用于测量拟南芥和小麦生长表型的开放式自动化软件包
植物表现出由遗传和环境因素决定的动态生长表型。随着时间的推移,对生长特征的表型分析是理解植物如何与环境变化相互作用以及对不同的处理作出反应的关键方法。虽然衡量动态增长特性的重要性得到了广泛的认可,但现有的开放软件工具在批图像处理、多特征分析、软件可用性和实验之间交叉引用的结果方面是有限的,使得自动表型分析存在问题。作者介绍Leaf-GP(Growth Phenotypes),一个易用且开放的软件应用程序,可以在不同的计算平台上执行。能够从大型图像数据集中自动提取多种生长性状。该软件已经在诺维奇研究公园(NRP,UK)的拟南芥和小麦(Triticum aestivum)生长研究中得到运用。随着时间的推移,通过量化一些生长表型,作者已经在几个实验条件下鉴定出不同基因型之间的不同植物生长模式。 Leaf-GP工作流程及图形用户界面Leaf-GP是一个复杂的软件应用程序,它提供了三种方法来量化大型图像系列中的生长表型。......阅读全文
用于测量拟南芥和小麦生长表型的开放式自动化软件包
植物表现出由遗传和环境因素决定的动态生长表型。随着时间的推移,对生长特征的表型分析是理解植物如何与环境变化相互作用以及对不同的处理作出反应的关键方法。虽然衡量动态增长特性的重要性得到了广泛的认可,但现有的开放软件工具在批图像处理、多特征分析、软件可用性和实验之间交叉引用的结果方面是有限的,使得自动表
岛津发布用于临床研究的QuantAnalytics软件包
——岛津发布用于临床研究的QuantAnalyticsTM开放存储液质的软件包 2014年6月16日-哥伦比亚马里兰州,岛津科学仪器推出了开放式解决方案QuantAnalyticsTM软件包,这是一款针对临床市场的LC/MS/MS数据工具。该软件提高了速度和数据处理的审查效率,允许用户突出和审查那
FluorCam叶绿素荧光成像技术应用案例(二)
3. 水分胁迫山东农科院研究了不同灌溉方式对小麦光合特性的影响[6]。研究发现比起传统的漫灌,沟灌条件下的小麦叶片有更高的最大光化学效率Fv/Fm、量子产额ΦPSII、光化学淬灭qP和更低的非光化学淬灭NPQ(图5)。这说明沟灌给小麦提供了更好的土壤水分条件,从而使小麦叶片拥有了更强的光化学活性。国
如何使用植物表型成像系统完成十字花科表型研究的论文
最近,来自比利时根特大学的专家利用WIWAM XY植物表型系统发表了题为Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae的文章,发表在植物学著名期刊New Phytol
植物表型成像系统在完成十字花科表型研究的论文的应用
最近,来自比利时根特大学的专家利用WIWAM XY植物表型系统发表了题为Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae的文章,发表在植物学先进期刊New Phytol
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛
4个LBD基因控制水稻和小麦生长
长穗偃麦草LBD蛋白质三级结构预测 长穗偃麦草LBD基因家族特征结构域 长穗偃麦草LBD保守基序(左)与基因结构(右) 长穗偃麦草LBD基因的共线性分析 图片均由论文作者提供
模块式植物表型分析技术方案——拟南芥UV胁迫的响应机制
植物面对各种生物和非生物胁迫时,会调整它们的响应机制来优化发育和适应程序。UV辐射作为一种环境因子,会影响植物的光合过程并触发细胞死亡。华沙生命科学大学的Anna Rusaczonek评估了红/远红光感受器光敏色素A和光敏色素B在拟南芥UV胁迫响应中的作用。通过测量相关突变株的CO2同化、叶绿素荧光
PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂...
PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂种优势的贡献杂交在促进作物生长与产量上效果显著,因而被广泛应用于农业生产。但杂交的分子机制仍然不是很清楚。最新的证据表明,水杨酸水平降低调节的相关基因表达,会造成某些杂交种基础防御能力降低,从而影响到这些杂交种的活力。澳大利亚联邦科学与工
PlantScreen植物表型成像分析系统气孔运动调节机制与相...
PlantScreen植物表型成像分析系统-气孔运动调节机制与相关表型分析叶片表面的保卫细胞能够调节气孔开放,从而使植物与大气间进行气体交换,让植物的光合作用与蒸腾作用之间达到平衡。保卫细胞的新陈代谢活性又主要依赖来源于叶肉的糖分。而参与到这一过程中的转运蛋白及其对保卫细胞功能的贡献还不清楚。
植物表型组学概念和测量方法讨论
首先植物表型是受基因和环境因素决定或影响的, 反映植物结构及组成、植物生长发育过程及结果的全部物理、生理、生化特征和性状。说到育种不得不提到“表型”的概念,在生物学和遗传育种领域,特别是作物育种领域,表型是指基因型和环境决定的形状、结构、大小、颜色等生物体的外在性状。表型组又是指某一生物的全部性状特
HORIBA推出用于最佳拉曼成像的新Easynav软件包
分析测试百科网讯 近日,HORIBA宣布推出新的EasyNavTM软件包,包括三个革命性的应用程序NavMapTM,NavSharpTM和ViewSharpTM。这三个模块使拉曼用户能够在保持对焦的同时浏览图像,以便轻松识别感兴趣的区域,并获得多种样品清晰、快速的拉曼化学图像。 使用NavMa
基于LED光源的科研级植物培养方案(二)
2)光强白炽灯、卤钨灯光效为12-24lm/W,荧光灯50-70lm/W,钠灯90-140lm/W,大部分的耗电变成热量损耗。而理论上LED发光源光效可达到300lm/W。FytoScope LED光源植物培养箱可以在30-50cm的距离上实现最大2000µmol(photons)/m².s的光
简介植物表型测量系统的技术指标和功能简介
植物表型测量系统是一种用于农学、林学、环境科学技术及资源科学技术领域的分析仪器,于2017年12月13日启用。 技术指标 1、成像面积不小于13x13cm;2、测量参数包括Fo,Fo’,Fs,Fm,Fm’,Fp,FtDn,FtLn,Fv,NPQ_Dn,NPQ_Ln,Qp_Dn,Qp_Ln,q
植物表型测量仪概述
植物表型测量系统是一种用于农学、林学、环境科学技术及资源科学技术领域的分析仪器,于2017年12月13日启用。 技术指标 1、成像面积不小于13x13cm;2、测量参数包括Fo,Fo’,Fs,Fm,Fm’,Fp,FtDn,FtLn,Fv,NPQ_Dn,NPQ_Ln,Qp_Dn,Qp_Ln,q
植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学
转基因拟南芥研究能提高作物生长速度
加拿大圭尔夫大学研究人员发现,在一种叫做拟南芥(Arabidopsis)的小花植物中插入一种特殊的玉米酶,会使其生长速度加倍,种子产量达到原来的4倍。 这一发现有望提高油菜籽、大豆等重要油料作物和生物燃料作物亚麻荠的产量,也会捕获更多大气二氧化碳,有可能给食用作物和生物燃料种植带来变革。
PlantScreen植物表型应用——高通量种子萌发活力与表型监测
种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。 种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工
使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化
Plant Phenomics | 使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化在全球范围内,最近十年是自19世纪以来最热的十年,并且多次发生了打破历史记录的高温天气。热胁迫会导致植物在所有生长阶段的性能和生产能力下降,这使得高温热浪成为了农业生产中的严重威胁。但是,目前对热应激现象的研究主要
种子萌发率高通量检测与活力评估
种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工计数来测量
Waters推出Live-ID软件,用于实时、直接分析食品和植物表型
沃特世公司(NYSE:WAT)今天推出了新的LiveID™软件,此软件搭载沃特世四极杆飞行时间质谱仪(QTof)能够进行即时的对食品等样品直接检测。该新软件使Waters®Xevo®G2-XS QTof或SYNAPT®G2-Si质谱仪配备了iKnife™采样设备、REIMS™离子源和MassLy
简介中通量植物光合表型测量系统的测量参数
调制叶绿素荧光参数:Fo、Fm、Fv/Fm、dFq/Fm=DF/Fm、Fs'、Fm'、Fo'、Fq'/Fm'=Fv'/Fm'、rETR、NPQ、Y(NO)、Y(NPQ)、qN、qP、qL、1-qP和1-qL等; 非调制叶绿素荧光参数:Fo
植物表型测量系统的技术指标
1、成像面积不小于13x13cm;2、测量参数包括Fo,Fo’,Fs,Fm,Fm’,Fp,FtDn,FtLn,Fv,NPQ_Dn,NPQ_Ln,Qp_Dn,Qp_Ln,qN,QY,QY_Ln,PARabs,Rfd,BGF,UV-Chl.F等60多个叶绿素荧光参数和稳态荧光、基本形态分析;3、高分
植物病理表型测量系统概述
植物病理表型测量系统PathoScreenProBlu集可见光成像、多光谱成像、叶绿素荧光成像和GFP荧光成像功能于一身,是目前国际上功能最全、成像面积最大(最大成像面积53cm x 53cm)的病理表型测量系统。该系统配备600万像素高清相机,全自动滤光轮和功能强大的分析软件,操作简单、功能强
开路测量光合仪开放式气路的缺点简述
1.不能进行群体光合速率的测定;较大的气流难以实现控制和精确测量。 2.不能测定土壤呼吸。 3.在进行光合实验时,对植物不宜移动,一旦移动了,植物的光合速率就不会稳定,在测定时饱和光下植物的光合速率时,当数值上下波动时,便可测定。
用于吸光度和荧光等测量的高纯度样品测量
用于吸光度和荧光等测量的高纯度样品测量海洋光学提供各种石英样品池,用于吸光度、透射率和荧光测量。 所有比色皿都适合用于170-2700纳米的范围,并且可牢固固定到支架上。 还提供了其它选件,以满足您的罐装容量要求和测量需求。 经过适当的护理和保养,流动池在无划痕、裂纹和类似缺陷情况下,可进行
识别田间条件下小麦的穗区域的表型分析方法
2019年6月,Plant Phenomics刊发了由来自英国诺里奇研究所(Norwich Research Park)的Tahani Alkhudaydi等人撰写的题为An exploration of deep-learning based phenotypic analysis to dete
植物生长室研究昼夜温差对小麦生长特性的影响
温度是植物生长发育和进行光合作用的必要条件之一,因此温度的变化也常常是影响植物生长发育的一个重要因素,为了研究昼夜温差对小麦生长特性的影响,我们借助植物生长室创造了较大的昼夜温差,分别为白天25℃,夜晚10℃,并通过植物生长室的控制功能严格控制光照和空气相对湿度,并与无昼夜温差的环境条件,
不同浓度生长素对小麦根芽生长的影响
摘要:目的:为了筛选出小麦成熟胚培养和遗传转化受体材料的优良基因型。方法:以小麦种子为材料,用正交试验的方法研究6-BA、NAA、2,4-D3种 营养物质对小麦愈伤的影响。结果:表明2, 4-D的浓度对愈伤的影响最小,6-BA对实验的影响介于二者之间,NAA的影响最大。通过正交分析结果可以得出小麦成
植物表型研究文章TOP10(一)
鸡年接近尾声,各行各业都已经做了各种年度盘点,小编也不能免俗,以影响因子和引用次数为标准,将近五年跟植物表型研究相关的文章,做了盘点,列出了植物表型研究文章的TOP10 ,从微观表型到宏观表型,从实验室表型到田间表型,从基因型到表型,赶紧一睹为快吧。 TOP 10● 植物表型组学数据中动态数量性状位