科研数据难共享阻碍国内生物科技发展
上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在近日举行的首届金桥产业技术创新会议上，当记者向他问及相关进展时，听到的却是一声叹息。 13年前，“大数据”尚未被任何字典收录，而今却被公认是全球生命科学研究的核心工具。李亦学告诉记者，科研数据难以共享已成为国内生命科学研究的一大障碍;而在大数据时代，其负面效应还可能被继续放大。 李亦学透露，国内一批院士和重量级专家正在起草一份报告，建议国家借鉴美国、欧洲、日本等的做法，建立国家级生命科学数据库，从而打破共享瓶颈。作为该调研报告的参与人，李亦学表示，在技术上，共享“不存在任何障碍”，国家应尽早落子布局。 一辈子的难题，几个月解决 在生命科学领域引入大数据工具，将给研究带来极大便利。科学家用传统方法可能要花一辈子才能解决的难题，大数据可能只要几个月就能找到答案。 一个典型案例是“腓骨肌萎缩症(CMT)”的研究。这是一种常见的遗......阅读全文
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
《自然》：知名数据库中超34万篇论文涉嫌造假
说起PubMed，很多小伙伴都非常熟悉，这应该算是国内最常用的生物医学相关SCI文献检索数据库，实验室的小白们一开始用的基本都是它。最近，Nature的一篇报道文章称，就是这样一个广受好评的文献检索集大成者，被一款名为Papermill Alarm的软件工具查出，至少有1%的论文可能出自论文工厂。1
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
重要化学数据库近千个晶体结构可能来自论文工厂
英国剑桥晶体学数据中心（CCDC）收录的近千个晶体结构的数据条目可能是论文工厂的产物，机构已将其标记为可疑条目，并对其进行审查。CCDC 是化学家寻求晶体结构信息的一个必查资源库，存放了结晶学领域许多期刊论文的数据，记录了 100 多万个晶体结构。今年 4 月，预印本平台 Research Squa
破解困局:－中国应建立国家级数据库应对优秀论文外流
“中国最重要的学术成果中有95%以上不在国内发表，我们借助国外同行把它发表出来，同时，国家每年还要花很多外汇把这个成果买回来用于支撑我们的科研教育。”上海书展还未开幕，一场围绕中国学术出版 “走出去”展开的高端论坛于8月13日下午开讲。国家新闻出版广电总局副局长邬书林在论坛上点出的中国学术出
生命科学常用数据库
The NationalCenter for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html T
QP2010农药数据库
Shimadzu气质联用的多种农药库 QP2010农药数据库
美国更新食品掺假数据库
9月5日食品安全新闻网消息，美国药典委员会（USP）更新了食品掺假数据库（FFD2.0）。食品掺假数据库主要为行业、监管部门以及消费者预防和应对食品掺假事件发生提供技术支持。最新的FFD2.0涵盖了科研文献、媒体信息、食品监管记录、司法裁决记录中涉及食品掺假事件的各种信息。新版食品掺假数据库将于
拉曼光谱免费数据库
拉曼数据库在物质鉴定和化学分析方面具有重要的作用。关于拉曼数据，我们一般会关注两个峰的位置，分别是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶体的 Raman特征峰，分别在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反应的是晶格的碳缺陷，G峰反应的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
信息服务商购买论文获取工具
图片来源：The Project Twins 大型学术引擎科学网（Web of Science）的所有者——科睿唯安公司已经购买了一家初创公司。后者的工具可为研究人员提供合法的一键获取期刊文章服务，即便当用户在校外时。 科睿唯安日前宣布，已收购总部位于英国伦敦的Ko
论文造假层出不穷！新工具有望“重创”论文工厂
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500905.shtm “唯论文”的科研环境助长了学术不正之风，学术垃圾井喷更是让人瞠目结舌。一方面，出版商正加大力度打击论文工厂，推出新型论文造假检测工具；另一方面，改变“不发表就灭亡”的学术氛围也成
英国启动细胞产品试验数据库
英国细胞治疗产品行业现在拥有了一个数据库，该数据库囊括了该国所有正在进行之中的临床试验项目。建立这个数据库的目的是要扩大研究合作，将更多的早期试验推进到后期开发阶段。 囊括21个研究项目 这个数据库包括21个细胞治疗研究项目，由英国细胞疗法中心(CTC)发起，并得到了英国技术战略委员
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
北京正在建罕见病数据库
今日，2014第三届中国罕见病高峰论坛在京举办。北京医学会罕见病分会副主任王琳在论坛中透露，北京正在建立罕见病病例登记系统和病人数据库，尝试单病种追踪调研和罕见病诊治地图的设置。 王琳介绍，中国目前所应用的罕见病相关数据都是基于欧盟、美国等地所提供的资料。“而国内到现在也没有对本国进行过罕见病
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成，每个字段由标识字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次标识字或特性表说明符开始，最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID（序列名称），DE（序列
论文常用数据分析方法
论文常用数据分析方法论文常用数据分析方法，对好的论文分析研究方法应该从哪些方面展开，如何表达才能显得自己对该论文真的有所理解，应该看哪些书呢？下面我整理了论文常用数据分析方法，一起了解看看吧!论文常用数据分析方法1论文常用数据分析方法分类总结1、 基本描述统计频数分析是用于分析定类数据的选择频数和百
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安全措施
天津建成食品污染物数据库
日前从天津市卫生计生委、市卫生监督所获悉，为了扩大食品污染物及有害因素监测覆盖面，实现对食源性疾病的主动监测，该市食品安全风险监测区域已覆盖全市16个区县，食源性疾病监测哨点医院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物数据库。 根据目前在食品安全领域担负的职责，该市卫生计生部门规划建立了
全球最大地震数据库建成
国际地震学中心绘制的2万次地震数据集。 2004年苏门答腊岛地震、2008年中国汶川地震、2010年海地地震、2011年日本地震，在每次灾难中，故事都是相同的：一场地震在毫无征兆的情况下发生，夺走成千上万条生命，并且摧毁了像沙子城堡一样的建筑。 地球科学家依然无法预测一场大地震
英特尔将建帕金森患者数据库
帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录，以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨，我虽然正视自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情？说起来容易做起来难！ 好消息是，现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐，帕金森病患者运
Nature：癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断
去年，美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效，美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现，尽管当时她的研