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生命科学国外重要数据库

EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目,包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成,每个字段由标识字起始,后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段,以次标识字或特性表说明符开始,最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID(序列名称),DE(序列简单说明),AC(序列编号),SV(序列版本号),KW(与序列相关的关键词),OS(序列来源的物种名),OC(序列来源的物种学名和分类学位置),RN(相关文献编号或递交序列的注册信息),RA(相关文献作者或递交序列的作者),RT(相关文献题目),RL(相关文献杂志名或递交序列的作者单位),RX(相关文献 Mediline引文代码),RC(相关文献注释),RP(相关文献其他注释),CC(关于序列的注释信息),DR(相关数据库交叉引用号),FH(序列特征表起始),FT(序列特征表子项),SQ(碱基种类统计数)。GenBank数据库结构完整......阅读全文

北京基因组所数据资源建设取得进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展,也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。  生命与健康大数

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

我国建成全球第四个综合基因组权威数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成

拉曼光谱技术综述

   【摘要】本文从拉曼散射原理出发,介绍了拉曼技术的特征,以及拉曼技术的优势和不足,从激光技术和纳米技术出发介绍了当前拉曼技术的广泛发展和应用。综述了近年来了曼技术的主要的分析技术。涉及拉曼光谱技术的发展简史,发展现状和最新研究进展等方面。  1、拉曼光谱的发展简史  印度物理学家拉曼于1928年

美国政府停摆给中国生命科学界的警示

  美国政府停摆给中国生命科学界的警示:中国需要自主的“国家生物信息学中心“   10月1日,由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧,联邦政府的非核心部门被迫关门了两个多星期。其中医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站在此期间处

2014年富兰克林奖揭晓 蛋白质数据库主任Berman博士获奖

          2014年3月10日,Bioinformatics.org主席Jeff Bizzaro宣布,来自罗格斯大学,新泽西州州立大学Helen M. Berman博士获得2014年“本杰明•富兰克林奖”,以表彰其在

贺福初:中国蛋白质组学面临的机遇和挑战

  蛋白质组学是一门新兴但发展迅速的学科。近年来,国际上主要发达国家和地区纷纷加大了对蛋白质组学的支持力度,这一研究领域也由此成为各强国科技角力的新战场。10月12~13日,以“蛋白质组学:前沿与挑战”为主题的第381次香山科学会议在北京举行,与会的59名海内外科学家围绕蛋白质组学发

世界微生物数据中心成立50周年纪念学术研讨会在京召开

  2016年正值世界微生物数据中心(WDCM)成立50周年,在中国科学院科技促进发展局、国际合作局、条件保障与财务局、环境保护部自然生态保护司和科技部国家科技基础条件平台中心的支持下,9月6日至8日,世界微生物数据中心WDCM成立五十周年国际学术研讨会在北京举行。会议邀请了来自世界菌种保藏联合会、

第十届中科院杰出青年终评推荐人选公示

  根据《关于评选第十届“中国科学院杰出青年”的通知》(科发京党字〔2009〕128号)文件规定,第十届中国科学院杰出青年评选程序性评审工作已于2010年1月11日进行,评选领导小组办公室按照有关文件要求及评选程序邀请相关人员对上报材料进行了认真的审阅,并选出了30位候选人进入最终的评选。   现

科研数据难共享阻碍国内生物科技发展

  上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在近日举行的首届金桥产业技术创新会议上,当记者向他问及相关进展时,听到的却是一声叹息。   13年前,“大数据”尚未被任何字典收录,而今却被公认是全球生命科学研究的核心工具。李亦学告诉记者,科研数据难以共享已成为国内生命科

【盘点】定量蛋白组学将在未来10年飞速发展

  人类基因组计划的成功实施,我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者",自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内,科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完

好消息!Journal of Analysis and Testing(JOAT)被数据库ESCI收录!

  2018年4月,Journal of Analysis and Testing (JOAT)在正式出版一周年之际,被科睿唯安(Clarivate Analytics)公司旗下Web of Science数据库ESCI(Emerging Sources Citation Index)收录。  Jo

微流控系统中毛细管电泳(CE)分离技术

前言微流控芯片是以微管道为网络连接微泵、微阀、微储液器、微电极、微检测元件等既有光、电和流体输送功能的元件,最大限度地把采样、稀释、加试剂、反应、分离、检测等分析功能集成在芯片上的微全分析系统。微流控芯片(Microfluidic Analysis)是微分析系统的主要组成部分,它与生物芯片(Bi

北京基因组所资源建设取得阶段性进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文,在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BIG

未来世界最大的不平等,可能就藏在这些医学趋势里

  最近这两年,每当我复盘一些愚蠢决策的时候,总会想起一个冷笑话。  有时候甚至半夜起来喝水,都会一不小心想到这个笑话,然后就会像个傻蛋一样笑半天。  这个笑话有很多版本,这里我讲一个细节经过我大量杜撰的版本。  话说铁蛋本来是个穷小子,结果经过努力奋斗在城里谋了一份还算高薪的工作。过了几年,铁蛋衣

中国实验动物学科发展40年

  实验动物学是一门新兴交叉学科,它集成了生物学、兽医学、生物工程、医学、药学、生物医学工程等学科的理论和方法,以实验动物和动物实验技术为研究对象,产生实验动物资源、动物模型资源、动物实验技术、生物信息和动物实验设备等,为生命科学、医学、药学、食品、农业、环境、航空航天等相关学科发展提供系统性生物学

新软件首次实现自动检测蛋白质组数据

  莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员将可能解决现代生命科学的重要难题:在大量的蛋白质原始数据组中自动检测公开的数据库中未被开发利用的数据。由于数据格式多样、数量庞大,精确查找这些数据一直以来都相当复杂。莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员在最新一期《自然生物技术》(“Natrue Biotech

新软件首次实现自动检测蛋白质组数据

  莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员将可能解决现代生命科学的重要难题:在大量的蛋白质原始数据组中自动检测公开的数据库中未被开发利用的数据。由于数据格式多样、数量庞大,精确查找这些数据一直以来都相当复杂。莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员在最新一期《自然生物技术》(“Natrue Biotech

上海生科院发表关于神经系统环形RNA研究的专评

  6月4日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲和计算生物学研究所研究员杨力题为Gear up in circles的专评,对当期Molecular Cell 和4月刊Nature Neuroscien

距离中国生物信息中心还有多远

  10月1日,由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧,联邦政府的非核心部门被迫关门。其中就包括医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站。   NCBI 是由美国参议员Claude Pepper于上世纪80年代后期发起成立。旨在发展新的

国内心脏干细胞研究陷入“造假大地震”?

   10月23日晚上7点,复旦大学附属中山医院心内科的年轻医生白英楠刚刚结束诊疗。这两天,她的名字不断以中文、英文的形式频繁出现在网络上,和科研造假、学术不端联系了起来。  白英楠感到有点冤。她对《中国科学报》记者表示:“我没有任何科研造假的行为。”  和白英楠一样处境尴尬的,还有一位心脏干细胞领

中美携手合作“十万食源性病原微生物基因组计划”

  5月28日,北京诺赛基因组研究中心(国家人类基因组北方研究中心)、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就“十万食源性病原微生物基因组计划”达成合作协议。据悉,中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发,建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库

2020年美国光学学会会士揭晓!哪几位中国科学家上榜?

  日前,美国光学学会(OSA)宣布了2020年度新当选会士名单,共有94位光科学家新当选为美国光学学会会士(OSA Fellow),其中中国科学家共有15位。  美国光学学会(OSA)成立于1916年,是世界光学领域权威的国际性学术组织。光学学会会士(OSA Fellow)是美国光学学会授予该领域

医学检测行业爆发前夜 博奥颐和布局五大健康板块

  自去年6月30日,国家卫计委放开无创产前基因检测以来,一系列支持性政策陆续发布。近日,国家发改委发布《关于实施新兴产业重大工程包的通知》,计划在3年时间内,建设30个基因检测技术应用示范中心。  博奥生物脱胎于清华大学生物芯片研究与开发中心。清华大学一直在考虑如何布局医疗健康产业,而博奥生物是清

杨立英张晓林:中国基础研究竞争力的定量分析

  中国科学院文献情报中心近期发布了《中国基础研究国际竞争力蓝皮书2015》(以下简称《蓝皮书》)。《蓝皮书》由张晓林研究员担任总策划、杨立英研究员主持,以科研产出为视角,采用定量研究方法,基于汤森路透公司(Thomson Reuters)发布的WoS数据库记录,勾勒出中国国际竞争力的宏观轮廓和基本

第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班第一轮通知

  蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2011年7月19-22日在

第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班第二轮通知

北京蛋白质组研究中心 第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第二轮通知)   蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心于2012年7月17-20日在北京举

第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第二轮通知)

  蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2011年7月19-22日在

第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)

  北京蛋白质组研究中心  第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)  蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物