UCSFDOCK6,AUTODOCK与AUTODOCKVINA对接准确率的探讨

以下是我司精选的微信群聊天记录,想加入微信学术交流群的朋友,请在公众号“殷赋科技”首页输入“加群”,验证后入群。 1 A:有没有关于主流对接软件的横评的综述啊,我看很多CNS级别的文章也在引用autodock还有vina,对接的准确与否一般是怎么定义的呢? 殷赋科技:这样的文章(文献)有很多,到pubmed搜一下就有了。之前群里有人发了一篇文章,说到vina的准确率比dock6高。我对此持怀疑态度。我只凭经验判断,没有重现过人家的结果,也没有去仔细研究人家的研究过程。 有两个方面,我认为dock6更好: 1、做过不少体系,dock6的结果更接近晶体构象或者能够解释实验现象,而vina则不太行。比如,我以前在做教程的时候,同一个PDB蛋白用dock6只产出少量(经常是一两个)pose结果,且第一个(也就是打分最好的)结果与实验晶体结构非常一致,而用vina则产生很多结果,没有一个好的。当然,并......阅读全文

多项技术助力神舟九号与天宫一号对接成功

  在神舟九号与天宫一号成功对接后,记者获悉,包括航天测控可视化系统、交会对接微波雷达、高精度加速度计等在内的多项技术成果,保障了神舟九号与天宫一号的对接成功。   在北京飞控大厅前方的巨幅显示屏上,三维动画把飞行器在太空中飞行的姿态实时展现出来。北京飞控中心软件室主任孙军介绍,针对此次任务“载人

广州分院与连南县召开“百千万工程”工作对接会

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506747.shtm8月14日,中国科学院广州分院与广东省清远市连南瑶族自治县(以下简称连南县)就推进广东省百校联百县助力“百县千镇万村高质量发展工程”(以下简称“百千万工程”)行动在广州进行工作对接。会

中国东盟技术转移与创新合作大会:重技术需精准对接

  作为第13届中国—东盟博览会的重要论坛之一,第4届中国—东盟技术转移与创新合作大会将于9月11日在南宁开幕。8月30日,记者从第4届中国—东盟技术转移与创新合作大会组委会举行的新闻通气会上获悉,大会从整体上更加注重实效,突出东盟各国的技术产业需求,注重技术需求精准对接,将进一步加强技术转移与创新

昆明分院与贵州省联合开展合作项目专项对接

对接会现场  6月28日至29日,贵州省科技厅、中科院昆明分院和贵州省复合改性聚合物材料工程技术中心,邀请中科院长春应用化学研究所的化工、材料等专业技术专家,在贵阳举办了“中科院长春应用化学研究所科研成果推介会”。贵州省科技厅副厅长苟渝新出席推介会并讲话。贵州省16家相关专业领域的企

九州通孵化器企业与北大进行资源对接

  分析测试百科网讯 2016年5月20日,丰台九州通孵化器企业(生物医药领域)与北京大学分析测试中心举行了资源对接活动,活动由首都科技条件平台北京大学研发实验服务基地和条件平台丰台工作站联合发起。北大基地专业服务机构负责人江向峰,首都科技条件平台丰台工作站副主任高家春

美科研小组利用iPhone与光谱仪检测癌症:准确率达99%

  据外媒报道,苹果公司利用iPhone和Apple Watch进军健康保健领域的宏伟计划已不再是什么秘密,但试图将智能手机整合进医学研究领域的却并非苹果一家。最近,来自华盛顿州立大学的一个研究小组在助理教授Lei Li的带领下,开发了一种由智能手机支持的便携式实验室,该实验室能够迅速对癌症患者的生

探讨拉曼光谱仪日常检修与维护内容

  拉曼光谱仪一般都是用于比较的实验室,在我们的日常中并不常见,所以陌生也是情有可原的。虽然这是一个比较陌生的高科技产品,但是它与我们的生活却息息相关,在我们的日常生活中,可以说拉曼光谱仪起到了很大的作用。   拉曼光谱仪长期使用那么出现问题是在所难免的。也并不是说厂家生产的产品质量有问题,无论什

国电集团与波兰积极探讨新能源领域合作

        9月14日,国电集团总经理、党组副书记朱永M,副总经理、党组成员米树华在北京会见了由波兰外交部经济合作司副司长凯帕奇克,波兰财政部战略项目司司长马杰兰诺斯基,波兰大使馆经济处一秘伊万妮卡,以及波兰能源企业界组成的波兰能源代表团一行。双方就加强能源领域的合作进行了深入交流。   朱永

争鸣与探讨:科研经费怎么管才能没问题

   近年来,有关科研经费的审计披露问题和贪腐报道屡屡见诸报端,给公众造成一种“错觉”,似乎整个科研系统是“坏的”、所有科研机构是“完全没有效率的”。笔者以为这种“错觉”对广大科研人员极其不公,不利于创新型国家的建设。  自1996年“科教兴国”成为我们的基本国策以来,历届中央政府更加重视科研经费投

干细胞牛人Cell子刊探讨癌症与“垃圾”DNA

  来自Whitehead生物医学研究所、Dana-Farber癌症研究所的研究人员,在一项研究中揭示出了称作为超级增强子(super-enhancers)的基因控制元件是如何作为功能部件将多个信号通路集中于一些关键基因处以及调节转录活性的。  这项研究工作表明,这些基因控制元件为一些信号通路提供了

五位专家撰文探讨“科研经费分配与管理”

  近年来,随着我国科研经费投入的增多,如何有效管理资金日益成为一个重要课题。本版围绕“科研经费分配与管理”的话题,约请科技政策与管理方面的学者进行笔谈,对科研经费的管理机制、评审制度和分配模式等问题作深入探讨,以期推动相关的改革。   科研经费流失是制度问题   上世纪90年代,我在一个中

国外黑臭河道治理典型案例与技术路线探讨

   2015年中共中央、国务院《关于加快推进生态文明建设的意见》(中发〔2015〕12号文)指出:“要将生态文明建设放在突出的战略位置,加大自然生态系统和环境保护力度,使蓝天常在、青山常在、绿水常在,实现中华民族永续发展”。针对我国水环境的严峻形式,国务院于2015年4月份颁布了《水污染防治行动计

首届科学数据大会探讨“科研大数据与数据科学”

  2月24日,首届科学数据大会在中国科学院大学国际会议中心举行。包括中科院院士郭华东、陈润生,中国工程院院士汪懋华在内的400多名专家、青年科研人员参会。   中科院副院长、国际科技数据委员会(CODATA)中国全国委员会主席丁仲礼向会议发来贺信。他在贺信中表示,科研大数据和数据科学的作用越来越

血尿酸与冠心病发病率关系探讨

  冠心病与脂质代谢,糖代谢紊乱有密切关系,但与嘌呤代谢产物尿酸研究不多[1],为探讨血尿酸水平与冠心病之间的关系,本文对100例冠心病患者进行血尿酸测定,并与阴性对照组相比较,分析探讨高尿酸血症与冠心病的关系。  1  资料与方法  1.1  资料  选择2006年4月~2007年3月在进修医院

污水流量测量中流量计的选型与探讨

  国外一位流量专家F.C.Kinghoro曾说过,流量计是少数几种使用比制造艰难的仪表之一。这是因为流量是一个动态量,处于运动状态的液体内部不仅存在着粘性摩擦作用,还会产生不稳定的旋涡和二次流等复杂流动现象。测量仪表本身受到众多因素,如:管道、口径大小、形状(圆形、矩形)、边界条件、介质的物性(温

探讨囊性肾癌的早期彩色多普勒超声诊断与临床价值

  近几年随着彩色超声仪器的不断更新,分辨率、清晰度得到进一步提高;同时,超声医生通过在实践中不断探讨及总结经验,囊性肾癌早期诊断水平有了很大的提升。   1资料和方法   1.1一般资料 自2005年3月-20011年2月采用彩色多普勒超声常规检查的3681例病例中,共发现15例患者,男9例,女6

便携式原子吸收光谱仪的研究与探讨

  引言原子光谱分析技术历经数十年发展,已经形成利用原子发射、原子吸收、原子荧光等不同光谱特性进行有效化学分析的光谱分析仪器系列。纵观原子光谱分析仪器近几年的发展,一方面,设计与制造技术日臻完善、质量水平日趋稳定的“综合大系统”被全球各领域数以万计的实验室购置使用,成为微量与痕量元素分析的重要装备。

尿沉渣镜检与尿液分析仪检测结果的探讨

  目前我国中小医院干化学尿液自动化分析基本普及。该方法操作简单、快速,检测少量尿液可获得多项实验参数,有利于临床诊断,减少了实验室的工作强度。但是,对有些项目的检测,也存在着不可忽视的缺陷。笔者对2009年4~5月2 000份门诊患者尿液标本进行了红细胞、白细胞尿干化学分析和显微镜涂片检查。现将结

探讨高校公共建筑能耗监测系统的设计与应用

在资源节约型社会建设进程中,高校公共建筑能耗管理存在问题已经成为办学成本加大、社会资源浪费的桎梏。在各级政府的推动下,高校公共建筑能耗监测系统建设在探索中发展,依托互联网+大数据技术逐步实现能耗管理信息化的实践,为高校乃至全社会公共建筑用能稳步向微能耗、零能耗发展提供可能和基础,促使绿色建筑快速发展

气相色谱与气质联用仪检测多氯联苯的探讨

多氯联苯(polychlorinated biphenyl,简称PCB),又称多氯联二苯,是许多含氯数不同的联苯含氯化合物的统称。在多氯联苯中,部份苯环上的氢原子被氯原子置换,一般式为 C12HnCl(10-n) (0≦n≦9)。   多氯联苯在常温下是比水重的液体,多氯联苯耐热性及电绝缘性能良好,

原子吸收光谱分析方法与仪器的技术探讨

原子吸收光谱分析仪器具有灵敏度高,可达到10-9 ~ 10-17 克/升;重复性和选择性好、操作比较简便、快速、结果准确、可靠等优点;检测时样品用量少,在几—几十微升之间,测量范围广,几乎能用来分析所有的金属元素和类金属元素元件。原子吸收光谱分析仪器可应用于冶金、化工、地质、农业及医药卫生等许多部门

原子吸收光谱分析方法与仪器的技术探讨

原子吸收光谱分析仪器具有灵敏度高,可达到10-9 ~ 10-17 克/升;重复性和选择性好、操作比较简便、快速、结果准确、可靠等优点;检测时样品用量少,在几—几十微升之间,测量范围广,几乎能用来分析所有的金属元素和类金属元素元件。原子吸收光谱分析仪器可应用于冶金、化工、地质、农业及医药卫生等许多部门

科研创新对接战场需求

  近日,从火箭军某基地传来喜讯:由该基地对接战场需求提出的“某高效检测屏蔽装置研制”项目,已进入研制定型阶段。该基地领导介绍,科研创新只有瞄准战场难题,精准发力破解,才能真正发挥好服务打仗保障打赢作用。   该基地先后出台了一系列举措:每次训演练或是执行重大任务,都组织大批科研骨干赴一线“淬火”,

分子对接技术流程介绍

蛋白与小分子的对接受体结构准备:通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构;药物分子准备;对接口袋的确定蛋白与蛋白的对接蛋白结构模型准备:通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构;对接,一般生成数万种pose如果知道某些残基参与结合,那么可以对对接pose进行过滤对对接POSE进行重新打分并排序,挑选

植物识别App,准确率不足4%

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498310.shtm很多智能手机里的应用程序(App)能根据照片识别植物,但一项研究发现,其识别准确率并不高。 应用程序可以识别植物,但并非完全准确。图片来源:Marko Geber/Digita

调查称Apple-Watch能够检测糖尿病-准确率达85%

  据科技博客TechCrunch北京时间2月8日报道,健康科技初创公司Cardiogram发布的一项最新临床研究报告称,苹果Apple Watch能够检测出之前被诊断为糖尿病患者的糖尿病症状,准确率可达85%。  这项研究是Cardiogram和加利福尼亚大学旧金山分校(UCSF)联合展开的一项名

分子对接技术的起源及方法

分子对接这一想法的历史可以追溯到19世纪提出的受体学说,Fisher提出的受体学说认为,药物与体内的蛋白质大分子即受体会发生类似钥匙与锁的识别关系,这种识别关系主要依赖两者的空间匹配。随着受体学说的发展,人们对生理活性分子与生物分子的相互作用有了更加深刻的认识,从基于空间匹配的刚性模型逐渐发展成为基

血液测试诊断ALS的准确率高达97%

一项新研究显示,研究人员已将8个遗传标记与肌萎缩侧索硬化(ALS)联系起来,未来可能通过血液检测来诊断这种最常见的运动神经元疾病。9月13日,相关研究成果发表于《大脑通讯》。血液中的生物标志物可以指向某些状况。图片来源:Evgeniy Salov/AlamyALS患者在行走、说话、吞咽和呼吸方面都会

如何提高肿瘤细胞药敏检测的准确率?

有助于提高肿瘤细胞药敏检测准确率的方法:优化样本采集和处理:确保采集的肿瘤样本具有代表性,尽量减少样本在处理过程中的细胞损伤和改变。采用先进的样本保存技术,以维持细胞的活性和特性。模拟肿瘤微环境:在药敏检测中,尝试更接近体内肿瘤微环境的条件,例如添加细胞外基质成分、共培养相关的免疫细胞或其他基质细胞

肿瘤细胞药敏检测的准确率高吗?

肿瘤细胞药敏检测的准确率受到多种因素的影响,不能简单地给出一个绝对的高或低的评价。一方面,肿瘤细胞药敏检测具有一定的优势和潜力。它能够在体外模拟肿瘤细胞对药物的反应,为临床用药提供有价值的参考。在一些研究和临床实践中,药敏检测结果与实际治疗效果之间显示出了一定的相关性。然而,另一方面,其准确率也存在