大连化物所蛋白质组学研究取得进展
蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象,其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心,并且N-中心甲基化还存在不同状态,同时甲基化对分离行为影响非常细微,限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科学院大连化学物理研究所研究员赵宗保和邹汉法提出了“同位素标记SAM甲基化”研究新策略,深入解析了模式生物酿酒酵母的蛋白质甲基化组,首次对蛋白质甲基化实现全覆盖,研究成果最近发表在Journal of Proteomics (2015, 114, 226)上。 该成果成功鉴定了43种甲基化蛋白,包括分布在64个甲基化中心的68个甲基化事件,其中超过90%的甲基化事件是首次发现。分析表明:(1)超过2.6%的酵母蛋白质存在甲基化;(2)甲基化发生在氨基酸残基的顺序为Lys >> Arg > Asp > Glu ≈......阅读全文
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:
甲基化研究新套路
组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。 为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士课
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
甲基化研究新思路
组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士
甲基化研究新套路
组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。 为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士课
新研究揭示水稻组蛋白甲基化调控根系核心菌群
根系微生物组与植物的养分吸收、抗病抗逆等生长发育过程密切相关,其在植物根系的定殖和组装受环境和植物遗传途径等因素的影响。表观遗传调控是调节染色体行为和基因表达的重要机制,探究表观遗传途径与植物根系微生物的关系能够更系统地揭示植物生长发育过程。表观遗传调控与宿主微生物组的关系已在动物模型中得到研究
罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法
自2004年美国批准Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治疗以来,通过改变致病基因的表观遗传学特征进行疾病治疗的方法,为人们带来了疾病的新治疗策略。然而,由于表观遗传检测方法的局限,要确定基因的碱基在何处以何种程度被甲基化一直以来困扰着研究者,从而难以确定基
RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。
RNA甲基化研究深度剖析(一)
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高
线粒体DNA甲基化研究进展
DNA 甲基化是表观遗传修饰的重要方式之一. 线粒体是真核细胞内的关键细胞器, 线粒体DNA(mtDNA)编码部分线粒体基因, 其 mtDNA 的甲基化修饰可能引起所编码基因的异常表达, 从而参与调节生理和病理过程. 近期来自西安交通大学生命科学与技术学院的研究人员就目前 mtDNA 甲基化及其
“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
精氨酸甲基化调控细胞凋亡研究
遗传与发育生物学研究所杨崇林实验室以秀丽线虫为模式,探索蛋白质精氨酸甲基化这一重要的蛋白质翻译后修饰方式在调控DNA损伤诱导的细胞凋亡方面的作用机制。 通过研究发现哺乳动物II型蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT5在线虫中的同源物,即线虫的PRMT-5,参与调控DNA损伤引起的细胞凋亡。在prmt-5基
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合
甲基化领域重要研究成果解读!
本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习! 【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制 doi:10.1126/science.aar7854 DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(一)
目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。文章导读:2018年10月31日,美国芝加哥大学何川团队,上海科技大学
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)
接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks
2018国自然研究热点二:-RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:
RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—
DNA甲基化研究方法的回顾与评价
摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲
科学研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化学修饰,这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在,科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。 近日,来自UNIGE大学的研究团队们,发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也
蛋白质DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干扰分析法—甲基化
实验方法原理在甲基化干扰实验中,探针通过将鸟嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)进行甲基化而产生。这些甲基化的碱基可被哌啶特异性切割。实验材料含有蛋白质结合位点的DNA片段试剂、试剂盒TE 缓冲液 pH 7.5 〜8.0硫酸二甲酯(DMS)DMS反应缓冲液DMS终止缓冲液10 mg m
两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症
拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展
3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
家蚕基因组甲基化谱研究获突破
我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱 由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”,5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表,这是中国科学家
DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)
摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲