定量蛋白数>1000个！血液样本DIA技术“质”的提升
传统的蛋白质组技术，如iTRAQ、TMT或者label-free等，采用的是DDA（data-dependent acquisition，数据依赖采集）数据采集方式，其策略是对响应最高的部分母离子进行二级采集。而新一代的蛋白质组学技术DIA（Data Independent Acquisition，数据非依赖采集）采用了不同的数据采集模式：将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂，从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息，实现了从传统的机枪扫射的方式向导弹轰炸方式的采集方式转变。 DIA（Data Independent Acquisition，数据非依赖采集）作为新一代的蛋白质组学技术，凭借其导弹轰炸式的全扫描数据采集方式，显著提升了蛋白质组学分析的覆盖度、重现性和准确性，已被众多顶级研究应用，并发表于Cell、Science、Nature Medicine、Circulation......阅读全文
定量蛋白数>1000个！血液样本DIA技术“质”的提升
传统的蛋白质组技术，如iTRAQ、TMT或者label-free等，采用的是DDA（data-dependent acquisition，数据依赖采集）数据采集方式，其策略是对响应最高的部分母离子进行二级采集。而新一代的蛋白质组学技术DIA（Data Independent Acquisitio
常见的质谱扫描模式丨DDA－－DIA
Data Dependent Acquisition DDA 1 之前已经提到，DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息，母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件，如信噪比，同位素分布，离子强度，选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z（通常为~1Da）窗口进行筛选目标离子减
质谱样本前处理步骤
生物样品基质复杂，且待测目标物多为内源性的化合物，如血清样本含有蛋白质、多肽、氨基酸、脂类、糖类、无机盐、维生素、有机酸、激素等。因此为了降低基质干扰、延长色谱柱使用寿命、防止系统堵塞损坏、提高检测灵敏度和特异性，往往需要对样品进行沉淀、萃取、净化、富集等前处理。 目前常用的样本前处理方法有：蛋白沉
质谱样本前处理步骤
生物样品基质复杂，且待测目标物多为内源性的化合物，如血清样本含有蛋白质、多肽、氨基酸、脂类、糖类、无机盐、维生素、有机酸、激素等。因此为了降低基质干扰、延长色谱柱使用寿命、防止系统堵塞损坏、提高检测灵敏度和特异性，往往需要对样品进行沉淀、萃取、净化、富集等前处理。 目前常用的样本前处理方法有：蛋白沉
Nature介绍2015值得关注的质谱技术：DIA策略
2014年末，《Nature Methods》杂志将年度技术授予了激光层照荧光显微技术（Light-sheet fluorescence microscopy）。同时，杂志也介绍了2015年值得关注的技术，包括非编码RNA、新一代CRISPR、DIA质谱以及微小晶体的结构等。 传统的
质谱样本制备技术资料
试剂耗材： Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips（eppendorf）、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Try
蛋白质DIA检测原理
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段，如iTRAQ\TMT、 Label-fr
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目，不一定要用到质谱技术简单说，蛋白质测序的方法有很多，一般是在构建完成后，通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后，用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
技术推广－DIA+PRM技术，全蛋白筛选及目标蛋白验证一体化
随着质谱仪器的不断更新换代，蛋白组学的技术也不断的革新，从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性；从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术，每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。 当下蛋白组学研究中
数据非依赖采集DIA－解决方案（一）
一、数据非依赖采集（DIA）随着生命科学的快速发展，蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性转向定量。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达量及差异进行分析，对于生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义。基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集（Da
数据非依赖采集DIA－解决方案（二）
二、特点与优势 数据非依赖采集（DIA）：• 采集所有离子及碎片谱图，不丢失任何信息，重现性好；• 数据易于追溯，即使目前的水平无法发现某些蛋白/ 化合物，未来可以回溯；• 无需优化方法，对于易降解样品可以即刻采集，获得数据后再深入挖掘；• 基于碎片离子（即母子离子对）定量，选择性好，与 SRM/M
ASMS－2024－|－SCIEX全新ZT－Scan－DIA质谱采集技术引领生命科学前沿
2024年6月3日在2024 ASMS（美国质谱学会年会）上，全球生命科学分析技术创新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS，这是全新一代数据非依赖采集（DIA）技术，将四极杆维度和Zeno Trap阱获得的丰富MS2数据相结合。 DIA以非依赖性的方式检测样品中的所有化
ASMS－2024－|－SCIEX全新ZT－Scan－DIA质谱采集技术引领生命科学前沿
在2024 ASMS（美国质谱学会年会）上，全球生命科学分析技术创新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS，这是全新一代数据非依赖采集（DIA）技术，将四极杆维度和Zeno Trap阱获得的丰富MS2数据相结合。DIA以非依赖性的方式检测样品中的所有化合物，已成为从发现科
SCIEX发布全新数据非依赖性采集技术—Zeno－SWATH－DIA
弗雷明翰市，美国马萨诸塞州——作为生命科学分析技术创新者，SCIEX在2022年美国质谱年会(ASMS) 期间正式发布Zeno™ SWATH® 数据非依赖性采集(Zeno SWATH DIA)技术，标志着其在生物标志物发现及转化应用中又向前迈进了重要一步。 Zeno SWATH DIA实现了高保真
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（一）
脂质组学技术 相比其他组学技术，脂质组学技术发展较晚，新颖性高，仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。DIA技术 新一代、革命性的蛋白质组技术DIA,相比传统的蛋白质组技术（shotgun，Label fr
强强联合（脂质组+DIA），IF>10（二）
5.聚类分析为了进一步识别人群队列中潜在的相似代谢，基于KODAMA值进行partition around medoids clustering分析，鉴定到4个cluster(A,B,C,D)。比较有意思的是，不同cluster的PEs的发生具有显著差异，分别是Cluster A：71%，Clust
DIA蛋白质组检测补体系统异常与精神疾病的关系
Less is more：DIA技术，2table+1figure，得一篇12分的Molecular Psychiatry文章 Nature旗下的Molecular Psychiatry（IF=11.64）是精神疾病领域的top期刊。 在19年1月发表了一篇题为“Complement
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
质谱检测法与蛋白质分析
在生命科学研究工作中有一个重要问题，就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息，我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来，从原则上来说，也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗，透过这个窗口，我们就能够对复杂的细胞调控网
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
布鲁克新品发布@USHUPO
#摘要# 应用在免疫肽组学的PaSER™ Novor，具有更快速、实时从头测序的特点 使用PaSER 2023b蛋白质组学软件实现无需构建谱图库的dia-PASEF数据分析（Library-free dia-PASEF®） 与Mass Dynamics合作, 实现4D-Proteomics
质谱技术有新用——临床样本的数字化进程
近日，来自瑞士的科学家在国际著名生物学期刊nature medicine发表了他们的一项最新研究成果，他们结合压力循环技术（PCT）和SWATH-MS技术提出一种将临床组织样本转换为单个数字文件的方法，应用这种方法对样本的蛋白组学信息进行记录，方便研究人员对样本信息进行反复分析和对比。这一方法的
质谱技术有新用——临床样本的数字化进程
近日，来自瑞士的科学家在国际著名生物学期刊nature medicine 发表了他们的一项最新研究成果，他们结合压力循环技术（PCT）和SWATH-MS技术提出一种将临床组织样本转换为单个数字文件的方法，应用这种方法对样本的蛋白组学信息进行记录，方便研究人员对样本信息进行反复分析和对比。这一方法
质谱检测样本氦3含量－打开月球能源宝库大门
7月12日，国家航天局探月与航天工程中心在北京国家天文台举行嫦娥五号任务第一批月球科研样品发放仪式，13家科研机构成为首批开展月球科研样品研究的单位。 本报策划了“走近月壤研究”系列选题，带你看看嫦娥五号奔赴月球“挖矿”，辛苦“背回”的月壤究竟能揭示月球哪些特征，不同科研机构又能从中获得哪些
行稳致远－|－ZenoTOF－7600系统稳定实现大队列定量蛋白质组分析
概述本技术文档1展示了ZenoTOF 7600系统扩展微升流速应用于蛋白质组学分析的性能和稳健性。该系统除常规调谐和校准外，连续运行28周，期间未对仪器进行清洗和维护。在连续运行的前21周时间内，通过定期质量控制(QC)测试来评估系统稳健性，使用Zeno SWATH DIA方法分析5 ng和50
黄超兰发《自然通讯》－DIA定量质谱研究COVID19早期免疫抑制
2020年11月17日，Nature Communication（自然通讯）在线发表了北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰课题组的研究成果：COVID-19疾病早期的免疫抑制（Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease
全国质谱分析学术研讨会：组学及生命分析分会
2014年4月27日下午，中国化学会首届全国质谱分析学术研讨会组学及生命分析分会在北京西郊宾馆召开。在此次的组学及生命分析分会报告中邀请了清华大学化学系/分析中心的梁琼麟教授； 中国科学院大连化学物理研究所的张丽华教授；中国科学院北京基因组研究所的刘斯奇教授； 复旦大学的陆豪杰
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析1
引言 数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）是当前最热门的质谱采集技术之一，它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口，依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似，也是基于子离子（transition）定量，相比
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质