用RNA的免疫沉淀rPCR方法进行体内分离核糖核蛋...(二)
6. 仪器(1) 微型凝胶水平电泳仪。(2) 紫外透射仪。(3) PCR 扩增仪。(4) 高速低温离心机。(5) 低温微型离心机。(6) 台式低温离心机。(7) 旋转真空浓缩仪(Speed-Vac concentrator)。二、实验方法1. 细胞提取物的制备(1) 培养 3~4 瓶 150 cm2 组织培养瓶的细胞。(2) 用 10~15 ml 冰冷的 PBS 洗三次。用细胞刮刀收集细胞,用冰冷的 PBS 重悬细胞并将其转移至 50 ml 的无菌离心管中。(3) 于 4℃ 1000 g 离心 10 min。(4) 用 0.5 ml 含有 100 U RNase 抑制剂的新鲜配制的 NET-2 缓冲液重悬细胞。(5) 将细胞重悬液放置冰上超声波处理,每次 5~10 s,共三次。(6) 将经超声波处理的细胞悬液转移至 15 ml 耐压透性玻璃管中,4℃ 10000 g 离心 10 min,回收上清液,用于免疫沉淀反应。上清液可冻存......阅读全文
核糖体RNA的特点
(1)含量高,rRNA是细胞内含量最高的RNA,占细胞总RNA的80%~85%。(2)寿命长,rRNA更新慢,寿命长。 (3)种类少,原核生物有5S、16S、23s三种rRNA,约占核糖体质量的66%(其中5S,23SrRNA占核糖体大亚基的70%,16S rRNA占核糖体小亚基的60%);真核生物
核糖体RNA的结构
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与
核糖体RNA的特点
(1)含量高,rRNA是细胞内含量最高的RNA,占细胞总RNA的80%~85%。(2)寿命长,rRNA更新慢,寿命长。 (3)种类少,原核生物有5S、16S、23s三种rRNA,约占核糖体质量的66%(其中5S,23SrRNA占核糖体大亚基的70%,16S rRNA占核糖体小亚基的60%);真核生物
核糖体RNA的组成
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起,形成核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为沉降系数(sedimentation coefficient),当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒
核糖体RNA的简介
rRNA的分子量较大,结构相当复杂,目前虽已测出不少rRNA分子的 一级结构,但对其二级、 三级结构及其功能的研究还需进一步的深入。 原核生物的rRNA分三类:5SrRNA、16SrRNA和23SrRNA。 真核生物的rRNA分四类:5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA
核糖体RNA的分类
原核生物的rRNA分三类:5SrRNA、16SrRNA和23SrRNA。真核生物的rRNA分四类:5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。S为大分子物质在超速离心沉降中的一个物理学单位,可间接反映分子量的大小。原核生物和真核生物的核糖体均由大、小两种亚基组成。在人基因组的四种
核糖体RNA的功能
在核糖体中,rRNA是起主要作用的结构成分,是结构和功能核心,主要功能是:(1)具有肽酰转移酶的活性。(2)为tRNA提供结合位点。(3)为多种蛋白质合成因子提供结合位点。(4)在蛋白质合成起始时,参与同mRNA选择性的结合以及在肽链的延伸中与mRNA结合。(5)此外,核糖体大小亚单位的结合、校正阅
核糖体RNA的功能
在核糖体中,rRNA是起主要作用的结构成分,是结构和功能核心,主要功能是: (1)具有肽酰转移酶的活性。 (2)为tRNA提供结合位点。 (3)为多种蛋白质合成因子提供结合位点。 (4)在蛋白质合成起始时,参与同mRNA选择性的结合以及在肽链的延伸中与mRNA结合。 (5)此外,核糖体
核糖体RNA的组成
rRNA一般与 核糖体蛋白质结合在一起,形成 核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为 沉降系数(sedimentation coefficient),当用 超速离心测定一个粒子的沉淀速度
原核和真核生物mRNA的二级结构与功能的关系
a-鹅膏蕈碱:抑制真核生物RNA聚合酶。 通常mRNA(单链)分子自身回折产生许多双链结构( [噬菌体M RNA中成熟蛋白] RNA中成熟蛋白" class=image>[编码区的二级结构及外壳蛋白的起始密码子AUG的位置])。原核生物,例如M 噬菌体RNA外壳蛋白编码区,经计算有66.4%的
用分离的亚细胞组分进行激酶分析
实验材料 细胞器样品 试剂、试剂盒 激酶分析缓冲液ATP 仪器、耗材 SDS-PAGE 凝胶 实验步骤 1. 准备反应混合物:反应体积通常是 50~100 ml。 5X 激酶分析缓冲液 10
用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图
核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理核糖核酸酶保护分析用于度量特
前核糖体RNA
中文名称前核糖体RNA英文名称pre-ribosomal RNA;precursor rRNA;pre-rRNA定 义真核细胞中rRNA基因转录的初级转录物。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
核糖体RNA特点
(1)含量高,rRNA是细胞内含量最高的RNA,占细胞总RNA的80%~85%。 (2)寿命长,rRNA更新慢,寿命长。 (3)种类少,原核生物有5S、16S、23s三种rRNA,约占核糖体质量的66%(其中5S,23SrRNA占核糖体大亚基的70%,16S rRNA占核糖体小亚基的60%);真核生
核糖核酸(RNA)测序
RNA在细胞中的稳定性较差,在实验中也更容易受到核酸酶的攻击。因为RNA是由DNA转录产生的,所以信息已经存在于细胞的DNA中。然而,有时也需要对RNA分子进行测序。虽然DNA测序给出了生物体的遗传图谱,但RNA测序却反映了细胞中活跃表达的序列。为了给RNA测序,通常的方法是首先对从样品中提取的
按大小分离RNA:在含有甲醛琼脂糖凝胶上进行RNA的电泳
RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (1990) 修改而来。RNA 在含有 2.2 mol/L 甲醛的凝胶上电泳分离。本实验来
按大小分离RNA:在含有甲醛的琼脂糖凝胶上进行的RNA的...
按大小分离RNA:在含有甲醛的琼脂糖凝胶上进行的RNA的电泳实验方法原理 RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (199
按大小分离RNA:在含有甲醛的琼脂糖凝胶上进行的RNA电泳
实验方法原理 RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (1990)
注射用硫酸核糖霉素的检查方法
检查溶液的澄清度与颜色取本品5瓶,按标示量分别加水制成每1ml中含20万单位的溶液,溶液应澄清无色;如显浑浊,与1号浊度标准液(通则0902第一法)比较,均不得更浓;如显色,与黄色或黄绿色4号标准比色液(通则0901第一法)比较,均不得更深有关物质照高效液相色谱法(通则0512)测定供试品溶液取本品
核小RNA的特点
①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。
核小RNA的用途
核小RNA是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。
核小RNA的特点
①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。通常snRNA不是游离存在,而是与蛋白质结合成复合物,成为小核核糖核蛋白颗粒(small nuclear ribo
核酸-活性多肽及递质的提取方法
核酸分为两大类:一类为核糖核酸(RNA),另一类为脱氧核糖核酸(DND)。核酸的分子量极大,人数万致亿万。核酸是两性化合物,在一定的等电点。溶于水,其水溶液呈酸性,不溶于乙醇等有机溶剂。细胞内的核酸常和蛋白质结合成核蛋白。核糖核蛋白和脱氧核糖核蛋白在不同浓度的电解质溶液中的溶解度有显著区别,有一定浓
核酸-活性多肽及递质的提取方法
核酸分为两大类:一类为核糖核酸(RNA),另一类为脱氧核糖核酸(DND)。核酸的分子量极大,人数万致亿万。核酸是两性化合物,在一定的等电点。溶于水,其水溶液呈酸性,不溶于乙醇等有机溶剂。细胞内的核酸常和蛋白质结合成核蛋白。核糖核蛋白和脱氧核糖核蛋白在不同浓度的电解质溶液中的溶解度有显著区别,有一定
环状RNA研究方法(二)
在此基础上,哪些环状RNA分子发生了差异表达?在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准,一共发现42个环状发生上调,47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章,差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
核糖体RNA的功能特点
(1)含量高,rRNA是细胞内含量最高的RNA,占细胞总RNA的80%~85%。 (2)寿命长,rRNA更新慢,寿命长。 (3)种类少,原核生物有5S、16S、23s三种rRNA,约占核糖体质量的66%(其中5S,23SrRNA占核糖体大亚基的70%,16S rRNA占核糖体小亚基的60%);真核生
核糖体RNA的结构介绍
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与
核糖核酸的种类信使RNA
信使RNA(mRNA)最早发现于1960年,在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成,具有以下特点。1.含量低,占细胞总RNA的1%~5%。 2.种类多,可达105种。不同基因表达不同的mRNA。3.寿命短,不同mRNA指导合成不同的蛋白质,完成使命后即被降解。细菌mRNA的平均半衰期
核糖核酸的种类转移RNA
转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点: ①是一类单链小分子RNA,
核糖体RNA的基本特点
核糖体RNA在各种生物中都有其特性,因此可以从不同生物的rRNA的对比中得出关于生物进化历程的结论。rRNA为肽酰转移酶(peptidyl transferase)时,催化使肽键形成,不需要额外的能量。过去认为,大亚基的蛋白质具有酶的活性,促使肽键形成,故称为转肽酶。20世纪90年代初,H.F.No