QExactive中TMT定量工作流程的参数优化和ProteomeDi...（一）
Q Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome Discoverer2.1数据处理方法Xiaoyue Jiang1, Tabiwang Arrey2, Eugen Damoc2, Michaela Scigelova2, David Horn1, Rosa Viner1, and Andreas F.R. Huhmer11Thermo Fisher Scienti c, San Jose, CA, USA; 2Thermo Fisher Scienti c, Bremen, Germany关键词Q Exactive Plus，Q Exactive HF，TMT，Proteome Discoverer 2.1，蛋白质鉴定，相对定量，同量异序标签，多重定量研究目标在 Thermo ScientificTM Q ExactiveTM 仪器平台上，采用 Thermo ScientificTM TMTsixple......阅读全文
Q－Exactive－Focus－结合－Compound－Discoverer实现泮托拉唑...（二）
3.1.2 更精准的四极杆隔离母离子提升二级谱图特征性在做二级碎裂时，需要使用四极杆筛选出母离子，送入碰撞池碰撞碎裂，进而获得二级高分辨质谱图，Q Exactive Focus 采用高性 能双曲面四极杆，具有低至 0.4 amu 的母离子选择能力，图 3 比较了不同母离子隔离宽度下杂质 367
赛默飞多款色谱与质谱仪器斩获《分析科学家》等奖项
2017年2月7日，北京 ——近日，科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技（以下简称：赛默飞）多款色谱与质谱产品获得《分析科学家》（The Analytical Scientist）和“药物厂商评价创新大奖”（The Medicine Maker Innovation Awards 2016）。
赛默飞Q－Exactive－Plus近460万中标中国地质大学采购项目
分析测试百科网讯 近日，中国地质大学（北京）液相色谱-四极杆-超高分辨组合式质谱仪设备购置项目（项目编号：BIECC-ZB7384）组织采购，兼顾大分子（蛋白质）和小分子（农药残留、有机物污染物等）定性和定量分析。主要功能包括蛋白质组学：蛋白质组学研究中的蛋白质鉴定、翻译后修饰、生物大分子相互作用、
简化流程、快速优化的HPLC系统
仪器设备的精密性和稳定性是过程分析中获得可靠分析结果的前提，除此之外，还必须排除操作过程中的误差来源，通过适当的软件设置和易于操作的系统即可实现上述目标。 过程分析对于所应用的分析系统及其操作提出了特殊要求。要获得准确、可靠的结果，必须保证仪器系统的精密性和稳定性，这样才能确保结果准确且具
技术推广－DIA+PRM技术，全蛋白筛选及目标蛋白验证一体化
随着质谱仪器的不断更新换代，蛋白组学的技术也不断的革新，从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性；从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术，每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。 当下蛋白组学研究中
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析1
引言 数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）是当前最热门的质谱采集技术之一，它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口，依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似，也是基于子离子（transition）定量，相比
应用气相静电场轨道阱质谱联用对制药包装容...（一）
应用气相-静电场轨道阱质谱联用对制药包装容器材料中可浸出杂质结构确证分析关键词 可萃取物和可浸出物、Q Exactive GC、静电场轨道阱（Orbitrap）质谱仪、差异分析、未知物鉴定、容器密闭系统、制药。 前言 塑料、聚合物及其它制药产品专用包装材料可析出具有潜在毒性的化学杂质，针对此类物质的
ADC－单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...（二）
2.1.3 数据分析方法采用 Protein Deconvolution 2.0 软件对原始质谱图进行去卷积处理，得到完整的蛋白质分子量信息。 2.2 氨基酸序列、糖基化位点和 ADC 药物结合位点测定 2.2.1 仪器和试剂质谱仪器：Q-Exactive（赛默飞世尔科技，美国）；色谱仪器：Acce
赛默飞世尔科技举办2014－CPSA欢迎晚宴
2014年4月16-19日，第五届中国上海化学与药物结构分析会议(Chemical &Pharmaceutical Structure Analysis) (CPSA Shanghai 2014)上海浦东新区淳大万丽酒店召开。16日下午举办了2014 CPSA会前研讨会及开幕式
qpcr中的相对定量和绝对定量的区别
荧光绝对定量中标准品：指用含有目的基因的质粒，知道质粒的分子量和浓度计算出拷贝数，然后倍比稀释就作为绝对定量的标准品。获取：把目的基因p出来，然后接到质粒上，转染摇菌扩增，然后再抽质粒，酶切纯化。最后把纯化的目的基因做个鉴定。
qpcr中的相对定量和绝对定量的区别
绝对定量是用已知浓度的标准品绘制标准曲线来推算未知样品的量，绝对定量不同于相对定量，我们是验室用BIOG KIT做PCR实验检测目标RNA，做下来CT值在28左右，S型曲线比较典型
赛默飞世尔科技举办CPSA－2012招待晚宴
2012年4月25日，第三届中国上海化学与药物结构分析会议(Chemical &Pharmaceutical Structure Analysis) (CPSA Shanghai 2012)在上海浦东新区淳大万丽酒店召开，来自国际知名药企、跨国大制药公司、中国CRO、
地埋一体化设备工作原理和流程
概述 随着我国对外开放的不断深入，我国旅游业及房地产业蓬勃发展，高级宾馆及别墅小区拔地而起，而高级宾馆及别墅小区往往又远离城市污水处理厂，给集中处理生活污水带来不便，为了保护环境，造福子孙后代，由我们依托高校环保专业研发的污水处理设备，该设备采用世界上先进的生物处理工艺，集去除BOD5、COD、
实时荧光定量PCR（RealTimePCR）实验流程（一）
一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录) 不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法，因为Real-TimePCR对RNA样品的质量要求较高，所以，正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法，在实验过程中要防止RNA的降解，保持RNA的完整性。 在总rna的提取过程中，注意避免mRNA
赛默飞世尔科技CPSA－2013报告集锦
2013年4月24日，第四届CPSA上海年会在上海淳大万丽酒店举行。来自国际知名药企、跨国大制药公司、生物医药研究所和高校的高管、专家、学者百余人参加了本次会议。赛默飞世尔科技作为金牌赞助商参加会议，并围绕其在生
质谱技术在食品组学分析中的应用
食品组学（Foodomics）将蛋白组学和代谢组学等组学的分析思路和方法，运用到食品分析和营养学分析范畴的一种研究方式，常用于鉴别食品的物种、产地和品质。“挂羊头，卖狗肉”是日常用的一个熟语。自从2013年欧盟“马肉风波”之后，中国肉类掺假的现象也屡见报道，进一步加深了人们对肉类真实性的担忧。目前最
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（六）
为了评价使用 250×0.2 mm PepSwift 整体柱时仪器的检测限，采集了一系列进样量的 LC/MS 样品。将 50pg-20ng 的完整抗体从最低浓度开始注入色谱柱（图 8）。在序列开始之前和各样品之间运行两针空白样品，以排除残留的影响。通过这种方法，我们发现完整抗体的最低检测限是
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（四）
表 4 显示的是轻链、非糖基化重链和完整抗体的计算质量数，分别从轻链的 213 和重链的 451 位氨基酸开始逐步计算。两个蛋白序列都包含的 N- 末端谷氨酰胺应会被修饰为焦谷氨酸，这将导致质量数丢失 17.0265 Da。此外，重链中 C- 末端赖氨酸有可能被切掉，导致质量数丢失128.0
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（五）
表 5. 单糖的化学组成和分子量 表 6. 用于计算表 4 和表 5 分子量的元素的单同位素原子量和平均原子量 最初的计算是根据发表在 DrugBank 数据库【2】的序列进行的，然而计算结果与我们实验测得的质量数并不匹配。通过将 DrugBank 中的序列与之前文献发表过的序列【3】进行
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（三）
图 2. 抗体上常见的糖链结构的命名 图 3 显示的是用 250×0.2 mm 内径整体柱分析 20 ng 利妥昔抗体得到的一级质谱图。在 m/z 1800–5000 范围内采集的质谱图显示了大分子蛋白质的典型电荷分布。插图显示的是 m/z 3269 时，放大的最大丰度电荷态（z=+45)
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（七）
图 11. 将利妥昔抗体还原、烷基化、胰蛋白酶切后，酶切后肽段的基峰色谱图。 图 12. 利妥昔单抗轻链和重链的氨基酸序列。黑色字母显示的氨基酸代表通过二级质谱图鉴定到的部分。绿色显示的序列是仅通过完整肽段一级全扫描数据鉴定到的。红色显示的是重链部分的两个氨基酸（AK），他们既不能用一级也
液相色谱耦联Q－Exactive－台式轨道阱质谱仪分析利...（二）
其他实验均采用 Thermo ScientificTM NanoFlexTM 离子源进行，离子源上配置 15 cm 的 PicoTipR 喷雾针（New Objective，Woburn，USA；20 μm 内径，360 μm 外径，10 μm 针尖)，流速为 1 μL/min，电压为 1.
赛默飞世尔科技发布用于Exactive台式LCMS系统的最新软件
ExactFinder软件为进行目标化合物和未知化合物筛选的实验室提供简化的工作流程 亚特兰大(2011年3月16日)——全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技，今日发布最新Thermo Scientific ExactFinder软件，应用于采用Orbitrap™技术
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（二）
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
质谱技术在食品组学分析中的应用
民以食为天，但随着社会发展，食品生产中以假乱真、以次充好的水平和手段却越来越高明，仿真度极高的伪劣产品给分析工作带来了巨大困难，使许多传统的鉴别方法失效，如何运用新型的技术手段来进行鉴定食品的真实性，已成为当下食品科技的研究前沿——食品组学。 食品组学（
茶叶中的农药多残留分析:QuEChERS方法萃取后优化净化流程
我国是传统的茶叶生产、消费和出口大国，茶叶是人们日常生活中不可缺少的饮品。在茶叶的秤和保存过程中，人们往往使用农药进行灭虫。农药中含有多种有毒物质，在杀死害虫的同时，对人体也造成损害。国内外对茶叶中的农药残留量有极其严格的限制，因此对于检测技术的要求也日趋严苛。及时研发茶叶及茶叶制品中多种农药残留的
茶叶中的农药多残留分析:QuEChERS方法萃取后优化净化流程
我国是传统的茶叶生产、消费和出口大国，茶叶是人们日常生活中不可缺少的饮品。在茶叶的秤和保存过程中，人们往往使用农药进行灭虫。农药中含有多种有毒物质，在杀死害虫的同时，对人体也造成损害。国内外对茶叶中的农药残留量有极其严格的限制，因此对于检测技术的要求也日趋严苛。及时研发茶叶及茶叶制品中多种农药
10标串联质谱标签（TMT）能更快速定量肿瘤蛋白
在过去十年中，基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变，但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）的蛋白组学研究表明，将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合，才能改善癌症通路的鉴定。图片来源于网络 然而，实体瘤组织在组成上比细胞系要复
荧光定量PCR详细流程和问题解析
选择单通道实验还是多通道实验？这是要根据实验需要来选择的，如果有一个、两个或是三个基因要进行比较，并用看家基因进行对照，可以考虑选择多通道实验。多通道实验的好处是可以消除样本加样的误差。但要克服的困难也比较多，一是条件的优化比较麻烦，即多种PCR反应以及探针要在同一个反应条件下进行，并且效率都要比较
赛默飞在HUPO上发布两款新质谱
Thermo Scientific Exactive Plus EMR 和 Q Exactive Plus Orbitrap 系统在 HUPO上加入最新 Orbitrap Fusion Tribrid 和 TSQ Quantiva 以及 Endura 系统 YOKOHAMA,HUPO,Sept.