蛋白质DIA检测原理
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段，如iTRAQ\TMT、 Label-free、SILAC采用的都是数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)。相对于DDA， DIA 具有更好的准确性和可重复性，是蛋白质组学研究的一大重要趋势。 下图为 DIA 定量技术原理图：......阅读全文
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（二）
FIGURE 2. Comparison of DDA and DIA raw data. (A) Comparison of MS1 base peak chromatograms. (B) Comparison of zoomedin chromatograms. (C) Composi
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（一）
Overview1) Purpose: Data Independent Acquisition (DIA) has been applied for large-scale protein and PTM quantification on the Thermo Scientific ™
蛋白质DIA检测原理
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段，如iTRAQ\TMT、 Label-fr
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（一）
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。DIA技术 新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术（shotgun，Label fr
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（二）
5.聚类分析为了进一步识别人群队列中潜在的相似代谢，基于KODAMA值进行partition around medoids clustering分析，鉴定到4个cluster(A,B,C,D)。比较有意思的是，不同cluster的PEs的发生具有显著差异，分别是Cluster A：71%，Clust
数据非依赖采集DIA－解决方案（五）
九、相关产品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨质谱仪（Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF） UltiMate ™ 3000 RSLCnano 纳升超高效液相色谱仪 Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超
数据非依赖采集DIA－解决方案（三）
图 9. 三步完成 DIA 方法编辑 典型 DIA 数据如图 10 所示，从色谱图上看 DIA 数据与传统 Shotgun 数据没有明显区别，只是每个循环的二级谱图数量固定，因此扫描点分布均匀。 图 10. 典型的 DIA 数据 图 11. 四步完成 msxDIA 方法编辑 2. msxDIAOr
数据非依赖采集DIA－解决方案（四）
Skyline 软件Skyline 软件是华盛顿大学 MacCoss 教授实验室开发的目标蛋白质组学分析软件（https://skyline.gs.washington.edu），是 DIA/SWATH 数据处理的权威工具，由于功能全面、性能强大而受到普遍认可，是目前使用最广泛的 DIA/S
数据非依赖采集DIA－解决方案（二）
二、特点与优势 数据非依赖采集（DIA）：• 采集所有离子及碎片谱图，不丢失任何信息，重现性好；• 数据易于追溯，即使目前的水平无法发现某些蛋白/ 化合物，未来可以回溯；• 无需优化方法，对于易降解样品可以即刻采集，获得数据后再深入挖掘；• 基于碎片离子（即母子离子对）定量，选择性好，与 SRM/M
数据非依赖采集DIA－解决方案（一）
一、数据非依赖采集（DIA）随着生命科学的快速发展，蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性转向定量。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达量及差异进行分析，对于生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义。基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集（Da
常见的质谱扫描模式丨DDA－－DIA
Data Dependent Acquisition DDA 1 之前已经提到，DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息，母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件，如信噪比，同位素分布，离子强度，选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z（通常为~1Da）窗口进行筛选目标离子减
Thermo－Fisher－Scientific和Biognosys推出非相关数据采集（DIA）
分析测试百科网讯 在2017年6月4日-8日举行的ASMS 2017上，世界科学服务领先供应商赛默飞世尔科技公司宣布与下一代蛋白质组学领导者Biognosys AG达成共同营销协议，为数据库的创建和数据处理研究，通过组合使用Orbitrap质谱仪和Spectronaut Pulsar软件，为非相
Nature介绍2015值得关注的质谱技术：DIA策略
2014年末，《Nature Methods》杂志将年度技术授予了激光层照荧光显微技术（Light-sheet fluorescence microscopy）。同时，杂志也介绍了2015年值得关注的技术，包括非编码RNA、新一代CRISPR、DIA质谱以及微小晶体的结构等。 传统的
定量蛋白数>1000个！血液样本DIA技术“质”的提升
传统的蛋白质组技术，如iTRAQ、TMT或者label-free等，采用的是DDA（data-dependent acquisition，数据依赖采集）数据采集方式，其策略是对响应最高的部分母离子进行二级采集。而新一代的蛋白质组学技术DIA（Data Independent Acquisitio
布鲁克发布PaSER重磅更新，强大新算法支持diaPASEF
布鲁克PaSER™ 2022软件加入TIMS DIA-NN模块，具有处理dia-PASEF®数据的能力 创新的TIMScore算法支持dda-PASEF数据和dia-PASEF库，与TIMS DIA-NN相结合，仅需35分钟梯度即可从200ng K562裂解液中鉴定约9000种蛋白质组 TI
SCIEX发布全新数据非依赖性采集技术—Zeno－SWATH－DIA
弗雷明翰市，美国马萨诸塞州——作为生命科学分析技术创新者，SCIEX在2022年美国质谱年会(ASMS) 期间正式发布Zeno™ SWATH® 数据非依赖性采集(Zeno SWATH DIA)技术，标志着其在生物标志物发现及转化应用中又向前迈进了重要一步。 Zeno SWATH DIA实现了高保真
最新高分文章套路－|－强强联合（脂质组+DIA），IF>10
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
最新高分文章套路－|－强强联合（脂质组+DIA），IF>10
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
一小时－DDA－鉴定－DIA－定量－4000－个－Hela－蛋白（二）
500 ng Hela 细胞裂解液用相同的色谱柱，相同的色谱梯度，将 QE HF 切换至 DIA 扫描模式进行 3 次 DIA 数据采集。在一次扫描循环中，目标母离子质核比范围 400–1000，四极杆的隔离窗口为 12 Da，包含 50 次 MS/MS 扫描。每一张 MS/MS 谱图中
一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。 DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并
一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白（二）
Skyline 中嵌入的 mProphet 软件会根据同一肽段的多个子离子峰的 feature 进行打分。 Feature 包括子离子共流出峰形、保留时间偏差、 dotp 值、信噪比等。为了区分假阳性的子离子峰， mProphet 可以建立 decoy 库，也可以将打分排名第二的肽段作为decoy，
一小时－DDA－鉴定－DIA－定量－4000－个－Hela－蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并快
DIA年会：以病患为中心新药研发与审评有哪些现实与挑战
5月22日，DIA开幕式上，沈阳药科大学药品监管科学研究所所长、礼来亚洲基金风险合伙人苏岭作为大会论坛主持人，他的开场白相当特别。他向参会的嘉宾展示着一个精美的手绘瓶，只见手绘瓶上画着一个微笑的女孩享受着阳光和美好的生活，而这一手绘出自一位多发性成骨不全的罕见病患者。 “这个世界上有很多和他一
Orbitrap－Exploris－480－DIA短梯度鉴定酒精性肝病生物标志物
以患者和/或家属回忆和口述的饮酒史作为两种疾病鉴别的主要依据, 得非常不可靠和牵强 非酒精性脂肪性肝病 (nonalcoholic fatty liver disease, NAFLD) 诊断要点 无饮酒史或饮酒折合乙醇量男性每周2有助于诊断； 肝脏B超或CT检查有典型表现； 排除嗜肝
DIA蛋白质组检测补体系统异常与精神疾病的关系
Less is more：DIA技术，2table+1figure，得一篇12分的Molecular Psychiatry文章Nature旗下的Molecular Psychiatry（IF=11.64）是精神疾病领域的top期刊。在19年1月发表了一篇题为“Complement pathway
DIA蛋白质组检测补体系统异常与精神疾病的关系
Less is more：DIA技术，2table+1figure，得一篇12分的Molecular Psychiatry文章 Nature旗下的Molecular Psychiatry（IF=11.64）是精神疾病领域的top期刊。 在19年1月发表了一篇题为“Complement
动态颗粒成像技术创新奖－岛津iSpect－DIA10申报ANTOP奖
面朝大海，春暖花开，希望如期而至的不止春天，还有疫情过后平平安安的你! 如今，2020 ANTOP奖申报窗口已全面开启，多家科学仪器企业竞相参与申报，这里将为您介绍ANTOP奖项“打榜”产品。岛津动态图像分析系统 iSpect DIA-10 DIA-10动态颗粒图像分析仪可用于颗粒形状，粒度以
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...（二）
肽段纳流液相分离的出峰时间一般在30 s 以上,因此在合适的循环时间内,3 种DIA 方法可以根据样本复杂程度灵活调节质量范围、分辨率、选择窗口等参数,达到最佳分析效果。例如,分析分子量较大的肽段时,质量范围可以调整为m / z 400 ~1200 或更宽。 图1 基于Q-qIT-OT 的
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...（三）
对10 条肽段的分析结果汇总(表1),结果表明,3 种DIA 方法在fg ~ pg 数量级肽段范围内均显示出良好的线性、重现性和灵敏度。3 种方法的最低定量限均达到amol 级,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限达14 amol,超越了常规SRM 和PRM 的定量水平。比
ASMS－2024－|－SCIEX全新ZT－Scan－DIA质谱采集技术引领生命科学前沿
2024年6月3日在2024 ASMS（美国质谱学会年会）上，全球生命科学分析技术创新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS，这是全新一代数据非依赖采集（DIA）技术，将四极杆维度和Zeno Trap阱获得的丰富MS2数据相结合。 DIA以非依赖性的方式检测样品中的所有化