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新测序技术揭开病毒突变“王国”

最近,新加坡A*STAR的研究人员,设计出一种测序技术,可在患者体内病毒(如乙型肝炎病毒)迅速变异时,跟踪所产生的特异病毒变体。这一突破对“进化中的病毒种群的结构”提供了前所未有的视图,并能有助于开发新药,防止病毒株对药物和免疫反应发展出抵抗力。相关研究结果发表在最近的《Genome Biology》。 病毒突变通过每个基因组中的小改变,产生单核苷酸变异(SNV)。在一个病毒基因组上发生的单核苷酸变异集合被称为单倍型。这些突变在不同宿主之间有所差异,从而产生的病毒基因组拷贝,在不同宿主之间也略有不同。科学家认为,突变的基因组在病毒复制中发挥了一定的作用。 A*STAR 分子和细胞生物学研究所的William Burkholder与其他科学家带领了这项研究,他指出:“深度测序已经彻底改变了病毒进化研究。然而,它不够敏感,因此不能发现罕见的SNVs,发现不了同一基因组上发生的突变,或者不能将病毒群体中的突变组织成不同的遗传群......阅读全文

刘昌孝:认识SARS-CoV-2,抗病新药研发策略该从“何”说起

  过去100年发生的多起事件让世人密切关注未来发生传染病大流行的风险。2018年是1918年流感流行的100周年,估计有数千万人死于100年前那次流感。现在拥有比一个世纪前更好的干预措施,季节性流感疫苗,但不一定完全有效预防。每年需要接种或选择接种的人所占比例较小。世界上还有抗生素可以帮助治疗细菌

反向遗传学技术及其在FMDV 研究中的应用

刘光清 刘在新 谢庆阁(中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点开放实验室,兰州730046)摘 要:  反向遗传技术是一种新兴的分子生物学技术, 已广泛应用于生命科学研究的各个领域。综述反向遗传技术研究进展,并讨论该技术在口蹄疫病毒研究中的应用。关键词:  反向遗传学 反向遗传技术 全长c

中疾控等重磅研究揭示新冠病毒演变

  当地时间3月2日,中国医学科学院北京协和医院、中国疾控中心、加州大学洛杉矶分校、匹兹堡大学、湖南大学五家合作单位的研究人员共同在生物科学预印本网站bioRxiv在线发表了一项针对新冠病毒演化过程中的突变、重组和插入的重磅研究(“Mutations, Recombination and Inser

新冠病毒源于自然界又有新证据

自新冠肺炎疫情暴发以来,世界科研人员争分夺秒地对其展开调查分析与科学研究。除了研究如何预防和治疗新冠肺炎患者之外,研究中的很大一部分问题集中在新型冠状病毒是如何产生的,它于何时何地首次出现,何时开始在人与人之间传播,该病毒是否来自蝙蝠,在传染给人类之前有没有中间宿主,以及新冠病毒为何能如此快速地在人

研究揭示揭示冠状病毒SARS-CoV-2如何传播和进化

  新型冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。2020年2月28日,Christian Drosten在网上发布了SARS-CoV-2的基因序列后,立即在推特上发出警告。随着这种病毒在世界范围内的传播,350多个SA

泛冠状病毒药物开发的基础知识

  高致病性冠状病毒感染成了这十年来广受关注公共卫生问题。严重急性呼吸综合征(SARS,2002-2004),中东呼吸综合征(MERs,2012-至今),2019-nCov(COVID-19),每一个对人类健康,经济发展都带了巨大的冲击。   病毒通过接触,飞沫,气溶胶等形式,引起广泛传播,引起高

5月世界肝炎意识月,盘点肝炎研究进展

  肝炎是甲型肝炎病毒(HAV)、乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、丁型肝炎病毒(HDV)或戊型肝炎病毒(HEV)感染导致的,其中以HBV和HCV感染最为严重,96%的肝炎死亡病例都是HBV和HCV感染导致的肝炎造成的。  据世界卫生组织统计,目前,全球有近2.4亿慢性乙型肝炎患者,每

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

昆明动物所郑永唐组等发现平顶猴对HIV-1易感的分子机制

  宿主病毒限制因子APOBEC3、TRIM5α、TRIMCyp、Tetherin、SAMHAD1及Mx2等可直接作用于HIV-1等逆转录病毒,从而限制病毒在宿主细胞中的复制。对宿主限制因子的研究有助于阐明HIV-1复制的分子免疫机制,构建合适艾滋病的动物模型,探究艾滋病药物新靶点和治疗新策略。中国

正粘病毒遗传与变异

甲型流感病毒每个核苷酸在每个复制周期中的突变机率大约是15×10-5,与其它RNA病毒的突变率相似。但是,由于流感病毒的基因组分为8个或7个不相同的片段,在病毒增殖过程中很容易发生基因重排,因而使流感病毒的抗原性和致病性很容易发生变异。 (1)病毒变异的类型A.抗原性变异〓抗原性变异

新冠病毒“变异”了?科学研究如何避免过度解读

  最近几天,关于新型冠状病毒变异成两个“亚型”的传言惹人注目。其来源是3月3日发表于《国家科学评论》的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》。  但是,中国—世卫组织联合考察组刚刚给出了新冠病毒未发生明显变异的结论。《自然—微生物学》也发表了耶鲁大学流行病学专家Nathan D. Gru

复旦大学从基因组学角度揭示SARS-CoV-2的起源和出现

  新型人类冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)的持续大流行引起了全球的极大关注。我们和中国的其他人参与了对这种病毒的初始基因组测序。在本文中,我们描述了针对SARS-CoV-2的出现,这些基因组数据揭示了什么,并讨论了我们对其起源理解上所存在的差距。  一种新的人类冠状病毒 

2015病毒领域重大研究盘点

  2016年2月14日/生物谷BIOON/--近期塞卡病毒在赤道附近国家开始大肆传播,引起了非常多的新生儿出现“小头症”。虽然这个病毒对于成人来说症状非常轻微,然而对于非常脆弱的孕妇和新生儿而言,简直像噩梦一样的存在。近两年来,仅仅巴西一国,就出现了超过两千例由塞卡病毒引起的小头症。这些年来,病毒

新冠病毒“备受争议”的神秘来源

  随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增,越来越多的各国专家也对新冠病毒(2019-nCoV或SARS-CoV-2)的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域,对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深度挖掘,为读者提供一个深刻而全新的视角。  一、华

深度分析人体病毒组

  自从微生物学诞生以来,研究人员着重关注让我们、我们驯养的家畜和种植的植物患病的病原体。鉴于症状的产生是了解特定病毒是否在几年前就已存在的唯一方法,因此大多数得到很好研究的病毒是那些导致疾病的病毒。但是很多病毒长期地感染人类,不会导致疾病,但是可能会导致年龄非常小的、年龄非常大的或者存在免疫抑制的

基因重组与变异导致甲型流感病毒致病性渐强

  积极防控H7N9  从2005年的H5N1到2009年的H1N1,再到今年4月初的H7N9,甲型流感病毒家族攻势凌厉、变化多端,让人类不得不被动应战。  是时候主动迎战防患未然了!“今天H7N9出现或又消失,明天可能又出现H10N8、H6N6等新变种。”4月18日,上海生物制品研究所所

冠状病毒是怎样敲开人体大门的?

   新冠肺炎病毒因其强大的感染和传播能力,在全球掀起了一场紧急防控大战。在这一过程中,一系列疑问在医生、科学家,甚至普通人的心中浮现:是什么决定了冠状病毒是否、何时、如何传染给人类,以及达到怎样的传染程度?为什么不同冠状病毒的致病性会有如此大的区别:有的只是让人流鼻涕,而有的则会引发重症肺炎?过去

强!中国学者用最短时间突破100篇CNS生命科学领域成果

  截止2020月7月27日,中国学者在Cell,Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果,其中新冠肺炎领域占了近一半(共43篇)。iNature系统总结了这些研究成果:   按杂志来划分:Cell 发表了30篇,Nature 发表了45篇,

新冠何时溢出到人类?疫苗如何应对变异?

  严重急性呼吸综合征(SARS)、中东呼吸综合征(MERS)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)都暴发于近二十年,并由不同的冠状病毒株(CoV)引起。这些病毒被认为来源于蝙蝠,然后通过中间宿主传播给人类。SARS-CoV来源于野生动物市场的果子狸,MERS-CoV源自单峰骆驼

中山大学等在Nature Genetics发文揭示鼻咽癌EB病毒高危亚型

  鼻咽癌是我国高发恶性肿瘤之一。在我国南方地区,每年发病率每10万人可达20~40例,并且该地区的鼻咽癌病例常与EB病毒感染有关。此外,EB病毒还与其他癌症类型有关,也经常在无癌人群中发现。EB病毒基因组变异在鼻咽癌发生发展中的重要作用以及其在我国南方流行的状态,一直未得到充分的研究探讨。目前,部

新型冠状病毒的第一个传播者:消失的零号病人

消失的零号病人  零号病人并不一定是第一个发病者。  而是第一个感染,并且把病毒传播给其它人的人。  因此,第一个出现症状并发病的人叫做一号病人。  那么,零号病人的医学意义是什么呢?专家给出了提示:  1. 能够锁定传染源,比如是否接触了什么动物?  2. 锁定传播方式,比如跟动物是如何接触的? 

清华等团队从蝙蝠“百毒不侵”中找答案

  蝙蝠是“百毒不侵”的天然病毒蓄水池,它们为什么携带大量病毒却免受其害?人类是否可以从这里寻求一条对付多种病毒的普适性思路?  北京时间3月31日,清华大学结构生物学高精尖创新中心、杜克-新加坡国立大学医学院、中国疾控中心、中科院动物研究所、美国杜克大学的研究团队联合在论文预印本网站BioRxiv

多篇文章解读流感研究新进展!

  本文中,小编整理了近期科学家们在流感研究领域取得的新成果,与大家一起学习!图片来源:Thomas Hagan et al, doi:10.1016/j.cell.2019.08.010  【1】Cell:临床试验表明肠道细菌可提高流感疫苗在临床试验中的疗效  doi:10.1016/j.cell

如何追踪“敌人”关键的基因特性?

  随着COVID-19疫情在全球范围内肆虐,来自蒙特利尔大学的生物信息学家如今开始使用人工智能手段来追踪引发这次大流行的冠状病毒的遗传图谱及特性,研究者Julie Hussin表示,自从SARS-CoV-19在中国出现以来,其已经发生了进化,因此我们需要深入了解它,以便能开发出个体化的疫苗和疗法策

华大在新冠病毒基因组变异监测及研究方法上取得突破

  随着新型冠状病毒肺炎(COVID-19)肆虐全球,世界卫生组织(WHO)已经正式宣布其为全球流行病(Pandemic)。WHO最新新冠疫情状态报告显示,截至北京时间2020年3月26日10点,新冠肺炎疫情已蔓延至全球198个国家和地区,确诊患者超过46万例,且仍呈现迅速增长态势。  病毒在传播过

疫情跟踪:水环境中的新兴和潜在新兴病毒

  在微生物中,病毒最适合成为新兴的病原体,因为它们能够通过突变、基因重组和重配感染新宿主并适应新环境。肠病毒是最常见和最危险的水传播病原体之一,会导致偶发性疾病和流行疾病。与肠病毒有关的主要健康问题是胃肠道疾病,但它们也可能引起呼吸道症状、结膜炎、肝炎、中枢神经系统感染和慢性疾病。非肠道病毒如呼吸

显微技术在病毒与传染病学研究中的应用

传染病(Infectious Diseases)是由各种病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。中国目前的法定报告传染病分为甲、乙、丙3类,共40种。此外,还包括国家卫生计生委决定列入乙类、丙类传染病管理的其他传染病和按照甲类管理开展应急监测报告的其他传染病。新型冠状

科学家分享基因测序技术研发成果

  临床类   杜克大学分子遗传学教授David Goldstein   David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题,其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变,但是它

我国科学家获得埃博拉病毒研究最新成果

  5月13日,国际学术期刊《自然》在线发表我国科学家关于埃博拉病毒最新研究成果:Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone,并同期配发评论文章Latest Ebola data rule ou