利用454技术解析样本中病毒耐药突变情况
H7N9是一种甲型流感病毒，是禽流感病毒的一个亚型，1988年在美国火鸡身上有了第一个病毒记录。H7N9原本属于低致病性感冒病毒，经基因交换后转移到人类上感染后成为病发期短、重症率与死亡率较高的传染性病毒。自今年3月下旬开始，人类感染甲型流感病毒H7N9的病例陆续在上海及长江三角洲一带的城市被发现。疫情爆发后，各地疾控中心与政府都采取了积极的应对措施，到5月中旬，已基本消除了新增病例。然而研究的步伐仍未停止，科学家们仍然在研究病毒基因重组的机制以及耐药情况的发生。 目前在临床上对H7N9的患者主要使用奥司他韦和帕拉米韦进行抗病毒治疗。为了直观地解析病毒基因耐药机制，测序仍然是主要的选择。国内学者们在收集病人在治疗过程中多个时间点的咽拭子、血液、尿液和粪便标本，使用自行设计的荧光定量RT-PCR方法对上述标本中的H7N9 流感病毒核酸载量进行了定量检测，并对其中的十四例患者进行了454测序，从而进行了病毒载量与病情严重程度......阅读全文
PCR技术在突变基因检测中的应用
基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因，检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学，医学遗传学及肿瘤学研究 的热点，它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 ＼意义，分子生物学技术的发展，尤其是PCR技术的出
Carterra－LSA－在指导国内外研究抗体鸡尾酒疗法的应用
自新型冠状病毒病（COVID-19）爆发以来，全球科研及医疗人员都在紧急寻找有效的治疗方法。2020年2月，泰国曼谷拉察维蒂医院（Rajavithi Hospital）医生表示，将抗艾病药洛匹那韦（lopinavir）及利托那韦 （ritonavir），抗流感病毒药特敏福（oseltamiv
利用TILDAS技术航测大气中HCOH和HCOOH
大气甲醛(HCHO)是烃类光氧化产物，也是HOx自由基前驱体。在对流层，主要是通过甲烷的氧化形成的，而在陆地边界层中，异戊二烯的氧化可以主导HCHO的产生。HCHO的光化学性质可以用来做HOx形成的模型预测。甲酸(HCOOH)的来源包括异戊二烯氧化、生物排放和生物量燃烧。实验结果表明，有机气溶胶大气
CRISPRCas系统新的应用：SHERLOCK检测技术
华裔科学家张锋利用CRISPR-Cas新系统，研发出了新的快速，便宜，高灵敏度的诊断工具，可以用于检测诸如寨卡病毒感染和登革热感染等的疾病，这一进展也有助于便捷检测和诊断许多其它的病原体，该结果发表在著名杂志科学（Science）上。不同于Cas9，新的Cas蛋白是Cas13a，具有在剪切掉目标
我国科学家开发解析肿瘤微环境免疫治疗耐药的新技术
2月12日，国际学术期刊Cell在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）王广川团队联合上海交通大学陈洛南团队及广州实验室景乃禾团队的合作研究成果“CLIM-TIME identifies metastatic microenvironment modulators
快速灵敏且经济地测定血液中的肿瘤标志物——ddPCR
在4月初召开的美国癌症研究学会年会上，多名研究人员展示了基于微滴式数字PCR（ddPCR）的液体活检在临床上的应用。他们认为，这种技术能够快速灵敏且经济地测定血液中的肿瘤标志物。 Bio-Rad的ddPCR技术目前已被900多篇液体活检文献引用。癌症研究人员常利用它来追踪疾病进展和确定治疗反应
焦磷酸测序在甲基化分析中的应用
DNA甲基化是近年来研究的热点，因为越来越多的证据表明，它参与了胚胎发育、基因印迹等过程。同时，它在疾病发展中也起着举足轻重的作用。甲基化状态的改变被认为是引起癌症的一个重要因素，这种变化包括基因组整体甲基化水平的降低和CpG岛局部甲基化水平的异常升高，从而导致基因组的不稳定(如染色体的不稳定、
新冠病毒已突变
新冠病毒是否已经发生突变？如何突变？这是目前学界研究的焦点之一。中国科研团队最新发现显示：新冠病毒已于近期产生了149个突变点，并演化出了两个亚型，分别是L亚型和S亚型。研究发现，在地域分布及人群中的比例，这两个亚型表现出了很大测差异。其中S型是相对更古老的版本，而L亚型更具侵略性传染力更强。对
新一代测序技术揭示一种I型糖尿病与肠道病毒感染相关..
新一代测序技术揭示一种I型糖尿病与肠道病毒感染相关的遗传变异2009年《Science》杂志在线公布的一项研究发现，某种疾病相关基因的一组罕见突变可以降低罹患I型糖尿病（T1D）的风险。这项研究由剑桥大学Wellcome Trust/JDRF糖尿病与炎症实验室的Nejentsev等人完成。他们利
Roche－454（GS－FLX－Titanium－System）超高通量测序技术原理
Roche 454（GS FLX Titanium System）超高通量测序技术原理2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》杂志以里程碑事件报道，开创了边合成边测序的先河。2007
广州健康院电镜平台：看清细胞里的“小宇宙”
“作为一种高端科学仪器，电子显微镜在细胞学研究中发挥着至关重要的作用，助力科学家们深入探索细胞这一‘小宇宙’的功能与奥秘。”中国科学院广州生物医药与健康研究院（以下简称广州健康院）分析测试中心电子显微成像技术平台（以下简称电镜平台）负责人、高级工程师李合英对《中国科学报》表示。针对广州健康院特色研究
感染性疾病基因诊断进展（一）
感染性疾病有病原微生物引起，致病的病原微生物主要有病毒、细菌、衣原体、支原体和螺旋体等。这些病原体的传统检测方法通常采用形态学检查，体外培养和免疫学试验。但对某些难以培养的病原体，抗原抗体检测不能判断体内病原体 DNA 或 RNAde 复制情况，或存在检测灵敏度低等问题。自聚合酶链反应（ P
中国医学科学院：RNAi技术解析病毒
肠道病毒71型(EV71))已被证明是引起近年来亚洲-太平洋地区频发的手足口病重症并导致患者死亡的最主要病原体。但是, 其是如何感染神经系统并导致严重神经系统病理损伤的分子机制尚不明确。 来自中国医学科学院&北京协和医学院，昆明医科大学等处的研究人员通过RNAi技术对 EV71 病
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（三）
3.2 dPCR在转基因植物检测方面的研究 转基因植物及相关食品的定量分析主要测定转入基因的相对含量。目前常用qPCR作为核酸定量方法。dPCR可以不需要校准物而准确测量低拷贝的DNA分子。Corbisier 等用dPCR分析了提取于MON810玉米种子的外源检测基因和hmg基因的拷贝数，验证了dP
武汉病毒所在HIV基因进化与传播耐药等研究中获系列进展
中科院武汉病毒研究所杨荣阁研究员带领的科研团队在HIV基因进化与传播耐药研究上厚积薄发，2013年上半年共累计发表SCI高水平论文达12篇，并取得了系列重要科研进展。 杨荣阁研究员带领的学科组针对HIV基因型的流行情况进行了系统、深入的研究，研究成果相继发表于AIDS，PLOS ONE，A
NGS的两大应用“门派”
二代测序技术能够针对数以万计的DNA分子进行测序，能够在碱基突变的水平上进行分析，测序技术的发展使得精准医学有了更加先进的技术解决方案。不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上，这些差别可以分为：模板制备方法(例如乳液PCR、DNA纳米球、桥式扩增 、单分子模板)、序列测定方法(焦磷酸测序
城环所利用同步辐射技术解析水稻籽粒砷的转运过程
中国科学院城市环境研究所朱永官研究员和博士后郑茂钟等通过同步辐射技术结合电感耦合等离子体质谱，揭示了水稻籽粒发育过程中砷的转运过程。 该研究针对水稻砷污染研究中对不同砷形态从土壤向籽粒中运输动力学和空间分布动态研究的不足，全面分析了水稻各个器官中的砷浓度和形态在整个生长发育期内的
著名学者朱健康最新PNAS文章：利用STTM技术解析miRNA功能
来自中科院植物逆境生物学研究中心的研究人员发表了题为Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating important agronomic traits”的文章，利用STTM技术大规模沉
第四军医大JBC文章解析癌症耐药
近日来自第四军医大学、清华大学的研究人员在新研究中证实：转录因子CUTL1是胃癌耐药性的一个负调控因子。这一研究发现在线发表在12月19日的《生物化学杂志》(JBC)杂志上。 文章的通讯作者是第四军医大学的刘志国(Zhiguo Liu)副教授，其主要从事病毒感染与肿瘤发生、肿瘤的多药耐
第四军医大JBC文章解析癌症耐药
近日来自第四军医大学、清华大学的研究人员在新研究中证实：转录因子CUTL1是胃癌耐药性的一个负调控因子。这一研究发现在线发表在12月19日的《生物化学杂志》(JBC)杂志上。 文章的通讯作者是第四军医大学的刘志国(Zhiguo Liu)副教授，其主要从事病毒感染与肿瘤发生、肿瘤的多药耐
利用现有技术，如何鉴定一个全新的病毒2
wuguojun680510网友的观点是：单纯凭分子生物学技术鉴定一个新的病毒是不可能的，只能得知可能是一个新病毒，鉴定一种新病毒还必需从经典途径走起。 1、纯化病毒。 2、大小、形态鉴定。 3、对称形式确定 4、核酸类型确定 5、细胞嗜性鉴定
利用基因重组技术平台－赛诺菲加入新冠病毒疫苗开发
赛诺菲（Sanofi）全球疫苗事业部赛诺菲巴斯德（Sanofi Pasteur）近日宣布，将利用先前开发SARS疫苗的经验，与美国生物医学高级研究与开发局（BARDA）合作, 利用先进的基因重组技术平台加速开发新冠病毒（COVID-19）疫苗。值得一提的是，赛诺菲是继强生之后在近日投身新冠病毒疫
“人体免疫细胞＋病毒”可抗耐药菌
随着抗生素的广泛使用，耐药菌株已成为引起临床感染较为常见的病原菌。特别是医院内耐药菌株的感染使病死率大幅增加，其治疗已成为临床上的难题。 目前临床常见的重要耐药革兰阳性菌有耐甲氧西林葡萄球菌（MRSA）、对青霉素耐药的肺炎球菌（PRSP）和万古霉素耐药的肠球菌（VRE）。我国各地报道耐中氧西林金
乙型肝炎病毒耐药基因检测方法
1.PCR产物直接测序：是将HBV基因组的逆转录酶区进行扩增后直接进行测序分析的方法。PCR产物直接测序法可检测已知和可能的未知耐药变异位点，是最常用的基因型耐药检测方法之一。PCR产物直接测序的方法一般作为基因型耐药检测的金标准。该方法的缺点是灵敏性较差，只有当变异株超过HBV准种池的20%时
乙型肝炎病毒耐药基因检测概述
一、乙型肝炎病毒耐药基因检测的临床意义 WHO相关资料显示，全球感染过乙型肝炎病毒（HBV）的患者超过三分之一，而慢性乙型肝炎患者约有2.4亿，乙肝严重影响着人类的生命健康。HBV是传染性疾病乙型病毒性肝炎的主要病因，感染HBV可引起肝硬化甚至肝细胞癌变。HBV属嗜肝DNA病毒科，为双链DNA
测序技术揭示I型糖尿病与肠道病毒感染相关的遗传变异
2009年《Science》杂志在线公布的一项研究发现，某种疾病相关基因的一组罕见突变可以降低罹患I型糖尿病（T1D）的风险。这项研究由剑桥大学Wellcome Trust/JDRF糖尿病与炎症实验室的Nejentsev等人完成。他们利用罗氏旗下454生命科学公司的Genome Sequence
揭示一种I型糖尿病与肠道病毒感染相关的遗传变异
2009年《Science》杂志在线公布的一项研究发现，某种疾病相关基因的一组罕见突变可以降低罹患I型糖尿病（T1D）的风险。这项研究由剑桥大学Wellcome Trust/JDRF糖尿病与炎症实验室的Nejentsev等人完成。他们利用罗氏旗下454生命科学公司的Genome Sequence
两篇Nature文章：从血液入手诊断癌症
一些罕见的肿瘤细胞携带着赋予耐药性的突变，用标准的测试程序通常无法检测到。根据Nature杂志的两项最新研究，这些突变可以通过患者的血液进行检测。 一些肿瘤携带着可赋予对某些特异药物抗性的突变，对于具有这些突变的患者应排除使用这些药物。然而有时候一种肿瘤似乎并不符合这些条件耐药也会出现。在
《Science》首次描述利用DNA修复缺陷靶向耐药肿瘤
一种新的胶质瘤药物利用了缺乏DNA修复酶MGMT的肿瘤;研究人员报告说，这些药物会产生细胞毒性DNA，选择性地杀死肿瘤细胞，而不会产生耐药性。这种新方法可能会导致新的胶质瘤治疗方法，并可能代表设计治疗方法的新范式，利用特定的DNA修复缺陷来对抗耐药肿瘤。胶质母细胞瘤(GBM)是最常见的恶性脑肿瘤，生
Nat－Commun：手机检测致癌突变，测序它也行！
1月16日，研究人员在《 Nature Communications》上表示，他们开发出了一种移动显微镜，利用手机相机来检测细胞和组织中DNA测序反应生成的荧光产物。这种移动显微镜可以检测到KRAS基因的突变位点，而该突发被发现于超过30%的结直肠癌患者体内。 本文共同作者，瑞典斯德哥尔摩大学