利用454技术解析样本中病毒耐药突变情况
H7N9是一种甲型流感病毒，是禽流感病毒的一个亚型，1988年在美国火鸡身上有了第一个病毒记录。H7N9原本属于低致病性感冒病毒，经基因交换后转移到人类上感染后成为病发期短、重症率与死亡率较高的传染性病毒。自今年3月下旬开始，人类感染甲型流感病毒H7N9的病例陆续在上海及长江三角洲一带的城市被发现。疫情爆发后，各地疾控中心与政府都采取了积极的应对措施，到5月中旬，已基本消除了新增病例。然而研究的步伐仍未停止，科学家们仍然在研究病毒基因重组的机制以及耐药情况的发生。 目前在临床上对H7N9的患者主要使用奥司他韦和帕拉米韦进行抗病毒治疗。为了直观地解析病毒基因耐药机制，测序仍然是主要的选择。国内学者们在收集病人在治疗过程中多个时间点的咽拭子、血液、尿液和粪便标本，使用自行设计的荧光定量RT-PCR方法对上述标本中的H7N9 流感病毒核酸载量进行了定量检测，并对其中的十四例患者进行了454测序，从而进行了病毒载量与病情严重程度......阅读全文
罗氏454测序分析软件升级
罗氏公司近日宣布推出一款新的软件包(v2.8)，能显著改善其GS FLX+系统上长读取鸟枪法测序的性能。这一测序平台能带来百万个读取，其读长超过1000 bp。此次改进将让研究人员发现更多复杂的遗传变异，并揭开隐藏在基因组、转录组和宏基因组样品中难以测序的区域下的生物学秘密。 罗氏
Nat－Commun：手机检测致癌突变，测序它也行！
1月16日，研究人员在《 Nature Communications》上表示，他们开发出了一种移动显微镜，利用手机相机来检测细胞和组织中DNA测序反应生成的荧光产物。这种移动显微镜可以检测到KRAS基因的突变位点，而该突发被发现于超过30%的结直肠癌患者体内。 本文共同作者，瑞典斯德哥尔摩大学
定点突变技术：从单点突变到多点突变
体外定点突变技术是研究蛋白质结构和功能之间的复杂关系的有力工具，也是我们在实验室中改造/优化基因常用的手段。蛋白质的结构决定其功能，二者之间的关系是蛋白质组 研究的重点之一。对某个已知基因的特定碱基进行定点改变、缺失或者插入，可以改变对应的氨基酸序列和蛋白质结构，对突变基因的表达产物进行研究
定点突变技术——从单点突变到多点突变
体外定点突变技术是研究蛋白质结构和功能之间的复杂关系的有力工具，也是我们在实验室中改造/优化基因常用的手段。蛋白质的结构决定其功能，二者之间的关系是蛋白质组研究的重点之一。对某个已知基因的特定碱基进行定点改变、缺失或者插入，可以改变对应的氨基酸序列和蛋白质结构，对突变基因的表达产物进行研究有助于我
定点突变技术――从单点突变到多点突变
体外定点突变技术是研究蛋白质结构和功能之间的复杂关系的有力工具，也是我们在实验室中改造/优化基因常用的手段。蛋白质的结构决定其功能，二者之间的关系是蛋白质组 研究的重点之一。对某个已知基因的特定碱基进行定点改变、缺失或者插入，可以改变对应的氨基酸序列和蛋白质结构，对突变基因的表达产物进行研究有助于我
超级耐药菌接踵而至！科学家们如何正面刚？
随着关于“超级细菌”的新闻的不断出现，人们对耐药细菌和超级细菌的担心和恐慌也与日俱增。诚然，耐药基因的出现成为了压垮抗生素的最后一根的稻草，而超级细菌的出现则给人类的生命健康带来了红果果的威胁。那么在这些威胁面前，科学家们如何应用最新知识和技术来创造对抗这些细菌的新技术和新方法呢？本文就为大家盘
全外显子组测序追踪找到了白血病复发的基因突变
近日，来自圣犹大儿童研究医院的研究人员发表在国际著名杂志Journal of the American Medical Association上的一篇研究论文中表示，他们已经使用了全外显子组测序对急性淋巴性白血病(Acute lymphoblastic leukemia，ALL)患者机体的基因组
耐多药结核分枝杆菌基因突变在耐药性检测中的应用
［摘 要］ 目的：探讨结核分枝杆菌耐链霉素(SM)和利福平(RFP)的耐药分子机制，应用聚合酶链反应一单链构象多态性(PCRSSCP)同时检测rpsL基因、rpoB基因突变在结核分枝杆菌耐SM和RFP耐药性测定中的应用价值。方法：采用PCRSSCP技术对168株结核分枝杆菌临床分离株rpsL基因、
临床多重耐药菌基因组编辑研究取得进展
直接在临床分离的多重耐药菌中进行功能基因组学研究是解析耐药机制以及开发抗耐药策略最直接有效的方法。然而，由于缺乏能在临床耐药菌中直接进行高效基因编辑的工具，目前耐药机制仍主要是采用组学分析加在模式菌中的异源验证进行研究。这种脱离了临床耐药菌本身遗传背景的研究策略，往往忽略了遗传背景本身对耐药因子
AJRCCM：利用唾液也能检测肿瘤突变？
AJRCCM：利用唾液也能检测肿瘤突变？ 目前筛选肺癌突变是利用血浆或血液来进行测试，但血液成分复杂。近日一项科学研究证实电场诱导释放和测量（electric field-induced release and measurement，EFIRM）是一种新的
鳄梨日斑类病毒的分布情况
该病害原先被认为生理性或遗传病害，Horne等（1931）证明其可通过嫁接传播，因而很久以来被认为是病毒病，直到1979年才被证明是由类病毒引起的（Palukaitis等，1979；da Graca，1979；Dale等，1979；Thomas等，1979）在很多种植鳄梨的国家都有该病的发生，包括澳
样本中铀的测定方法
废水中铀的测定方法,一般采用铀试剂Ⅲ或5-Br-PADAP分光光度法及固体荧光法。三烷基氧磷萃取-(2-(5-溴-2-吡啶偶氮)-5二乙氨基酚)光度法(简称TRPO萃取-(5-Br-PADAP)光度法)与固体荧光法相比,选择性好、准确、快速。
实验中样本空白的作用
1、样品空白可以抵消加入测试试剂前由于样品自身存在的色度或浊度而引起的正误差。2、在使用样品空白对测试仪器进行调零后,只有样品与测试试剂发生反应而产生的色度被测定了。由于样品的背景色度和浊度往往各不相同,样品空白经常用来对仪器进行调零。如:显色反应,按照与显色反应相同的条件,取同样量的样品溶液,但不
新的智能手机夹可以检测血液样本中的寨卡病毒
从COVID-19大流行的情况看，快速、简单、准确和敏感的检测方法对检测病毒病原体和控制传染病传播至关重要。不幸的是，基于实验室的方法通常需要训练有素的人员和复杂的程序。在一项新研究中，伊利诺伊大学香槟分校(University of Illinois Urbana-Champaign)的研究人员联
再解析：新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能...
再解析：新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能的关联性2019新型冠状病毒于2020年1月12日被世界卫生组织（WHO）命名为2019-nCoV。2020年3月13日，世卫组织将2019冠状病毒疫情从流行病升级为全球大流行病，疫情已在全球广泛传播。随着分子生物学技术的发展，分子诊断方法成为病原体检
乙型肝炎病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒
乙肝病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒是专门为服用或准备服用拉米夫定（贺普丁）的慢性乙肝患者设计生产的。 该产品可以准确检测出拉米夫定（贺普丁）耐药病毒株的存在，为临床医生及时发现HBV病毒变异，调整治疗方案提供有效帮助，避免拉米夫定因耐药性无效用药及由此带来的副作用、减轻患者不必要的经济负担
乙型肝炎病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒
乙肝病毒YMDD基因突变检测芯片试剂盒是专门为服用或准备服用拉米夫定（贺普丁）的慢性乙肝患者设计生产的。 该产品可以准确检测出拉米夫定（贺普丁）耐药病毒株的存在，为临床医生及时发现HBV病毒变异，调整治疗方案提供有效帮助，避免拉米夫定因耐药性无效用药及由此带来的副作用、减轻患者不必要的经济负担，具
全基因组测序揭示结核分枝杆菌的抗生素“预抗性”特征！
细菌全基因组测序的最新进展让研究人员成功绘制出了结核分枝杆菌抗生素耐药基因组特征的完整目录；近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Genomic signatures of pre-resistance in Mycobacterium tuberculosi
罗氏454起诉赛默飞Ion－Torrent－三项ZL侵权
近日，罗氏454将赛默飞世尔告上法庭，他们起诉赛默飞旗下的Ion Torrent侵犯了他们的3项ZL。这3项ZL都与测序前样本处理使用到的一项技术——微乳液PCR有关，ZL号（美国）分别为7323305、8748102、8765380。 赛默飞和罗氏都拒绝对诉讼发表评论。值得注意的是
西班牙可再生能源利用情况
西班牙主要利用的可再生能源为风力、水力、太阳能和其它可再生热能(地热等)。据西班牙工业能源和旅游部资料，2011年，西班牙风力、太阳能及地热作为初级能源的消耗量为5226 Ktep，比上年增加了8.1%。根据西班牙国家电网《2011年西班牙电力系统报告》，2011年，西电力总发电量26981
科学家利用基因编辑技术剔除小鼠艾滋病病毒
美国天普大学华人科学家胡文辉等人近日报告说，他们利用基因编辑技术，有效剔除了一种人源化小鼠多个器官组织中的人类艾滋病病毒，朝着开展人类临床试验的方向迈出一大步。 此前，胡文辉等人已成功利用基因编辑技术，有效清除了体外培养的人类细胞系、艾滋病患者体内取出的T免疫细胞以及转基因小鼠体内的艾滋病病毒
Nat－Genet：结核病细菌耐药往往需要多个突变
根据新泽西州立大学一项新研究的证实：结核病耐药性不是一个全有或全无的现象。 相反，结核病致病细菌往往以分步进行的方式积累突变，虽然初始突变的影响最小，但病菌获得其他突变后会发展高层次的耐药。这项研究发表在Nature Genetics杂志上。 抗结核药物乙胺丁醇阻断病菌保护性细胞壁
NEJM：微小突变引发常见白血病耐药性
最近，一个多结构研究小组发现，一个微小突变，使常见白血病——慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者对brutinib（一种高效精确的靶向抗癌药物）产生了耐药性。2014年5月28日在《新英格兰医学杂志》（New England Journal of Medicine）发表的一篇通讯中，研究人员阐述了该
NEJM：微小突变引发常见白血病耐药性
最近，一个多结构研究小组发现，一个微小突变，使常见白血病——慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者对brutinib（一种高效精确的靶向抗癌药物）产生了耐药性。2014年5月28日在《新英格兰医学杂志》（New England Journal of Medicine）发表的一篇通讯中，研究人员阐述了该
我所利用单细胞分泌分析技术解析神经免疫细胞互作网络
近日，我所单细胞分析研究组（1820组）陆瑶研究员团队利用单细胞多种类分泌因子检测技术，实现了对神经—免疫细胞互作网络的解析。 随着全球人口逐步进入老龄化阶段，神经退行性疾病正成为威胁人类健康的重大疾病之一。与神经退行性疾病直接相关的是神经细胞，但神经细胞并不是孤立存在的，神经细胞需要通过物理接触
Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型
人类细胞内的DNA，即我们熟知的基因型，为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的，但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成，这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色，身高，体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些
HIV的分子诊断
确定病毒载量的分子技术的发展和基因型耐药性的发展，使HIV病治疗发生了根本的改变。商业上可获得的病毒载量检测技术有许多，从逆转录PCR到分支链DNA扩增等不同方法。这些检测的局限性在于没有一个国际标准来比较不同方法测定的病毒载量，以及由于HIV的不同分化枝的差异性引起某些患者样本检出低下或未被检出。
Nature：测序人类皮肤微生物组－解析真菌多样性
历史上，人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了，然而我们对居住在自己身体上的真菌却并十分不了解。 现在，美国国立卫生研究院(NIH)的研究人员，首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌 DNA 进行了测序，明确了皮肤上正常真菌群落的构成，为研究真菌类皮肤病打下了
JCI：揭秘黑色素瘤对药物产生耐药性的新型图谱
名为BRAF抑制剂的药物对于黑色素瘤患者而言非常重要，该药物可以通过关闭刺激癌细胞生长的BRAF蛋白来间接抑制癌症发展挽救患者的生命；然而这种药物通常仅能有效使用1年甚至更短，科学家们在癌细胞中发现了可以产生耐药性的DNA突变，但他们并未找出这些遗传突变产生的原因。 近日，一篇发表于国际杂志J
质谱可以检测病毒吗？
提到现在主流的病毒检测手段，首推本次疫情期间大放异彩的荧光定量PCR为主，具备快速、灵敏的特点；传统细胞培养分离法，虽然操作繁琐，但仍旧是病毒分离鉴定金标准，如本次新型冠状病毒, 在初期是通过将呼吸道分泌物置于人呼吸道上皮细胞培养传代，通过透射电镜和培养上清液的全基因组测序得到最终确认；而基于抗