焦磷酸测序技术原理及应用

焦磷酸测序技术(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年发展起来的一种新型的酶联级联测序技术,焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。焦磷酸测序技术产品具备同时对大量样品进行测序分析的能力,为大通量、低成本、适时、快速、直观地进行DNA甲基化、SNP等单个/连续多个核苷酸变异进行实时定量检测提供了非常理想的技术操作平台。一. 焦磷酸测序技术原理焦磷酸测序技术是由4种酶催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应。焦磷酸测序技术的原理是:引物与模板DNA退火后,在DNA聚合酶(DNA polymerase)、ATP硫酸化酶(ATP sulfurytase).荧光素酶(1uciferase)和三磷酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)4种酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP的聚合与一次荧光信号的释放偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,达到......阅读全文

澳发明新基因测序技术“捕获测序”有助快速诊断血癌

  澳大利亚科学家发明了一种新的基因测序技术,其精度大大高于现有方法。它就像一台倍数更高的显微镜,可用于对基因组进行精细研究,并帮助快速诊断血癌(即白血病)。  这项技术被称为“捕获测序”,由新南威尔士大学和加文医学研究所的科研人员开发,发表在新一期英国《自然·方法学》杂志上。  新南威尔士大学日前

第二代测序(NGS)技术

  二代测序是一个强大的功能平台,它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力,在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面,二代测序也就是高通量测序开创了革命性的领域。  早在1900年代就发明的Sanger测序法,成为了DNA测序的黄金法则,即便到了今天它仍被广泛用来进

关于单分子测序技术—第三代测序技术的基本信息介绍

  第三代测序技术是指单分子测序技术。DNA测序时,不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序。第三代测序技术也叫从头测序技术,即单分子实时DNA测序。  第三代测序技术发明人:Stephen W Turner1 & Jonas Korlach1博士。基因测序技术逐渐成为临床分子诊断中

关于单分子测序技术—第三代测序技术的关键问题分析

  第一:第三代测序技术的关键问题— 因为在显微镜实时记录DNA链上的荧光的时候,DNA链周围的众多的荧光标记的脱氧核苷酸形成了非常强大的荧光背景。这种强大的荧光背景使单分子的荧光探测成为不可能。Pacific Biosciences公司发明了一种直径只有几十纳米的纳米孔[zero-mode wav

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

DNA测序技术的基本内容

  DNA测序技术,即测定DNA序列的技术。在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和 Maxam和 Gilbert(1977)发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一

生物芯片技术用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

生物芯片技术用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

新测序技术揭开病毒突变“王国”

  最近,新加坡A*STAR的研究人员,设计出一种测序技术,可在患者体内病毒(如乙型肝炎病毒)迅速变异时,跟踪所产生的特异病毒变体。这一突破对“进化中的病毒种群的结构”提供了前所未有的视图,并能有助于开发新药,防止病毒株对药物和免疫反应发展出抵抗力。相关研究结果发表在最近的《Genome Biolo

高通量测序技术总结与展望

  第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率,适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补,但是成本昂贵,而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中,454序列片段最长,比较适合对未知基因组从头测序,搭建主体结构,但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454

基因测序里还有哪些技术“劫”?

  日前,一些从事医疗投资和基因组医学研究的学者在艾瑞咨询主办的“基因测序赛道扫描沙龙”上探讨产业发展上的技术“劫”,希望明晰产业发展“路线图”。  2016年3月,在科技部发布的重点专项申报指南的相关通知中,将“精准医学研究”列为2016年优先启动的重点专项之一,支持以基因测序为基础的精准医疗行业

Nature-Methods发布新RNA测序技术

  Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。  这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰(甲基化)的小RNA。“tRNA是生物体内

什么是基因组测序技术

自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

基因测序技术:诊断发育迟缓患儿

  最新研究显示广泛的遗传分析可能对发育迟缓的儿童有所帮助,有希望能帮助他们找到残障的原因。图片来源于网络  加拿大的研究人员对10名不明原因发育迟缓的儿童进行了精确遗传原因分析,发现了其中7名儿童发育迟缓的原因。  很多情况下,遗传分析都会有突破性发现。研究人员发现了11个新的与发育迟缓有关的致病

DNA测序技术的基本内容

  (一)  测序模板制备  测序模板应为单一来源DNA,包含质粒DNA、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增产物回收的DNA等。测序模板制备过程中应防止外源DNA污染,避免外部因素对测序模板的破坏和降解。  1.质粒DNA的制备  样品经平板培养挑取用质

基因测序技术随“新”而“动”

  【摘要】5月16日,在杭州举办的“2014转化医学高峰论坛”上,赛默飞世尔科技公司旗下Life Technologies中国区仪器平台销售总监张焱女士指出,基因组工具的发展突飞猛进,转化医学正从一个平台深入到医疗领域的方方面面,创新技术和方法令人应接不暇,临床应用迎来了前所未有的机遇期。  十年

基因测序技术侦破“跨国腹泻案”

  英国疾控部门一个快速反应小组近日发表论文,还原了他们怎样利用全基因组测序和食品溯源技术,将一场跨国暴发的肠炎沙门氏菌疫情追溯到德国的一家禽蛋生产商。  这次疫情最初发生在2014年5月~9月之间,涉及英国中部、西北部和南部的至少287个病例。同时,肠炎沙门氏菌疫情也在法国和奥地利出现。这三国样本

DNA测序技术的研究与发展

70年代末,WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序,同位素标记80年代中期,出现自动测序仪(应用双脱氧终止法原理)、荧光代替同位素,计算机图象识别90年代中期,测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图

高通量测序技术核酸片段分选

近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量

带您了解单分子测序技术

  单分子测序技术,也被称为纳米测序技术,是通过纳米孔只允许一条链进入的方式,根据碱基的荧光或者电流阻断来识别碱基序列的一种新型测序技术。这种技术包括PacBio技术和Nanopore技术两种主要方法。  PacBio技术主要是利用荧光标记不同的碱基与待测序列、DNA聚合酶一起放入纳米孔底部。当DN

激光荧光推动测序技术发展

  DNA测序,无论从何种角度而言,都着实代表了生物检测最具活力的领域。尽管已历经25年发展,测序技术却没有合并为某种单一基本方法,而是发展出日益丰富的多样化技术。然而,激光激发的荧光技术依然是最为流行的检测方法。事实上,激光荧光技术在基因测序的发展中担任着关键的角色,测序环境的飞速变化也

PCR实验技术指南之产物测序

1. DNA 直接测序:指直接分析不经分离的PCR 扩增产物,如果各个位点上碱基序列都是一致的,则所得信号是确定的,否则,在那些有相异碱基的位点出现模糊信号, 如果模板在多数情况下被正确扩增,则少数的突变将被掩盖,这是结果显示的是模板的序列.但是,当扩增的前几轮即出现错误扩增并被后续的循环积累,这时

NGS测序技术的不同检测方案

测序技术是单基因遗传病诊断应用的主要技术,针对检测基因的范围可大体分为单基因检测技术和多基因检测技术。单基因检测是指针对某一特定基因进行测序的技术,适用于具有特异疾病表型的疾病。单基因检测技术中应用最广泛的是Sanger测序,也称一代测序。Sanger测序因仅能检测一个或少数几个基因,因此适用于明确

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

测序技术查明罕见疾病致病基因

  临床遗传学家Hugh Rienhoff称,9岁大的女儿Bea性格暴躁行为放肆,从生理上看其眼距过宽和上颚后部组织分裂,这些特征据估计很可能是遗传疾病。Bea因无法承担肌肉重量而佩戴支架以支撑纤细的大腿,令Rienhoff忧虑的是,目前健康状况良好的她可能面临严重的心脏疾病。   为了查明女

纳米孔测序技术发展简介

  随着对DNA结构和序列的研究,DNA测序技术不断发展,成为生命科学研究的核心领域,对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。  纳米孔测序技术发展简介  纳米孔检测技

DNA测序技术的材料相关介绍

  待测已提纯的DNA,可为单链,也可为双链。  科学家在一个蚀刻有纳米结构的微阵列芯片上放置了数以千计的波导管。这是一种微型、中空的金属管,直径大约20纳米,体积大约是1毫微微微升,一个DNA分子外加一个DNA多聚酶分子便可将管内空间占满。这样一来,仅在一块小小的芯片上,就能同时进行数千个测序反应

基因测序技术首次实现胚胎筛选

  来自牛津大学的科学家们利用新的基因测序技术对胚胎进行分析,从而选择试管受精的胚胎。之前,新的基因测序技术从来没用被用于胚胎的筛选。   这项分析技术称为“下一代测序技术”,一种强大的方用来解读所有的基因。通过测试每个样品产生大量的DNA数据,同时揭示遗传性疾病,染色体的异常及线粒体的突变。下一

基因测序技术发展的历史

  1986年,第一台商用基因测序设备出现,间隔19年,第二代测序设备出现,从第二代设备到第三代设备只用了5年,说明基因测序设备更新换代速度加快。第一代测序技术,主要基于 Sanger双脱氧终止法的测序原理,结合荧光标记和毛细管阵列电泳技术来实现测序的自动化,基本方法是链终止或降解法,人类基因组计划