血清中miRNA抽提和实验设计经验谈

人体内的血液循环系统犹如印度的圣河 – 恒河,河水中携带的养分滋养着古老的大地;洗涤带走地上的ㄧ切污秽,人们的一生都在河水中完成。如此的恒河可以想象,河水中充斥着各种物质,有废物有养分,只要你想都可以从河水中捞取。同样的我们的循环系统如同恒河;流动的血液如同恒河水,身体所需的ㄧ切由血液运送,身体产生的废物也由血液清运,同样可以想象血中的成份也是包罗万象。如果我们想知道大地有多纯净或污染有多严重,只要取一瓢水加以检视就可以知道答案;而相同的想了解人的生理状况,取一滴血加以检验也可以知道端倪,但是做这些检测并非漫无目标的,必须要知道哪ㄧ些物质是所谓的指针,在生物体内的这些指针就是我们熟知的生物标记(biomarker)。生物标记的研究和应用已有ㄧ段光景,各项代谢疾病的筛检广泛的被使用,而在癌症的筛检也已经有ㄧ些不错的生物标记,例如 AFP (Alpha-fetoprotein)。顺着 microRNA (miRNA) 的发现......阅读全文

中大首席专家PLOS解析肿瘤miRNA

  7月18日,中山大学肿瘤防治中心首席专家马骏教授带领的研究小组,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表题为“Overexpression of Mitochondria Mediator Gene TRIAP1 by miR-320b Loss Is Associated wit

PNAS:miRNA揭示脊椎动物进化起源

美英科学家的一项最新研究表明,脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示,“新的研究不仅为认识人类自身的进

-西农:miRNA参与决定海胆性别

  MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性非编码小RNA,在转录后水平调控基因表达。光棘球海胆(Strongylocentrotusnudus)既是非常好的研究发育的模式生物,又是具有重要商业价值的食物来源。然而,到目前为止还没有报道过miRNAs参与调控S.nudus性腺分化。由西北农林科

TRIzol影响实验结果?miRNA文章被撤回

  韩国首尔大学的科学家Narry Kim(金娜蕊)及其研究小组近日撤回了一篇关于microRNA(miRNA)衰减的文章,因为她们发现,所用的TRIzol试剂会对富含GC的miRNA或具二级结构的miRNA产生不同影响。   这篇文章去年发表于《Molecular Cell》杂志上。研究

Science子刊揭示抑瘤诱饵miRNA

  研究人员发现了导致横纹肌肉瘤和其他软组织肉瘤中一个关键肿瘤基因丧失的新机制。这些罕见的癌症主要累及儿童,往往治疗反应不佳。对于它们的病因还不是很清楚。   俄亥俄州立大学Arthur G. James综合癌症中心的研究人员说,了解这一机制有可能引导开发出针对这些恶性肿瘤的更有效的治疗。   

一种miRNA可抑制癌症扩散

  最近,伦敦帝国理工学院的科学家们发现,在乳腺癌和肺癌细胞中的一个关键分子,可以帮助关掉肿瘤的扩散能力。研究人员将这项研究结果,发表在了国际学术期刊《EMBO Reports》,可能帮助科学家开发出某种治疗方法,阻止癌症在体内扩散,或产生某种测试方法,让医生评估癌症可能是如何传播的。  在肿瘤的生

miRNA与癌症:了解它们之间的关联

  在肿瘤发生的经典模型中,癌症通过慢慢积累突变、放任细胞增长而发生。许多这样的突变影响关键的调控蛋白,如原癌基因和抑癌基因。不过,非编码RNA基因的突变也同样有害,尤其是microRNA。  microRNA(miRNA)是一类22个核苷酸的调控转录本。它们与mRNA靶点相结合,或抑制其翻译,或诱

《自然》首次发现miRNA影响基础信号传导

来自意大利帕多瓦大学生物组织学和胚胎学部,微生物与医学生物技术系,美国路易斯安那州大学健康科学中心(LSU Health Sciences Center)的研究人员发现microRNAs可以影响早期脊椎动物胚胎形成模式中的关键事件。这一首次发现miRNAs调控基础信号放大过程。这一研究成果公布在《N

miRNA研究之RNA提取试剂的选择

RNA提取试剂的选择RNA提取对于科研人员来说并不陌生,但是要得到好的结果却不是一件很容易的事情。事实上,现在市面上的丰富的RNA提取试剂基本上可以满足科研人员的需要,为什么往往提取的RNA却容易失败呢?RNA提取失败的主要现象有三个:提取的RNA降解、提取的RNA量偏低以及提取的RNA纯度低。究竟

miRNA功能分析的五点建议

  随着microRNA(miRNA)研究的深入,很多人开始从miRNA的发现转入功能分析。miRNA抑制是一种确定miRNA功能的强大技术。如何开展,需要注意些什么?Exiqon公司的专家给出了五点建议。   1. 选择合适的抑制剂   若希望miRNA功能分析成功,首先要选择一个最适合您实验

植物miRNA及piRNA的逆转录

miRNA在植物的发育、抗病、和应激反应中发挥着重要作用。一般认为,这些小的非编码RNA通过靶向mRNA剪切,在后转录水平调节植物的基因表达。这些基因表达中的靶向变化由数百个成熟miRNA的差异表达所调控,每个成熟miRNA结合在靶mRNA的特定序列上。因此,对植物的成熟miRNA调控和表达进行分析

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较

  心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA)已在患粉丝性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在

如何预测和鉴定miRNA的靶基因

免疫沉淀当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物,然后开展深度测序以鉴定发现的RNA,

miRNA调控植物对镉的应激反应

土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题,主要是由于一些人为活动,如采矿,工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉(Cd)可以很容易地被植物吸收,从而导致各种中毒症状,如降低生物量,叶片失绿,抑制根系生长,发生形态学改变,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA)参与

昆虫利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染

棉铃虫(Helicoverpa armigera),是夜蛾科昆虫的一种,寄主植物有20多科200余种,其中大部分为重要栽培作物,是棉花的主要害虫之一。棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)是一种杆状病毒,能专一性地感染棉铃虫,作为生物杀虫剂已得到广泛应用。近日澳大利亚昆士兰大学的研究人员对棉铃虫

miRNA检测的三种方法

MicroRNA (miRNA)是一种机体内源性表达的单链小分子RNA,位于基因组非编码区,本身不具有开放阅读框(open reading frame,ORF),具有高度保守性,时序性和组织特异性。miRNA广泛存在于各种真核细胞中,不编码任何蛋白质,长度仅为20~24nt。成熟的miRNA 5′端

miRNA检测的三种方法

MicroRNA  (miRNA)是一种机体内源性表达的单链小分子RNA,位于基因组非编码区,本身不具有开放阅读框(open reading frame,ORF),具有高度保守性,时序性和组织特异性。miRNA广泛存在于各种真核细胞中,不编码任何蛋白质,长度仅为20~24nt。成熟的miRN

快速灵敏-让-miRNA-无处可逃

miRNA 是一种既可爱又可恨的小东西,它们深居简出,它们飘忽不定,它们似乎总是在和我们捉迷藏,当我们费尽力气以为即将要将它们掌控的时候,它却又顽皮的从我们的指缝中溜走,而我们却又毫无办法。同学莫怕,TIANGEN 即将上市的最新产品 miRcute 增强型 miRNA cDNA 第一链合成试

miRNA荧光定量PCR结果怎么看

荧光定量我用罗氏的反应速度算是相当快的,在样本处理(提出核酸)后,放在荧光定量PCR仪器上一般需要30分钟~1小时左右.但是如果你的样本比如支原体的含量非常高,可能在没有运行结束已经可以看出结果了,但是如果说5分钟就出结果了,确实太快了点.如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个

小非编码RNA可以作为急性髓细胞白血病临床诊断标志物

小非编码RNA(sncRNA),包括miRNA、tsRNA、rsRNA和ysRNA,是重要的调节分子。急性髓细胞白血病(AML)具有异质性,并涉及多种非编码RNA改变。近年来,miRNA在AML中的作用已被广泛探索,miRNA的明确表达谱已在白血病中得到区分。由于环状miRNA具有敏感性、稳定性和非

不同来源的样本miRNA(microRNA)如何提取?

如何提取小小的miRNA(microRNA),各大生物技术公司均推出了自己的试剂盒,国内知名核酸纯化公司百泰克针对不同来源的样本亦推出了一系列拥有自己独特技术的miRNA(microRNA)提取试剂盒!miRNA(microRNA)的成功提取依赖于样本中核酸的充分裂解和释放,有没有一种试剂盒能够针对

案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

不同来源的样本miRNA(microRNA)如何提取?

 如何提取小小的miRNA(microRNA),各大生物技术公司均推出了自己的试剂盒,国内知名核酸纯化公司百泰克针对不同来源的样本亦推出了一系列拥有自己独特技术的miRNA(microRNA)提取试剂盒!       miRNA(microRNA)的成功提取依赖于样本中核酸的充分裂解和释放,有没有一

:胎牛血清、新生牛血清、小牛血清有何区别?

  胎牛血清、新生牛血清、小牛血清有何区别?   牛血清根据采集阶段不同可分为胎牛血清、新生牛血清、小牛血清等,不同的细胞培养所选用的牛血清也有所不同,有些癌细胞可能比较容易存活,可以选择一些普通等级,这样既能省钱,也能达到实验效果。   而有些细胞比较娇贵,比如神经细胞,一般的人都不太容易

胎牛血清、小牛血清与新生牛血清的区别

  细胞培养实验都要用到血清,而血清又分为胎牛血清、小牛血清和新生牛血清,今天威正翔禹|缔一生物就给大家分享一下他们之间的区别以及保存方法~~~欢迎来围观哦!  胎牛血清、小牛血清、新生牛血清之间的区别  1、采血时间不同  胎牛血清(Fetal Bovine Serum)是在母牛怀孕5-8个月时,

中外学者PNAS发现癌症抑制关键miRNA

  来自俄亥俄州立大学综合癌症中心,四川大学华西医院的研究人员公布的一项最新研究表明,肺癌中的microRNA-486是一种强效的抑癌分子,有助于调节肺癌细胞的增殖和迁移,并且诱导这些癌细胞程序性细胞死亡或细胞凋亡。   研究人员证实microRNA-486(miR-486)能直接靶向胰岛素生长因

细菌,病毒,miRNA……统统都能改变我们的大脑?

  每天我们接触到,甚至吃入到口中的细菌,病毒,还有小小的miRNA分子不计其数,如果我告诉你这些物质都能影响我们的大脑,控制我们的思维,你相信吗?  近年来几项实验室研究成果纷纷指出不仅是非生物形式的RNA分子,还有细菌和病毒这样的生物形式都能改变我们的记忆方式,掌控我们的思想。这样看来,埃博拉,

牛校Cell发文解析miRNA与表观遗传

  近期北京大学生命科学学院接连在Cell,Nature structural and molecular biology上发表文章,介绍了关于先天免疫信号转导通路中的重要接头及感应蛋白STING结构生物学研究成果,以及基因组稳定性方面的研究成果。   在“The structura