circRNA机制研究汇总（一）
文章导读超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子，但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此，作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能，并探究了其调节心脏重塑的分子机制，并于2019年4月5日，将该成果发表在了circulation杂志（IF=18.88）中。在本研究中，作者首先利用生物信息学分析RNA测序数据并结合SE目录，识别与SE相关的circRNAs，并利用qPCR和原位杂交技术检测发现发现circNfix在人类、大鼠和小鼠的成年心脏中过表达。然后通过在心肌梗死(MI)后心肌细胞(CM)中干扰或过表达circNfix，探究其对细胞增殖和心肌修复过程中的作用，并发现下调circNfix能够促进心肌梗死后CM增殖和血管生成，并抑制CM凋亡，减轻心功能障碍，改善预后效果。最后作者利用染色质免疫......阅读全文
【客户成果】外泌体circRNA－PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究，近期，其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路，促进癌细胞侵袭。进一步研究发现，病人血浆外泌体中circ-PDE8A
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
文章导读：在非编码RNA的大家族中，环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环，所以在生物体中具有稳定性高，不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制，现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作
中山大学Blood封面文章：circRNA对翻译进程的正调控作用
2012年以前，经典教科书和主流观点里，RNA还是线性的，主要有这3类RNA：mRNA、tRNA和rRNA，但随着时间的推进，研究的深入，越来越多的RNA被发现，除了本世纪初备受关注的miRNAs，snRNA，siRNA，LncRNA，还有近年来研究最火热的环状RNA（circRNA），与其它
环状RNA结合功能蛋白！找对方向20分文章水到渠成
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转
环状RNA结合功能蛋白！找对方向20分文章水到渠成
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转
环状RNA，飞速发展的新前沿
生物学家们几十年前就知道存在一种不寻常的分子，环状RNA（circRNA）。与线性RNA相比，circRNA受到的关注比较少，也比较难于研究。举例来说，circRNA很难与其它RNA区分开，扩增或片段化会破坏RNA环，而且早期RNA测序的分析算法会过滤掉circRNA的标志性序列。因为技术和方法
中科院Cell子刊发表lncRNA新发现
生物通报道：长非编码RNA（lncRNA）是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子，来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质，但它们在不同组织和发育阶段特异性表达。研究者们普遍认为lncRNA具有重要的生物学意义，但对它们的具体功能还知之甚少。 中科院上海生命科学研究院生物化
circRNA抑制由DNA感受器cGAS介导的长期造血干细胞耗竭
中科院生物物理研究所的范祖森教授课题组主要从事肿瘤干细胞、免疫细胞发育分化及肿瘤靶标发现与肿瘤个体化治疗等领域的研究，近期其团队利用Arraystar Mouse CircRNA Array研究了小鼠骨髓细胞（BM）中分离的长期造血干细胞（LT-HSCs）和多能干细胞（MPPs）的circRN
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点，大部分的研究人员在立项之初，通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析，获得了合适的研究对象，但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因：1. 找错了转录本；2. ncRN
CircRNA422通过SP7/LRP5轴促进骨髓间充质干细胞早期成骨分化
环状RNA(CircRNAs)在干细胞的增殖、自我更新和成骨分化等生物学活动中发挥重要作用。与其他线性RNA相比，CircRNA由于其共价封闭结构，在细胞和组织中具有高度的稳定性和独特的构象。 目前，研究最多的是线性RNA(miR-21、antimR-138或siMIR31HG)，它们被组装在
结直肠癌的新型生物标志物和治疗靶点
环状RNA（circRNA）等非编码RNA在人体内大量存在，影响着各种疾病的发生和发展。然而，circRNAs在结直肠癌（CRC）中的生物学功能在很大程度上是未知的。 2021年6月1日，徐州医科大学宋军及王人颢共同通讯在Molecular Cancer（IF=15.30） 在线发表题为“Th
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
中外学者Nature子刊发文：环状RNA翻译出抑癌蛋白质！
由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现：使用翻译组测序技术，在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA（circRNA），其中320个有差异表达现象，并具体验证了一种名为LINC-PINT的环状RNA可编码长度为87个氨基酸的蛋白质PINT87aa。 近
超越mRNA疫苗？北大开发可应对新冠突变株的环状RNA疫苗
2020年初，新冠病毒（SARS-CoV-2）导致的肺炎疫情开始在全球大流行，并一直延续至今。遗憾的是，直到今天，新冠疫情的形势仍然非常严峻。据世界卫生组织（WHO）报告，截至目前全世界范围内超过1.8亿人被感染，累计死亡人数接近400万。 值得注意的是，随着新冠病毒在全球范围内的广泛传播，新
新蛋白AXIN1295aa激活Wnt/βcatenin信号通路促进胃癌进展
环状RNA(CircRNAs)是一类具有共价闭环结构的转录本。它们没有5‘到3’的极性或Polya尾巴。大多数CircRNA是由外显子的后向剪接产生的，这是一种非规范的剪接过程。CircRNA以组织特异性、发育阶段特异性和疾病特异性的方式表达。它们被认为是微RNA海绵、转录调节剂和介导蛋白质相互
新蛋白AXIN1295aa激活Wnt/βcatenin信号通路促进胃癌进展
环状RNA(CircRNAs)是一类具有共价闭环结构的转录本。它们没有5‘到3’的极性或Polya尾巴。大多数CircRNA是由外显子的后向剪接产生的，这是一种非规范的剪接过程。CircRNA以组织特异性、发育阶段特异性和疾病特异性的方式表达。它们被认为是微RNA海绵、转录调节剂和介导蛋白质相互
复旦大学Nature子刊发布环状RNA重要发现
来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员借助分析环状RNA，揭示出了丰富的circHIPK3通过像海绵般结合多种miRNAs调控了细胞生长。这一重要的研究发现发布在4月6日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 复旦大学的黄胜林（Shenglin Huang）研
EB病毒阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤进展
EB病毒(Epstein-Barr virus，EBV)是淋巴瘤的重要致病因子，与弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的临床转归密切相关。环状RNA(CircRNAs)在淋巴瘤的发展过程中起着重要作用。然而，CircRNA在与EBV相关的DLBCL进展中的潜在机制仍然很大程度上是未知的。 本研究
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一：非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
环状RNA在肠道干细胞自我更新中的重要作用
肠道是食物消化和吸收的主要场所，由单层上皮细胞形成肠上皮屏障。除了上皮细胞，肠道中还有大量的免疫细胞。即使在成体稳态（homeostasis）条件下，肠上皮仍经历着快速的自我更新，在小鼠中大约5天可以更新一次【1】。定位于肠道隐窝中的干细胞可以分化为肠道中所有的上皮细胞类型【2】。肠干细胞的自我
2020年自然研究热点——外泌体研究（二）
2.外泌体获批项目中的热点分子由于外泌体的主要功能被认为是细胞之间的信息传递，了解它带有的蛋白质和多种RNA上的信息就变得尤其重要。2019年外泌体中标项目中带有热门话题miRNA、lncRNA和环状RNA的项目数量如下图（图4）所示。我们可以看到，外泌体中的miRNA和lncRNA过去研究的是比
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花？
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell
IGF2BP3的蛋白诱饵，调控MYC和SNAIL的表达，抑制胃癌的转移
胃癌(Gastric cancer, GC)仍是我国最常见的胃肠道恶性肿瘤，肿瘤转移是预后不良的主要原因。环状rna (circrna)是一种具有重要调控作用的有趣的非编码rna。然而，circrna在胃癌转移中的作用尚未完全阐明。在这里，作者报道了与匹配的非癌组织相比，在103对GC组织中ci
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA
来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称，他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA（circRNAs），将之命名为外显子-内含子circRNAs（EIciRNAs）。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
肉鸡胫骨软骨发育不良研究取得新进展
肉鸡是提供禽肉产品的重要经济动物。近年来，集约化养殖模式在不断发展数量、产量以及出栏速度的过程中，由于增重速度过快及饲养空间的限制，导致肉鸡胫骨软骨发育不良（TD）的发病率大幅度增加。据统计，TD在世界范围内发病率可达10%-30%，由于其多表现为亚临床症状而常被忽视。TD不仅抑制肉鸡生长，还
CircEIF4G3或可成为判断胃癌预后的生物标志物和治疗靶点
胃癌是全球第五大常见癌症，也是癌症相关死亡的第三大原因。尽管有了很大的改善，但胃癌的早期诊断率、根治性切除率和五年生存率仍不尽如人意。因此，迫切需要寻找更有效的生物标志物和治疗靶点用于GC的诊断和治疗。 越来越多的研究表明，环状RNA(CircRNAs)是癌症发生和发展的关键调节因子。然而，C