利用454技术解析样本中病毒耐药突变情况

H7N9是一种甲型流感病毒,是禽流感病毒的一个亚型,1988年在美国火鸡身上有了第一个病毒记录。H7N9原本属于低致病性感冒病毒,经基因交换后转移到人类上感染后成为病发期短、重症率与死亡率较高的传染性病毒。自今年3月下旬开始,人类感染甲型流感病毒H7N9的病例陆续在上海及长江三角洲一带的城市被发现。疫情爆发后,各地疾控中心与政府都采取了积极的应对措施,到5月中旬,已基本消除了新增病例。然而研究的步伐仍未停止,科学家们仍然在研究病毒基因重组的机制以及耐药情况的发生。 目前在临床上对H7N9的患者主要使用奥司他韦和帕拉米韦进行抗病毒治疗。为了直观地解析病毒基因耐药机制,测序仍然是主要的选择。国内学者们在收集病人在治疗过程中多个时间点的咽拭子、血液、尿液和粪便标本,使用自行设计的荧光定量RT-PCR方法对上述标本中的H7N9 流感病毒核酸载量进行了定量检测,并对其中的十四例患者进行了454测序,从而进行了病毒载量与病情严重程度......阅读全文

利用454技术解析样本中病毒耐药突变情况

H7N9是一种甲型流感病毒,是禽流感病毒的一个亚型,1988年在美国火鸡身上有了第一个病毒记录。H7N9原本属于低致病性感冒病毒,经基因交换后转移到人类上感染后成为病发期短、重症率与死亡率较高的传染性病毒。自今年3月下旬开始,人类感染甲型流感病毒H7N9的病例陆续在上海及长江三角洲一带的城市被发现。

454测序识别早期HIV耐药性突变

回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败 2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医学院研究人

454测序应用于HBV耐药性突变检测

  HBV(Hepatitis B Virus)乙型肝炎是一种基因组长约3.2kb,部分双链环状DNA病毒。我国的乙肝病毒感染率约60%-70%,乙肝表面抗原携带率约占总人口的7%,以此计算,全国约有9300万人携带乙肝病毒,其中乙肝患者大约有3000万。由于HBV很

利用454测序技术进行HIV耐药检测可提高灵敏度

    HIV耐药性是指病毒对某种药物敏感性降低,在某些核酸类药物抑制下,病毒可通过自身基因突变获得对这些药物的抗药性,而当有抗药性的病原微生物再传染他人时,即可对这些药物产生抗药性。由于HIV繁殖存在错误率高的逆转录这一独特的复制过程,因此在药物治疗中也最易出现耐药性。

454测序识别早期HIV耐药性突变低水平突变对临床结果重大

  回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败   2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医

454测序识别早期HIV耐药性突变低水平突变对临床意义重大

  回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败   2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医

NGS:病毒耐药突变检测精度提高20倍

  Population Genetics Technologies(PGT)今日宣布了与凯斯西储大学和合作,深入开发基于下一代测序技术的艾滋病病毒耐药性诊断测试。  该项新型诊断测试将采用PGT公司所自主开发的VeriTag技术,提高下一代测序技术的敏感性,帮助临床医生为HIV患者制定更加科学的治

新HIV整合酶与侵入抑制剂治疗相关的耐药性和嗜性新观点

研究结果也许能作为未来治疗HIV病患的潜在治疗方案加拿大蒙特利尔召开的第16届逆转录病毒及机会性感染会议(CROI)上公布的两项研究的最新数据证明,罗氏旗下454生命科学公司Genome Sequencer FLX系统的超深度测序(ultra-deep sequencing)与传统方法相结合

冷冻电镜样本制备新技术在新冠病毒结构解析的应用2

现有冷冻电镜样本制备技术的缺陷然而,传统冷冻电镜样本制备方法存在缺陷:1. 以手工或半自动设备,操作复杂,依赖较高的技巧  2. 采用blot方式,大量样品被浪费在滤纸 3. 实验的稳定性和可重复性较差 4. 样品存放的可追溯性差,容易导致样品丢失        总体而言,冷冻电镜的样品制备技术

冷冻电镜样本制备新技术在新冠病毒结构解析的应用1

前言近日,由新型冠状病毒引起的肺炎疾病在武汉和全国各地都形成了一定规模的爆发,已经引起了中国甚至全球的高度重视,那么这个冠状病毒究竟是什么?冠状病毒在系统分类上属冠状病毒科(Coronaviridae),是具外套膜(envelope) 的正链单股RNA病毒,直径约80~120nm。冠状病毒可以引

重磅!利用CRISPR技术成功修复人类胚胎中的基因突变

  8月13日,这项成果以“Correction of the Marfan Syndrome pathogenic FBN1 mutation by base editing in human cells and heterozygous embryos”为题发表在《Molecular Thera

新一代超高通量基因组测序系统-GS-FLX开创科研无限新...

新一代超高通量基因组测序系统 GS FLX开创科研无限新可能GS FLX系统是由罗氏454生命科学公司推出的目前应用最广的超高通量基因组测序系统,研究人员利用高准确性、长读长的GS FLX系统快速的获得高质量的生物数据,取得科研突破性进展。自GS系统问世以来,于世界顶级杂志共发表250余篇高质量

焦磷酸测序原理

  焦磷酸测序技术(pyrosequencing)是一种新型的酶联级联测序技术,焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。焦磷酸测序技术产品具备同时对大量样品进行测序分析的能力,为大通量、低成本、适时、快速、直观地进行单核苷酸

利用好”病毒攻击“坏”细菌,对付引起疾病的耐药菌

  以色列特拉维夫大学的一项新研究发现,“好”病毒可通过一种机制攻击“坏”细菌的系统,摧毁它们并阻止它们的繁殖。研究人员证明,噬菌体能够在不影响自身的情况下阻止细菌DNA的复制机制,并指出区分自己和他人的能力在自然界中是至关重要的。  他们解释说,这些结果从一个有趣的层面揭示了细菌与噬菌体之间的相互

PNAS:利用新型成像技术追踪细胞突变

这是科学家首次在完整组织里查明突变细胞的数量和位置 美国科学家近日开发出一种新型成像系统,利用它可以观察到经历特殊突变的细胞。这一研究是科学家首次在完整组织里查明突变细胞的数量和位置,也有望帮助他们理解癌症前期突变如何产生。相关论文在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 图片说明

利用454技术进行结核杆菌全基因组测序有效追踪疫情传播

  众所周知,肺结核多数是由结核分枝杆菌感染肺部引起的肺部感染性疾病,已成为一个严重威胁人类健康的疾病。世界卫生组织(WHO)统计表明,全世界每年发生结核病800~1000万,每年约有300万人死于结核病,是造成死亡人数最多的单一传染病。1993年WHO宣布“全球结核病紧急状态”, 认为结核病已

中国科学家在部分H7N9重症病人样本中检测到耐药突变

  5月28日,国际权威医学杂志《柳叶刀》(The Lancet)在线发表的一项研究显示,部分H7N9禽流感病毒感染的重症病人样本中发生了耐药突变。该项研究由上海市公共卫生临床中心发起,中科院上海巴斯德研究所病原诊断中心郝沛研究员负责其中的高通量测序部分数据分析研究工作,并作为共同第一作者参与发

新测序技术揭开病毒突变“王国”

  最近,新加坡A*STAR的研究人员,设计出一种测序技术,可在患者体内病毒(如乙型肝炎病毒)迅速变异时,跟踪所产生的特异病毒变体。这一突破对“进化中的病毒种群的结构”提供了前所未有的视图,并能有助于开发新药,防止病毒株对药物和免疫反应发展出抵抗力。相关研究结果发表在最近的《Genome Biolo

我国细菌耐药情况有所缓解

  国家卫生计生委医政医管局局长张宗久日前表示,目前我国抗菌药物管理机制逐步建立,公众和医务人员的合理用药意识和临床合理用药水平逐步提高,细菌耐药情况有所缓解。但抗菌药物管理体系发展的不平衡不充分问题仍然较为突出。  张宗久日前在国家卫生计生委、世界卫生组织驻华代表处共同启动的“2017年抗菌药物合

技术解析之不同类型的样本的处理方法

elisa试剂盒通常我们可用于ELISA检测的样本是有多种类型的,如血清、血浆、尿液、细胞培养上清或组织匀浆液等,不同类型的检测样本前期的处理方法是不一样的。正确的处理样本是保证ELISA检测的正确性和准确性的步。1、 血清血清是*常用于ELISA检测的一类样本,处理也比较简单。用无热原、无内毒素的

结核分枝杆菌耐药基因突变检测技术介绍

耐多药结核病(MDR-TB)和广泛耐药结核病(XDR-TB)是目前临床亟待解决的难题之一。因此,快速、准确地检测标本中耐药结核分枝杆菌(MTB)至关重要。采用多色探针熔解曲线法可快速检测MTB对利福平、异烟肼、链霉素、乙胺丁醇和氟喹诺酮类药品常见耐药决定区域,简便、快速,闭管检测,不会交叉污染或造成

中国科学家利用CRISPR技术成功修复人类胚胎中基因突变

  基因编辑技术发展势如破竹,遗传性疾病的有效治疗显得日益迫切。近日,来自上海科技大学的黄行许教授和广州医科大学附属第三医院的刘见桥教授领导的研究小组利用最新CRISPR技术成功纠正了胚胎中的马凡综合症(MFS)致病突变。这一研究成果代表着在重塑人类胚胎DNA的尝试基础上取得了重大突破。  8月13

新一代测序技术之三国时代(中):Roche/454

      454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序(sequencing-by-synthesis)的先河

科学家利用AI预测小样本数据下抗耐药菌聚合物结构

华东理工大学教授唐漾与刘润辉合作,依赖小样本(1060)中精准预测聚合物抗菌活性,并通过逆向设计发现大量具有突出广谱抗耐药菌活性和高选择性的优选聚合物结构,为抗耐药菌多肽模拟聚合物研究提供了新思路。相关研究发表于《自然—通讯》。全球抗生素耐药性风险不断升级,亟需探索高效抗耐药菌广谱抗菌剂的新策略。宿

解析物位计行业发展情况

  中国物位液位计,液位变送器,电容式液位计,物位开关等产品开展状况和商场趋向!的今世新式外表液位计除夜多进口,特别是除夜型公司用的物位外表根基都是进口外表电容式液位计,乃至压力式或差压式超声波电容式液位计也都用进口或合股公司的压力或德鲁克差压变送器。因而,斥地、出产前辈的物位外表仍旧是占据海内物位

武汉病毒所合作在HIV传播耐药研究中取得进展

  近期,中国科学院武汉病毒研究所研究员杨荣阁学科组与国际HIV/AIDS相关领域专家合作,在HIV传播耐药研究方面取得新的研究成果,相关论文Geographic and Temporal Trendsin the Molecular Epidemiology and Genetic Mechani

解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(一)

大家好,最近在研究在搞Python的大作业,有个需求就是利用Matplotlib画几个像模像样的统计图然后合并在一张图中,因为此前很少用这方面的东西,所以折腾了不少时间,今天介绍一下。1、subplot多合一其实,利用python 的matplotlib包下的subplot函数可以将多个子图

解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(三)

2、subplot2grid分格显示这种方式和上一种实现的效果一样,只不过更加容易理解罢了,先来看一个案例代码:import  matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npplt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] #

解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(二)

plt.figure(1):表示取第一块画板,通俗地讲,一个画板就是一张图,如果你有多个画板,那么最后就会弹出多张图。plt.subplot(221):221表示将画板划分为2行2列,然后取第1个区域。那么第几个区域是怎么界定的呢?这个规则遵循行优先数数规则!比如说4个区域:优先从行开始数,

地沟油循环利用样本:航油研发技术有别、成本高企

  地沟油丑闻近年来屡屡见诸报端,越来越多的企业和科研人士也在实践回收利用地沟油的可能性。  据不完全统计,目前仅在国内,地沟油就被作为燃油、肥皂、洗涤剂、选矿剂、工业脂肪酸等多类产品的原料进行科研尝试。而在海外,甚至有研究正在探讨能否将地沟油作为饲料来源。  但由于技术转化和成本控制的难度,不同行