小环状干扰RNA(sciRNA)作为基因沉默的有效治疗平台
为了实现由RNA干扰(RNAi)途径介导的有效的治疗性基因沉默,小干扰RNA (sirna)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定sirna潜力的超rna结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜力作为生物标志物和疾病靶点,环状RNA模拟正在被探索用于治疗。 本文报道了小环状干扰rna (sciRNAs)的合成和评价。为了合成scirna,将三价n -乙酰半乳糖胺(GalNAc)配体功能化并经click化学环化的sense链退火成反义链。这一策略用于small circles的合成,但也可以用于合成更大的环状RNA模拟物。作者在体内和体外评估了各种sciRNA设计。作者观察到在循环和脱靶效应被消除后,感觉链的代谢稳定性得到了改善。反义链的5 -(E)-乙烯基膦酸酯修饰导致galna -scirna在治疗相关剂量的......阅读全文
小环状干扰-RNA-(sciRNA)-作为基因沉默的有效治疗平台
为了实现由RNA干扰(RNAi)途径介导的有效的治疗性基因沉默,小干扰RNA (sirna)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定sirna潜力的超rna结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜
小干扰RNA转录后基因沉默的介绍
siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰 实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使
基因敲除,rna干扰,基因沉默有什么关系
基因敲除一般指永久的、不可逆转的敲除/失活靶基因,目前其中一种热门的,常见的基因敲除方法是CRISPR/Cas9,利用gRNA靶向靶基因并指导cas9切割基因双链,形成移码突变或片段敲除来完成基因敲除。基因沉默与基因敲除不同的地方在于,沉默可以是暂时性的、可逆转的失活基因/抑制基因表达,基因可以是存
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
关于小干扰RNA的简介
小干扰RNA(siRNA),有时称为短干扰RNA或沉默RNA,是一类双链RNA分子,长度为20-25个碱基对,类似于miRNA,并且在RNA干扰(RNAi)途径内操作。它干扰了表达与互补的核苷酸序列的特定基因的转录后降解的mRNA,从而防止翻译。 siRNA由双链RNA (double str
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体 DNA 模板 试剂、试剂盒d
RNA介导的基因沉默实验
实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c
关于小干扰RNA的结构介绍
siRNA具有明确定义的结构:具有磷酸化5'末端的短(通常20至24bp)双链RNA(dsRNA)和具有两个突出核苷酸的羟基化3'末端。该切酶酶催化生产的siRNA由长的dsRNA和小发夹RNA。siRNA也可以通过转染引入细胞。由于原则上任何基因都可以被具有互补序列的合成siR
关于小干扰RNA的发现介绍
siRNA最早是由英国的大卫·包孔博(David Baulcombe)团队发现,是植物中的转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing;PTGS)现象的一部分,其研究结果发表于《科学》。2001年,汤玛士·涂许尔(Thomas Tuschl)团队发现合成
关于小干扰RNA的基本介绍
小干扰RNA(Small interfering RNA;siRNA)有时称为短干扰RNA(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),是一个长20到25个核苷酸的双股RNA,在生物学上有许多不同的用途。已知siRNA主要参与RNA干扰(RNAi)现象
小干扰RNA的概念和作用
在后生生物中,由Dicer产生的小干扰RNA(siRNA)被整合到称为RNA诱导沉默复合物(RISC)。该复合物含有内切核酸酶,切割与siRNA结合的完全互补的mRNA,产生的片段然后被核酸外切酶降解。 siRNA通常用于实验室细胞培养中阻断基因的功能。SiRNA被认为是病毒先天免疫系统的一部分,可
关于小干扰RNA的siRNA设计介绍
最初,siRNA序列的选择是基于实验经验而获得的(Elbashir et al. 2001,2002)。最近,生物信息学工具被用来设计siRNA(表18-1),目前多个数据库收录了经过实验确证的siRNA和shRNA。值得推荐的是,在设计新的siRNA之前可以通过搜索已有的siRNA数据库和科研
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
首款小干扰RNA药物-能干扰RNA的“信使”功能
美国食品和药物管理局日前批准首款小干扰RNA药物,用于治疗患有遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性的成年患者。 小干扰RNA是一段微小的RNA分子,能干扰RNA的“信使”功能,导致致病基因“沉默”,相关蛋白质无法合成。新获批的Onpattro是第一款利用这一机理研制的药物。 遗传性转甲状腺素
RNA沉默的分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类:以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS);以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(trans
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
RNA-沉默的概念
RNA 沉默(RNA silencing)或基因沉默(gene silencing)是广泛存在于植物、动物、线虫和真菌等真核生中的一种高度保守的、序列特异的 RNA 降解机制. RNA 沉默对于调控发育、维持基因组的稳定性以响应生物和非生物胁迫等具有重要作用.
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
简述RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必
RNA干扰用于肿瘤病的治疗
肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种dsR
基因敲除与RNA干扰的关系
20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这个方法在当年来说,存
中国科大在小干扰RNA领域获进展
近日,中国科学技术大学生命科学学院及中国科学院分子细胞科学卓越创新中心教授光寿红课题组在小干扰RNA领域取得突破性进展,研究成果以RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi p
RNA沉默的功能作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录;而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉默
RNA沉默的应用特点
RNA 沉默(RNA silencing)或基因沉默(gene silencing)是广泛存在于植物、动物、线虫和真菌等真核生中的一种高度保守的、序列特异的 RNA 降解机制. RNA 沉默对于调控发育、维持基因组的稳定性以响应生物和非生物胁迫等具有重要作用.
简述RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RN