数据非依赖采集DIA解决方案(四)
Skyline 软件Skyline 软件是华盛顿大学 MacCoss 教授实验室开发的目标蛋白质组学分析软件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 数据处理的权威工具,由于功能全面、性能强大而受到普遍认可,是目前使用最广泛的 DIA/SWATH 解析软件。通过与Thermo Fisher Scientific 的紧密合作,MacCoss 教授实验室有针对性地优化了 Skyline 对 Orbitrap 数据的处理,一步实现从原始数据到最终结果的完整 DIA 解析流程,使 Orbitrap DIA 如虎添翼。 以 Proteome Discoverer 软件(或 MaxQuant、Mascot 等)搜库鉴定结果为谱图库,导入 Skyline 软件;设置肽段、离子对挑选规则;将符合条件的肽段及子离子从谱图中挑选出来,生成 Target List......阅读全文
数据非依赖采集DIA-解决方案(四)
Skyline 软件Skyline 软件是华盛顿大学 MacCoss 教授实验室开发的目标蛋白质组学分析软件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 数据处理的权威工具,由于功能全面、性能强大而受到普遍认可,是目前使用最广泛的 DIA/S
数据非依赖采集DIA-解决方案(五)
九、相关产品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨质谱仪(Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF) UltiMate ™ 3000 RSLCnano 纳升超高效液相色谱仪 Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超
数据非依赖采集DIA-解决方案(三)
图 9. 三步完成 DIA 方法编辑 典型 DIA 数据如图 10 所示,从色谱图上看 DIA 数据与传统 Shotgun 数据没有明显区别,只是每个循环的二级谱图数量固定,因此扫描点分布均匀。 图 10. 典型的 DIA 数据 图 11. 四步完成 msxDIA 方法编辑 2. msxDIAOr
数据非依赖采集DIA-解决方案(二)
二、特点与优势 数据非依赖采集(DIA):• 采集所有离子及碎片谱图,不丢失任何信息,重现性好;• 数据易于追溯,即使目前的水平无法发现某些蛋白/ 化合物,未来可以回溯;• 无需优化方法,对于易降解样品可以即刻采集,获得数据后再深入挖掘;• 基于碎片离子(即母子离子对)定量,选择性好,与 SRM/M
数据非依赖采集DIA-解决方案(一)
一、数据非依赖采集(DIA)随着生命科学的快速发展,蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性转向定量。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达量及差异进行分析,对于生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义。基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集(Da
SCIEX发布全新数据非依赖性采集技术—Zeno-SWATH-DIA
弗雷明翰市,美国马萨诸塞州——作为生命科学分析技术创新者,SCIEX在2022年美国质谱年会(ASMS) 期间正式发布Zeno™ SWATH® 数据非依赖性采集(Zeno SWATH DIA)技术,标志着其在生物标志物发现及转化应用中又向前迈进了重要一步。 Zeno SWATH DIA实现了高保真
Thermo-Fisher-Scientific和Biognosys推出非相关数据采集(DIA)
分析测试百科网讯 在2017年6月4日-8日举行的ASMS 2017上,世界科学服务领先供应商赛默飞世尔科技公司宣布与下一代蛋白质组学领导者Biognosys AG达成共同营销协议,为数据库的创建和数据处理研究,通过组合使用Orbitrap质谱仪和Spectronaut Pulsar软件,为非相
SCIEX发布多领域应用的尖端SWATH非数据依赖型采集技术
——SCIEX 发布用于食品、法医和环境样品综合分析的尖端 SWATH 非数据依赖型采集技术SCIEX TripleTOF® 系统搭配 SWATH® 采集技术提供的强大功能实现了工业化蛋白质组学,这一模式现在有望在其他应用领域掀起类似变革 马萨诸塞州弗雷明翰(2017 年 6 月1 日)行业领先的
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(三)
对10 条肽段的分析结果汇总(表1),结果表明,3 种DIA 方法在fg ~ pg 数量级肽段范围内均显示出良好的线性、重现性和灵敏度。3 种方法的最低定量限均达到amol 级,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限达14 amol,超越了常规SRM 和PRM 的定量水平。比
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(二)
肽段纳流液相分离的出峰时间一般在30 s 以上,因此在合适的循环时间内,3 种DIA 方法可以根据样本复杂程度灵活调节质量范围、分辨率、选择窗口等参数,达到最佳分析效果。例如,分析分子量较大的肽段时,质量范围可以调整为m / z 400 ~1200 或更宽。 图1 基于Q-qIT-OT 的
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(一)
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析摘要 数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT 三
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA质谱采集技术引领生命科学前沿
2024年6月3日在2024 ASMS(美国质谱学会年会)上,全球生命科学分析技术创新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,这是全新一代数据非依赖采集(DIA)技术,将四极杆维度和Zeno Trap阱获得的丰富MS2数据相结合。 DIA以非依赖性的方式检测样品中的所有化
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA质谱采集技术引领生命科学前沿
在2024 ASMS(美国质谱学会年会)上,全球生命科学分析技术创新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,这是全新一代数据非依赖采集(DIA)技术,将四极杆维度和Zeno Trap阱获得的丰富MS2数据相结合。DIA以非依赖性的方式检测样品中的所有化合物,已成为从发现科
工业创新智能数据采集器应用解决方案
智能数据采集器SKA-A1 一.产品介绍1. 产品概述 智能数据采集器SKA-A1 采用全工业化硬件设计,适用于户外多变复杂的工作环境。采集器可直连运营商网络信号,帮助用户节省布线成本,免除大规模施工烦恼。同时,仪器还设计了GPS和GPRS传输方式,一路开关量输出,可满足用户对终端设备实时、动态监
SCIEX发布ZenoTOF-7600+新品!ZT-Scan-DIA实现精准蛋白质组学发现
2024年10月22日,在2024年第23届国际人类蛋白质组(HUPO)大会上,全球生命科学分析技术创新者SCIEX通过推出高分辨质谱ZenoTOF 7600+系统,进一步拓展了其高分辨率精确质量质谱系列产品,并宣布了三项新的合作以提升蛋白质组学能力。 作为ZenoTOF高分辨质谱系列的最新系
通过Zeno-SWATH-DIA,SCIEX宣布推出下一代数据独立采集技术
近日,丹纳赫公司(NYSE:DHR)旗下公司SCIEX推出Zeno SWATH DIA,这是生物标志物发现和翻译工作流程的重要一步。 Zeno SWATH DIA 是样本的最终数字记录,可以使研究人员发现更多的潜在生物标志物,可用于临床试验的开发和新疗法的发现。通过将 ZenoTOF 7600
破界而来-|-SCIEX发布ZenoTOF-8600旗舰新品:极速超敏多重碎裂高分辨质谱系统
美国东部时间2025年6月2日上午7时 在ASMS 2025年会上,全球生命科学分析技术创新者、丹纳赫集团(纽约证券交易所代码:DHR)旗下运营公司SCIEX正式推出ZenoTOF 8600系统,为高分辨质谱产品树立全新标杆。该系统在定性和定量的能力均有出色表现,其不仅提升了对复杂结构的解析能
Nature介绍2015值得关注的质谱技术:DIA策略
2014年末,《Nature Methods》杂志将年度技术授予了激光层照荧光显微技术(Light-sheet fluorescence microscopy)。同时,杂志也介绍了2015年值得关注的技术,包括非编码RNA、新一代CRISPR、DIA质谱以及微小晶体的结构等。 传统的
蛋白质DIA检测原理
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段,如iTRAQ\TMT、 Label-fr
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白(一)
引言数据非依赖性的扫描模式(data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。 DIA 扫描模式中,超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并
定量蛋白数>1000个!血液样本DIA技术“质”的提升
传统的蛋白质组技术,如iTRAQ、TMT或者label-free等,采用的是DDA(data-dependent acquisition,数据依赖采集)数据采集方式,其策略是对响应最高的部分母离子进行二级采集。而新一代的蛋白质组学技术DIA(Data Independent Acquisitio
数据采集器
数据采集器(Bar code Hand Terminal),又称盘点机、掌上电脑。它是将条码扫描装置与数据终端一体化,带有电池可离线操作的终端电脑设备。具备实时采集、自动存储、即时显示、即时反馈、自动处理、自动传输功能。为现场数据的真实性、有效性、实时性、可用性提供了保证。其具有一体性、机动性、
一小时-DDA-鉴定-DIA-定量-4000-个-Hela-蛋白(一)
引言数据非依赖性的扫描模式(data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。DIA 扫描模式中,超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快
新方法提升农兽药残留筛查效率
近日,中国农业科学院蜜蜂研究所(以下简称蜜蜂所)蜜粉源植物产地识别与控制团队基于液相串联高分辨质谱平台,开发一种新型集成式数据采集方法,适用于农产品中兽药、农药、霉菌毒素等混合污染物的高通量筛查,显著提升液相串联高分辨质谱技术在高通量筛查方面的准确性和实用性,为保障我国食品安全提供了一条新的策略
新品前瞻|突破800Hz极速边界!SCIEX新一代ZT-Scan-DIA全景质谱采集技术详解
延续经典,超越期待!全新一代SCIEX质谱系统即将重磅亮相,标志性ZT Scan DIA采集技术也将再度进化——突破每秒800Hz超高速扫描速度,结合新一代智能触发逻辑,将复杂样本的深度覆盖与数据完整性推向全新高度! 01 ZT Scan DIA介绍 ZT Scan DIA的核心创新在于通
专访苏黎世联邦理工学院Ruedi-Aebersold教授
苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold团队一直致力于蛋白质组学的研究,其中包括开发将蛋白质组作为一个完整实体加以研究的相关技术。通过与SCIEX合作,该团队开发了SWATH® 质谱采集技术,这是一种能够同时碎裂多种多肽的数据非依赖性采集(DIA) 方法。得到的全面数据集可以通过回溯进
GCMS数据采集
有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入,经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子。离子经质量分析器,检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机。样品由色谱柱不断流入离子源,离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱,只要设定好分析器扫描的质量范围和扫描时间,计算机就可以采集到一个个的质
GCMS数据采集
有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入,经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子。离子经质量分析器,检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机。样品由色谱柱不断流入离子源,离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱,只要没定好分析器扫描的质量范围和扫描时间,计算机就可以采集到一个个的质谱。
瑞士ELSYS数据采集仪
瑞轩电子科技(上海)有限公司-------国内一线仪器仪表供应商专业提供 欢迎前来咨询 是全国仪器仪表行业“产品研发、销售、技术培训、设备维修”为一体供应商 公司主要经营: 一、传感与测量仪器 (GE druck, GE Panametrics,GE Bently,Wika,H