追根溯源：细说靶向重测序与扩增子捕获技术
追根溯源：细说靶向重测序与扩增子捕获技术 Thermo 与 Illumina合作的消息公布之后，在生物医学界投下了一颗重磅炸弹，Ion Ampliseq也一下子成为网络热搜词。Ion Ampliseq这个技术究竟是什么？它有什么独特之处？为什么这个技术会造成轰动性的效应呢？让我们追根溯源，从NGS说起。 illunina.jpeg NGS，即下一代测序技术（Next-generation sequencing technology）又称高通量测序技术（High-throughput sequencing），以能一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定但读长一般较短为标志。 NGS技术正逐年成熟，这使得全基因组测序的成本越来越低，但是对全基因组进行测序后得到的极其庞大、繁杂的数据量的分析工作并没有随之一起变得更加简单，恰恰相反，更高的测序深度反而导致最后的数据量变得更加庞大了,分析工作也变得更加困难......阅读全文
Nature－Methods：两轮捕获+双重测序－成就史上最精准的测序！
传统的高通量测序会产生不少错误，掩盖基因组中的罕见突变。前不久科学家们开发了一种新测序法，能够成功从背景噪音中分离出信号，实现极为准确的测序。 肿瘤是异质性细胞的混合体，测序可以检测其中的罕见突变，但成本较高而且容易出现错误。华盛顿大学的研究团队为此开发了新测序技术，将靶序列纯化与高精度的DN
基因捕获技术的定义
基因捕获技术是最具应用前景的基因克隆方法之一。利用该技术建立的随机插入突变的突变体文库，可用于寻找、鉴定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因，它是继自然突变、物理突变和化学突变之后发展起来的新的分子生物学方法。基因捕获载体是带有报告基因和/或选择标记基因的不完整的基因表达载体；这些载体所带的基因只
基因捕获技术的概念
基因捕获技术是最具应用前景的基因克隆方法之一。利用该技术建立的随机插入突变的突变体文库，可用于寻找、鉴定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因，它是继自然突变、物理突变和化学突变之后发展起来的新的分子生物学方法。基因捕获载体是带有报告基因和/或选择标记基因的不完整的基因表达载体；这些载体所带的基因只
Paragon－Genomics推广CleanPlex®－NGS靶点富集产品
Paragon Genomics，Inc.是给新一代测序（NGS）基于扩增子的靶向富集解决方案的佼佼者。Paragon今天宣布已在中国建立子公司，旨在将其CleanPlex®产品推向快速增长的中国市场。根据今年早些时候与MGI Tech Co.，Ltd.（MGI）达成的分销协议，Paragon推
基因文库制备仪简介
基因文库制备仪是一种用于基础医学领域的分析仪器，于2015年11月1日启用。 技术指标 通量为10M，100M和1G测序芯片可以任意选择；标准测序时间为2~3小时；使用无标记的核苷酸及酶进行测序。 主要功能 新一代测序技术，基因组DNA序列测定（微生物基因组测序、线粒体测序、靶向测序）、
中英碳捕获与封存技术联合研究项目征集建议
截止日期：2010年4月15日下午4点。 英国工程与自然科学研究理事会(EPSRC)领导下的英国研究理事会能源项目已确定中国为国际合作的优先国家。这项活动根据之前两个在可再生能源和清洁矿物燃料领域进行合作研究的提议，由EPSRC和中国自然科学基金委员会(NSFC)联合发布。
英国科学家实验碳捕获与储存监测技术
位于北海的海上石油钻井平台最终将成为储存碳排放的场所 碳捕获与储存技术(CCS)是减缓温室气体排放对全球气候和海洋影响的一种方式。通过碳捕获与储存技术(CCS)，发电厂等工矿企业产生的二氧化碳可以被注入曾经储存石油和天然气的岩层中。 在欧洲北海油气田，有很多废弃的海上石油气钻井平台，而C
2012最受欢迎的测序文章，点滴决定成败
作为测序生力军的第三代测序技术能够大大增加测序的效率和通量，不过很显然第二代测序技术仍会继续被广泛采用。近日BioTechniques杂志评出了今年最受欢迎的两篇测序文章以飨读者，而这两篇文章正是目前技术过渡时期的写照。 近年来，基因组学、转录组学和宏基因组学等领域迎来了爆炸式的增长，这都
Ion－Torrent新一代测序仪介绍
引言 整个或部分基因组测序的研究问题已解决，研究者的研究重点向着遗传密码如何编码调控细胞功能方向转移。同样，在分子水平了解人类健康状况，基因序列数据则显得更加重要。大多数的测序都是针对部分基因序列或是一段目标区域，提供必需的数据来解释给定假说。利用PCR技术很容易从基因组中扩增得
安捷伦科技通过战略性收购扩张生命科学业务
安捷伦科技通过战略性收购扩张其在新一代测序和药物自动分析解决方案领域的生命科学业务 2011 年 12 月 1 日，加利福利亚州圣克拉拉市 – 安捷伦科技公司(纽约证交所：A)前宣布了通过两项战略性收购扩张其生命科学业务。其中一项是收购 Halo Genomics 公司，该公司专
Macrogen千年基因应邀赴汕头国际眼科中心进行学术交流
12月21日，Macrogen千年基因应邀赴汕头大学•香港中文大学联合汕头国际眼科中心进行学术交流，该中心的陈建欢老师、陈浩宇主任等数十名研究人员参加了会议。会议期间，双方共同探讨了眼科疾病的研究进展及基因组学技术在该类疾病研究中的应用。基于汕头国际眼科中心在眼病基因组学领域取得的科研成果，以及
DNA测序技术的研究与发展
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
高通量测序技术总结与展望
第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率，适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补，但是成本昂贵，而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中，454序列片段最长，比较适合对未知基因组从头测序，搭建主体结构，但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454
二代测序杂交捕获是100％结合吗
不是 有两种第二代杂交捕获检测技术(HC2)进行...DNA定量分析方法结合HC2检测筛查宫颈癌的敏感性和特异...度分别是100%、96.49%,HPG方法和DNA直接测序方法
细胞化学词汇扩增子
扩增子为基因组的一个DNA片段，当生物接触某种抑制该片段所含基因的功能的药物后，该DNA片段可形成多个线性拷贝。例如，哺乳动物中二氢叶酸还原酶可被甲氨喋呤抑制，当哺乳动物接触该药物后，则引起二氢叶酸还原酶基因(dihydrofolate reductase)的扩增。扩增片段常会有除被抑制基因序列以外
基因扩增子的定义
扩增子为基因组的一个DNA片段，当生物接触某种抑制该片段所含基因的功能的药物后，该DNA片段可形成多个线性拷贝。例如，哺乳动物中二氢叶酸还原酶可被甲氨喋呤抑制，当哺乳动物接触该药物后，则引起二氢叶酸还原酶基因(dihydrofolate reductase)的扩增。扩增片段常会有除被抑制基因序列以外
安捷伦科技推出SureSelect激酶组靶向序列捕获试剂盒
安捷伦科技推出用于生物标记物发现的表达激酶组研究的靶向序列捕获系统该系统可帮助研究人员寻找新的癌症疗法和药物靶标 2010年10月，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日推出SureSelect激酶组靶向序列捕获试剂盒，帮助研究者实现针对表达激酶（激酶组）的新一代测序研究
安捷伦交付首批中国本土生产的靶向捕获产品
2021年9月9日，浙江杭州——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日，安捷伦于杭州生产基地成功交付首批国内生产的SureSelect靶向捕获探针产品。此次完成的生产交付，标志着近期落成的国内生产线，实现了与安捷伦全球标准一致的生产水平和质量保障。未来，国内生产线将生产供应高质量的SureSele
安捷伦科技与Covaris公司签署合作开发市场协议
安捷伦科技公司与Covaris公司签署合作开发市场协议 将靶向序列富集与DNA剪切技术结合 用于新一代测序分析 2010年1月5日，北京安捷伦科技公司(NYSE: A)与Covaris 公司于今日宣布了一项合作开发市场协议，该协议表明，未来Covaris S2 DNA剪切技术将与安捷伦 S
Nature子刊发布单色靶向测序法
最近，研究人员开发出一种新的边合成边测序（sequencing-by-synthesis）方法，这种方法可让你在非常熟悉的平台上更快、更划算地进行靶向临床测序。相关研究结果发表在最近的《自然通讯》杂志（Nature Communications）。 新一代测序（NGS）技术通过降低测序的成本，
靶向测序：表达谱分析的新选择
没有人愿意听到“癌症”这个词。不过在提到前列腺癌时，人们的情绪往往更加复杂：有些人的肿瘤不会扩散，需要积极监控；而有些人就没那么幸运，需要手术或放疗和化疗。医生所面临的挑战是正确的诊断，再加上适当的治疗。 Carlos S.Moreno是埃默里大学温希普癌症研究所（Winship Cancer
中国人群甲状腺乳头状癌遗传图谱绘就
本报讯 近日，中国科学院北京生命科学研究院孙中生研究团队与北京大学肿瘤医院头颈外科刘宝国课题组合作，收集了355对甲状腺乳头状癌的癌组织和癌旁组织样本，运用目标区域扩增子测序技术和RNA目标区域捕获测序技术对癌症样本中的点突变和基因融合作了全面检测，绘制了中国人群甲状腺乳头状癌的遗传图谱。相关研
中国人群甲状腺乳头状癌遗传图谱绘就
近日，中国科学院北京生命科学研究院孙中生研究团队与北京大学肿瘤医院头颈外科刘宝国课题组合作，收集了355对甲状腺乳头状癌的癌组织和癌旁组织样本，运用目标区域扩增子测序技术和RNA目标区域捕获测序技术对癌症样本中的点突变和基因融合作了全面检测，绘制了中国人群甲状腺乳头状癌的遗传图谱。相关研究成果发
华大在新冠病毒基因组变异监测及研究方法上取得突破
随着新型冠状病毒肺炎（COVID-19）肆虐全球，世界卫生组织（WHO）已经正式宣布其为全球流行病（Pandemic）。WHO最新新冠疫情状态报告显示，截至北京时间2020年3月26日10点，新冠肺炎疫情已蔓延至全球198个国家和地区，确诊患者超过46万例，且仍呈现迅速增长态势。 病毒在传播过
BioTechniques：2015最受欢迎的技术文章
BioTechniques杂志日前评出了2015年最受欢迎的十篇技术文章，涵盖了对PCR、DNA提取、无细胞蛋白表达等常规技术的改良，以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微图案化等新技术的应用。 1. Visual detection of isothermal nucleic aci
全新一代测序技术：没有光的测序
至今，新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心 ――明斯特大学Dag Harmsen 在去年召开的美国微生物学会上，来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言，这场疫情首先在德国北部地区爆发，感染了至少4000人，夺去了超过
西安交大等提出轴平面光学捕获与成像技术
近日，西安交通大学理学院教授雷铭团队提出轴平面光学捕获与成像技术，打破了传统光学捕获技术的操控范围局限在焦平面附近的限制，首次实现了轴平面（X-Z）全息光镊动态操控多粒子的功能，极大地提升了光镊在三维空间操控粒子的能力。该研究成果发表在最新的《物理评论快报》。 光镊利用光与物质相互作用过程中的
基因捕获技术的主要分类
根据报告基因在载体中的位置及报告基因激活表达的方式，基因捕获分为3种类型。增强子捕获载体基因捕获含有一个最小的启动子和翻译起始位点,当载体整合到顺式增强子元件附近时,此增强子将调控报告基因的表达 。对报告基因在体内表达的ES 细胞系插入位点进行克隆鉴定发现插入位置邻近编码序列。关于增强子捕获的诱变比
基因捕获技术的优点缺点
用常规方法进行基因打靶研究需耗费大量的时间和人力。研究者必须针对靶位点在染色体组文库中筛选相关的染色体组克隆，绘制相应的物理图谱，构建特异性的打靶载体以及筛选中靶ES细胞等。通常一个基因剔除纯合子小鼠的获得需要一年或更长的时间。面对人类基因组计划产生出来的巨大的功能未知的遗传信息，传统的基因剔除方法
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α