倚天屠龙,谁与争锋——且看基因敲除与RNA干扰的关系

研究历史 20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这个方法在当年来说,存在效率低、劳动成本高的缺点,严重制约了基础研究和临床应用,这就需要科学家探索更为简洁高效的基因编辑技术。 为了实现利用简单的方法使特定基因失去功能,科学家研发出了RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术,希望更易于研究哺乳动物细胞的基因功能,它具有操作简单、效果明显等优点。但RNAi不能作用于所有基因和某些细胞类型(如神经元),而且存在位置效应、临时性和不完全敲除的缺点[3]。 随着各种基因编辑技术的进步,如:锌指核酸酶技术(zinc finger nuclease,ZFN)[4]、......阅读全文

波数与波长的关系

波数等于真实频率除以光速,即波长(λ)的倒数,理论物理中定义为:k=2π/λ。意为2π长度上出现的全波数目。从相位的角度出发,可理解为:相位随距离的变化率(rad/m)。波数的量纲是长度-l,采用国际单位制,波数的单位是m-1。一般来说,科学家比较喜好采用厘米-克-秒制(CGS)来表达波数。采用(C

溶酶体与肿瘤的关系

溶酶体与肿瘤的关系日益引起人们的关注,一般有以下几种观点:(1)致癌物质引起细胞分裂调节机能的障阻及染色体畸变,可能与溶酶体释放水解酶的作用有关;(2)某些影响溶酶体膜通透性的物质,如巴豆油,某些去垢剂、高压氧等,是促进致癌作用的辅助因子,也能引发细胞的异常分裂;(3)在核膜残缺的情况下,核膜对核的

细胞与原子的关系

  一、细胞和原子的关系:   细胞由各种物质构成,物质由分子构成,分子由原子构成。有些物质直接由原子构成,如一个氧气分子由两个氧原子构成。  二、细胞与原子的大小比较: 细胞 > 原子

砝码与天平的关系

在日常工作现场,要想是天平的实际显示误差在允差之内,是很不现实的。所以,就应当分时段对器具进行校准,zui好是满称量砝码校准,也可以按实际称重大小选择校准值。常用的度不高的天平,由托盘、指针、横梁、标尺、游码、砝码、平衡螺母、分度盘等组成。分度值一般为0.1或0.2克。 每台天平都是配备相同等级砝码

关于小干扰RNA的RNA激活介绍

  已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。

RNA干扰主体实验

siRNA表达载体构建好后,即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于:成功将siRNA表达载体导入目的细胞如果目的细胞的质粒转染效率较低(低于70%),则应采用腺病毒或慢病毒载体,利用病毒载体的高感染率、高表达特性,更好地开展RNA干扰主体实验。设置好分组和对照按照nature的标准

RNA干扰制备方法

化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高,定制周期长,特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高,为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了,比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于:已经找到最有效的siRNA的情况

RNA干扰功能特点

1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实

RNA干扰回复实验

RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

RNA干扰主体实验

siRNA表达载体构建好后,即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于:成功将siRNA表达载体导入目的细胞如果目的细胞的质粒转染效率较低(低于70%),则应采用腺病毒或慢病毒载体,利用病毒载体的高感染率、高表达特性,更好地开展RNA干扰主体实验。设置好分组和对照按照nature的标准

RNA干扰实验技术

实验概要本文介绍了RNA干扰的原理及基本实验方法,包括了siRNA的设计、siRNA的制备和siRNA的转染等方法,及RNA干扰实验中的注意事项。实验原理近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因

RNA干扰回复实验

RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

RNA干扰回复实验

RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

RNA的分离与纯化

包括Northern杂交在内的许多分子生物学实验均是以RNA为材料,mRNA的制备也需要一定质量的总RNA样品,RNA的数量、纯度与完整性将直接影响这些实验的结果。RNA中rRNA的数量最多,占总量的80%~85%;tRNA及核内小分子RNA占15%~20%;mRNA仅占1%~5%。由于各种rRNA

乳腺癌细胞与基因关系图谱绘出

  英国研究人员日前在美国《基因组研究》杂志上报告说,他们绘制出可清晰展示乳腺癌细胞形态与基因之间关系的图谱,未来有望帮助医生更准确地选择治疗方案,提升治疗乳腺癌的效果。  英国癌症研究所的研究人员利用大数据技术,分析了大量图片展示的超过30万个乳腺癌细胞的细胞形态,以及超过2.8万个基因的数据,绘

恶性血液病与基因检测项目的关系

  一些恶性血液病,尤其是急性白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征、骨髓增殖性疾病等。没有特异性的免疫学、染色体或融合基因异常,在早期时主要表现为血液细胞轻度升高或降低,难以与再生障碍性贫血、类白血病反应等良性疾病鉴别。  在之前的血液科临床上对此的诊断主要是靠排除法,需要长时间的观察才

RNA干扰相关知识RNARITS)

RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。

反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)

最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA

RNA干扰相关知识RNARISC

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

条件基因敲除的定义

中文名称条件基因敲除英文名称conditional gene knockout定  义使靶基因在特定细胞类型或者特定发育阶段完全丧失功能的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

基因敲除的实验步骤

实验步骤构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染

基因敲除技术的分类

基因敲除分为完全基因敲除和条件型基因敲除(又称不完全基因敲除)两种。完全基因敲除是指通过同源重组法完全消除细胞或者动物个体中的靶基因活性,条件型基因敲除是指通过定位重组系统实现特定时间和空间的基因敲除。噬菌体的Cre/LoxP系统、Gin/Gix系统、酵母细胞的FLP/FRT系统和R/RS系统是现阶

RNAi引起的基因敲除

RNAi引起的基因敲除:由于少量的双链RNA就能阻断基因的表达,并且这种效应可以传递到子代细胞中,所以RNAi的反应过程也可以用于基因敲除。

基因敲除的实验步骤

构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染色体靶位

基因敲除的操作步骤

利用基因打靶技术产生转基因动物的程序一般为:获得干细胞基因敲除一般应用于鼠,而最常用的鼠的种系是129及其杂合体,因为这类小鼠具有自发突变形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的倾向,是基因敲除的理想实验动物。而其他遗传背景的胚胎干细胞系逐渐被发展应用,来自于C57BL/6×CBN/JNCrjF1小鼠的胚胎干细胞系成

基因敲除的技术应用

基因敲除技术主要应用于动物模型的建立,而最成熟的实验动物是小鼠,对于大型哺乳动物的基因敲除模型还处于探索阶段。近年来,牛、羊、猪、猴等大型哺乳动物实现了基因敲除。但由于狗的生殖生理较为特殊,基因敲除狗的培育难度大为增加,狗基因组的定点修饰一直未获成功。针对这一问题,研究团队设计了一个自体移植的策略,

基因敲除的技术路线

基因敲除的技术路线如下:(1)构建重组基因载体﹔(2)用电穿孔、显微注射等方法把重组DNA转入受体细胞核内﹔(3)用选择培养基筛选已击中的细胞﹔(4)将击中细胞转入胚胎使其生长成为转基因动物,对转基因动物进行形态观察及分子生物学检测。

RNA提取与纯化

实验概要掌握RNA提取的基本技术,了解RNA提取过程中的各种注意事项。实验原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术。 RNA提取和DNA提取有类似的地方,因为它们都是核酸,都具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞,然后用提取液将RNA溶出,反复抽提去除蛋白质,加入乙醇沉淀RNA,将RNA

甲醇与乙腈谁极性大

极性是指分子中电荷偏移的程度,也就是偶极矩,6楼和9楼说的都对.比如在烷烃与烯烃中,碳与氢对电子的吸咐能力差不多,电子基本在两个原子的中间,电荷偏移不大,所以总的来说极性比较小,比醇的极性小多了,因为醇中氧对电子的吸附能力大,电子偏向等原子.而对烷烃和烯烃来说,由于烯烃中的双键共用了四个电子,会影响

甲醇与乙腈谁极性大

极性是指分子中电荷偏移的程度,也就是偶极矩,6楼和9楼说的都对.比如在烷烃与烯烃中,碳与氢对电子的吸咐能力差不多,电子基本在两个原子的中间,电荷偏移不大,所以总的来说极性比较小,比醇的极性小多了,因为醇中氧对电子的吸附能力大,电子偏向等原子.而对烷烃和烯烃来说,由于烯烃中的双键共用了四个电子,会影响