新冠样本准确度达91.4%陈德喜团队提出基于mNGS的新方法

在大多数严重的急性呼吸道感染病例中,RNA病毒是主要病原体,如2019年12月以来的新冠病毒(SARS-CoV-2),已导致全球超过400万人感染,超过30万名患者死亡[1,2]。mNGS因无需培养、不依赖核酸序列、无偏好广覆盖的优点,在临床疑似新发病原体、罕见病原感染、急危重症、未知原因发热等患者病原检测应用有较多案例报道,国内专家共识推荐使用[3]。但是这种实验室自建检测方法由于缺乏方法标准化和实验室分析性能和临床性能的确认,阻碍了该方法在临床的应用普及[4]。来源:medRxiv 首都医科大学陈德喜教授团队基于illumina Nextera XT Tn5转座酶直接切割RNA/DNA杂合链的特性[5],优化mNGS建库方法,并在NextSeq 500平台上对该方法在临床检测呼吸道RNA病毒的各项性能指标进行了确认,包括低检测限、精密度、稳定性、抗干扰能力以及SARS-CoV-2病毒检测准确性等,为mNGS临床实验室常......阅读全文

新冠样本准确度达91.4%-陈德喜团队提出基于mNGS的新方法

  在大多数严重的急性呼吸道感染病例中,RNA病毒是主要病原体,如2019年12月以来的新冠病毒(SARS-CoV-2),已导致全球超过400万人感染,超过30万名患者死亡[1,2]。mNGS因无需培养、不依赖核酸序列、无偏好广覆盖的优点,在临床疑似新发病原体、罕见病原感染、急危重症、未知原因发热等

新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证

据物理学家组织网9日报道,通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,巴西圣保罗联邦大学(UNIFESP)的科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。 在本研究中,来自UNIFESP的科研团队通过直接RNA测序,

前沿报道|新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证

北京11月10日。据物理学家组织网9日报道,通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,巴西圣保罗联邦大学(UNIFESP)的科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。在本研究中,来自UNIFESP的科研团队通过直接RNA

新冠病毒RNA直接测序-这次科学家得到了什么?

  澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及合作者,提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列,详细介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构,并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相关论文3月7日发布于预印本服务器bioRx

空气中测出新冠病毒RNA,气溶胶真的可以传播新冠肺炎吗

据世界卫生组织报道,截至欧洲中部时间27日10时(北京时间27日16时),全球新冠肺炎确诊病例已到达2878196例,死亡超过198668例。 随着全球新冠肺炎疫情升温,人类对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的研究越来越多,虽然人类认识SARS-CoV-2已经3个多月了,但关于新冠的不解之谜越来

RNA病毒介绍

RNA是核糖核酸,single-stranded是单链。一般看脱氧核糖核酸(DNA)的图片都是有两条链扭在一起,而核糖核酸一般都是单链的。讲到ssRNA,一般都是在说RNA病毒。一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。(1)正链RNA病毒(

MagaBio-plus病毒DNA/RNA纯化试剂盒III在新冠病毒疫情防控...

MagaBio plus病毒DNA/RNA纯化试剂盒III在新冠病毒疫情防控的应用新冠病毒疫情防控一直是一项重要的任务,在疫情的检测中,通过核酸检测试剂盒进行检测是最重要的确诊手段之一。而检测试剂盒不可或缺的部分是核酸分离纯化试剂盒,需要先分离后才能检测。杭州博日科技作为中国PCR行业的领军者,拥有

上海研制的“新冠病毒体外转录RNA标准物质”获批

  记者23日从上海市市场监管局获悉,上海研制的“新冠病毒体外转录RNA标准物质”近日被批准为国家级标准物质,能有效评价新冠病毒核酸检测试剂盒的准确性。这是新冠病毒首个由地方研制成功并获国家批准的体外转录RNA标准物质,可供国内外核酸试剂盒生产企业和研发机构使用,研制及审批时间从一年以上缩短至两个月

研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构

  由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构,整体分辨率达到2.9 埃(Å)。  该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,

哪些病毒属于RNA病毒?

  RNA病毒是指病毒的遗传物质为核糖核酸(RNA)的一类病毒。这类病毒包括了多种类型,常见的有流感病毒、艾滋病毒(HIV)、丙肝病毒(HCV)、冠状病毒(包括新型冠状病毒SARS-CoV-2)、鼻病毒等。这些病毒在全球范围内都有分布,且有些还会引起季节性流行或在特定地区流行,例如流感病毒和冠状病毒

病毒RNA提取实验

TE-饱和酚/氯仿提取法             实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获

植物病毒RNA提取

大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。   一、材料   提纯TMV病毒液(10mg/ml)。   二、设备   冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。   三、试剂   TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿

RNA病毒的简介

  RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif -lower mosaic virus),几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80~160nm,为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中,其错误修复机制的酶的活性很低很低,几乎是没有

提取病毒RNA方法

一、用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题):1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,

双RNA病毒介绍

本科病毒形态与呼肠孤病毒相似,过去归于呼肠孤病毒科,亦曾作为分类地位 未定的病毒。1973年,当人们认识到该科成员中的传染性胰坏死病毒和传染性 法氏囊病病毒在形态学上很相似,尤其是它们的基因组都含有双股双节段RNA后 ,建议设立一个新科。1984年正式命名为双RNA病毒科。在国际病毒分类委员会(IC

病毒RNA提取实验

病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒复制机制研究;(2)用于反向遗传学研究;(3)用于分子病毒学其他研究。实验方法原理大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。实验材料TMV病毒液试剂、试剂盒TE-饱和酚:氯

病毒RNA提取实验

实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。实验材料 TMV病毒液试剂、试剂盒 TE-饱和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE缓冲液双菌水仪器、耗材 冷冻台式离心机低温真空干燥仪电泳仪电泳槽实验步骤 一、实验

RNA病毒类型介绍

病毒的核酸包括双链DNA(dsDNA)、单链DNA(ssDNA)、双链RNA(dsRNA)、正单链RNA(+ssRNA)、负单链RNA(-ssRNA)五种不同类型。病毒颗粒中的组成成分有简有繁,有的用颗粒自带专门用于病毒复制的核酸酶,有的则无。有些RNA病毒的RNA并不仅有一个分子,如流感病毒有8条

科学研究!新冠病毒RNA是否能够整合进宿主基因组?

  新型冠状病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范围肆虐的病因。该病毒为一种单股正链RNA病毒,具有高传染性特性,能够感染人体各代谢系统的多种组织器官,并引发严重的临床症状,深入研究新冠病毒基因组RNA的特性十分必要。  2021年8月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中

赛默飞推出AcroMetrix新冠病毒RNA对照品-有2种不同浓度

  分析测试百科网讯 2020年3月31日,赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)宣布推出AcroMetrix冠状病毒2019(COVID-19)RNA Control,这是其最新的质量控制产品,可用于验证COVID-19分子诊断测试。  为了与最近爆发的新冠肺炎抗争,赛

新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构获解析

  近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。  3月17日,相关

RNA修饰对新冠病毒2019nCoV多个方面能力影响的研究应用

随着新冠病毒肺炎疫情在全世界大范围的爆发,我们不得不加紧步伐开拓对新冠病毒2019-nCoV的了解。古人云:知己知彼,百战不殆。疫情伊始,由于缺乏对2019-nCoV新冠病毒的了解,我们付出了惨痛的代价。至今,我们仍然没有找到对抗2019-nCoV新冠病毒的有力武器。作为一种容易变化的RNA病毒,新

浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

  近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding

研究团队解析新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构

  近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。新型冠状病毒RdRp

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

病毒RNA的复制介绍

  病毒RNA进入宿主细胞后,可进行复制,即在RNA指导的RNA聚合酶催化进行RNA合成反应。  RNA复制酶催化的合成反应是以RNA为模板,由5′向3′方向进行RNA链的合成。RNA复制酶缺乏校对功能的内切酶活性,因此RNA复制的错误率较高,RNA复制酶只是特异地对病毒的RNA起作用,而宿主细胞的

乙型脑炎病毒-RNA-提取

试剂、试剂盒 酚氯仿 异戊醇 乙醚 KAc 乙醇 DEPC 处理水 TBE 缓冲液 上样液 KCI。仪器、耗材 透析袋实验步骤 一 材料与设备1) 酚:氯仿:异戊醇 (25:24:1),2) 乙醚3)2.5mol/LKAc4) 乙醇5)DEPC 处理水6)TBE 缓冲液7〕上样液:40% 甘油,0.

乙型脑炎病毒-RNA-提取

            试剂、试剂盒 酚 氯仿 异戊醇  乙醚  KAc  乙醇  DEPC 处理水  TBE 缓冲

甲型肝炎病毒-RNA-提取

试剂、试剂盒 TSES 缓冲液TSES 缓冲液饱和酚氯仿辛醇乙酸钾乙醇缓冲液 Almol LNaH2P04 缓冲液氯胺 T 溶液Na125I5 mmol LNa2S2O5lOOmmol LKINET 缓冲液酵母 tRNA蔗糖纤维素柱平衡液三重蒸馏水0.1mol LNaOH5 mmol L