越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用,而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP(云序生物提供此服务)等多种技术联合分析,揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)
双荧光素酶验证
miR 和LncRNA/circRNA/mRNA 结合双荧光素酶验证方案 一、 检测原理全基因合成 miR 潜在结合位点上下游~500bp( LncRNA、circRNA 或 mRNA 的3’UTR)野生形式 WT 及结合位点的突变形式 Mut,克隆到 psiCHECK-2 多克隆位点处
五位大咖在线直播,与您共享多组学如何助力医学研究
2022年2月,南京医科大学杜牧龙等在Molecular Cancer(IF=27.401)发文,全面阐明了外泌体circRNA参与结直肠癌发生的生物学功能。2022年1月,上海交通大学特别研究员林关宁等在Science Advances(IF=14.136)发文,发现了强迫症的重要的风险机制。20
今年我国科学家在CNS上发表的重要研究成果
【1】Cell:我国科学家揭示人FcRn是B族肠道病毒的细胞脱衣壳受体 doi:10.1016/j.cell.2019.04.035 B族肠道病毒(Enterovirus B, EV-B)包括埃可病毒(Echovirus)、柯萨奇病毒B、柯萨奇病毒A9,以及多个新发现的B族肠道病毒血清型。它
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)
研究发现环状RNA限制皮肤癌的转移
一项新的研究发现,一种神秘的遗传物质可以抑制皮肤癌细胞的扩散,但随着它们的成熟,这种物质往往会丢失。这项新研究近日发表在《Cancer Cell》上。通常,DNA被转化成RNA,然后转化成具有细胞功能的蛋白质。虽然大多数RNA是线性分子,但当它们的末端循环并附着时,有些会形成圆圈。 该研究的作
我国学者首次揭示脑胶质瘤免疫微环境形成新机制
日前,山东大学齐鲁医院神经外科教授李刚团队在国际肿瘤学杂志《分子癌症》 在线发表最新研究成果,首次揭示了脑胶质瘤外泌体促进肿瘤免疫微环境形成的新机制,阐明了环状RNA对脑胶质瘤细胞及其免疫抑制微环境的双重作用机制。这也是环状RNA领域首个外泌体相关的非ceRNA机制介导的肿瘤免疫相关研究。肿瘤免疫抑
我国学者首次揭示脑胶质瘤免疫微环境形成新机制
日前,山东大学齐鲁医院神经外科教授李刚团队在国际肿瘤学杂志《分子癌症》 在线发表最新研究成果,首次揭示了脑胶质瘤外泌体促进肿瘤免疫微环境形成的新机制,阐明了环状RNA对脑胶质瘤细胞及其免疫抑制微环境的双重作用机制。这也是环状RNA领域首个外泌体相关的非ceRNA机制介导的肿瘤免疫相关研究。肿瘤免疫抑
2020年自然研究热点外泌体研究
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
空间转录组测序样本准备指南
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)
从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛
当外泌体遇上环状RNA(三)
2. 外泌体circSHKBP1通过调控miR-582-3p/HUR/VEGF过程以及抑 制HSP90降解来促进胃ai发展发表期刊:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.6.29文章链接:Exosomal circSHKBP1 promotes gastric
凝血机制
因常遇见临床凝血功能障碍的病人,拿到他的凝血功能检查报告单,总会回想其凝血机制:想一次,疯一天;看一回,傻一月。不知“医学生”有没同学写过关于凝血功能的文章,以备临床运用或者职业医考试之用。在此,我备好了鲁米那,尝试着写写,万一受到了刺激,就启动自救模式,哇哈哈哈哈哈(持续性应激,间断性发疯中)。
2020年环状RNA高分文章怎么发?
环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,
防治橡胶树割面干涸研究有了新发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514917.shtm近日,中国热带农业科学院橡胶研究所死皮机理与防控团队在橡胶树割面干涸发生机制研究方面取得新进展,解析了橡胶树割面干涸发生的ceRNA(竞争性内源RNA)调控网络,进一步增进了对橡胶树
非编码RNA调控骨骼肌发育研究取得进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508336.shtm骨骼肌约占成年动物体重的45%~60%,是维持动物运动和代谢功能的重要组织。经济动物骨骼肌纤维的数量和质量直接影响了产肉能力和肉品质,决定了动物的经济价值。动物肌纤维数量在胚胎期基本固
Molecular-Cancer:环状RNA通过经典信号通路抑制肿瘤进展
环状RNA(circRNAs)以单链和共价闭环结构为特征,通常由preRNAs的外显子反向剪接而成。以前,circRNA被认为是低丰度剪接错误的副产品。然而,通过深入的RNA测序和生物信息学,circRNAs已被证明广泛存在于转录本中。大量证据表明,环状RNA(circRNAs)在肿瘤的发生发展
环状RNA研究的方法及功能作用(一)
环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路,认识圆圈重塑
2020年自然研究热点外泌体研究
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
水生所非编码RNA分子机制研究取得进展
非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学
云序生物环状RNA研究文章汇总
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达