与CRISPR/Cas系统相爱相杀的抗CRISPR蛋白研究最新进展二
利用一种被称作冷冻电镜的高分辨率成像技术,这些研究人员发现了CRISPR系统和抗CRISPR蛋白的三个重要的方面。首先,他们准确地观察这种CRISPR监视复合物如何识别病毒遗传物质以便发现它应当在何处发起攻击。这种监视复合物中的蛋白像握手那样缠绕在细菌crRNA的周围,让这种crRNA的特定片段暴露出来。这种特定片段扫描病毒DNA,寻找它们能够识别的基因序列。再者,这些研究人员分析了病毒抗CRISPR蛋白如何瘫痪这种监视复合物。他们发现一种抗CRISPR蛋白覆盖住crRNA的这个暴露片段,从而阻止这种CRISPR系统扫描病毒DNA。另一种抗CRISPR蛋白采用一种不同的策略。基于这种抗CRISPR蛋白的结合位置和负电荷,这些研究人员认为它起着模拟DNA的作用,诱导CRISPR结合这种抗CRISPR蛋白,而不是入侵的病毒DNA。6.Science子刊:利用抗CRISPR蛋白显著降低CRISPR-Cas9脱靶效应doi:10.112......阅读全文
Cell:CRISPR/Cas9再获重要突破
Whitehead研究所的科学家们首次对顶复门(Apicomplexa)生物进行了全基因组筛选。这项重要的研究成果于九月二日发表在Cell杂志上。顶复门的单细胞寄生虫会引起疟疾、巴贝斯虫病、隐孢子虫病和弓形虫病,但我们对这些家伙还知之甚少。 “我们一直没什么办法研究顶复门寄生虫所有基因的功能,
川大院士发表CRISPR/Cas综述文章
七月十五日,四川大学生物治疗国家重点实验室的研究人员在国际学术期刊《Human Gene Therapy》发表综述文章,提出了CRISPR/Cas传递载体所面临的挑战,并指出了非病毒载体所发挥的潜在作用。 中国科学院院士魏于全是本文共同作者之一。魏于全目前是四川大学副校长、教育部“长江学者奖励
CRISPRCas9基因编辑技术简介
CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术,短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最高、最简便、成本最低、最容易上手的技术之一,成为当今最主流的基因编辑系统。一、什么是CRISPR-Cas系统CRISPR-Ca
抗铜绿假单胞菌IE型CRISPRCas的噬菌体蛋白质结构
本研究首次对铜绿假单胞菌抗I-E型CRISPR/Cas系统蛋白AcrE1进行了结构解析,分析了AcrE1作用的机理,并且利用AcrE1蛋白将铜绿假单胞菌內源的I-E型CRISPR系统变成了基因组调控工具。 image.png CRISPR/Cas广泛存在于细菌和古细菌中,是细胞保护自
相爱相杀,动植物是复杂的“命运共同体”
一种濒危的蛇菰属植物,其生命周期中种子传播的关键环节,竟然源自另一种濒危物种——奄美兔。近日,一则关于此研究的报道,登上美国科学新闻网站等媒体的显著位置。无数事实和科学研究表明,在生命长期演化过程中,植物和动物之间形成了互惠互利甚至是协同演化的关系,如蜂鸟专爱花蜜、考拉钟情于桉树叶……与此同时,植物
利用I型CRISPR/Cas系统对人细胞进行靶向转录调节
在一项新的研究中,美国杜克大学生物医学工程副教授Charles Gersbach、Gersbach实验室博士后研究员Adrian Oliver及其团队首次描述了他们如何成功地利用I型CRISPR系统开启和关闭基因,并对人细胞中的表观基因组进行编辑。他们希望这能够极大地扩展生物医学工程师可用的基于
中国科学家揭示III型CRISPRCas系统免疫机制
11月29日,《细胞》杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组和章新政课题组合作的研究成果。研究人员系统地阐述了III型CRISPR-Cas系统抵御外源核酸的分子机制。 CRISPR-Cas系统是一种由RNA介导的获得性免疫系统,在原核生物中广泛存在。在此之前,科学家们已经系统研究过
生物物理所揭示III型CRISPRCas系统免疫机制
11月29日,《细胞》(Cell)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组和章新政课题组合作的研究论文“Structure Studies of the CRISPR-Csm Complex Reveal Mechanism of Co-transcriptional Interfer
Cell发布CRISPR/Cas9重要研究成果
来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员,在新研究中揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。研究成果发布在2月25日的《细胞》(Cell)杂志上。 京东大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nu
一文盘点12月CRISPR/Cas最新研究进展
基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。
张锋再发Cell:两张图详解“魔剪”CRISPR家族!
微生物利用多种CRISPR-Cas系统组成了它们的免疫力,其中,2类CRISPR系统(特别是基于核酸酶Cas9的系统)已成为最热门的基因编辑工具。1月初,发表在Molecular Cell杂志上的一项新成果中,CRISPR先驱张锋带领的研究小组发现了两个新型的RNA靶向2类CRISPR系统。
CRISPR先驱Nature解析新一代CRISPR系统
在4月20日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,科学家们描绘了一种新型细菌CRISPR-Cpf1系统的分子细节,这为实现其他的基因编辑应用,如平行靶向多个基因打开了可能的途径。 领导这一研究的任职于德国马克思普朗克感染生物学研究所和瑞典于默奥大学的Emmanuelle Charp
Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(二)
ResultsRNA-induced structural stabilization in Cas9We first observed apo-Cas9 and pre-assembled Cas9–RNA on a mica surface treated with 3-aminopro
CRISPRCas系统引领药物发现途径和疾病治疗方案的革新
CRISPR-Cas系统作为基因组编辑和调节的编程工具,可以在各种细胞中(包括人类细胞)进行遗传操作。虽然目前科学家们的注意力主要集中在CRISPR-Cas系统治疗孟德尔遗传疾病方面的潜力,但是该技术还有望为复杂的体细胞疾病提供新的治疗方法,同时CRISPR-Cas通过加速药物靶点的鉴定和验证,
我国学者揭示新型CRISPRCas系统靶向DNA的作用机制
1月8日,国际学术期刊Cell Research在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)杨荟研究组题为“Structural basis of a Tn7-like transposase recruitment and DNA loading to CRIS
强强联合:在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术
摘要: CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验
微生物所噬菌体抑制细菌CRISPRCas系统机制研究中获进展
原核生物通过一系列的防御系统来抵抗噬菌体等寄生生物的攻击。与真核生物的免疫系统类似,原核生物的防御系统也可以分为天然免疫系统和获得性免疫系统。天然免疫系统又包括限制性修饰(Restriction-Modification, R-M)系统、DNA干扰、毒素-抗毒素系统等,是非特异性的防御措施;而获
生物物理所在IIIE型CRISPRCas系统研究方面取得进展
CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌、古菌和某些细菌的病毒中(bacteriophage),可以特异性识别并降解外源入侵的基因。根据CRISPR-Cas系统干扰机制的不同,这些系统被分为两类,即Class1和Class2。Class1由多个蛋白构成效应复合物(包括I、III和IV型),Clas
SpCas9,首个抗CRISPR小分子抑制剂
自2012年“魔剪”技术出道以来,该技术一直备受争议。一些专家指出,基因编辑在很多层面上难以实现控制。近年来,科学家一直致力于开发“抗CRISPR”系统,来干扰细胞中的Cas核酸酶功能,以此来给CRISPR基因编辑技术带上一定程度的“镣铐”,规范该技术的使用操作。 如今,在美国Broad研究所
生物物理所揭示噬菌体防御CRISPRSpyCas9的分子机制
2018年12月31日,《分子细胞》(Molecular Cell)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组在CRISPR-Cas系统研究中取得的最新进展。标题为Phage AcrIIA2 DNA Mimicry: Structural Basis of the CRISPR and
中科院王艳丽课题组在Crispr/Cas系统获得新的研究成果
2016年12月15日,Molecular Cell 杂志在线发表了中科院生物物理研究所王艳丽课题组关于CRISPR-Cas系统的最新研究成果,文章标题为“C2c1-sgRNA Complex Structure Reveals RNA-Guided DNA Cleavage Mechanism
Nature:以彼之道,还施彼身!揭开病毒对抗细菌CRISPR免疫系统的全新方式
噬菌体(Phage)和其他可移动遗传元件(MGE)对细菌施加了巨大的选择压力,作为回应,细菌也发展出了广泛的防御机制。其中最我们熟知的就是——CRISPR-Cas系统,这是一组在细菌中广泛存在的RNA引导的适应性免疫系统。 CRISPR-Cas系统的特异性和可编程性导致了基因组编辑、分子诊断等
基因编辑进展梳理-Part-I-CRISPR系统拓展及机制研究(二)
两篇研究揭示Cas4核酸酶对于CRIPSR免疫反应的重要性2018年3月27日的,Shiimori团队在Cell Reports期刊上发文,证明了Cas4核酸酶是间隔序列前体临近基序( PAMs )靶向选择所必须的,有助于Cas1和Cas2选择新的CRISPR间隔物,并赋予天然宿主Synech
CRISPR/Cas9应用近期重大进展
基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。
利用CRISPR/Cas9来攻克乙肝
在一项新研究中,麻省理工学院的研究人员利用CRISPR/Cas9 系统,对受到感染的哺乳动物肝细胞进行基因组编辑,从中删除了乙肝病毒(HBV)DNA。根据发表在《Scientific Reports》杂志上的研究结果,该研究小组靶向切割了HBV病毒共价闭合环状DNA(cccDNA)的一些特异位点
ES打靶和CRISPR/Cas9如何选择?
近年随着生物医药技术快速迭代,靶向药物、免疫疗法、基因治疗等个性化治疗方式成为生物药创新的主要方向。国内企业亦纷纷向生物药领域挺进或转型,生物药市场愈发火热。 其中,基因编辑婴儿事件虽然近日被《科学》杂志列入2018年度十大科学突破的负面事件,但从一年前的ZL之争,到年底基因编辑公司E
Nature-Methods发布CRISPR/Cas9新技术
麻州大学医学院的科学家们开发出了一种新的CRISPR/Cas9技术,其可以精确地在几乎所有的基因组位点如外科手术般编辑DNA,同时避免标准CRISPR基因编辑技术中看见的一些潜在的有害脱靶改变。通过配对CRISPR/Cas9系统与一个可编程的DNA结合结构域(CRISPR/Cas9-pDBD),
Cell新文章平息CRISPRCas长期争议
我们躯体内外的每一寸都布满细菌。事实上,人体携带细菌细胞的数量是人体自身细胞的10倍。许多细菌都是我们的朋友,帮助了我们消化食物和抵抗感染。但对于我们生命所依赖的这些丰富的生物体,还有很多仍有待去了解。在发布于5月7日《细胞》(Cell)杂志上的一项研究中,洛克菲勒大学的科学家们最终破解了细菌利
用CRISPR/cas9编辑精原细胞基因
利用CRISPR/Cas9 系统对胚胎进行基因编辑,可有效地产生具有靶向基因组修饰的生物体。三月十二日在Cell子刊《Cell Reports》发表的一项研究中,来自德克萨斯大学西南医学中心、芝加哥大学和犹他大学等处的研究人员,用CRISPR / cas9技术对大鼠的精原细胞进行基因编辑,为在大
遗传学大牛用CRISPR/Cas识别SNPs
随着基因组编辑系统的发展,没有什么比CRISPR/Cas更简单的了。然而,在实践中,将该系统限定于预期的位点可能是具有挑战性的,尤其是两个或两个以上的位点只有一个单碱基差异的情况。哈佛大学Wyss生物启发工程研究所的Benjamin Pruitt指出:“Cas9是杂乱的。在许多情况下,它将高效地