大规模蛋白质相互作用研究方法进展（三）
图1 TAP亲和层析纯化原理[14] 注：A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白，TEV 酶切分离ProteinA 和靶蛋白；B:利用CBP(Calmodulin binding peptide)-Calmodulin 的相互作用进一步纯化复合物，缓冲液洗去杂蛋白。加入过量的螯合剂(EGTA)螯合Ca2+，使纯化的复合物与层析柱分离。 TAP 纯化时存在蛋白污染问题，很难判断这些蛋白是真正的相互作用，还是蛋白处理过程中的副产品。为此，有人建议用三标签的方法[19]，但实验表明该法也不能排除蛋白的污染。其他标签也有应用，比较流行的是Flag[20]。GST、His6、生物素等也分别用于蛋白纯化，但由于......阅读全文
武汉植物园在纳米银与蛋白质相互作用研究中取得进展
纳米银（Silver nanoparticles）是空间三个维度都处于1-100 nm范围内由银原子构成的具有特殊性质的材料，由于具有卓越的抗菌性能，被广泛用于人类生产生活的各个领域。然而，随着纳米银使用的增加，越来越多的纳米银释放到环境中，由此可能会对生物体造成毒害，从而破坏生态系统的结构和
大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作（Nature Structural & Molecular Biology）基础上，再次与合作者利用结构生物学手段，揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的
蛋白质相互作用识别和干预机制分析获进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队在蛋白质复合物形成和干预机制分析新方法研究方面取得新进展。研究人员通过溶液状态蛋白质赖氨酸两步稳定同位素标记和定量蛋白质组学分析，实现对蛋白—蛋白识别关键位点区域的精确探测，并可评估小分子对蛋白质复合物的构象识别干预情况。相关研究结果发表于《化学
蛋白质相互作用研究：从整体到局部
随着越来越多的物种基因组测序完成，对全蛋白质组与相互作用组的解释已经成为近期研究的热点。虽然蛋白质组研究阐述了表达蛋白质的所有组成成分，但是相互作用组包括了生物体内存在或者可能存在的成对蛋白质-蛋白质相互作用，因此，形成了庞大且稀疏的网状结构。伦敦帝国理工学院生物信息学中心的WP Ke
研究蛋白质RNA相互作用的新工具
近日，赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit，让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵，轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比，这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。 蛋白
鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展
【摘要】鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中，这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切，以肽段为鉴定单元，继而推导真实的样品蛋白质。由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率，而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失，所鉴定的蛋白质难免存在
蛋白质的研究方法
蛋白质是被研究得最多的一类生物分子，对它们的研究包括“体内”(in vivo)、“体外”(in vitro)、和“在计算机中”(in silico)。体外研究多应用于纯化后的蛋白质，将它们置于可控制的环境中，以期获得它们的功能信息；例如，酶动力学相关的研究可以揭示酶催化反应的化学机制和与不同底
蛋白质组技术的研究进展
大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心，在相当短的时期内，一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年，流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译，在此后不到两年的时间，近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而，这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代，许多DNA序列信息仅
蛋白质组技术的研究进展
大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心，在相当短的时期内，一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年，流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译，在此后不到两年的时间，近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而，这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代，许多DNA序列信
蛋白质组的研究进展介绍
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。 上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白
人体最大蛋白质家族研究获进展
5月18日凌晨，《自然》期刊同时在线发表两篇G蛋白偶联受体（GPCR）重大科研成果，分别由中科院上海药物研究所、上海科技大学领衔，联合复旦大学药学院共同完成。 中科院上海药物研究所领衔的科研团队成功解析人源胰高血糖素受体（GCGR）全长蛋白的三维结构，揭示了该受体蛋白不同结构域对其活化的调控机
研究在构建大规模异构生物分子关联网络取得进展
中国科学院新疆理化技术研究所多语种信息技术研究室研究生郭镇豪、易海成在研究员尤著宏的指导下，开展的关于大规模异构生物分子关联网络的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via l
扬子地块奥陶纪末的大规模气候波动研究取得进展
扬子地块奥陶-志留系界线附近高分辨率化学蚀变指数（CIA）变化及对比 （A）宜昌王家湾剖面；（B）贵州桐梓南坝子（红花园附近）剖面。CIAcorr.代表校正的CIA指数（实圆心），垂直虚线代表平均页岩的CIA值范围，阴影段代表Hirnantian气候寒冷期，箭头指示奥陶纪末的两
高能光核相互作用研究获重要进展
华南师范大学教授叶早晨团队携手美国莱斯大学等科研人员，依托欧洲核子研究中心的大型强子对撞机（LHC）上的CMS国际合作实验，在相干高能光核相互作用领域取得关键进展——首次观测到ϕ矢量介子的产生过程。近日，相关成果发表于《物理评论快报》。记者获悉，该研究为深入探索原子核深层结构、极致密条件下强相互作用
蛋白质相互作用(protein－interaction)实验方法
免疫共沉淀和亲和层析共分离：免疫共沉淀是证明蛋白质-蛋白质相互作用的最直接最经典和最有效的方法，如蛋白A能与B相互作用结合成异源二聚体，无论用抗A或抗B的抗体或与A或 B的亲和物偶联的agarose小珠都能把A和B沉淀下来。因此广泛用于蛋白质相互作用研究。常用的小珠：GST-Agarose（不需要抗
预测蛋白质相互作用的计算方法
蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能，帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。
蛋白质含量的测定方法（三）
（二）Bradford法的优缺点1、Bradford法的突出优点是：（1）灵敏度高，据估计比Lowry法约高四倍，其最低蛋白质检测量可达1g。这是因为蛋白质与染料结合后产生的颜色变化很大，蛋白质－染料复合物有更高的消光系数，因而光吸收值随蛋白质浓度的变化比Lowry法要大的多。（2）测定快速、简便，
蛋白质相互作用
Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System· Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast
蛋白质组学分离分析方法进展
分析测试百科网讯 2015年10月17日，第二届全国质谱分析学术报告会（质谱大会）在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕。中国科学院大连化学物理研究所 张玉奎 来自中国科学院大连化学物理研究所的张玉奎院士带来了题为《蛋白质组学分离分析方法进展》的报告。 张玉奎主要介绍了蛋白质样品预处理、蛋白质组
大连化物所蛋白质组学研究取得进展
蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象，其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心，并且N-中心甲基化还存在不同状态，同时甲基化对分离行为影响非常细微，限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科
蛋白质组技术的研究进展（一）
大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心，在相当短的时期内，一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年，流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译，在此后不到两年的时间，近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而，这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代，许多DNA序列信
蛋白质组技术的研究进展（二）
3 蛋白质组技术的支柱－－-鉴定技术（Identification） 如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有
植物蛋白质氧化折叠研究中进展
二硫键的形成对于真核生物的分泌蛋白和质膜蛋白在内质网中的折叠十分重要。在动物和酵母中，内质网氧化还原蛋白oxidoreductin-1 (Ero1) 是二硫键的主要供体，将二硫键通过蛋白质二硫键异构酶（PDI）传递给底物蛋白。前期，中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心研究员吕东平研究
Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
大化所磷酸化蛋白质组分析方法研究取得新进展
近日，我所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）邹汉法、叶明亮等在磷酸化蛋白质组分析新方法研究方面取得新进展。该团队与加拿大西安大略大学李顺成教授研究团队利用生物分子之间的特异性识别作用建立了一种非抗体的酪氨酸磷酸化肽段富集新方法，显著提高了酪氨酸磷酸化蛋白质组的分析覆盖率和灵敏度，相关
大连化物所定量蛋白质组学新技术新方法研究取得进展
近日，中科院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)邹汉法、叶明亮研究员等人在定量蛋白质组学新技术新方法研究方面取得新进展。相关研究成果发表在最新一期的Angew. Chem. Int. Ed.上(2013年52卷，9205-9209页)。 该项研究工作利用胰蛋
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
金属—载体强相互作用研究取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510395.shtm
金属载体强相互作用研究取得新进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所航天催化与新材料实验室研究员乔波涛和中科院院士张涛团队与穆斯堡尔谱技术研究组研究员王军虎团队合作，在金属载体强相互作用研究方面取得新进展：首次发现铂族金属（Pt、Pd）与羟基磷灰石之间的金属载体强相互作用。研究成果在Chemical Science上发表。 1
波浪与可渗结构相互作用研究取得进展
近日，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）教授、广东省创新团队“南海生态环境权益综合研究”带头人唐丹玲团队与合作者，利用无网格方法研究波浪与可渗结构相互作用方面取得进展。相关成果发表于《流体物理学》。 该研究通过采用光滑粒子流体动力学（SPH）技术开发了一种先进的数值模型，以精确模拟海洋工程