农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10) 是一个典型的籽粒变小发育迟缓的突变体。通过图位克隆发现，dek10编码了一个定位于线粒体的E族PPR蛋白。测序表明dek10突变体是由于nad3-61，nad3-62和cox2-550位点的C-U变化导致的。这些位点的变化导致Nad3显著下降，Cox2蛋白的缺失。有趣的事，复合物I并没有变化，但是NADH脱氢酶活性显著下降。复合物IV的含量显著下降。转录组测序与透射电镜（TEM）分析表明，nad3和cox2对线粒体功能密切相关。这些结果表明，E族PPR蛋白dek10对nad3和cox2的位点编辑至关重要，而这在植物发育过程中是必不可少......阅读全文
我国创建世界上最大转座子插入资源库
不知你有没有注意到，从菜市场买回来的玉米，有的是黄灿灿的，有的却像个大花脸，中间夹杂着紫色、白色的玉米粒？ 其实，这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子，它们就像一支“小画笔”，跳到哪个基因上，就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒颜色变化有一部分是转座子运动产生的。 转座
助力地方发展，浙江农林大学开化研究院揭牌
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498084.shtm4月6日，浙江农林大学开化研究院揭牌成立。浙江农林大学将以全校服务浙江省开化县全域，为将该县打造中国式现代化山区县样板提供人才科技支撑。 ?揭牌仪式现场 浙江农林大学供图去
dek35编码PPR蛋白影响玉米籽粒的线粒体nad4基因内...（二）
dek35影响nad4内含子1的剪切由于PPR蛋白可以与对应的线粒体或者叶绿体RNA互作，因此研究人员对dek35突变体胚乳以及野生型胚乳的线粒体转录本进行了分析。研究人员使用特异的引物扩增了线粒体cDNA，在35个基因中，只有nad4的成熟转录本在dek35中显著下降（图5）。进一步研究发现，na
PNAS：新测序方法助力癌症研究
在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中，两位来自华盛顿大学的年轻研究人员：Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想，谈到了一个简单但功能强大，可用于检测癌细胞，获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率，那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异，这种改进
六项中国学者成果同登Nature子刊中国即将成为基因大国？
在最新刊出的著名遗传学杂志Nature Genetics在线版上，同时发表了六项中国学者的最新研究成果，分别是乙肝患者患上肝癌的关键易感基因玉米籽粒油份遗传结构分析，iPS细胞重编程过程的一个主要障碍，西瓜基因组草图，甜橙基因组草图，以及大熊猫种群历史与适应研究。国内遗传学基因研究在国际上的
玉米Proline－responding－1(pro1)突变在蛋白合成和细胞周期调控
上海大学生命科学学院、上海市能源作物育种及应用重点实验室的研究人员证实，玉米Pro1基因(Zm P5CS2)的突变造成了突变体细胞中脯氨酸(proline)合成受阻，从而导致proline积累的减少。突变体中proline的缺乏引起了相应的转运RNA(tRNApro AGG)空载形式(uncha
上海生科院最新PNAS文章
4月19日，《美国科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日，华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列，不仅可以对已知lncRNA进行定量分析，还可对 novel lnc
我国学者证明Opaque2可以调控玉米高效灌浆
1月31日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究组在Plant Biotechnology Journal 杂志上在线发表题为Transactivation of Sus1 and Sus2 by Opaque2 is an essential supplement to sucrose
植物所破解优质蛋白玉米育成之谜
2020年1月7日，《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究组和上海交通大学农业与生物学院王文琴研究组合作的题为Long-read sequencing reveals genomic structural variati
籽粒机收玉米“鲁单608”通过国家品种审定
近日，农业农村部发布品种审定公告。山东省农科院玉米所高产育种创新团队育成的早熟、耐密、抗倒、籽粒机收玉米新品种“鲁单608”通过国家审定。“鲁单608” 山东省农科院供图 玉米是我国第一大粮食作物。生产上玉米收获多采用果穗机收或人工收获方式，籽粒机收（直接在田间脱粒机收）占比不到5%，
籽粒机收玉米“鲁单608”通过国家品种审定
近日，农业农村部发布品种审定公告。山东省农科院玉米所高产育种创新团队育成的早熟、耐密、抗倒、籽粒机收玉米新品种“鲁单608”通过国家审定。 “鲁单608” 山东省农科院供图 玉米是我国第一大粮食作
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析（GWAS）是通过推断
植物表型成像系统助力研究促进玉米增产基因
玉米主要用作动物饲料，也可供人类食用，一小部分用于生产生物燃料。世界范围内，玉米年种植面积达1.8亿公顷，年产量接近10亿吨，是全球种植量最大的农作物。由于全球变暖以及极端天气状况对农业影响范围越来越广，研究新型玉米品种对保障充足的玉米产量极为重要，而通过选取促生长基因，育种者可以培育出改良的农作物
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
新技术缩短玉米穗腐病抗性育种时间
近年来，玉米穗腐病已成为威胁我国玉米生产的主要病害之一，其病原真菌主要是镰孢菌。已有研究表明，小麦、玉米中存在镰孢菌的抗性基因。其中，玉米中的ZmFER1基因可能具有镰孢菌病害抗性育种开发价值。 近日，中国农业科学院作物科学研究所玉米基因编辑育种研究团队，通过基因编辑靶向编辑玉米内源基因创制的
我国学者揭示玉米籽粒与植株发育调控新机制
近日，从河南农大传来消息，该校汤继华教授团队和中国农科院李文学团队合作，揭示了Urb2基因在玉米籽粒发育中的关键作用及其调控机制。相关研究成果发表在最近出版的国际著名期刊《新植物学家》杂志上。图片来源于网络 玉米籽粒发育是一个非常复杂的生物学过程，受到成百上千的基因调控，籽粒性状作为影响玉米产
河南大学最新文章解析玉米遗传突变
报道：干旱胁迫严重影响作物产量, 其所造成的损失几乎是其他自然灾害的总和。来自河南大学生命科学学院的研究人员近期利用自主性Mutator转座子玉米材料与玉米自交系材料杂交，获得了F1插入诱变群体, F1自交得F2群体，并进行了深入的突变体分析鉴定，为深入开展玉米抗旱育种提供了实验材料。
新型DNA测序方法助力干细胞分化研究
生物医学领域的一个重要研究课题是解释为何拥有完全相同DNA的细胞会分化成不同的功能细胞。美国的一支联合研究小组近日发现，环绕DNA的染色质蛋白在这一过程中扮演了重要角色。《自然》网站日前预先发表了相关论文。染色质蛋白的功能不仅仅限于包裹基因物质，它们可以影响DNA双螺旋的各个部分的打开和关闭状态，从
Nature：史上最大型RNA测序研究成果
来自日内瓦大学医学院的研究人员领导一个欧洲科学家小组，发布了一张人类功能性遗传变异的综合图谱。这一研究发表在9月15日的《自然》(Nature)和《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上，提供了有史以来RNA水平上最大的人类基因组与基因活性关联数据集。 了解每
单细胞RNA测序，众多研究都pick它
多细胞测序和单细胞测序，你pick谁？如今，大多数研究人员也许会选择后者，因为不一样的角度，会带来不一样的见解。 多细胞测序和单细胞测序，你pick谁？如今，大多数研究人员也许会选择后者，因为不一样的角度，会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究，可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环
在玉米全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础
近期，中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队在国际学术期刊Plant Biotechnology Journal上在线发表了题为“Genetic basis of kernel starch content decoded in a maize multi-parent population”的
研究揭示玉米胚乳早期发育新机制
4月8日，The Plant Cell 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Maize VKS1 Regulates Mitosis and Cytokinesis during Early Endosperm Development 的研究论文。该研
大豆突变体基因定位测序方法的改良
随着新一代测序技术的发展和全基因组测序（Whole Genome Sequencing, WGS）成本的不断下降，基于WGS的分离群体分组分析（Bulk Segregation Analysis，BSA）已经成为快速定位候选基因的常规工具，但已报道的方法依然有待完善。例如，依赖于自交系杂交的QT
在全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础
玉米是全球最重要的农作物之一。淀粉为玉米籽粒的主要组分，约占籽粒干重的70%，不仅是影响籽粒产量的重要因素，还为食品生产和工业加工如造纸业、医药行业、生物燃料等领域提供原料。因此，解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础，对高产优质玉米新品种的培育意义重大。 近日，中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队
双RNA测序技术
在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇研究论文中， 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制，以及在研究中获得的重要发现
科研人员创制玉米穗腐病抗性育种技术
近日，中国农业科学院作物科学研究所玉米基因编辑育种研究团队通过基因编辑靶向编辑玉米内源基因创制了一种突变体，并发现其在多环境下对玉米拟轮枝镰孢穗腐病具有明显抗性，为抗病育种提供了重要的种质材料与育种技术基础。近日，相关研究结果在线发表于《植物生物技术》（Plant Biotechnology J
科学家揭示玉米簇生花序如何影响产量
花序的分枝数目在一定程度上决定了籽粒数目，进而影响籽粒产量。近日，美国《国家科学院院刊》在线发表了华中农业大学玉米团队教授张祖新和美国加州大学伯克利分校教授Sarah Hake的合作成果。该成果揭示了Fascicled ear1位点两个基因的拷贝数变异可调控玉米花序分生组织细胞命运，并阐述了花序
应用Arraystar－ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期，其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明，Tug1能够直接结合PGC