454测序协助发现疱疹样病毒与热带珊瑚礁的大面积减少...
454测序协助发现疱疹样病毒与热带珊瑚礁的大面积减少有关为了确定病毒病原体对珊瑚健康衰退的影响,圣地亚哥州立大学的研究人员最近在Forest Rohwer博士的领导下,用454生命科学的Genome Sequencer系统对各种环境压力下的Porites compressa珊瑚样本进行了宏基因组分析。此项研究的目的是重现目前热带珊瑚栖息地的生态变化,如pH降低、养分增加、温度升高,进而确定它们对珊瑚体内病毒群体的影响。这些实验发现在环境压力大的Porites compressa珊瑚中,一种类似疱疹的病毒呈现高丰度水平。有趣的是,病毒序列在无压力、健康的样品中几乎检测不到。尽管珊瑚是热带珊瑚礁系统的主要建造者,但人们对它们的微生物学还知之甚少。因此,珊瑚疾病的研究也只是局限在容易培养的细菌和真菌上。454测序的覆盖深度及无需克隆步骤,让它成为无偏向性的大量样品宏基因组研究的理想选择。在这项研究中,Genome Se......阅读全文
454测序协助发现疱疹样病毒与热带珊瑚礁的大面积减少...
454测序协助发现疱疹样病毒与热带珊瑚礁的大面积减少有关为了确定病毒病原体对珊瑚健康衰退的影响,圣地亚哥州立大学的研究人员最近在Forest Rohwer博士的领导下,用454生命科学的Genome Sequencer系统对各种环境压力下的Porites compressa珊瑚样本进行了宏基
DNA测序仪:454测序仪
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了
DNA测序454-焦磷酸测序简介
该方法在油溶液包裹的水滴中扩增DNA(即emulsion PCR),每一个水滴中开始时仅包含一个包被大量引物的磁珠和一个链接到微珠上的DNA模板分子(控制DNA浓度出现的大概率事件)。将emlusion PCR产物加载到特制的PTP板上,板上有上百万个孔,每个微孔只能容纳一个磁珠。DNA Pol
RNA测序深入了解疱疹病毒
近日,发表在《Nature Communications》上的一项研究中,研究人员利用单细胞RNA测序深入了解了疱疹病毒,为预防疱疹感染带来了新的见解。 如果你的嘴唇开始刺痛发痒,通常意味着你将患上唇疱疹,这是一种小而令人疼痛的水泡,里面充满了具有高度传染性的单纯疱疹病毒(HSV)。 单纯疱疹
罗氏454测序分析软件升级
罗氏公司近日宣布推出一款新的软件包(v2.8),能显著改善其GS FLX+系统上长读取鸟枪法测序的性能。这一测序平台能带来百万个读取,其读长超过1000 bp。此次改进将让研究人员发现更多复杂的遗传变异,并揭开隐藏在基因组、转录组和宏基因组样品中难以测序的区域下的生物学秘密。 罗氏
454用于西红柿基因组测序
最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发
生殖器疱疹与单纯疱疹病毒
单纯疱疹病毒(简称HSV)感染是一种全身性疾病,病毒经呼吸道、口腔、生殖器粘膜或破损皮肤进入人体,可潜于人体正常粘膜、血液、唾液以及局部感觉神经节和多数器官内,几乎所有的内脏和粘膜表皮内都可分离到HSV.目前在欧美发达国家,生殖器疱疹(GH)是发病率位居第三位的性传播疾病,也是最常见的性
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当
454测序识别早期HIV耐药性突变
回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败 2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医学院研究人
罗氏454高通量测序平台的特点及应用
Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台,GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展,必将带动整个测序领域的技术发展,对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生
454测序应用于花生种子败育研究
花生为豆科作物,是我国优质食用油主要油料品种之一,又名“落花生”或“长生果”,在全国各地均有种植,主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中,胚栓插入土壤,膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程,因此,胚栓入土失败、胚轴的膨压
疱疹样皮炎的病因
关于疱疹样皮炎的发病原因,目前尚未有定论,大多数学者认为该病与患者免疫异常及小肠病变有关。1.免疫异常在患者的皮损和正常皮肤真皮层有免疫物质IgA沉积,在荧光显微镜下可见到它们呈颗粒状。另外,大约70%的患者血中可以找到特殊的抗体及免疫复合物。这些均提示疱疹样皮炎与患者自身免疫异常有关。2.小肠病变
β淀粉样蛋白通过捕获病毒颗粒阻止疱疹病毒感染大脑
在一项新的研究中,来自美国麻省综合医院(MGH)的研究人员发现β-淀粉样蛋白(amyloid β-protein, Aβ)---在阿尔茨海默病患者的大脑中堆积而形成斑块的蛋白---保护大脑免受大脑中经常发现的疱疹病毒感染的机制。这一结果支持了疱疹病毒感染在加快Aβ蛋白堆积和阿尔茨海默病进展中发挥
单纯疱疹病毒(HSV)感染与复发的过程
HSV侵入粘膜或破损的皮肤,约经1~26天(平均5~7天)的潜伏期,便在入侵部位产生红斑,丘疹及水疱性损害。早期损害通常是一群或数群红色**性或疼痛性 斑丘疹,直径3~5毫米,约24~36小时之后会发展成小水疱,疱液清晰,5~6天后,成群的小水疱顶端露以灰色痂,疱液变黄,继之水疱破溃,形成小
454测序应用于HBV耐药性突变检测
HBV(Hepatitis B Virus)乙型肝炎是一种基因组长约3.2kb,部分双链环状DNA病毒。我国的乙肝病毒感染率约60%-70%,乙肝表面抗原携带率约占总人口的7%,以此计算,全国约有9300万人携带乙肝病毒,其中乙肝患者大约有3000万。由于HBV很
全国珊瑚礁论坛聚焦珊瑚礁研究与保护
近日,以“共享未来:珊瑚礁研究与保护”为主题的全国珊瑚礁论坛暨中国太平洋学会珊瑚礁分会2022年会/中国互联网公益峰会·边会在海南三亚举行。来自南海海洋所、自然资源部南海生态中心、上海交通大学、厦门大学、中国海洋大学、广西大学、海南大学、暨南大学、海南热带海洋学院的多位专家作特邀报告。 南海海洋所副
疱疹样皮炎的鉴别诊断
需与疱疹型天疱疮、大疱性类天疱疮、多形红斑和大疱性表皮松解症相鉴别。
疱疹样皮炎的临床特点
疱疹样皮炎是一种较为少见的慢性良性复发性大疱性皮肤病,病因不明。它的特点是反复发作、病程呈慢性经过、皮疹形态多样、对称分布、剧烈瘙痒、预后良好。多发生于22~55岁。常有无症状的谷胶过敏性肠病。
疱疹样皮炎的诊断标准
根据多形性皮疹,以水疱为主,排列呈环形,好发于肩胛、臀部和四肢伸侧,对称分布,剧烈瘙痒,尼氏征阴性,有时伴有吸收不良表现,组织病理为表皮下水疱,真皮乳头有中性粒细胞小脓肿,IgA呈颗粒状沉积,砜类药物有较好的治疗效果,可诊断。
疱疹样皮炎的治疗方法
1.一般治疗避免吃含碘剂、溴剂的药物(如华素片)和食物(如紫菜、海带),宜无谷胶(面筋)饮食。2.全身治疗(1)氨苯砜 每日2次或3次口服,可在1~3天之内缓解瘙痒等症状。若症状无改善,遵医嘱适当增加剂量。(2)磺胺吡啶 无氨苯砜效果好。接受氨苯砜和磺胺吡啶治疗的疱疹样皮炎病人,在治疗前和治疗后的前
疱疹样皮炎的预防方法
部分病人对谷胶过敏,限制谷胶饮食后,病情可自然好转,同时亦应避免含碘、溴、氯的食物、药物。
疱疹样皮炎的检查方法
1.实验室检查(1)血液中嗜酸性粒细胞升高,分类计数最高可达0.40。(2)25%~50%碘化钾软膏做斑贴试验,多数患者24小时内局部出现红斑、水疱。2.免疫学检查(1)直接免疫荧光检查 皮损周围3mm内外观正常皮肤或淡红斑处,90%患者真皮乳头有颗粒状IgA和C3沉积。水疱处由于炎症的破坏常呈阴性
Nature医学:发现危险的新SARS样病毒
冠状病毒(CoV)是目前基因组最大的一种RNA病毒,能够感染人类引起多种急性和慢性疾病,其中最引人注目的就是SARS以及之前困扰韩国的MERS。 北卡罗来纳大学的研究人员发现了一种新SARS样冠状病毒。这项发表在NatureMedicine杂志上的研究显示,新病毒不需要突变就可以直接从蝙蝠宿主
疱疹病毒介绍
疱疹病毒(Herpesviruses)是一群中等大小的双股DNA病毒,有100个以上成员,根据其理化性质分为α、β、γ三个亚科。α疱疹病毒(如单纯疱疹病毒、水痘一带状疱疹病毒)增殖速度快,引起细胞病变。β疱疹病毒(如巨细胞病毒),生长周期长,感染细胞形成巨细胞。γ疱疹病毒(如EB病毒),感染的靶细胞
疱疹样天疱疮病例分析
患者男, 69岁。因全身红斑、水疱伴瘙痒1个月余,于2016年 7月18日入院。患者1个月前无明显诱因双下肢出现红斑,边界清 楚,其上水疱,疱壁较薄,易破,瘙痒明显,后皮损逐渐加重,蔓延至上 肢,仍以红斑及水疱为主,就诊于外院,诊断不详,给予糠酸莫米松软 膏(艾洛松)外用后皮损好转不明显。入院前1周
类病毒的发现与研究
20 世纪 70 年代初期,美国植物病理学家 Diener及其同事在研究马铃薯纺锤块茎病(potato spindle tuber disease)病原时,观察到病原无病毒颗粒和抗原性、对酚等有机溶剂不敏感、耐热(70 ℃ ~75 ℃ )、对高速离心稳定(说明其低分子量)、对 RNA 酶敏感等特点。
病毒的发现与研究历史
一、病毒病由来已久 地球上的人类,其他动物和植物遭受病毒病的折磨已有许多世纪。许多记述表明至少在公元前二至三个世纪印度和中国就存在天花,中国从公元十世纪宋真宗时代就有接种人痘预防天花的记载了。在明代隆庆年间(1567-1572),人痘预防天花推行甚广,先后传至俄国、日本、朝鲜、土耳其及英国。179
疱疹病毒的病毒分离和鉴定
病毒分离培养是当今临床上明确诊断疱疹病毒感染的可靠依据。可采集皮肤、生殖器等病变部位的水疱液、脑脊液、角膜刮取物、唾液等标本,接种人二倍体成纤维细胞株WI38及其它传代细胞株如Vero、BHK等,经24~48小时后,细胞则出现肿胀、变圆、细胞融合等病变。然后用HSV-1和HSV-2的单克隆抗体作
454高通量测序研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环的