国外田间高通量植物表型平台FieldScan应用案例
随着高通量植物表型测量技术的快速发展，越来越多的研究人员和育种家开始采用这一新兴的技术进行研究。植物表型组学时代已经来临！植物表型组学是一个跨学科的研究领域，它必须与基因组学、生物信息学、大数据计算相结合才能更好的为育种服务。由国际植物表型组织（IPPN）、欧盟植物表型组织（EPPN）和德国植物表型组织（DPPN）联合进行的一项调查表明，田间表型、数据管理、费用、根系表型、非生物胁迫、行业标准、技术限制、生物信息学、通量等是制约植物表型组学发展的主要问题。 这其中，田间表型（Field Phenotyping）被公认为是植物表型研究和植物表型组学发展所遇到的最大挑战！ 国际上第一个真正意义上的商业化高通量植物田间表型平台是于2014年初在印度国际半干旱地区作物研究所（ICRISAT）投入正式运转的FieldScan系统（视频链接）。印度国际半干旱地区作物研究所FieldScan系统配置有8个PlantEye......阅读全文
国外田间高通量植物表型平台FieldScan应用案例
随着高通量植物表型测量技术的快速发展，越来越多的研究人员和育种家开始采用这一新兴的技术进行研究。植物表型组学时代已经来临！植物表型组学是一个跨学科的研究领域，它必须与基因组学、生物信息学、大数据计算相结合才能更好的为育种服务。由国际植物表型组织（IPPN）、欧盟植物表型组织（EPPN）和德国植物表型
高通量植物表型平台简介
高通量植物表型平台是植物表型组学、植物功能基因组学、现代遗传育种研究的强大工具。利用高通量植物表型平台可以快速获取大量植株的各种信息。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良，获得更大的果实/种子，更高的含油量（油料作物），更发达的根系等等。通过高通量植物表型平台可以快速获取大量植物表型信息。
温室型高通量植物表型平台概述
温室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量植株（从幼苗到成熟植株即可）进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像、根系近红外成像、高光谱成像中的一种或多种，每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头，结合样品旋转装置，就可以对植株进行3D形
野外型高通量植物表型平台简介
野外型高通量植物表型平台可以高通量对大田中的农作物进行自动表型成像的系统。它可以在长40 m、宽10 m、高6 m的范围内对植物进行表型分析。该系统可以配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、高光谱成像和激光3D成像，在田间对植物进行三维形态学分析。
实验室型高通量植物表型平台简介
实验室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像或激光扫描3D成像（只适合高度15 cm以下的小植株）中的一种或多种。成像系统带程控移动装置，可以在X轴和Y轴上进行移动，并配有射频或条形码读
PlantScreen植物表型应用——高通量种子萌发活力与表型监测
种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和（发芽和出苗期间的活性水平与行为），是种子品质的重要指标，具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。 种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工
高通量基因分型检测平台及其应用案例
Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA，通量达到800个样本/3小时。同时，适用于多
植物表型组学研究平台建设及技术应用
在生物学和遗传育种领域,表型是指构成生物体的全部特征，包括外观、基本维度、形态和颜色,是基因型和环境因素互相作用的结果。表型采集分析是指以定性和定量的方式测量这些特征。表型组(phenome)则是指某一生物的全部性状特征，不仅局限于农艺性状，还包括植株所表现出来的生理状态及生化组分。随着许多重要作物
藻类表型分析技术应用案例
藻类是蓝藻门、绿藻门等一系列水生生物的总称，诞生于数亿年前，广泛分布于地球的各个角落，不仅是生物学和生态学研究的极佳材料，而且在解决粮食安全、能源危机和环境污染等问题中扮演重要角色。 捷克科学研究院、悉尼大学、匈牙利科学研究院和邓迪大学的研究者，使用FMT150研究碳胁迫对微拟球藻的影响[1]，
高通量小型植物光合表型测量系统
高通量小型植物光合表型测量系统是一款对小型植物自动进行顶部高通量光合表型高清成像（600万像素）测量的系统，配备6种滤光片进行叶绿素荧光成像和反射光谱成像。能够获得用于表型分析的可见光成像、用于光合作用分析的叶绿素荧光成像、在近红外区的NIR反射成像RNIR、反映叶绿素含量的叶绿素指数成像RCh
高通量小型植物光合表型测量系统的应用领域介绍
拟南芥和其它小型植株的光合作用和表型研究 光合作用机理研究，全叶片和整株植物的光合作用测量 环境胁迫对植物的影响 基因型筛选、突变株筛选 植物功能基因组学研究 胁迫损伤的早期检测 植物病理学、毒理学、环境科学研究
FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——植物病害表型研究
1. 植物病害早期快速无损检测由于次生代谢产物如多酚等与植物的病害胁迫应答机制紧密相关。因此最初，FluorCam多光谱荧光成像技术主要用于植物病害早期快速无损检测，希望能在病害产生严重影响前就能发现感染（图4）。 图1. UV-MCF多光谱荧光成像早期研究，左：烟草
植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例
植物源蛋白水解物（PHs）是一类重要的生长刺激素，影响植物表型组及代谢组特征，进而促进植物生长和作物产量，尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下，这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等，利用PlantScreen高通量表型分析平台，就一种PH对
植物育种表型筛选技术方案与案例分享
表型筛选是在植物育种过程中将植物表现的优良性状筛选出来，并最终能够固定在植株上，从而培育出优良的品种。标准的生化检测技术，如分光光度法或高效液相色谱，已被用于植物育种过程中的表型筛选。这些方法结果准确，但它们具有破坏性、耗时、劳动密集且繁琐、成本高，并且不能满足大规模筛选程序的需要。植物育种过程需要
PlantScreen高通量表型组学平台研究叶片衰老
韩国大邱基础科学研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等，利用PlantScreen大型高通量表型组学研究平台，对植物叶片衰老进行了系列研究（参见论文：Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study
高通量小型植物光合表型测量系统的技术原理
叶绿素a荧光作为光合作用研究的探针，是研究各种逆境胁迫（干旱、高温、低温、营养缺失、污染、病害等）对植物影响的强大工具，亦被广泛用于筛选同一植物品种的不同基因型。叶绿素a荧光不仅能反映光能吸收、激发能传递和光化学反应等光合作用的原初反应过程，而且与电子传递、质子梯度的建立及ATP合成和CO2固定
植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节，随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入，传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈，而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点，相关概念仍然较为模糊，阻碍了这一新兴学
高通量表型分析平台可视化评估大麦病害程度
背景表型是新植物栽培品种发展的瓶颈，该研究引入了一种新的高光谱表型分析系统，此系统将冠层测量的高通量与高空间分辨率和可控测量环境的优势相结合。此外，测量的大麦生长在大容器（称为Mini-Plots）中，这使得植物能够在温室实验中形成田间表型，从而不受容器尺寸的影响。结果在接种白粉病后30天，通过Sp
高通量小型植物光合表型测量系统的技术参数
成像面积：24 cm x 24 cm 光照面积：30 cm x 30 cm 相机传感器类型：CCD 相机分辨率：600万像素，即2440 x 2440像素 光谱范围：350-950 nm 镜头类型：高质量百万像素镜头 光纤滤光片轮：6种高质量光学干涉滤光片，步进电机驱动 直角坐标机
简介高通量小型植物光合表型测量系统的功能特性
利用直角坐标机器人实现X-Y-Z轴自动移动 测量范围4.5m x 2m或6m x 3m 带两套潮汐式灌溉水培系统 能够进行叶绿素荧光成像、叶绿素指数成像、花青素指数成像和可见光成像 配备控制电脑和分析电脑 配备控制软件和分析软件 配备NAS（网络附属存储）系统
博普特田间植物表型产品和解决方案在精准农业方向...1
随着气候变化、人口增长，对育种和农学研究人员提出了巨大挑战，随着自动化技术、机器视觉技术、生物信息技术等的发展，对野外生长植物进行迅速、准确、高通量无损伤的进行多源、多尺度、多性状表型分析，变的尤为迫切。除了传感器技术，传感器获取数据的解读更加重要，法国Hiphen团队源自法国农业科
表型分析技术在藻类研究的应用案例分析
表型（Phenotype）是基因组（Genome）和环境(Environment)共同作用的结果，近年来，随着高通量测序技术的快速发展，基因组的研究更加简单快速，然而由于植物表型本身的复杂性以及动态变化的特性，表型研究滞后于基因组研究[1]。目前表型研究主要集中在植物/作物领域，在藻类领域，表型组学
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
博普特田间植物表型产品和解决方案在精准农业方向...2
高通量的表型分析直接影响三个方面：更精确的遗传筛选、鉴定新的遗传变异以及改进对目标群体环境因子的筛选，进而较好做遗传决策。植物田间高通量表型分析也间接影响育种规模以及育种周期。下图是法国农业科学院Fred教授提出的田间表型研究不同遥感传感器的总结，实际上在科研中，田间多种传感器结合也得到了深度应用和
博普特田间植物表型产品和解决方案在精准农业方向...3
地面维度：温室多光谱表型系统（带闪光灯） Airphen 相机同时可配备闪光灯，专用于温室应用。Airphen相机可以完全同步控制闪光灯。该特征能提供稳定光照条件（无阴影），进行长期值守和无间断测量（日以继夜）。所获得数据可直接由CLOVERFIELD进行处理。地面维度：植物表型机器人平台Air
移动式激光雷达LiDAR植物表型成像平台
植物表型受基因和环境因素决定和影响，反映植物结构及组成、植物生长发育过程及结果的全部物理、生理、生化特征和性状。植物表型分析的精确实现有助于农作物基因型与育种工作。植物表型分析对高效且低成本的表型获取技术需求强烈。作物表型测量技术发展的滞后已成为当前育种领域的发展瓶颈,高通量的精确表型测量有助于加速
llumina高通量测序平台的应用（二）
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理，加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”，因为3’羟基末端带有可化学切割的部分，每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后，用激光扫描
llumina高通量测序平台的应用（一）
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
植物表型分析系统—植物表型的名词解释
“植物表型是指能够反映植物细胞、组织、器官、植株和群体的结构及功能特征的物理、生理和生化性质，其本质实际是植物基因图谱的时序三维表达及其地域分异特征和代际演进规律”。这是目前所见最精辟的定义。 那么什么是高通量植物表型的？高通量植物表型技术是从器官、个体到群体水平上高通量、自动化获取产量、抗性