全基因组表达谱芯片应用于TMED3调控原发性肝细胞癌...

全基因组表达谱芯片应用于TMED3调控原发性肝细胞癌(HCC)的转移机制研究原发性肝细胞癌(HCC)肝内外转移是导致临床手术后病人预后较差的重要原因之一。由于目前临床上尚缺乏有效的靶向治疗肝癌的化疗药物,寻找治疗HCC转移的有效靶点一直是科学家关注的重点。来自东方肝胆外科医院周伟平教授,第二军医大学微生物教研室任浩教授,上海同仁医院马俐君教授的研究团队通过临床样本,细胞系功能实验的研究,发现TMED3的异常表达与肝细胞癌转移和病人生存率相关,且通过调控IL-11/STAT3 Pathway 影响细胞转移。该研究的发现为治疗HCC的转移提供了一个新的治疗靶标。研究思路 研究结果1.TMED3在HCC病人中的表达情况 TMED3被发现在Colon cancer能够抑制肿瘤细胞的转移,但是TMED3在HCC的作用目前还没有相关研究。研究人员首先在60对HC......阅读全文

全基因组表达谱芯片应用于TMED3调控原发性肝细胞癌...

全基因组表达谱芯片应用于TMED3调控原发性肝细胞癌(HCC)的转移机制研究原发性肝细胞癌(HCC)肝内外转移是导致临床手术后病人预后较差的重要原因之一。由于目前临床上尚缺乏有效的靶向治疗肝癌的化疗药物,寻找治疗HCC转移的有效靶点一直是科学家关注的重点。来自东方肝胆外科医院周伟平教授,第二军医大学

谱芯片应用于TMED3调控原发性肝细胞癌HCC的转移机制研究

  原发性肝细胞癌(HCC)肝内外转移是导致临床手术后病人预后较差的重要原因之一。由于目前临床上尚缺乏有效的靶向治疗肝癌的化疗药物,寻找治疗HCC转移的有效靶点一直是科学家关注的重点。来自东方肝胆外科医院周伟平教授,第二军医大学微生物教研室任浩教授,上海同仁医院马俐君教授的研究团队通过临床样本,细胞

《Scientific-Reports》报告HCC转移新机制

  原发性肝细胞癌(HCC)肝内外转移是导致临床手术后病人预后较差的重要原因之一。由于目前临床上尚缺乏有效的靶向治疗肝癌的化疗药物,寻找治疗HCC转移的有效靶点一直是科学家关注的重点。来自东方肝胆外科医院周伟平教授,第二军医大学微生物教研室任浩教授,上海同仁医院马俐君教授的研究团队通过临床样本,细胞

什么是原发性肝细胞癌?

核心提示: 发生在肝脏的恶性肿瘤很多,但大体可分为原发性肝癌和继发性肝癌两大类。如果发现了肝脏有肿瘤,必须鉴别这个肿瘤是在肝脏发生的,还是由别处的恶性肿瘤转移过来的。如果肿瘤是在肝脏发生的称为原发性肝癌,否之则为继发性肝癌。那什么是“原发性肝细胞癌”,肝脏主要有两大类细胞,是肝

全表达谱的定义

中文名称全表达谱英文名称global expression profile定  义反映待检样品中所有基因的表达情况的图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

The-Plant-Cell:利用Agilent表达谱芯片研究茉莉酸调控拟南...

The Plant Cell:利用Agilent表达谱芯片研究茉莉酸调控拟南芥抗冷害反应和作用机制中国科学院西双版纳热带植物园余迪求课题组致力于研究改良农作物抵抗外源逆境因子胁迫的重要功能基因及其信号分子。最新研究发现,植物激素茉莉酸能够提高拟南芥抗冻害反应,并利用Agilent表达谱芯片,挖掘茉莉

表达谱基因芯片实验

表达谱基因芯片可应用于:(1)疾病诊断;(2)新药开发;(3)环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记,在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号

microRNA-芯片与表达谱芯片的联合应用

microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前, 国际上许多科研

GP73在肝细胞癌和胆管细胞癌中的表达

GP73在肝细胞癌和胆管细胞癌中的表达邹 凡1a,揭小华1a,巢映晖1b,傅华群1b,王荣胜2,王开阳1c,昌毓穗1d(1.南昌大学a.临床医学院2012级;b.第二附属医院肝胆外科;c.第二附属医院急诊科;d.附属医院急诊科;2.江西省人民医院ICU,南昌330006)摘要:目的 探讨血清高尔

表达谱芯片的介绍与应用

  基因表达谱芯片可使是科研工作者实现在MRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。 它与传统的研究基因表达的方法(如差异cDNA文库筛选、Northern blot和PCR)相比较,可为使用者节省大量的研究经费和时间并获得范围更广、更具有关联性的研究结果。它的主要用途是用于大规模分

表达谱芯片的介绍与应用

基因表达谱芯片可使是科研工作者实现在MRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。 它与传统的研究基因表达的方法(如差异cDNA文库筛选、Northern blot和PCR)相比较,可为使用者节省大量的研究经费和时间并获得范围更广、更具有关联性的研究结果。它的主要用途是用于大规

Agilent表达谱芯片研究茉莉酸调控南芥抗冷害反应和作用

   中国科学院西双版纳热带植物园余迪求课题组致力于研究改良农作物抵抗外源逆境因子胁迫的重要功能基因及其信号分子。最新研究发现,植物激素茉莉酸能够提高拟南芥抗冻害反应,并利用Agilent表达谱芯片,挖掘茉莉酸通过多条信号通路提高植物的抗冻害反应。该成果发表于顶尖杂志The Plant Cell。

Science发布肝癌研究重要发现

  通过比较肿瘤和正常组织,研究人员发现了一个在纤维板层肝细胞癌(fibrolamellar bepatocellular carcinoma.FLHC)中表达的嵌合转录物,他们将研究结果发布在本周的《科学》(Science)杂志上。   在洛克菲勒大学Sanford Simon的领导下,

表达谱基因芯片实验操作流程

一、试剂1. TRIzol2. 异丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 无水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 杂交试剂110. 标记试剂I11. 杂交试剂212. 标记试剂II13. 反转录酶14. 

生物芯片入门(三):基因表达谱芯片实验操作1

待检测样品制备生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应,必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度,但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰,杂合癌基因的检

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

Nat-Commun-|-蛋白质组学揭示病毒性肝癌治疗靶点

  发性肝癌是一种高度异质性肿瘤。其组织学病理分型可分为肝细胞肝癌、肝内胆管细胞癌和混合型肝癌三种类型。在亚洲,乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)感染在肝细胞癌的发生发展中起主要作用。在西方,酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝炎是更普遍的驱动因素。尽管阿替利珠单抗联合贝伐单抗一线治疗晚期肝癌取

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

  表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。    CpG岛的异常甲基化是导致基

基于超声原发性肝细胞癌微血管侵犯状态全面预测新思路

  原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界常见的恶性肿瘤之一,致死率位居第二。其中微血管侵犯(microvascular invasion,MVI)是HCC具有侵袭性生物学行为的标志,被证实是HCC复发风险的重要预测指标,MVI状态关系到患者治疗方案的选择以

基因是否表达:cfDNA全基因组测序可揭晓

  《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的

Nature子刊:肝炎与肝癌联系的新发现

  最近,日本理化学所(RIKEN)的科学家们,利用全基因组测序首次证实,慢性肝炎感染和炎症可能对肝脏肿瘤中发现的基因突变,产生深远的影响,从而为更好理解慢性肝炎导致癌症的机制,铺平了道路。相关研究结果发表在最近的《自然通讯》(Nature Communications)。  原发性肝癌是全世界癌症

一例原发性肝细胞癌合并颅眶组织受侵病例分析

患者男,59岁,诊断肝细胞癌1个月,眼眶占位1周。患者因腹部不适入院,既往饮酒、吸烟史30年,有乙、丙型肝炎病史和肝癌家族史。 查体:右下腹部轻压痛。行腹部超声、腹部CT和三期增强扫描示,肝内多发占位;未行头部CT等检查。 超声引导下活组织检查示,中分化肝细胞癌;结合免疫组化诊断为原发性肝细胞癌,肝

基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓

  8月29日,《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的

中国烟草局联合Affymetrix成功研发烟草全基因组基因芯片

  烟草全基因组基因芯片(Tiling)目前由中国烟草制作完成。该芯片是全球第一套基于全基因组水平的高密度表达谱芯片,是现有烟草基因芯片中探针密度最高、覆盖基因数最多的一款芯片。这是在绒毛状烟草和林烟草全基因组序列精细图谱绘制完成基础上,我国烟草基因组计划重大专项取得的又一项重要的标志性成果。

雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌

浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1 p