斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
科学家首次发现肠道微生物分泌蛋白可提高胰岛素水平
记得老编辑有天对我讲，「有些投资人告诉我，现在微生物领域是投资热点，大家都在看项目，但是好的项目实在是太少了。」 近十年来，二代测序技术不仅催生了一大批专注于人体基因组的公司，也孕育了一大批关注人体肠道微生物的公司。几乎每周都有肠道微生物的重磅研究进展刊登在各个顶级期刊上，然后迅速刷爆朋友圈。
西班牙科学家引入新基因使鱼鳍变“鱼腿”
据美国媒体12月11日报道，西班牙保罗・德・奥拉维德大学的遗传研究人员发现，鱼鳍细胞中引入HOXD13基因后，鱼发育出的肢体更像是一条腿。 科学家用斑马鱼进行了试验，他们将额外的HOXD13基因引入斑马鱼坯胎的鱼鳍顶端，该基因促成了新软骨组织的产生和鱼鳍组织的减少，进而发育出“鱼腿”。
海归青年科学家44岁病逝－曾誓言培养百名博士
今年7月16日，中科院上海生命科学研究院暨上海交通大学医学院健康科学研究所研究员刘廷析因病去世，年仅44岁。“我是带着感恩、幸福和愉快的心情离开这个世界的。我此生只追求忠诚，上对国家，下对学生。”这是这位“海归”青年科学家留给世界最后的话。 “廷析天天往医院跑，但从来都是去看他的实验
新溴代阻燃剂暴露影响雌性斑马鱼生殖内分泌系统
阻燃剂通常作为消费产品中的添加剂防止燃烧或是延迟火灾蔓延，被广泛应用于电子设备制造、纺织品、塑料制品以及汽车产业中。随着传统溴代阻燃剂的禁用，新溴代阻燃剂十溴二苯乙烷（DBDPE）作为十溴二苯醚（BDE209）的替代品被大量生产和使用。 环境监测数据表明DBDPE在环境
新溴代阻燃剂暴露影响雌性斑马鱼生殖内分泌系统
阻燃剂通常作为消费产品中的添加剂防止燃烧或是延迟火灾蔓延，被广泛应用于电子设备制造、纺织品、塑料制品以及汽车产业中。随着传统溴代阻燃剂的禁用，新溴代阻燃剂十溴二苯乙烷（DBDPE）作为十溴二苯醚（BDE209）的替代品被大量生产和使用。 环境监测数据表明DBDPE在环境
模式动物研究进展
在生命科学与人类健康领域中，实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型，对分析疾病的发病机制，解答特定人群对某种疾病的易感性，及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而，由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别，而疾
朱强课题组建立麻竹内源基因的敲除的基因编辑系统
福建农林大学教授朱强课题组以东南亚地区广泛种植的麻竹为材料，建立了适合麻竹内源基因的敲除的基因编辑系统，实现了对麻竹基因的定点敲除。相关成果近日发表于《植物生物技术杂志》。该研究为竹子分子生物学的发展及通过分子育种方法进行竹子农艺性状的改良提供了有力的技术支撑。图片来源于网络 目前，世界上约有
新技术追踪单个细胞如何产生完整身体
生物学最大的谜题之一是单个受精卵如何产生众多组合在一起形成身体的细胞类型、组织和器官。如今，由单细胞测序技术和计算工具构成的组合体正在为这一过程提供迄今最详细的画面。在3篇日前在线发表于《科学》杂志的论文中，研究人员报告称拍下了正在发育的斑马鱼或青蛙胚胎中大多数细胞基因活性的多个快照。随后，他
被氯酚污染后鱼类“女宝”更多的分子机制获揭示
2,4-二氯酚通过雌激素受体ESR2a依赖的信号途径导致斑马鱼原始生殖细胞数量增加 兰州大学供图 氯酚作为化工原料被广泛使用于工农业生产和日常生活中，为水环境普遍存在的一类持久性有机污染物。氯酚类化合物可通过食物链等途径在生物体内累积和放大，且具有内分泌干扰效应，不可避免对水生动物产生毒性
生命科学研究中常见模式生物简介（二）
2.3 斑马鱼的特殊优势斑马鱼能够成为模式生物，也有这它本身独特的优势。在生物学上，斑马鱼体外受精，胚胎在体外发育并且透明，易于观察和操作，受精卵直径约1mm，便于进行显微注射和细胞移植。在技术上，斑马鱼可以像线虫和果蝇一样，进行细胞标记和细胞谱系跟踪，也可以像爪蟾一样进行胚胎的细胞移植。在基因水平
美或批准转基因鱼上市－生长速度比普通鱼快1倍
转基因大马哈鱼18个月可长到60厘米长、3公斤重，而养殖大马哈鱼则需3年时间。转基因的大马哈鱼最重可达5公斤。 公司表示，所有转基因大马哈鱼都被设计为雌性，且不具备繁殖后代能力，理论上杜绝异种繁殖的危险。 本报讯 据英国《每日邮报》11月25日报道，在加拿大政府批准一种可食用转基
看细菌真相学DNA分离－南医大实验室向公众开放
使用显微镜观察菌落、观赏模式动物斑马鱼的养殖过程，观看小鼠主动脉分离实验……今天（5月19日），南京医科大学重点实验室向公众开放，吸引了大批小学生、大学生前来参观，近距离接触了科研的神秘世界。每平方厘米皮肤有十万细菌 显微镜下让孩子了解勤洗手的意义“一只手用酒精消毒，一只手没用酒精消毒。消毒后的这只
Nature：利用新开发的计算机确定早期胚胎中发挥作用基因
在一项新的研究中，来自美国华盛顿大学医学院的研究人员开发的计算机软件可以预测当个别基因缺失或受到过多激活时，复杂的基因网络会发生什么。此类基因网络在早期胚胎发育中发挥着关键作用，指导干细胞形成特定的细胞类型，然后构建组织和器官。绘制这些网络中单个基因的作用，是了解健康发育和寻找再生受损细胞和组织的方
蝾螈如何重生四肢
重新长出四肢的能力似乎是科幻小说中的内容，但是新研究展示了蝾螈和斑马鱼等动物如何利用这项惊人的本领，以及人类如何利用它们的这种能力设计生物型机械。 科学家已经知道一些鱼类和两栖类物种具有再生能力：即它们在被捕食者伤害后，能够重新生长出四肢或鳍，而且它们能够利用受伤处的干细胞重新长出骨头、肌肉和
Glia：神经干细胞再生的机制
“与哺乳动物不同，斑马鱼拥有超强的神经元再生功能，因此在大脑受到损伤后能够快速激发脑组织再生过程。然而，它们的基因与人以及小鼠却无太大差异”。该研究的作者，来自Waseda大学分子神经学系的教授Toshio Ohshima说道：“此前有研究表明斑马鱼的神经元再生功能能够应用于小鼠，因此或许人类也
营养所发现淋巴管发育的一个关键基因
近日，《生物化学杂志》（Journal of Biological Chemistry）在线发表了中科院上海生命科学研究院营养所陈雁研究组的最新研究进展The RAS guanyl nucleotide-releasing protein RasGRP1 is involved in
人类为何睡觉？或为修复遭损害DNA
人的一生中，有三分之一时间要用于睡觉。以前光知道，睡眠有助于加强记忆和提升学习能力。至于为什么会这样，还有其它什么功效，则知之甚少，迄今为止缺乏系统科学解释。 据英国《每日邮报》报道，以色列巴兰大学里奥·艾波包姆教授领导的一个科研小组，最近开展了一项实验。实验是在斑马鱼身上进行的。斑马鱼基因
双酚S（BPS）毒性对神经发育及其它方面的影响机制研究－1
无处不在的双酚S（BPS）真的是安全无毒害的吗？环境与人类健康目前是最受关注的，双酚A（BPA）存在于日常生活消费品中的各个方面，广泛应用于罐头食品和饮料的包装、奶瓶、水瓶、牙齿填充物所用的密封胶、眼镜片以及其他数百种日用品的制造过程中。但是双酚A有毒，长时间摄入与吸取会对肝功能和肾功能有害，而且会
Science重要发现：炎症促进再生
发表在最新一期(11月8日)《科学》(Science)杂志上的一篇报告揭示斑马鱼具有非凡的大脑修复能力秘密在于炎症。斑马鱼大脑的神经干细胞表达了一种炎症信号分子的受体，促使细胞增殖并发育成新神经。 约翰霍普金斯大学神经病学和神经科学教授明国丽(Guo-Li Ming，未参与该研究)说：
使用徕卡体视显微镜观察细胞
徕卡体视显微镜在特殊照明、电脑程序和样品制备的帮助下，观察细胞特别是活体内细胞，能得到细胞结构和细胞动力学的宝贵信息。不过，这对于高等生物尤其困难。德国卡尔斯鲁厄理工学院（KIT）、马克斯·普朗克协会高分子研究所,以及美国国家卫生研究所（NIH）的研究人员，通过一种新观察方法观察到八分之一微米大小的
应用优化CRISPR技术建立基因完全敲除的小鼠及猴
6月6日，《细胞研究》在线发表了一项成果，应用改进的“C-CRISPR”技术可以获得单基因或多基因功能完全敲除的小鼠及猴。这项研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心的杨辉研究组、熊志奇研究组以及神经所苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究通过将多个
条件性基因敲除的基本原理Flp／FRT系统
条件性基因敲除的基本原理 Flp ／ FRT 系统该系统与Cre／loxP系统相同，也是由一个重组酶 和一段特殊的DNA序列组成。从进化的角度上考虑，Flp／FRT系统是Cre／loxP系统在真核细胞内的同源系统。其中．重组酶Flp是酵母细胞内的一个由423个氨基酸组成的单体蛋白。与Cre相似，Fl
基于PCR评估sgRNA特异性的方法
CRISPR/Cas9已经成为一种通用的基因组工程工具，依赖于一个单导向RNA（sgRNA）和Cas9酶进行基因组编辑。研究人员可以用简单、快速和经济的方法来产生sgRNAs，因此能够在培养细胞、小鼠、斑马鱼和其他模型系统中进行靶向诱变。为了靶向效率，预先筛选sgRNAs，对于成功诱变和减少动物
Cell子刊：表观修饰在抗病毒天然免疫中的作用
来自浙江大学生科院的研究人员发表了题为“Lck/Hck/Fgr-mediated tyrosine phosphorylation negatively regulates TBK1 to restrain innate antiviral responses”的文章，报道抗病毒天然免疫关键激酶
Cell子刊：表观修饰在抗病毒天然免疫中的作用
来自浙江大学生科院的研究人员发表了题为“Lck/Hck/Fgr-mediated tyrosine phosphorylation negatively regulates TBK1 to restrain innate antiviral responses”的文章，报道抗病毒天然免疫关键激酶
原油泄漏是如何伤害金枪鱼的心脏的
太平洋蓝鳍金枪鱼。 一项新的研究显示了为什么来自石油外泄的已知会损害鱼类心脏的有毒化合物会引起这样的损害。该研究所揭示的机制显示了脊椎动物心脏对当今广泛存在于石油中的有毒化合物的易感性。当原油泄漏时，其组分化合物——其中包括多环芳烃(PAHs)——会被释放出来。科学家们已知PAHs对鱼胚胎
健康所造血干/祖细胞生存和自我更新能力研究获新成果
中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所，中国科学院干细胞生物学重点实验室发育与疾病研究组于近日在国际著名学术期刊Blood在线发表了最新研究成果Dominant-Negative C/ebpα and Polycomb Group Protein Bmi1
Nature揭示多变的基因表达模式
脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成，并开发出一些新的治疗药物。第一次，一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》（Nature）杂志上。 在对几个基因组进
模式生物高通量多维表型研究方法概述（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
北京大学Nature子刊发表心脏病研究新文章
来自北京大学生命科学学院佟向军(Xiangjun Tong)副教授领导研究团队在斑马鱼中证实，KCTD家族成员Kctd10通过抑制Tbx5a转录活性调控了心脏形态发生。这一研究发现在线发表在1月16日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 先天性心脏病