ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（二）
案例解析案例1：ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊：Nature Materials 影响因子：39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成，通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况，发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库，建立了疾病预测分析模型，结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关（P＜0.001）。与此同时，作者还构建了诊断结果预测模型，该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物（P＜0.001）。......阅读全文
焦磷酸测序在甲基化分析中的应用
DNA甲基化是近年来研究的热点，因为越来越多的证据表明，它参与了胚胎发育、基因印迹等过程。同时，它在疾病发展中也起着举足轻重的作用。甲基化状态的改变被认为是引起癌症的一个重要因素，这种变化包括基因组整体甲基化水平的降低和CpG岛局部甲基化水平的异常升高，从而导致基因组的不稳定(如染色体的不稳定、
全基因组测序解读重要甲基化机制
DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列，可一旦它与组蛋白包装形成染色质，情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种，分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默，要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化)，能够影响它对基因的控制。 H3K4me3是
IVD这个细分领域未来市场容量或达200亿
2017年6月，世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出了2017年度全球十大新兴技术榜单，其中肿瘤的无创诊断技术成功入选并荣膺榜首。肿瘤无创诊断技术即液体活检（liquid biopsies）的出现，标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。与传统的组织活检相比，液体活检具备实时
基于循环肿瘤DNA甲基化特征的结外NK/T细胞淋巴瘤诊断预测模型
结外NK/T细胞淋巴瘤（ENKTL）是非霍奇金淋巴瘤的一种少见亚型，多数病例发生在鼻腔和咽喉部以上部位，又称鼻型NK/T细胞淋巴瘤。ENKTL的诊断依赖于病理学检查，然而坏死组织的存在以及发病部位的解剖学复杂性为病理采样带来了挑战。目前临床使用Ann Arbor分期标准和NK/T细胞淋巴瘤预后指
PCB失效分析案例及方法（二）
裂纹产生的机理：由于热胀冷缩原理，PCB板在回流焊和波峰焊时受高温膨胀，由于PCB板材的选择与表面处理工艺不匹配，板材便会给孔环一个向上的应力，将孔环向上顶起，造成孔环发生向两边翘起的形变，导致孔环出现裂纹。改善方案：①更换CTE更小的板材；②更换表面处理工艺。③ PTH孔电化学腐蚀失效2017年，
cfDNA甲基化检测在乳腺癌诊断方面甚至超过乳腺钼靶？
乳腺钼靶检查是最常用的乳腺癌筛查手段之一，但亚洲女性乳腺腺体致密，严重限制了其发现乳腺癌的灵敏度。血浆游离核酸（cfDNA）甲基化检测有望弥补乳腺钼靶检查的不足。记者10月12日从哈尔滨医科大学附属肿瘤医院获悉，该院庞达教授团队近期在Nature子刊《npj Breast Cancer》上发表了
从被基因测序拯救的儿童案例－看测序技术的商业化趋势
第一例被基因测序拯救的儿童Nic Volker是世界上第一例被基因测序拯救的人，他喜欢瑜伽、巨轮卡车、游泳、乡村音乐和西部歌曲。 “每次跌倒我都爬起来。” 这句话对于将满11岁的Nic来说具有特殊的意义：他患有癫痫症，这会使他毫无预兆地失去肌肉张力，往往一天有100次之多。如果发作时他站着，
临床质谱中美大咖汇聚第二届中美检验大师论坛
2017年11月3日~4日，由中国医药教育协会主办, 中华医学会检验医学分会、美国临床化学学会（AACC）联合学术主持的第二届中美检验大师论坛（The Best of AACC China）在上海隆重举行。会议以“全面、快速、精准”为主题，旨在将AACC学术年会的最前沿科学报告和最新研究进展分享
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例： **案例一：乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析，发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群，这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
单细胞测序数据分析中的应用案例
以下是一些深度学习方法在单细胞测序数据分析中的应用案例： 1. 细胞类型分类 - 研究人员使用深度学习算法，如卷积神经网络（CNN），对单细胞测序数据进行分析，以准确地识别和分类不同的细胞类型。例如，通过训练模型学习不同细胞类型的基因表达特征，从而能够对新的单细胞数据进行快速准确的分类。
二羟丙茶碱的检查方法
酸碱度取本品0.50g,加水10ml使溶解,加溴麝香草酚蓝指示液5滴,应显黄色或绿色;再加氢氧化钠滴定液(0.02mol/L)0.20m,应显蓝色。溶液的澄清度与颜色取本品1.0g,加水10ml,振摇使溶解,溶液应澄清无色;如显色,与黄色或黄绿色1号标准比色液(通则0901第一法)比较,不得更深。氯
简述二羟丙茶碱的性状
白色粉末或颗粒；无臭，味苦。 在水中易溶，在乙醇中微溶，在三氯甲烷或乙醚中极微溶解 熔点为160～164℃。 吸收系数 取本品，精密称定，加水溶解并定量稀释制成每1ml中约含10μg的溶液，照紫外－可见分光光度法，在273nm的波长处测定吸光度，吸收系数（）为354～376。
重磅！ctDNA检测纳入医保，跨界推进数据共享
医疗保险机构Palmetto最近宣布已将体细胞变异ctDNA分析测试纳入其保险范围。“我们应该鼓励各大临床实验室向ClinVar提交体细胞变异检查报告以及有关的临床表型分析结果。”Palmetto说。ClinVar是一家免费基因型和表型数据供应机构，由NIH于3年前创立。迄今为止，已经有超过50
表观遗传之DNA甲基化（二）
二 DNA甲基化 DNA甲基化：DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的，从而产生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在体细胞中，几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC，而在胚胎干（ES）细胞中，在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和
专访张鹍教授：从“不被信任”到突破传统，改写癌症早筛
本月，《Nature Genetics》杂志上一篇与高通量甲基化无创检测新技术相关的文章受到了国内外媒体的关注。 这项技术由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）生物工程系张鹍教授及其团队开发，不仅可以检测癌症，还能确定肿瘤在体内的生长位置，为癌症早期诊断提供了新方向。这项技术的核心是肿瘤ctDNA液
气体透过率测定仪VACV2的检测案例分享
Labthink兰光VAC-V2气体透过率测试仪，又可称为压差法气体渗透仪、透气仪、透气性测试仪、透气率测试仪等，是各行业企事业单位进行材料透气性能检测研究的必备设备。VAC-V2基于压差法的测试原理，是一款专业用于薄膜试样的气体透过率测试仪，适用于塑料薄膜、复合膜、高阻隔材料、片材、金属箔片、橡胶
织物透气性测试仪织物透气仪的检测案例分享
以下跟大家分享一个TQD-G1设备的制衣用织物透气度检测案例！ 制衣用织物的透气度检测： 测试样品：某品牌制衣用织物材料。 参考标准：GB/T 5453-1997 《纺织品织物透气性的测定》 试验设备：TQD-G1织物透气性测试仪（织物透气仪） 透气度检测过程：从织物样品表面裁取直径为12
高校实验室装修案例分享：装修、电器、暖通工程、供气系统
高校实验室装修，无论是在设计装修上还是选材施工上都需要非常严谨和考究的，对于这一类的实验室建设，接下来从装修工程、电器工程、暖通工程、供气系统工程这几方面深入了解该实验室工程，下面给大家分享一下我们的高校实验室装修案例的经验给大家参考。 高校实验室装修方案： 1.实验室装饰安装工程：在隔断门窗
饮食诱导非酒精性脂肪肝动物造模案例分享（一）
2020年您是不是奉旨宅家了呢？有没有贴春夏秋冬膘？体检过后突然发现身边一群小伙伴患了肝浸润？也许很多人会认为，只要不饮酒那么自己的肝脏就不会有多大损伤。那当然是No, No, No~脂肪在肝细胞中堆积到一定量时，非酒精性脂肪性肝（NAFLD）就出现了。相对于酒精性肝病来说，NAFLD的发病率正以惊
两篇PNAS：蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序，成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息，包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中，动态的DNA甲基化模式，是基因表达的重要调控者，与细胞分化、胚胎发育和癌症
ctDNA结合CTCs检测结果与早期化疗癌症患者的预－...
大部分早期三阴性乳腺癌（TNBC）患者在手术前需要进行新辅助化疗，有助于缩小肿瘤、提高手术的可行性和成功率。其中，大约三分之一患者可以获得病理完全缓解、生存结局较好。不过，其余三分之二患者仍然残留病变、复发风险较高。手术后对外周血液进行循环肿瘤DNA（ctDNA）测序和循环肿瘤细胞（CTCs）计数的
翱锐生物推出五癌早筛产品「消为安」，针对癌症联检
据IPO早知道消息，杭州翱锐医学检验实验室有限公司（下称“翱锐生物”）于7月6日宣布推出针对消化系统五大常见癌症肝癌、胃癌、肠癌、食管癌、胰腺癌的多癌种早筛产品“消为安”。消为安是一个全球首创的基于荧光定量PCR和化学发光双平台的消化系统多组学癌症联检产品，达到整体灵敏性 88.4% 、特异性 98
基因组直接测序法检测甲基化的介绍
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
单细胞测序揭示了人类胚胎DNA甲基化动态
2017年12月19日，北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心、生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组和北京大学第三医院乔杰研究组合作在国际知名学术期刊《自然遗传学》上在线发表题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla
基因组直接测序法检测DNA的甲基化
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应
二代测序技术
人们常说“事后诸葛亮”，可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力，天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种，不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面：1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文，但是这些中国话想表达什么听
二代测序原理
第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Seque
妊娠合并梅毒的诊疗案例分析（二）
孕妇可以通过胎盘将梅毒螺旋体传给胎儿，引起先天梅毒。梅毒孕妇即使病期超过4年，梅毒螺旋体仍可通过胎盘感染胎儿，未经治疗的一期、早期潜伏和晚期潜伏梅毒的母核垂直传播率分别为70%~100%、40%、10%。新生儿也可在分娩时通过产道被传染，还可通过产后哺乳或接触污染衣物用具而感染。 由于母体相关抗体的
FluorCam叶绿素荧光成像技术应用案例（二）
3. 水分胁迫山东农科院研究了不同灌溉方式对小麦光合特性的影响[6]。研究发现比起传统的漫灌，沟灌条件下的小麦叶片有更高的最大光化学效率Fv/Fm、量子产额ΦPSII、光化学淬灭qP和更低的非光化学淬灭NPQ（图5）。这说明沟灌给小麦提供了更好的土壤水分条件，从而使小麦叶片拥有了更强的光化学活性。国
基因测序“摩尔定律”初现，“三代测序”要革“二代”的命？
在“二代测序”（NGS）尚未迎来投资热潮的情况下，技术突破捷报连连的“三代测序”（3GS）又进入到了投资人的视野中。1986年，第一台商用基因测序设备正式出现，到第二代测序设备出现，期间间隔了19年时间。而第二代设备问世，到第三代设备的诞生，仅仅用了5年，基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。