T7RNA聚合酶/启动子表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养过夜。 2. 挑取独立的转化菌落于LB/氨苄青霉素培养基中,37℃培养,通过小量制备方法获得质粒DNA。以限制性酶谱分析确证基因正确插入与否。 3. 从pGP1-2转化大肠杆菌K38株涂布LB/卡那霉素平皿上,30℃下培养过夜(24 h)。挑取单个的转化菌落于LB/卡那霉素培养基中,30℃培养。4. 将一含有Pt7控制下的待表达基因的载体转化入大肠杆菌K38/pGP1-2,于LB/卡那霉素培养基上生长(转化期间细胞可经热激处理),将转化物涂布于LB/氨苄青霉......阅读全文
Northwestern筛选蛋白表达文库实验
Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上,以标记的 RNA 探针进行筛选,最终获取能与靶 RNA 分子特异性结合
分子克隆蛋白表达实验指南(十二)
– Note: The yield of fusion protein can be estimated by measuring the absorbance at 280 nm. The GST affinity tag can be approximated by 1 A280 Å 0.5
原核表达实验前分析设计
表达不同于其它一些实验,比如:提取质粒、PCR 、电镜切片,这些人为控制的因素比较多,出问题相对来说也比较好分析。表达呢,你把质粒克隆好啦,交给细胞,然后有些事情就不全是你要怎样就怎样了。原核表达在表达当中来说还是比较简单,细菌培养条件简单、生长速度快,需要的仪器和培养基都比较便宜。当然
分子克隆蛋白表达实验指南(六)
10. 测序 突变后氨基酸序列没有变化仍可用于表达。测序报告中blast时若有‘-’符号,则人工对照测序图谱。 测序验证后没有突变或者同义突变的重组质粒必须小抽,50ul,conc300ug/ml备份。测序文件应妥善保存,蛋白表达完成后一并提交存档。 获得GS后,即可构建含GE的重组T载体,用
分子克隆蛋白表达实验指南(十一)
SDS-PAGE胶样品排列: MarkerUII 37CUI’I’ Marker:低分子量蛋白marker,上样10ul UI:未诱导菌液,上样10ul。任取37C和20C中一个 I:诱导后对照,上样10ul UI’, I’代表G
分子克隆蛋白表达实验指南(八)
15. 小量蛋白诱导表达 该步骤的目的是检测蛋白是否在上清存在表达。低温时蛋白易于表达于上清,因此小量蛋白诱导表达以20或30C为培养温度。 1. 挑一单克隆的菌落于5ml含有相应的抗生素的LB培养液中,37℃振荡培养过夜(8-16h)。 2. 过夜培养液加入三瓶50ml含
基因表达系列分析实验(SAGE)(四)
83. 用作测序的 2 ul PCR 产物(所需的确切用量取决于测序的方案,并应当优化)用下述方法处理:0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl,pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应
基因表达系列分析实验(SAGE)(二)
31. 乙醇沉淀:11.5 ml 样品10 ul SeeDNA100 ul 糖原5.1 ml 7.5 mol/L 乙酸铵38.3 ml 100% 乙醇干冰/甲醇浴 15 min。然后室温溶化 2 min。32. 轻轻涡旋混匀,台式离心机的吊桶转子室温约 3000 g (4000 r/min) 离心
痘苗病毒系统基因表达实验(二)
实验方法原理含有 pT7 控制的外源基因(本实验「重组痘苗病毒(VTF7-3)感染后的脂质体转染」)的重组质粒,通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞,在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA 聚合酶转录,并在感染细胞的细胞质完成
分子克隆蛋白表达实验指南(十六)
Amp(50mg/ml) 溶解1g Amp于足量的水中,最后定容至20ml。分装成小份于-20℃贮存。常以20~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基,1:1000比例稀释 Kan(50mg/ml) 溶解1g Kan于足量的水中,最后定容至20ml
分子克隆蛋白表达实验指南(十五)
LB固体培养基 Tryptone 1g Yeast Extract 0.5g NaCl 1g Agar 1.5g 加蒸馏水至总体
分子克隆蛋白表达实验指南(十四)
RbCl制备感受态细胞 需准备的灭菌器具和培养液: SOB,Buffer 1,Buffer 2,3×200ml广口瓶,1.5ml EP管,1×500ml离心瓶(按200ml摇菌量计算),2×50ml离心管,2×移液管(用于加Buffer 1),液氮,冰 离心管,EP管,移液管使用前均需要放
蛋白质的短暂表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 牛血清DMEM葡聚糖PBSDMSOEDTA仪器、耗材 培养皿培养箱相差显微镜离心机实验步骤1. 将目的基因亚克隆至合适的载体中得到所需的重组DNA,用小量法(5 ml 培养物)或用CsCl/溴化乙锭离心法纯化重组DNA。2. 将在DMEM-10 CS中生长汇片的COS
蛋白质的短暂表达实验
实验材料载体试剂、试剂盒牛血清DMEM葡聚糖PBSDMSOEDTA仪器、耗材培养皿培养箱相差显微镜离心机实验步骤1. 将目的基因亚克隆至合适的载体中得到所需的重组DNA,用小量法(5 ml 培养物)或用CsCl/溴化乙锭离心法纯化重组DNA。2. 将在DMEM-10 CS中生长汇片的COS-7细
分子克隆蛋白表达实验指南(七)
目的基因表达 14.快速诱导表达 快速诱导目的是为检测该重组质粒在BL21中是否能被诱导表达重组蛋白,并确定在不同IPTG浓度蛋白诱导效率的差异。 5. 挑单克隆菌落于7ml含有相应抗生素LB培养液的50ml培养管中,37C振荡培养过夜(8-16h)。 6. 37C,1mM
分子克隆蛋白表达实验指南(二)
取DEPC水时切记带上手套 Genequant使用方法: 开机-set-up-enter(只更改DNA/RNA,看光波是否为320nm)-set-ref(此时插入空白对照)-样品 1.使用前将比色皿中水吸出,用1ml蒸馏水重新洗涤再将比色皿中的水吸尽(先用1ml枪吸,后用100ul枪吸)
Northwestern筛选蛋白表达文库实验
实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子来说
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子清除的定义
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子清除的概念
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
杂合启动子的定义
中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定 义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子,兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻
启动子封堵的定义
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子封堵的概念
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
翻滚启动子的定义
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)