ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)

案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materials 影响因子:39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成,通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况,发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库,建立了疾病预测分析模型,结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关(P<0.001)。与此同时,作者还构建了诊断结果预测模型,该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物(P<0.001)。......阅读全文

单细胞测序技术的应用案例有哪些?

以下是一些单细胞测序技术的应用案例:  1. 肿瘤研究:    - 描绘肿瘤细胞的异质性,识别不同的肿瘤细胞亚型,了解肿瘤的发生、发展和转移机制。    - 发现肿瘤微环境中的免疫细胞组成和状态,为免疫治疗提供靶点和策略。  2. 神经科学:    - 解析大脑中不同类型神经元的基因表达

肿瘤早筛领域新突破!抽血可检测早期胃癌

近日,中国科学院合肥物质科学研究院肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展,开发了基于血液循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍,“这项研究强

肿瘤早筛领域新突破!抽血可检测早期胃癌

近日,中国科学院合肥肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展,开发了基于血液循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍,“这项研究强调了ctDNA

使用血液进行基因检测如何减少假阴性

基因检测-入门攻略什么是基因检测?肿瘤基因检测是通过特定检测设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,分析它所含有的各种基因突变情况,从而能针对性地为每位患者“量身定制”一套最合适的治疗方案。它是肿瘤精准医疗的基础。选择什么样本最合适?做基因检测,是检测肿瘤细胞的突变,因此需要获取肿瘤细胞。临床上

壳聚糖絮凝剂处理印染废水的实际案例分享

以下是一个壳聚糖絮凝剂处理印染废水的实际案例:某印染厂每天产生大量印染废水,其水质复杂,含有多种染料、助剂和高浓度的有机物,色度深,化学需氧量(COD)和生化需氧量(BOD)均较高。在处理过程中,首先对废水的水质进行了详细分析,确定了主要污染物的种类和浓度。然后进行了壳聚糖絮凝剂处理的小试实验,以确

分享一下-Immune-Cell-Atlas-数据集的分析案例

以下是一个关于 Immune Cell Atlas 数据集的简单分析案例示例:  **研究问题**:比较健康个体和自身免疫性疾病患者(如类风湿关节炎)中特定免疫细胞亚型的基因表达差异。  **数据获取**:从相关数据库下载 Immune Cell Atlas 数据集,其中包含健康对照和患者的免疫细胞

反应釜在环氧树脂乳化中的应用案例分享

LR1000反应釜应用案例分享用户国内知名特种纤维复合材料研发生产企业环氧树脂环氧树脂是泛指分子中含有两个或两个以上活泼的环氧基团的高分子化合物,可与多种类型的固化剂发生交联反应而形成不溶的具有三向网状结构的高聚物。固化后的环氧树脂具有良好的物理、化学性能,它对金属和非金属材料的表面具有优异的粘接强

透气率测试仪VACVBS的检测案例分享

 Labthink兰光VAC-VBS透气率测试仪基于压差法的测试原理,是一款专业用于薄膜试样的气体透过率测试仪,适用于薄膜、片材、高阻隔材料、金属箔片等材料气体透过率的测定。透气率测试仪的别名:压差法气体渗透仪、透气性测试仪、压差法透气仪、气体透过率测试仪、气体透过性能测试仪、透气性能检测仪等。  

TOPEM技术应用案例集锦(二)

图4.  80℃下DGEBA-DDM 体系等温固化中测试的比热曲线(上边)和总热流曲线(下边)。 硝酸钠的固-固转变 硝酸钠显示在约275℃有一个二级转变。在硝酸钠的这个相转变中,比热先随着温度增加而增加,然后于临界温度点在100mK内突然下降。要得到这种转变的物理性质的信

免疫细胞杀伤经典案例(二)

除了传统T细胞杀伤外,DELFIA细胞毒法还可以被用于检测靶向T细胞的新型免疫治疗分子,如双特异抗体(BiTE)等的细胞杀伤功能[6]。四,NK细胞杀伤 鉴于NK细胞在天然免疫系统的重要性,其活力检测也是免疫检查点抑制剂研发过程中的核心项目。此外,NK细胞活力检测还可以用于衡量用于免疫疗法开发的新型

DLTMA技术应用案例解析(二)

如图4的DLTMA测试曲线所示,上下包络线(虚线)表示对于0.5N和1.0N应力的弯曲曲线。包络线之差是对样品弯曲模量弹性的量度。钢刀片的弹性模量可假定不变,因而变化仅由环氧树脂试样产生。玻璃化转变温度Tg可计算为平均曲线(红色)的起始点(101.49℃)或中点(104.66℃)。 图4中

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

m5C-RNA甲基化测序介绍

m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基

BioTechniques:从外周血中分离cfDNA的高通量方法

  传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。  在液体活检中,人们通常需要对游离的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行分析。传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化

亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较

磷酸二羟丙酮的概念

磷酸二羟丙酮,生物学术语,是一种存在于生物中的糖酵解的中间产物。中文名磷酸二羟丙酮外文名DHAP,dihydroxyacetone phosphate概    念糖酵解以及糖异生的中间产物作    用甘油-3-磷酸经NAD+氧化成为DHAP学    科生物学

全基因组及转录组测序案例分析

案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25

科学家分享基因测序技术研发成果

  临床类   杜克大学分子遗传学教授David Goldstein   David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题,其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变,但是它

芯片与测序(二)

  另外,欲寻找疾病诊断标记物的小伙伴可要记住了,无论是mRNA或者lncRNA,HTA平台有更多的基因可作为biomarker。  可变剪切分析是识别基因不同转录本特异性表达的有效手段。其中,RNA-seq可鉴定到23,934个差异exons,HTA鉴定到26,999个差异exons(3698个共

6大革命性技术!IVD行业快速前行

  微流控芯片,高通量技术,单细胞测序,CTC循环肿瘤细胞,纳米医学,ddPCR技术,单分子免疫阵列技术(SiMoA),ctDNA,质谱检测,大数据,人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。  01  微流控芯片技术  微流控芯片,又称为芯片实验室(Lab on a Chip),是指在几平方厘米

IVD行业6大技术

  微流控芯片,高通量技术,单细胞测序,CTC循环肿瘤细胞,纳米医学,ddPCR技术,单分子免疫阵列技术(SiMoA),ctDNA,质谱检测,大数据,人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。  01  微流控芯片技术  微流控芯片,又称为芯片实验室(Lab on a Chip),是指在几平方厘米

分享一些苔藓物种监测系统频率的操作规范案例

苔藓物种监测系统频率的操作规范案例示例,您可以根据实际情况进行修改和完善。《苔藓物种监测系统频率操作规范案例》一、监测区域与目标物种监测区域:[具体的地理位置,如山脉、森林、湿地等]目标苔藓物种:[列出需要监测的苔藓物种名称]二、监测目的了解目标苔藓物种的种群动态和分布变化。评估生态环境变化对苔藓物

优化微生物絮凝剂投加量的案例分享

以下是一个优化微生物絮凝剂投加量的案例分享:某污水处理厂需要处理印染废水,以降低废水中的色度、浊度和化学需氧量(COD)。最初,该厂使用某微生物絮凝剂时,采用了一个估计的投加量,但处理效果并不理想。于是,工作人员进行了一系列实验来优化投加量。他们首先设定了投加量的范围,从 10 mg/L 开始,以

纳米碳酸钡喷雾干燥机实验结果案例分享

  一.碳酸钡喷雾干燥实验目的:    1.客户物料是纳米碳酸钡,需要制作3种不同规格的成品,3-5微米,40-100微米,大于100微米;已在无锡常州等地寻找厂家,目前没有厂家能够同时满足3种规格。   二.碳酸钡喷雾干燥实验器材:    物料:纳米钛酸钡,LE-10型喷雾干燥机,离心雾化器

致敬中国医生-——把中国经验分享出去

致敬中国医生 ——把中国经验分享出去 今年8月19日是我国第三个医师节,新冠无情人有情,在抗击新冠疫情中,医务人员义无反顾,充分体现了医者仁心和责任担当,万怡医学全体员工向仍然奋战在抗击新冠疫情最前线的医务人员致以崇高敬意!“我正在去医院的车上,已经来新疆10多天了。”半年多过去了,即便在全国各地已

血检如何捕捉肿瘤的踪迹?

  近日,在芝加哥召开的“2016美国临床肿瘤学会年会”发布的一项研究称,大规模基因组分析表明,利用血液检测筛查癌症、监测癌症发展演变可达到与传统组织活检同样的效果。这项技术有助医生更好地确立诊疗方案,有望成为常规活检的一种可靠替代选项。  癌症血液检测是通过分析血液中的游离肿瘤脱氧核糖核酸(ctD

血检替代活检,路有多远?

   近日,在芝加哥召开的“2016美国临床肿瘤学会年会”发布的一项研究称,大规模基因组分析表明,利用血液检测筛查癌症、监测癌症发展演变可达到与传统组织活检同样的效果。这项技术有助医生更好地确立诊疗方案,有望成为常规活检的一种可靠替代选项。  癌症血液检测是通过分析血液中的游离肿瘤脱氧核糖核酸(ct

肿瘤无创诊断技术在癌症检测中应用

  肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。2015年液体活检技术被MIT科技综述杂志(MIT Technology Review)评为年度十大突破技术之一;2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出的

肿瘤无创诊断技术在癌症检测中应用

 肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。2015年液体活检技术被MIT科技综述杂志(MIT Technology Review)评为年度十大突破技术之一;2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出的2

单分子测序助力细菌甲基化组的分析

  New England Biolabs联合Pacific Biosciences的研究人员利用PacBio RS系统对6种细菌基因组进行了重测序,不仅鉴定出细菌基因组中新的胞嘧啶和腺嘌呤甲基化位点,还鉴定出介导这些表观遗传学标志的甲基转移酶。该研究成果近日发表在《Nucleic Acid