circRNA机制研究汇总（二）
结合蛋白：（2）CircNfix与Ybx1结合并促进其降解：circNfix和对照组的蛋白质谱分析（A）。采用Ybx1、Nedd4l或阴性IgG抗体进行RIP实验（云序生物提供该服务）（B）。P0 CMs中过表达circNfix后Ybx1蛋白表达水平（C-D）。qRT-PCR检测P0 CMs中Ybx1 mRNA表达水平（E）。RNA FISH在P0 CMs中过表达和不表达circNfix时， circNfix和Ybx1的亚细胞共定位（F）。分馏实验表明，circNfix过表达促进了Ybx1在细胞质中的易位，增加了Ybx1在细胞质中的降解（G）。在circNfix和Ybx1干扰后，细胞周期蛋白A2和细胞周期蛋白B1的表达水平（H）。ChIP-qPCR（云序生物提供该服务）检测显示，cyclin A2和cyclin B1启动子中Ybx1结合位点扩增（I）。细胞裂解物用抗Ybx1抗体免疫沉淀，用泛素(Ub)特异性抗......阅读全文
环状RNA研究深度剖析（一）
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀青年基金，两
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀
2018国自然研究热点一：环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀
揭示登革热媒介白纹伊蚊环状RNA的功能和机制
近日，南方医科大学公共卫生学院/热带医学研究所教授顾金保团队研究揭示了登革热媒介白纹伊蚊circRNA（circular RNA，环状RNA）的功能和机制。相关研究论文发表于PLoS Pathogens。白纹伊蚊是一种传播疾病的蚊子，它是多种病毒的媒介。白纹伊蚊是登革病毒主要的传播媒介，其种群在全球
环状RNA（circRNA）功能研究又一利器——过表达载体
circRNAs 环状 RNA（circular RNAs,circRNA）是一类具有闭合环状结构的 RNA 分子，早在 20 世纪八十年代即有研究报道，但由于其表达丰度低，文献报道较少，一直被认为是 RNA 转录剪切的罕见错误而被忽视。直到 2012 年开始有研究者开始大批量鉴定 circRN
全转录组测序的“一箭三雕”：circRNA，lncRNA，mRNA
1. 文章主题：环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊：Journal of pathology影响因子：5.942发表时间：201906实验方法：全转录组测序实验样本：结直肠癌组织肝转移是结直肠癌（CRC）患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模
CircRNAmiRNAmRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症
大多数非蛋白质编码的RNA被鉴定为具有参与细胞内稳态的多种功能。环状RNA(CircRNAs)是一种非编码转录本，在许多生理和病理状态的发生和发展中起着关键作用。高通量RNA测序和生物信息学工具的进步帮助我们确定了几条CircRNA调控途径，其中之一就是microRNA(MiRNA)介导的调控。
circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点
东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化，释放相关炎性因子和纤维化因子，继而影响矽肺纤
circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点
东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化，释放相关炎性因子和纤维化因子，继而影响矽肺纤
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用（二）
4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示，circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊：Aging-us影响因子：4.831发表时间：2020.9.10研究方法：全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接：Pr
科研人员搭建首个跨物种、跨组织的衰老相关环状RNA数据库
环状RNA（circRNA）是一类单链、闭合环状的RNA分子，由mRNA前体通过反向剪切环化产生。相较于常规的线性RNA，circRNA有着独特的结构特点，其不具备5'端帽和3'端poly(A)尾结构，也不存在游离末端，因此不易被核酸外切酶降解，从而比线性RNA更加稳定。circ
科研人员搭建首个跨物种、跨组织的衰老相关环状RNA数据库
环状RNA（circRNA）是一类单链、闭合环状的RNA分子，由mRNA前体通过反向剪切环化产生。相较于常规的线性RNA，circRNA有着独特的结构特点，其不具备5'端帽和3'端poly(A)尾结构，也不存在游离末端，因此不易被核酸外切酶降解，从而比线性RNA更加稳定。circ
Nat－Neurosci－∣－环状RNA或可成为阿尔兹海默症的临床新指标
阿尔茨海默症（Alzheimer’s disease，AD）是世界卫生组织公认的全球公共卫生重点。AD是一种由多种原因引起的、不可逆转的神经退行性疾病，是痴呆中最常见的一种类型，主要表现为进行性记忆丧失、认知功能障碍、注意力散漫、情感障碍、人格变化等特点，在疾病的最后阶段，患者表现为卧床不起，需
重庆医科大学利用lncRNA芯片和circRNA芯片来研究膀胱癌
重庆医科大学基础医学院的陈俊霞教授主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期，该课题组和西南医科大学田强教授课题组合作应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌组织的非编码RNAs表达情况，同时筛选到一批可预测膀胱癌发生和复发的分子标志物，并阐明了lnc
环状RNA研究深度剖析（二）
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR：挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验，检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。（AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白） b RNA pull down：对上述circRNA进行RNA pull down实验，拉
circRNA研究揭示矽肺炎症和肺纤维化的干预靶点
东南大学医学院巢杰教授课题组主要研究方向为肺炎和肺纤维化的机理机制的研究。该课题组利用Arraystar CircRNA芯片研究发现circRNA circHECTD1通过HECTD1/ZC3H12A依赖的泛素化介导SiO2诱导的矽肺中巨噬细胞活化，释放相关炎性因子和纤维化因子，继而影响矽肺纤维化的
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复
作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期，其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查，发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
外泌体circRNA－PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究，近期，其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路，促进癌细胞侵袭。进一步研究发现，病人血浆外泌体中circ-PDE8A
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2
3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析，文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系，统计发现表达高的基因分组中，受m6A修饰的基因比例也更高。4）甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达，发现在高度近视白内障患者中甲基
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
在非编码RNA的大家族中，环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环，所以在生物体中具有稳定性高，不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制，现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章，影响因子高达7.8分! 文章导读： 在非编码RNA的大家族中，环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环，所以在生物体中具有稳定性高，不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m
外泌体circRNA－PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭研究
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究，近期，其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路，促进癌细胞侵袭。进一步研究发现，病人血浆外泌体中circ-PDE8A显著高
circRNA抑制由DNA感受器cGAS介导的长期造血干细胞耗竭
中科院生物物理研究所的范祖森教授课题组主要从事肿瘤干细胞、免疫细胞发育分化及肿瘤靶标发现与肿瘤个体化治疗等领域的研究，近期其团队利用Arraystar Mouse CircRNA Array研究了小鼠骨髓细胞（BM）中分离的长期造血干细胞（LT-HSCs）和多能干细胞（MPPs）的circRN
circRNA抑制由DNA感受器cGAS介导的长期造血干细胞耗竭
中科院生物物理研究所的范祖森教授课题组主要从事肿瘤干细胞、免疫细胞发育分化及肿瘤靶标发现与肿瘤个体化治疗等领域的研究，近期其团队利用Arraystar Mouse CircRNA Array研究了小鼠骨髓细胞（BM）中分离的长期造血干细胞（LT-HSCs）和多能干细胞（MPPs）的circRNAs表
circRNA抑制由DNA感受器cGAS介导的长期造血干细胞耗竭
中科院生物物理研究所的范祖森教授课题组主要从事肿瘤干细胞、免疫细胞发育分化及肿瘤靶标发现与肿瘤个体化治疗等领域的研究，近期其团队利用Arraystar Mouse CircRNA Array研究了小鼠骨髓细胞（BM）中分离的长期造血干细胞（LT-HSCs）和多能干细胞（MPPs）的circRNAs表
结直肠癌中的CircRNA：潜在的生物标志物和治疗靶点
在全球范围内,结直肠癌(CRC)是第三大最常见的癌症,也是癌症相关死亡的第二大原因。最近的估计表明,2020年发生了超过190万新病例和93,000例与CRC相关的死亡,约占所有癌症病例的10%,占与癌症相关的死亡的9.4%。 早期发现结直肠癌有助于将发病率和死亡率降至最低；然而,由于缺乏明显