创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(一)
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析摘要 数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT 三合一质谱,发展了经典DIA 方法以及WiSIM-DIA 和Full MS-DIA两种全新DIA 方法,并对Hela 细胞全蛋白中添加的10 条低浓度肽段进行定量分析,考察方法的线性、重现性和灵敏度。结果表明,3 种方法的定量限均低至amol (14 ~435 amol),并展示出良好的线性和定性确证可靠性。其中,WiSIM-DIA 基于超高分辨一级监测定量,与经典DIA 优势互补;Full MS-DIA 的选择窗口仅3 amu,能够直接进行搜库鉴定,实现了数据依赖性采集(DDA)和DIA 的统一,摆脱了DIA 依赖于DDA......阅读全文
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(一)
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析摘要 数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT 三
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(三)
对10 条肽段的分析结果汇总(表1),结果表明,3 种DIA 方法在fg ~ pg 数量级肽段范围内均显示出良好的线性、重现性和灵敏度。3 种方法的最低定量限均达到amol 级,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限达14 amol,超越了常规SRM 和PRM 的定量水平。比
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(二)
肽段纳流液相分离的出峰时间一般在30 s 以上,因此在合适的循环时间内,3 种DIA 方法可以根据样本复杂程度灵活调节质量范围、分辨率、选择窗口等参数,达到最佳分析效果。例如,分析分子量较大的肽段时,质量范围可以调整为m / z 400 ~1200 或更宽。 图1 基于Q-qIT-OT 的
SCIEX发布全新数据非依赖性采集技术—Zeno-SWATH-DIA
弗雷明翰市,美国马萨诸塞州——作为生命科学分析技术创新者,SCIEX在2022年美国质谱年会(ASMS) 期间正式发布Zeno™ SWATH® 数据非依赖性采集(Zeno SWATH DIA)技术,标志着其在生物标志物发现及转化应用中又向前迈进了重要一步。 Zeno SWATH DIA实现了高保真
数据非依赖采集DIA-解决方案(一)
一、数据非依赖采集(DIA)随着生命科学的快速发展,蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性转向定量。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达量及差异进行分析,对于生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义。基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集(Da
出色灵敏度提升复杂基质中目标肽段定量能力(一)
前言生物标志物的研究包括发现(Discovery),验证(Verification),确认(Validation) 阶段, 最后进入临床检验(Clinical Utilization)等更深入的阶段。在研究生物标志物的过程中,主要的挑战在于如何在成分复杂的生物样品中发现中等丰度或低丰度的蛋白
用于复杂基质残留分析时选择离子扫描程序的建立
单四极气相色谱质谱(DSQ)用于复杂基质中残留分析时选择离子扫描程序的建立 食品中农药残留物的分析方法,已有较多报道。但大多数样品是干扰较少的品种。但对于复杂的谷物类,动物源类样品,需要精心设计检测方法。该文使用Thermo的DSQ气质联用仪,详细描述了建立选择离子程序的过程,选择最能代表目标化合
出色灵敏度提升复杂基质中目标肽段定量能力(二)
高效液相色谱分离高效液相色谱仪: Thermo Scientific EASY-nLC 1000预柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(2cm, ID75μm, 3μm)分析柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(15cm, ID75μm, 3μm)流动相:A,含0.1% 甲酸的
数据非依赖采集DIA-解决方案(五)
九、相关产品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨质谱仪(Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF) UltiMate ™ 3000 RSLCnano 纳升超高效液相色谱仪 Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超
数据非依赖采集DIA-解决方案(三)
图 9. 三步完成 DIA 方法编辑 典型 DIA 数据如图 10 所示,从色谱图上看 DIA 数据与传统 Shotgun 数据没有明显区别,只是每个循环的二级谱图数量固定,因此扫描点分布均匀。 图 10. 典型的 DIA 数据 图 11. 四步完成 msxDIA 方法编辑 2. msxDIAOr
数据非依赖采集DIA-解决方案(四)
Skyline 软件Skyline 软件是华盛顿大学 MacCoss 教授实验室开发的目标蛋白质组学分析软件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 数据处理的权威工具,由于功能全面、性能强大而受到普遍认可,是目前使用最广泛的 DIA/S
数据非依赖采集DIA-解决方案(二)
二、特点与优势 数据非依赖采集(DIA):• 采集所有离子及碎片谱图,不丢失任何信息,重现性好;• 数据易于追溯,即使目前的水平无法发现某些蛋白/ 化合物,未来可以回溯;• 无需优化方法,对于易降解样品可以即刻采集,获得数据后再深入挖掘;• 基于碎片离子(即母子离子对)定量,选择性好,与 SRM/M
基质辅助激光解析仪高速数据采集系统设计和实现
生物安全是指生物性的传染媒介通过直接感染或间接破坏环境而导致对人类、动物或植物的直接或潜在的威胁。通过研究发现,传染媒介大部分是由微生物引起的。由于微生物种类繁多,且容易发生突变,在面对突发生物安全事件时,需要迅速确定微生物的种类及来源,才能够采取有效措施抑制传染媒介的扩散和发展,因此安全、可靠、快
数据采集系统的功能安全(一)
简介功能安全是诸多行业整体安全策略的一部分,其目的是将对人或作业设备造成伤害的概率降至可接受的范围以内。近年来,人们对系统功能安全的要求显著增长。从核电站到医疗设备,无故障系统已成为部分应用的理想选择,也是其他应用的必备条件。例如,在传感领域,获取的数据如果不正确或遭到损坏,结果可能具有破坏
Thermo-Fisher-Scientific和Biognosys推出非相关数据采集(DIA)
分析测试百科网讯 在2017年6月4日-8日举行的ASMS 2017上,世界科学服务领先供应商赛默飞世尔科技公司宣布与下一代蛋白质组学领导者Biognosys AG达成共同营销协议,为数据库的创建和数据处理研究,通过组合使用Orbitrap质谱仪和Spectronaut Pulsar软件,为非相
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
复杂基体中目标肽的测定
本文介绍了使用Thermo Scientific公司的TSQ Quantum Ultra质谱仪进行复杂生物机体中目标肽的方法,结果表明,基于串连质谱的选择反应监测(SRM)流程,该方法可以在具有高化合物背景的复杂基体中检测低浓度水平肽,同时保证良好的定量准确度和精密度。 目前一般生物标
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
工业创新智能数据采集器应用解决方案
智能数据采集器SKA-A1 一.产品介绍1. 产品概述 智能数据采集器SKA-A1 采用全工业化硬件设计,适用于户外多变复杂的工作环境。采集器可直连运营商网络信号,帮助用户节省布线成本,免除大规模施工烦恼。同时,仪器还设计了GPS和GPRS传输方式,一路开关量输出,可满足用户对终端设备实时、动态监
许国旺:复杂食品基质中兽药及代谢物非靶向筛查新策略
近日,大连化物所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)许国旺研究员团队在食品中风险物质非靶向筛查技术研究方面取得新进展,通过系统研究兽药及其相应代谢物的质谱碎裂特征,构建了复杂食品基质中兽药及其代谢物的非靶向筛查策略,可为食品中风险物的发现提供重要的技术手段。 食品安全关系国计民生,不断
非贴壁依赖性细胞的概念
不需要贴附到固体介质上才能生存和生长的细胞。大多数动物细胞在培养时,皆需贴壁。从形态上,贴壁依赖性细胞又常分为成纤维细胞和上皮样细胞等。
什么是胸腺非依赖性抗原?
胸腺非依赖性抗原(TI-Ag)是指刺激B细胞产生抗体时不需要Th细胞辅助的抗原。可分为TI-1抗原和TI-2抗原,如细菌脂多糖,聚合鞭毛素。
数据采集器
数据采集器(Bar code Hand Terminal),又称盘点机、掌上电脑。它是将条码扫描装置与数据终端一体化,带有电池可离线操作的终端电脑设备。具备实时采集、自动存储、即时显示、即时反馈、自动处理、自动传输功能。为现场数据的真实性、有效性、实时性、可用性提供了保证。其具有一体性、机动性、
成都生物所成功开发用于非目标型筛查的软件平台
食品安全是社会公共安全的重要环节,近年来,食品安全事件中出现的危害物种类逐年增加,从三聚氰胺毒奶粉和苏丹红事件,到各种添加剂的使用、农药残留、瘦肉精滥用、转基因作物的种植与安全、塑化剂和地沟油事件,无论深度和广度,涉及的危害物已不拘泥于食品添加剂和农兽药残留物质。 食品危害物种类繁多,如何
SCIEX发布多领域应用的尖端SWATH非数据依赖型采集技术
——SCIEX 发布用于食品、法医和环境样品综合分析的尖端 SWATH 非数据依赖型采集技术SCIEX TripleTOF® 系统搭配 SWATH® 采集技术提供的强大功能实现了工业化蛋白质组学,这一模式现在有望在其他应用领域掀起类似变革 马萨诸塞州弗雷明翰(2017 年 6 月1 日)行业领先的
非贴壁依赖性细胞的应用特点
细胞培养过程添加的血清中会含有贴壁因子,细胞就是靠这些贴壁因子而贴壁生长的,一般的,细胞都会贴壁生长,但是经过无血清驯化后的细胞,会从贴壁生长转到悬浮生长,目前在生物工程制药领域,趋势是使用无血清的悬浮培养为主。细胞不贴壁一样可以生长。
T细胞非依赖性激活过程
在没有T细胞帮助的情况下激活B细胞的抗原被称为T细胞非依赖性(TI)抗原,包括外来多糖和未甲基化的CpG DNA 。它们能够在缺乏T细胞的生物体中诱导体液反应。B细胞对这些抗原的反应是快速的,尽管所产生的抗体倾向于具有比T细胞依赖性激活所产生的抗体更低的亲和力和更少的功能。[7]与TD抗原一样,被T
GCMS数据采集
有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入,经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子。离子经质量分析器,检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机。样品由色谱柱不断流入离子源,离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱,只要设定好分析器扫描的质量范围和扫描时间,计算机就可以采集到一个个的质
GCMS数据采集
有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入,经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子。离子经质量分析器,检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机。样品由色谱柱不断流入离子源,离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱,只要没定好分析器扫描的质量范围和扫描时间,计算机就可以采集到一个个的质谱。
瑞士ELSYS数据采集仪
瑞轩电子科技(上海)有限公司-------国内一线仪器仪表供应商专业提供 欢迎前来咨询 是全国仪器仪表行业“产品研发、销售、技术培训、设备维修”为一体供应商 公司主要经营: 一、传感与测量仪器 (GE druck, GE Panametrics,GE Bently,Wika,H