转录组+蛋白组联合，揭示microRNA调控靶点与功能机制一
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时，miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是，miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能，该研究构建了miR-137 KO动物，并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功能的损伤进行了评价。借助于转录组+蛋白组联合分析，研究者进一步鉴定出phosphodiesterase 10a(Pde10a)是miR-137的重要调控靶点。文献小笔记Partial loss of psychiatric risk gene Mir137 in mice causes repetitive behavior and impairs sociability and learning via increased Pde10aNature Neuroscience IF=19.912原文链接：h......阅读全文
科学家揭示细胞更新转录调控新机制
中国科学技术大学教授刘行、姚雪彪，研究员王志凯合作，发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制，以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。9月13日，相关研究成果在线发表于《细胞报告》。细胞更新是生命的源泉，其质量控制是个体发育与生命健康的基础。细
科学家揭示水稻转录因子高产抗病调控机制
近日，《科学》在线发表了四川农业大学陈学伟团队、中科院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队及美国加州大学戴维斯分校Pamela Ronald团队合作在水稻产量与抗病协同调控机制研究领域取得的最新进展，揭示了水稻理想株型建成的关键基因IPA1既能提高产量又能提高稻瘟病抗性的调控新机制。 高产抗病
分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制
近期，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上，发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a
遗传所在植物microRNA生物生成机制研究中获进展
MicroRNA(miRNA)是一类真核生物中广泛存在的内源非编码小分子RNA。它主要通过碱基互补配对的形式在转录后水平上负调控靶mRNA，从而广泛地参与动植物各种生物学过程的调控。在植物miRNA生成通路中一些主要因子的功能已经被鉴定，其中Dicer-Like 1(DCL1)是主要负责切割
戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制
microRNA（miRNA）是一类长约21个核苷酸的内源小RNA，它们从其前体（primary miRNA, pri-miRNA）在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生，与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因
戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制
microRNA（miRNA）是一类长约21个核苷酸的内源小RNA，它们从其前体（primary miRNA, pri-miRNA）在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生，与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因表达。叶绿体
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
2019年5月2日，Cell杂志报道了美国休斯敦贝勒医学院研究人员利用基因、转录、蛋白及翻译后修饰等多组学技术，对结肠癌/癌旁组织进行了系统、全面的分析，整合多组学结果为后续癌症治疗方案提供了新思路，同时也为生物标志物筛选、药物靶点、分子分型等研究工作奠定理论基础。实验背景结肠癌是世界上死亡率排名第
高通量解析骨质疏松非编码易感变异被揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517668.shtm西安交通大学生命科学与技术学院杨铁林教授团队开发了一个增强子调控网络打分方法，鉴定了33个显著富集的转录因子，并发现这些转录因子显著富集到转录激活和骨代谢相关分子通路。近日该研究成果发
研究揭示抗衰老靶点
根据最近发表在《Nature》杂志上的一项研究，两个保守的表观遗传调控因子可能是新型的抗衰老靶标。这项研究由中国科学院神经科学研究所脑科学与智能技术卓越中心蔡时青博士以及中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌博士合作完成。通过使用多种方法和系统，作者确定了保守的衰老负向调节因子，从而为如何实现健康衰老
学者提出参与香蕉冷胁迫响应的级联工作模型
中国科学院华南植物园果蔬保鲜技术研发与利用团队在国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的资助下，在由microRNA介导的香蕉冷胁迫响应级联调控方面取得新进展。近日，相关成果发表于《分子园艺》（Molecular Horticulture）。 防控冷害一直是水果保鲜产业的技术难题，而解析冷
北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能
4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
双荧光素酶报告基因检测（二）
双荧光素酶报告基因检测（二）双荧光素酶实验通常被用来评估miRNA是否与其潜在的靶基因发生相互作用。实验中，预测的miRNA靶标基因的3’-UTR序列被克隆到含有萤火虫荧光素酶的报告基因载体的3’-UTR位置。如果miRNA与插入到质粒中的目标序列发生结合，miRNA将通过抑制该序列的翻译来降低萤火
代谢调控血栓形成的新机制和治疗新靶点
上海交通大学医学院刘俊岭课题组与孙海鹏课题组合作首次将支链氨基酸（BCAA）代谢与血小板功能和血栓风险建立紧密联系，揭示了一个全新的BCAA代谢调控血小板活化和血栓形成的机制。3月23日，该成果发表于《血液循环》。 由于摄入BCAA被广泛用于专业运动员和运动人士增肌营养物，BCAA注射剂被用于
分子植物卓越中心揭示抗铝毒转录因子调控机制
10月21日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zin
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
原文： Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities 原文链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/
科学家揭示内含子来源环形RNA新分子及转录调控功能机制
9月27日，国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文，发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子，揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知，人类基因组中存
miR285pIL34巨噬细胞反馈回路调节肝癌转移
周俭教授揭示肝癌转移新机制复旦大学（附属中山医院）肝癌研究所周俭教授研究团队在2016年5月正式发表《Hepatology》（肝脏病学）杂志的文章"miR-28-5p-IL-34-Macrophage Feedback Loop Modulates Hepatocellular Carcinoma
双萤光素酶报告基因检测
萤光素酶报告基因系统广泛应用于真核生物基因表达和细胞生理学研究，包括受体活性、转录因子、细胞信号转导、mRNA加工和蛋白质折叠等。萤光素酶是理想的报告基因，因为哺乳动物细胞中不含内源性萤光素酶，一旦转录完成立刻就生成功能性的萤光素酶。单萤光素酶报告基因实验往往会受到各种实验条件的影响，而双萤光素
金黄色葡萄球菌一氧化氮合成酶NOS调控万古霉素耐药性
金黄色葡萄球菌是人类重要机会性致病细菌，由甲氧西林耐药性金黄色葡萄球菌（MRSA）引发的感染正严重威胁公共健康安全。万古霉素被认为是临床上治疗严重MRSA感染的最后一道防线，其中度耐药性菌（VISA）的频繁出现，为MRSA的感染治疗带来了巨大挑战。 一氧化氮（NO）可由一氧化氮合成酶（NOS）
动物所揭示靶基因Windpipe对果蝇肠道稳态的调控机制
肠道稳态维持是通过肠干细胞的增殖分化实现的。由于外界病原微生物感染，饮食等环境压力，肠道上皮细胞不断受损，肠干细胞通过自我更新、增殖和分化来维持肠道上皮的完整性。果蝇中肠系统是研究干细胞和组织稳态的重要模型。其稳态受到多种信号通路的综合调控，包括Notch、JAK/STAT、Wnt等。然而，这些
上海生科院首次揭示一条新lncRNA调控MYC转录的新机制
3月25日，国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-ran
研究人员揭示组织驻留与肿瘤浸润CD8+－T细胞转录调控机制
2019年9月17日，梅奥诊所（Mayo Clinic）的孙杰团队在Immunity 期刊上发表了题为“The transcription factor Bhlhe40 programs mitochondrial regulation of resident CD8+ T cell fitne
研究人员揭示组织驻留与肿瘤浸润CD8+－T细胞转录调控机制
2019年9月17日，梅奥诊所（Mayo Clinic）的孙杰团队在Immunity 期刊上发表了题为“The transcription factor Bhlhe40 programs mitochondrial regulation of resident CD8+ T cell fitne
上海生科院发现甲状腺激素调控骨骼肌肌纤维类型的新机制
12月15日，中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所应浩研究组在The Journal of Cell Biology 杂志上在线发表了题为Thyroid hormone regulates muscle fiber type conversion via miR-133a1 的研究论文。该
张余课题组揭示细菌Class－III转录激活机制
9月28日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上，在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文，主要研究细菌
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示新的治疗策略
近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Can
生物物理所揭示EBV致癌蛋白组装与激活机制
7月11日，中国科学院生物物理研究所高璞、高光侠、张立国合作团队，在《细胞》（Cell）上发表了题为Assembly and activation of EBV latent membrane protein 1的研究论文。该研究报道了EBV（Epstein-Barr Virus）关键致癌蛋白潜伏期
研究揭示转录因子MYC2调控玉米抗虫响应机制
茉莉酸是重要的植物激素，在植物响应昆虫取食的过程中发挥着重要的作用，而MYC2是茉莉酸信号转导途径中关键的转录因子。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员吴建强团队通过遗传学、生物化学、分子生物学和生物信息学手段，确定了玉米MYC2在茉莉酸介导的抗虫防御响应过程中的功能。该研究在线发表在《植物学报》。
杨树次生木质部发育转录调控新机制获揭示
近日，林木遗传育种国家重点实验室（东北林业大学）李伟研究组在《新植物学家》（New Phytologist）上在线发表研究论文。该研究发现了调控杨树次生木质部发育的“PtrMYB074-PtrWRKY19-PtrbHLH186”分子模块，揭示了木材形成过程中转录因子（TF）TF-DNA和TF-TF相
帕金森病靶点Nurr1转录激活的结构基础揭示
Nurr1单体晶体结构（左）和Nurr1-RXRα别构调控的模型（右）；左图两种颜色代表晶体里发现的两种构象，右图A为Nurr1-RXRα结合DNA的模型。课题组 供图 近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘劲松课题组揭示帕金森病靶点Nurr1以及Nurr1-RXRα别构激活的结构基础